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细菌耐药机制及检测,细菌耐药机制及检测,一、细菌耐药的遗传机制,细菌耐药性的遗传学机制主要指细菌的耐药性通过基因突变(即染色体介导的耐药性)获得,或通过质粒或转座子水平传播获得外源耐药性基因,也可通过整合子捕获外源基因使之转变为功能性基因来传播耐药性。,1、染色体介导的耐药,2、质粒介导的耐药,3、整合子介导的耐药,二、细菌耐药的化学机制,(一)产生灭活抗生素的各种酶,(二 ) 膜通透性下降,(三)抗菌药物作用靶位改变,(四)细菌主动药物外排机制,(五)细菌生物被膜的形成,三、当前主要的耐药性问题,革兰阳性菌:耐青霉素肺炎链球菌(Penicillin resistant Streptococcus pneumoniae,PRSP);耐甲氧西林葡萄球菌(Methicillin resistant Staphylococci,MRS);耐万古霉素肠球菌(Vancomycin resistant enterococcus,VRE)及耐万古霉素金黄色葡萄球菌(Vancomycin resistant S.aureus,VRSA)。,革兰阴性菌:产超广谱-内酰胺酶的肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌(ESBLs);持续高产型-内酰胺酶的阴沟肠杆菌、枸橼酸杆菌等;多重耐药的铜绿假单胞菌、不动杆菌、嗜麦芽窄假单胞菌。,对异烟肼和利福平耐药的多重耐药结核分枝杆菌(Multidrug resistance Mycobacteria tuberculosis,MDR-Tb)。,四、主要的耐药性检测方法,(一)耐青霉素G的肺炎链球菌(PRSP),筛选试验:1g/片苯唑青霉素,MH琼脂+5%羊血,35含5%CO2%环境中孵育20-24小时,抑菌环直径19mm耐药,20mm敏感;确证试验:稀释法测定青霉素MIC,MIC0.06g/ml敏感 2g/ml耐药。,(二)耐甲氧西林的葡萄球菌(MRS),(1)纸片筛选法:含4%NaCl的MH琼脂,30g/片头孢西丁,33-35,24小时。对于金黄色葡萄球菌,抑菌环直径19mm,为MRSA,抑菌环直径20mm,为MSSA;对于凝固酶阴性葡萄球菌,抑菌环直径24mm,为MRCONS,抑菌环直径25mm,为MSCONS。,(2)琼脂筛选法:MH琼脂中加入6ug/ml苯唑西林、4%氯化钠,直接菌落悬液法,涂布接种,35,孵育至24小时。任何有生长的现象均为MRS。,(3)乳胶凝集或基因扩增法直接检测MecA基因。,(四)耐万古霉素的肠球菌,检测方法:30g/片万古霉素,抑菌环14mm为耐万古霉素肠球菌。,(五)超广谱-内酰胺酶(extended-spectrum-lactamases ESBLs),(1)药敏推测法:根据ESBLs能水解三代头孢的原理进行检测。用标准琼脂扩散法测定头孢他啶、氨曲南、头孢噻肟、头孢泊肟和头孢曲松的抑菌环直径,按NCCLS标准进行判断。凡头孢他啶抑菌环直径22mm、头孢泊肟抑菌环直径17mm、氨曲南或头孢噻肟抑菌环直径27mm、头孢曲松抑菌环直径25mm,任何一种药物抑菌环直径达到上述标准,或用稀释法检测上述药物的MIC大于等于2ug/ml,均疑为ESBLs菌株。应进一步作确证试验确诊。,(2)表型确证试验:根据ESBLs可被克拉维酸抑制的原理,按NCCLS推荐的指南进行操作,包括纸片法和稀释法。前者采用头孢他啶(30g)及头孢他啶/克拉维酸(30g/10g)组合,头孢噻肟(30g)及头孢噻肟/克拉维酸(30g/10g)组合,任一组药物的抑菌环的直径差5 mm时,判定为ESBLs阳性株。,(5)等电聚焦及克拉维酸抑制试验:将临床分离菌中粗提的未知ESBLs进行等电聚焦电泳,,测定其等电点(PI),与已知酶的ESBLs的PI进行比较,又根据克拉维酸可以抑制的ESBLs活性,而对其他-内酰胺酶的活性无明显抑制作用的特性。可先用克拉维酸对凝胶板上的酶进行抑制,再用头孢硝噻吩进行显色反应,可进行ESBLs的检测和分型。,(6)产酶基因的检测:提取待测菌的DNA作为扩增模板,采用已知标准酶基因的特异性引物,进行体外循环扩增,结果如为阳性说明有已知ESBLs的产酶基因。还可对扩增产物进行测序,确定ESBLs的类型。,(2)AmpC酶表型筛选试验:根据AmpC酶对大部分头孢菌素、尤其是三代头孢菌素耐药的特性,对产AmpC酶的菌株进行表型筛选。选用亚胺培南(IP)、头孢吡肟(FEP)、头孢他啶/克拉维酸(CAZ/Cla)、头孢噻肟(CTX)和头孢噻肟/克拉维酸(CTX/Cla)5种抗菌药物纸片,按NCCLS的K-B法进行操作。判断方法:(1)IP、FEP敏感,而CTX、CAZ/Cla和CTX/Cla耐药;(2)IP、FEP敏感,而在CTX、CAZ/Cla和CTX/Cla的抑菌环内存在散在的菌落;(3)IP敏感,而FEP、CAZ/Cla和CTX/Cla耐药。以上三种结果提示,待检菌株产AmpC酶。最后一种表型提示,待检菌株产AmpC酶的同时,产生其他-内酰胺酶,如产ESBLs。此方法操作简便、快速省时,较三维实验简单得多,可作为产AmpC酶菌株的筛选试验。,(3)氯唑西林(CLO)双抑制剂扩散协同实验:根据氟氯西林(CLO)可抑制AmpC酶的特性进行检测,按NCCLS的K-B法操作,在M-H平板上均匀涂布待检菌株,中央贴一空白纸片,并在其周围2025mm处贴上头孢他啶(CAZ)、头孢曲松(CRO)、头孢哌酮(CFP)、氨曲南(ATM)和头孢噻肟(CTX)纸片,再在空白纸片上滴加10mg/mlCLO20ul,35。C孵育1824h,观察纸片之间的抑菌环情况,CLO与任何一种头孢菌素协同为阳性,提示产AmpC酶。因CLO在琼脂中的扩散能力较差,故将FCC药液直接加在空白纸片上进行扩散,效果较好。此方法操作简便、快速省时。结果基本可靠,可以在各临床微生物实验室推广应用。,(5)等电聚焦及氟氯西林抑制试验:一般的AmpC酶的等电点(PI)偏碱,且大多大于等于9.0,故可用物理方法先将其从待检菌细胞中释放出来,制成酶粗提物,再用等电聚焦的方法在琼脂糖凝胶板上将其与其他 -内酰胺酶或其他蛋白成份分开。又根据氟氯西林可以抑制AmpC酶的活性,而对其他-内酰胺酶的活性无明显抑制作用的特性。若先用氟氯西林对凝胶板上的酶进行抑制,再用头孢硝噻吩进行显色反应,被抑制掉的条带即可能为AmpC酶条带。,具体操作方法:用超声粉碎法制备待检细菌中的-内酰胺酶粗提物,再对待测-内酰胺酶进行等电聚焦(用两份同种-内酰胺酶粗提物跑出两块凝胶板,电泳的条件完全相同)。在一块凝胶板(A)上覆盖浸有氟氯西林(1mmol/L)的滤纸条,另一块凝胶板(B)上仅覆盖用无菌蒸馏水浸润的滤纸条,30s后去除两块凝胶板上的滤纸,再分别覆盖上浸润头孢硝噻吩(500ug/ml)的滤纸条,1min后揭去滤纸条,观察结果。如果A、B两块凝胶板上的条带颜色不同,即在B板上变色(有黄变红者)、而在A板上不变色(仍为黄色)的条带,即为AmpC酶阳性。与三维试验相同,该方法也是利用酶的粗提物而不是活菌做检测,不受抗菌药物的诱导影响,还可确定AmpC酶的型别。但缺点较三维试验更繁琐、费时,不宜在临床微生物实验室推广应用。,(6)AmpC酶的基因检测:AmpC酶的基因组是由一种结构基因ampC和四种调控基因ampR,ampD,ampE,ampG组成,AmpC酶基因存在于阴沟肠杆菌、福氏志贺菌、普通变形杆菌及肺炎克雷伯菌等产AmpC酶的细菌的染色体远端或质粒中。存在于不同细菌中的AmpC酶基因其特定的核苷酸序列都是相同的,即不论是结构基因ampC还是各种调控基因,都有其特定的核苷酸序列。故通过查找待检细菌中有无特定的AmpC酶的基因片段(通过特异性的基因引物,扩增待检细菌中特定的AmpC酶的基因片段,分析其特定的核苷酸序列),即可确定待检细菌能否产AmpC酶。如将PCR产物测序,并与标准序列相比较,还可检测AmpC酶的型别。AmpC酶的基因检测法可直接检测待检细菌中染色体或质粒上的ampC基因或ampD基因片段,不受表型和外界因素的影响,准确性高。但该方法的实验操作仍较繁琐,不适合于临床常规应用。,(七)金属-內酰胺酶,(1)协同法药物敏感性检测:以巯基丙酸或EDTA.K2为酶抑制剂,头孢他啶、头孢噻肟、亚胺培南为底物,在MH平板上用KB法进行检测。巯基丙酸或EDTA与CZA、CTX、IMP四纸片中任一纸片间出现抑菌环扩大现象则表示协同试验阳性(该细菌产金属-内酰胺酶);如无此现象,则表示协同试验阴性。,(2)耐药基因PCR检测:质粒介导的blaIMP和染色体介导的blaIMPPCR检测,尤其使用于沉默型金属酶基因的检测。,
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