血流感染实验室诊断剖析课件

血流感染实验室诊断新进展血流感染实验室诊断新进展北京协和医院检验科王瑶2013年4月13日血流感染实验室诊断新进展北京协和医院检验科内容什么是血流感染？血流感染流行病学特点血培养流程优化提高阳性率分析培养结果减少污染分子生物学方法检测血流感染基于PCR的技术MALDI-TOFMSPNA-FISH内容什么是血流感染？概念感染炎症+病原体全身炎症反应综合征（SIRS）体温38C或90次/分呼吸频率20次/分，或PaCO212109/L或10%脓毒血症（sepsis）感染+SIRS，血培养可以阳性或阴性重度脓毒血症（severesepsis）sepsis+脏器功能障碍、组织灌注不良和低血压感染性休克（septicshock）概念感染炎症+病原体概念败血症（septicemia）：病原菌及其毒素侵入血流所引起的临床综合征，是一种严重的全身感染。病原菌主要是细菌，也可为真菌、分枝杆菌等。菌血症（bacteremia）：细菌在血流中短暂出现的现象，一般无明显毒血症状，在国外文献中常与败血症通用。血流感染（bloodstreaminfection,BSI）：败血症和菌血症目前统称为血流感染。概念败血症（septicemia）：病原菌及其毒素侵入血流所血流感染医院获得性血流感染原发血流感染实验室证实血流感染（Laboratory-confirmedBloodstreamInfection,LCBI）临床血流感染（ClinicalSepsis）继发血流感染：血培养分离出有意义微生物，而且此微生物与另一部位之院内感染有关。唯不包括血管或血管内导管装置所引起之血流感染。社区获得性血流感染血流感染医院获得性血流感染实验室证实血流感染（LCBI）标准一：从一次或多次血标本中培养出一种一致的致病菌，而且培养出的病原体与其它部位的感染无关。标准二：病人至少具有下列症状和体征之一：发热（38C），寒颤或低血压，并致病符合下列之一：1.从两次或两次以上不同部位抽血的标本中培养出皮肤寄生菌（如类白喉杆菌、芽孢杆菌、丙酸杆菌、凝固酶阴性葡萄球菌或微球菌）。2.至少一次从带血管内导管的病人血标本中培养出皮肤寄生菌群（如类白喉杆菌、芽孢杆菌、丙酸杆菌、凝固酶阴性葡萄球菌或微球菌），并且主管医生开始了适当的抗菌药物治疗。3.血中抗原检测阳性（如流感嗜血杆菌、肺炎链球菌、脑膜炎奈瑟菌或B群链球菌）。与实验室阳性结果一致的症状和体征与其它部位的感染无关。标准三：年龄38C），低温（37C），呼吸暂停、脉搏徐缓，并具有下列之一（同上3点略）实验室证实血流感染（LCBI）标准一：从一次或多次血标本中培临床血流感染（ClinicalSepsis）具有下列二条件之一者：具有非其它已知原因所引起的发烧、血压过低（收缩压90mmHg或收缩压低于平常超过40mmHg），少尿（每小时尿量低于30ml）等临床症状任何一项，且符合下列所有条件者：未做血培养，或血培养阴性或血液抗原反应呈阴性者其它部位无明显感染者医生针对此感染中毒症状给予适当抗菌药物治疗1岁以下婴儿，具有非其它书籍原因引起的发烧、体温过低、呼吸中止或心跳过缓等临床症状任何一项，且符合下列所有条件者：未做血培养，或血培养阴性或血液抗原反应呈阴性者其它部位无明显感染者医生针对此感染中毒症状给予适当抗菌药物治疗临床血流感染（ClinicalSepsis）具有下列二条件BSI流行病学特点BSI发病率逐年增加凝固酶阴性葡萄球菌、肠球菌、真菌血流感染发病率逐年上升，革兰阴性菌下降耐药菌比例逐年增加社区获得与医院获得血流感染病原谱存在差异院内BSI患者病死率高BSI流行病学特点BSI发病率逐年增加美国脓毒血症流行病学+600%+300%+300%Martin et al,NEJM 2003;348:1546美国脓毒血症流行病学+600%+300%+300%Marti加拿大CANWORD监测2002-2009DiagMicrobioloInfectDis.2011;69:307加拿大CANWORD监测2002-2009DiagMicr加拿大CANWORD监测2002-2009DiagMicrobioloInfectDis.2011;69:307加拿大CANWORD监测2002-2009DiagMicr美国49医院BSI病原谱CID.2004,39:309-317美国49医院BSI病原谱CID.2004,39:309PUMCH2012年834血培养分离株PUMCH2012年834血培养分离株PUMCH2012年144株BSI大肠埃希菌药敏结果ESBL60.2%PUMCH2012年144株BSI大肠埃希菌药敏结果ESBLPUMCH2012年67株BSI肺炎克雷伯菌药敏结果ESBL34.4%PUMCH2012年67株BSI肺炎克雷伯菌药敏结果ESBLPUMCH2012年61株BSI鲍曼不动杆菌药敏结果PUMCH2012年61株BSI鲍曼不动杆菌药敏结果PUMCH2012年76株BSI金黄色葡萄球菌药敏结果PUMCH2012年76株BSI金黄色葡萄球菌药敏结果PUMCH2012年46株BSI草绿色溶血链球菌药敏结果PUMCH2012年46株BSI草绿色溶血链球菌药敏结果2011CHIF-NET489株BSI酵母菌2011CHIF-NET489株BSI酵母菌2011CHIF-NET念珠菌对氟康唑的敏感性2011CHIF-NET念珠菌对氟康唑的敏感性2011CHIF-NET念珠菌对伏立康唑的敏感性2011CHIF-NET念珠菌对伏立康唑的2011CHIF-NET其他酵母菌对氟康唑的敏感性2011CHIF-NET其他酵母菌对氟康唑的敏感性2011CHIF-NET其他酵母菌对伏立康唑的敏感性2011CHIF-NET其他酵母菌对伏立康唑的采血量是影响血培养阳性率的独立相关因素CLSIM47-A：每位患者采集23套血培养（4060ml）SurvivingSepsisCampaignGuidelines(Worldwide)：抗菌药物治疗前至少采集2套血培养英国NHS血培养标准：采集2套血培养采血量是影响血培养阳性率的独立相关因素CLSIM47-A采血量对血培养阳性率的影响JCM2007采血量对血培养阳性率的影响JCM2007采血量对血培养阳性率的影响J.Clin.Microbiol.2011,49(12):4047采血量对血培养阳性率的影响J.Clin.MicrobioJ.Clin.Microbiol.2011,49(12):4047 Routine Set Mayo Clinic:2 BACTEC Aerobic Plus Bottles+1 BACTEC Anaerobic Lytic Bottle采血量和阳性率27非条件致病菌J.Clin.Microbiol.2011,49(128在多次血培养中单次培养下列细菌阳性凝固酶阴性葡萄球菌棒状杆菌微球菌丙酸杆菌芽孢杆菌如多次培养阳性，可能为条件致病菌，需结合临床分析血培养污染菌28在多次血培养中单次培养下列细菌阳性血培养污染菌非条件致病菌Mayo Clinic(p0.001)为什么需氧+厌氧？29PathogenNo.两种组合均能检测不同的病原菌J.Clin.Microbiol.2011,49(12):4047非条件致病菌MayoClinic(p38Cor90/min;呼吸 20/min;白细胞12or10%未成熟中性粒细胞32%患者有1瓶以上CNS阳性，BSI68%，污染12%(p0.001)没有SIRS症状：BSI5%，污染29%(p30秒1%2%碘酊30秒或10%碘伏消毒60秒：从穿刺点向外画圈消毒,直径3cm70%酒精脱碘 一步法葡萄糖酸洗必泰作用30s，或70%异丙醇消毒后自然干燥，但不适用于2个月以内的新生儿。降低血培养污染率严格消毒血培养瓶消毒：70%酒精消毒血培急诊血培养污染率与工作量相关TheUniversityofMichiganHealthSystem急诊血培养大多数由采血员采集，其次为护士和医生采血员:病人=1:9，重症区护士:病人=2:3，其它区域护士:病人=1:4年病人量82521人，采集血培养者7586人11.4%至少1瓶阳性，病原菌阳性率8.0%，污染率3.7%多套培养患者阳性率7.4%，单套培养阳性率5.1%（p0.001），污染率无显著差别（2.2%vs.2.6%）SchuylerHalverson,etal.JCM.2013online急诊血培养污染率与工作量相关TheUniversityo急诊小时工作量SchuylerHalverson,etal.JCM.2013online急诊小时工作量SchuylerHalverson,et繁忙时血培养污染率增加OR=1.23OR=0.93SchuylerHalverson,etal.JCM.2013online繁忙时血培养污染率增加OR=1.23OR=0.93Schuy抗菌药物治疗与血流感染死亡率死亡率Chest115(2):1999抗菌药物治疗与血流感染死亡率死亡率Chest115(2)血培养三级报告制度血培养血培养阳性阳性终报告终报告革兰染色革兰染色传种培养传种培养初步报告初步报告(直接药敏直接药敏)鉴定菌株鉴定菌株电话报告电话报告鉴定标准药敏鉴定标准药敏42血培养三级报告制度血培养终报告革兰染色传种培养初步报告(直血培养结果回报对治疗的影响A=AppropriateTherapy(正确治疗)I=InappropriateTherapy(不正确治疗)ClinInfecDis24:584-602,1997血培养结果回报对治疗的影响A=Appropriate血流感染快速分子诊断分子诊断不受抗菌药物使用的影响血培养阳性后分子诊断直接使用血标本进行分子诊断快速但不能提供药敏结果血流感染快速分子诊断分子诊断不受抗菌药物使用的影响血培养阳性瓶分子鉴定AntigoneKotsaki,etal.ExpertOpin.Med.Diagn.2012,6(3):209血培养阳性瓶分子鉴定AntigoneKotsaki,et阳性血培养基于PCR的检测PCR特异性检测病原特异性PCR特定耐药基因检测：葡萄球菌mecA,肠球菌van细菌载量：肺炎链球菌自溶毒A基因lytA拷贝数广谱检测：PCR扩增特定靶位多态性分析测序后续基因检测种特异性real-timePCRExpertOpin.Med.Diagn.2012,6(3):209.CurrOpinInfectDis.2011,24(2):137阳性血培养基于PCR的检测PCR特异性检测ExpertOqPCR鉴定血培养阳性瓶中铜绿假单胞菌Target：ecfXgene血培养系统：BacT/ALERT，87瓶FA、13瓶FN，涂片均显示G-b对照方法：氧化酶，API20EDNA提取：0.5ml肉汤，离心后加裂解液，水煮法定量PCR：扩增：Oligonucleotideprimers基因特异性检测：fluorescent-labeledhybridizationprobes，152bpfragmentAnnalClinMicrobiolAntimicrob2010,9:2147qPCR鉴定血培养阳性瓶中铜绿假单胞菌Target：ecfXqPCR鉴定血培养阳性瓶中铜绿假单胞菌33瓶pae，敏感性和特异性均为100%1瓶kpn+pae，由于pae(20CFU/ml)kpn(108CFU/ml)，PCR(-)检测限：将ATCC27853ecfX基因克隆至TOP10E.coliAnnalClinMicrobiolAntimicrob2010,9:2148qPCR鉴定血培养阳性瓶中铜绿假单胞菌33瓶pae，敏感性和阳性血培养基于PCR的检测最常见病原体多重PCR电泳谱、ELISA杂交、多重Real-timePCRHyplexBloodScreen(BAG,Lich,Germany):多重PCR+ELISA,4.5-6h完成Prove-ItSepsis(Mobidiag,Helsinki,Finland)：多重real-timePCR+微阵列分析，检测多种病原及mecA，3h完成多重Real-timePCRExpertOpin.Med.Diagn.2012,6(3):209.阳性血培养基于PCR的检测最常见病原体多重PCRExper血培养阳性多重real-timePCRNEWMICROBIOLOGICA,36,65-74,2013血培养阳性多重real-timePCRNEWMICRO血培养阳性多重real-timePCRNEWMICROBIOLOGICA,36,65-74,2013血培养阳性多重real-timePCRNEWMICRO血培养阳性PNAFISH核酸荧光原位杂交血培养阳性肉汤革兰染色PNAFISH革兰阴性菌：商品化试剂盒eco/kpn/paeEfa/其它肠球Sau/scnCal/cgl/其它念珠菌报道Salmonellaspp.90minPNAFISH完成ApplEnvironMicrobiol.2010;76:4476 J.Clin.Microbiol.2013,51(4):1301JClinMicrobiol.2009;47:24752血培养阳性PNAFISH核酸荧光原位杂交血培养阳性肉汤MALDI-TOFMS基质辅助激光解析电离（MALDI）原理：将样品分散在基质分子中形成结晶后直接进样，当用激光照射结晶时，基质吸收了激光的大部分能量，使基质分子和样品获得能量投射到气相并得到电离，成为带电荷的离子。基质在样品离子形成过程中起到了质子化或去质子化的作用，使样品带上正电荷或负电荷，成为带电荷的离子基质会干扰被检测分子质谱峰的大小和浓度；不同类型的分析物选择不同的基质MALDI-TOFMS基质辅助激光解析电离（MALDI）MALDI-TOFMS飞行时间（TOF）原理：离子源产生的离子在加速电场获得动能，当进入高真空无电场飞行管道并在此管道内飞行时，质量较轻的离子飞行速度快，早到达检测器；质量较重的离子飞行速度慢，晚到达检测器。因此依据离子的飞行时间与其质荷比平方根（m/z）成正比的关系，通过测定飞行时间，计算出相应离子的分子量。MALDI-TOFMS飞行时间（TOF）MALDI-TOFMS操作步骤MALDI-TOFMS操作步骤MALDI-TOFMS快速鉴定阳性血培养使用菌落、阳性血培养肉汤鉴定快速：20分钟(从报警到鉴定出结果）MALDI-TOFMS(Bruker)+BACTEC(BD):正确鉴定：193/213阴性菌（包括厌氧菌）(90.61%)，284/319阳性菌(89.02%)80.9%复数菌正确鉴定出一种，7株缓症链球菌鉴定为spnMALDI-TOFMS(Bruker)+BacT/ALERT(bioMrieux):388个阳性瓶，种正确率91%（包括念珠、厌氧菌）15瓶复数菌：使用通用库多鉴定出一种，革兰染色后使用阴性或阳性库分析，6瓶鉴定出第二种菌ClinMicrobiolInfect2010;16:1631JClinMicrobiol2010;48:154256MALDI-TOFMS快速鉴定阳性血培养使用菌落、阳性血培MALDI-TOFMSVITEKMS(bioMrieux)以16s为金标准，980株临床分离株，ID正确率肠杆菌科97.7%非发酵菌92%葡萄球菌属94.3%链球菌属84.8%HACEK84%酵母菌85.2%57JClinMicrobiol.2010;48:900MALDI-TOFMSVITEKMS(bioMrieuPCR/ESIMS广谱PCRESIMS（电喷射质谱）189阳性血培养和45阴性血培养，种一致率98.7%6例spn标本方法阴性提供定量结果评估病原体载量假阴性率24%：几乎均由混合感染导致5-6h完成检测结合PCR的敏感性和ESIMS特异性可以直接检测标本，不需要培养ProcNatlAcadSci.2005;102:8012PCR/ESIMS广谱PCRESIMS（电喷射质谱）P血标本分子检测种特异性、属特异性、广谱、多重PCR、微阵列分析血培养阴性的苛养菌，如Bartonellaspp.巴尔通体,Coxiellaburnetii伯氏考克斯体,Mycoplasmaspp.支原体,Chlamydiaspp.衣原体,Ricketssiaspp.立克次体，Tropherymawhipplei血标本分子检测种特异性、属特异性、广谱、多重PCR、微阵列分商品化分子生物学检测方法:血标本SeptiFast(Roche)：multiplexreal-timePCR，种属特异性荧光探针，检测重要血流感染致病菌SepsiTestTM(Molzym)：eubacterialandpanfungalreal-timePCR，a16Sand18SrRNAgene-baseduniversalPCR+sequencing，几乎可以鉴定所有细菌、真菌VYOO(SIRSLab)：multiplexPCR，检测重要血流感染菌，电泳分离扩增片段Plex-ID(Abbott)：eubacterialandpanfungalPCR+质谱，几乎可以鉴定所有细菌、真菌60IntensiveCareMed.2011May,publishonline.商品化分子生物学检测方法:血标本SeptiFast(RocSeptiFasttest检测的病原谱BMJOpen2012;2:e000392IntensiveCareMed(2010)36:4956SeptiFasttest检测的病原谱BMJOpen2SeptiFasttest评估IntensiveCareMed(2010)36:4956SeptiFasttest评估IntensiveCareSeptiFast与PCT、CRP相关性LangenbecksArchSurg(2012)397:447455SeptiFast 与PCT、CRP相关性LangenbeckVYOO检测能力评估PLoSONE.2012,7:e38916Sepsis非感染SIRS血培养阳性血培养阴性，其它标本培养阳性Sepsis,所有培养阴性VYOO检测能力评估PLoSONE.2012,7:VYOO与微生物学一致性为46.2%仍需改进PLoSONE.2012,7:e38916VYOO与微生物学一致性为46.2%PLoSONE.23种商品化PCR检测系统比对MedKlinIntensivmedNotfmed20133种商品化PCR检测系统比对MedKlinIntens3种商品化PCR检测系统比对MedKlinIntensivmedNotfmed20133种商品化PCR检测系统比对MedKlinIntens分子生物检测血标本几乎所有与血培养对照的研究，都显示更高的敏感性，但并非所有血培养阳性菌一定能检测出来不可替代血培养！相较于血培养，其高敏感性可以更早地开始抗菌治疗，或改变治疗方案污染导致的假阳性无法排除！评估血培养阴性的PCR阳性结果分析其它微生物检查结果（如BALF，伤口拭子等）免疫反应指标68IntensiveCareMed.2011May,publishonline.分子生物检测血标本几乎所有与血培养对照的研究，都显示更高的敏小结BSI发病率逐年升高，尤其是革兰阳性菌和真菌BSI病原菌耐药率持续升高优化血培养流程，提高阳性率，降低污染率结合临床分析血培养结果分子生物学技术快速诊断BSI，MALDI-TOFMS、商品化多重PCR检测平台、PNA-FISH成为未来发展方向血培养不可被分子方法取代！小结BSI发病率逐年升高，尤其是革兰阳性菌和真菌谢谢！谢谢！谢谢！