环境生物化学ppt课件

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凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 蛋白质存在于所蛋白质存在于所蛋白质存在于所蛋白质存在于所有的生物细胞中,有的生物细胞中,有的生物细胞中,有的生物细胞中,是构成生物体最是构成生物体最是构成生物体最是构成生物体最基本的基本的基本的基本的结构结构结构结构物质物质物质物质和功能物质和功能物质和功能物质和功能物质。蛋白质是生命活蛋白质是生命活蛋白质是生命活蛋白质是生命活动的物质基础,动的物质基础,动的物质基础,动的物质基础,它参与了几乎所它参与了几乎所它参与了几乎所它参与了几乎所有的生命活动过有的生命活动过有的生命活动过有的生命活动过程程程程。第一章第一章 蛋白质蛋白质(Protein)(Protein)环境生物化学ppt蛋白质存在于所有的生物细胞中,是构成生物体最基本的结构物质和1 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 第一节第一节 概概 述述一、蛋白质的定义一、蛋白质的定义 蛋白质:是一切生物体中普遍存在的,由天然氨基酸通过肽键连接而成的生物大分子;其种类繁多,各具有一定的相对分子质量,复杂的分子结构和特定的生物功能;是表达生物遗传性状的一类主要物质。二、蛋白质在生命中的重要性二、蛋白质在生命中的重要性 早在1878年,思格斯就在反杜林论中指出:“生命是蛋白体的存在方式,这种存在方式本质上就在于这些蛋白体的化学组成部分的不断的自我更新。”可以看出,第一,蛋白体是生命的物质基础;第二,生命是物质运动的特殊形式,是蛋白体的存在方式;第三,这种存在方式的本质就是蛋白体与其外部自然界不断的新陈代谢。现代生物化学的实践完全证实并发展了恩格斯的论断环境生物化学ppt 第一节 概 述一、蛋白质的定2 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 1.1.蛋白质是生物体内必不可少的重要成分蛋白质是生物体内必不可少的重要成分蛋白质是生物体内必不可少的重要成分蛋白质是生物体内必不可少的重要成分 蛋白质占干重 人体中(中年人)人体 45%水55%细菌 50%80%蛋白质19%真菌 14%52%脂肪19%酵母菌 14%50%糖类1%白地菌50%无机盐7%2.蛋白质是一种生物功能的主要体现者蛋白质是一种生物功能的主要体现者 (1)酶的催化作用 (2)调节作用(多肽类激素)(3)运输功能 (4)运动功能 (5)免疫保护作用(干扰素)(6)接受、传递信息的受体 (7)毒蛋白环境生物化学ppt 1.蛋白质是生物体内必不可少的重要成分 3 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡3.3.外源蛋白质有营养功能,可作为生产加工的对象外源蛋白质有营养功能,可作为生产加工的对象外源蛋白质有营养功能,可作为生产加工的对象外源蛋白质有营养功能,可作为生产加工的对象.三、蛋白质的组成三、蛋白质的组成1.元素组成元素组成 蛋白质是一类含氮有机化合物,除含有碳、氢、氧外,还有氮和少量的硫。某些蛋白质还含有其他一些元素,主要是磷、铁、碘、碘、锌和铜等。这些元素在蛋白质中的组成百分比约为:碳 50 氢 7 氧 23 氮 16%硫 03 其他 微 量环境生物化学ppt3.外源蛋白质有营养功能,可作为生产加工的对象.三、蛋白质的4 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 氮占生物组织中所有含氮物质的绝大部分。因此,可以将生物组织氮占生物组织中所有含氮物质的绝大部分。因此,可以将生物组织的含氮量近似地看作蛋白质的含氮量。由于大多数蛋白质的含氮量接近的含氮量近似地看作蛋白质的含氮量。由于大多数蛋白质的含氮量接近于于16%16%,所以,可以根据生物样品中的含氮量来计算蛋白质的大概含量,所以,可以根据生物样品中的含氮量来计算蛋白质的大概含量蛋白质含量的测定:蛋白质含量的测定:凯氏定氮法凯氏定氮法 (测定氮的经典方法)优点:对原料无选择性,仪器简单,方法也简单;缺点:易将无机氮(如核酸中的氮)都归入蛋白质中,不精确。一般,样品含氮量平均在16%,取其倒数100/16=6.25,即为蛋白质换算系数,其含义是样品中每存在1g元素氮,就说明含有6.25g 蛋白质);故:蛋白质含量=氮的量100/166.25环境生物化学ppt 氮占生物组织中所有含氮物质的绝大部分。因此,5 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 除了上法外,还有除了上法外,还有 紫外比色法紫外比色法紫外比色法紫外比色法 双缩脲法双缩脲法双缩脲法双缩脲法 Folin Folin酚酚酚酚 考马斯亮兰考马斯亮兰考马斯亮兰考马斯亮兰G250G250比色法比色法比色法比色法(条件:蛋白质必须是可溶的)(条件:蛋白质必须是可溶的)2.化学组成化学组成(两种类型)单纯蛋白质:水解为-氨基酸 结合蛋白质=单纯蛋白质+辅基 环境生物化学ppt 除了上法外,还有 2.化学组成(两种类型)环境生物化6 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 第二节第二节 氨基酸化学氨基酸化学一、氨基酸的结构与分类一、氨基酸的结构与分类一、氨基酸的结构与分类一、氨基酸的结构与分类(2).除甘氨酸外,其它所有氨基酸分子中的-碳原子都为不对称碳原子,所以:A.氨基酸都具有旋光性。B.每一种氨基酸都具有D-型和L-型两种立体异构体。目前已知的天然蛋白质中氨基酸都为L-型。1.氨基酸的结构氨基酸的结构 氨基酸是蛋白质水解的最终产物,是组成蛋白质的基本单位。从蛋白质水解物中分离出来的氨基酸有二十种,除脯氨酸和羟脯氨酸外,这些天然氨基酸在结构上的共同特点为:(1).与羧基相邻的-碳原子上都有一个氨基,因而称为-氨基酸 COOHH2N CH -碳原子基团 R R基团-氨基酸基本结构通式环境生物化学ppt 第二节 氨基酸化学一、氨基酸的结构与分类7 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 2.2.常见氨基酸的分类常见氨基酸的分类常见氨基酸的分类常见氨基酸的分类 中性AA(1)按R基团的酸碱性分 酸性AA 碱性AA(2)按R基团的 疏水性R基团AA 电性质分 不带电荷极性R基团的AA 带电荷R基团的AA 脂肪族A(3)按R基团的化学结构分 芳香族AA 杂环族AA环境生物化学ppt 2.常见氨基酸的分类 8 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 3.3.构成蛋白质的构成蛋白质的构成蛋白质的构成蛋白质的2020种氨基酸种氨基酸种氨基酸种氨基酸环境生物化学ppt 3.构成蛋白质的20种氨基酸环境生物化学ppt9 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 4.人体所需的八种必需氨基酸人体所需的八种必需氨基酸 赖氨酸(Lys)缬氨酸(Val)蛋氨酸(Met)色氨酸(Try)亮氨酸(Leu)异亮氨酸(Ile)酪氨酸(Thr)苯丙氨酸(Phe)婴儿时期所需:精氨酸(Arg)、组氨酸(His)早产儿所需:色氨酸(Try)、半胱氨酸(Cys).几种重要的不常见氨基酸几种重要的不常见氨基酸几种重要的不常见氨基酸几种重要的不常见氨基酸 在少数蛋白质中分离出一些不常见的氨基酸,通常称为不常见蛋白质氨基酸。这些氨基酸都是由相应的基本氨基酸衍生而来的。其中重要的有4-羟基脯氨酸、5-羟基赖氨酸、N-甲基赖氨酸、和3,5-二碘酪氨酸等。这些不常见蛋白质氨基酸的结构如下环境生物化学ppt 4.人体所需的八种必需氨基酸 .几种重要的不常见氨10 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 环境生物化学ppt 环境生物化学ppt11 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 二二二二.氨基酸的重要理化性质氨基酸的重要理化性质氨基酸的重要理化性质氨基酸的重要理化性质1.1.一般物理性质一般物理性质一般物理性质一般物理性质 常见氨基酸均为无色结晶常见氨基酸均为无色结晶,其形状因构型而异其形状因构型而异(1)溶解性:溶解性:各种氨基酸在水中的溶解度差别很大,并能溶解于稀酸或稀碱中,但不能溶解于有机溶剂。通常酒精能把氨基酸从其溶液中沉淀析出。(2)熔点:熔点:氨基酸的熔点极高,一般在200以上。(3)味感:味感:其味随不同氨基酸有所不同,有的无味、有的为甜、有的味苦,谷氨酸的单钠盐有鲜味,是味精的主要成分。(4)旋光性:旋光性:除甘氨酸外,氨基酸都具有旋光性,能使偏振光平面向左或向右旋转,左旋者通常用(-)表示,右旋者用(+)表示。(5)光吸收:光吸收:构成蛋白质的20种氨基酸在可见光区都没有光吸收,但在远紫外区(97%以上);B.B.知道蛋白质的分子量;C.C.知道蛋白质由几个亚基组成;D.D.测定蛋白质的氨基酸组成;并根据分子量计算每种氨基酸的个数。E.E.测定水解液中的氨量,计算酰胺的含量。(2)测定步骤测定步骤测定步骤测定步骤 多肽链的拆分:多肽链的拆分:由多条多肽链组成的蛋白质分子,必须先进行拆分。几条多肽链借助非共价键连接在一起,称为寡聚蛋白质,如,血红蛋白为四聚体,烯醇化酶为二聚体;可用8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍处理,即可分开多肽链(亚基).环境生物化学pptA.样品必需纯(97%以上);(2)测定步骤环境生物化学p30 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 测定蛋白质分子中多肽链的测定蛋白质分子中多肽链的测定蛋白质分子中多肽链的测定蛋白质分子中多肽链的数目:数目:数目:数目:通过测定末端氨基酸残通过测定末端氨基酸残基的摩尔数与蛋白质分子量之基的摩尔数与蛋白质分子量之间的关系,即可确定多肽链的间的关系,即可确定多肽链的数目。数目。二硫键的断裂:二硫键的断裂:二硫键的断裂:二硫键的断裂:几条多肽链几条多肽链通过二硫键交联在一起。可在通过二硫键交联在一起。可在可用可用8mol/L8mol/L尿素或尿素或6mol/L6mol/L盐酸盐酸胍存在下,用过量的胍存在下,用过量的-巯基乙巯基乙醇处理,使二硫键还原为巯基,醇处理,使二硫键还原为巯基,然后用烷基化试剂保护生成的然后用烷基化试剂保护生成的巯基,以防止它重新被氧化。巯基,以防止它重新被氧化。可以通过加入盐酸胍方法解离可以通过加入盐酸胍方法解离多肽链之间的非共价力;应用多肽链之间的非共价力;应用过甲酸氧化法或巯基还原法拆过甲酸氧化法或巯基还原法拆分多肽链间的二硫键。分多肽链间的二硫键。环境生物化学ppt 测定蛋白质分子中多肽链的数目:通过测定末端氨31 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 巯基的保护测定每条多肽链的氨基酸组成,并计算出氨基酸成分的分子比;测定每条多肽链的氨基酸组成,并计算出氨基酸成分的分子比;分析多肽链的分析多肽链的N-N-末端和末端和C-C-末端末端 末端氨基酸的测定:末端氨基酸的测定:多肽链端基氨基酸分为两类,N-端氨基酸和C-端氨基酸。在肽链氨基酸顺序分析中,最重要的是N-端氨基酸分析法。末端氨基酸测定的主要方法有:环境生物化学ppt 巯基的保护测定每条多肽链的氨基酸组成,并计算出氨基酸32 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 A.A.二硝基氟苯(二硝基氟苯(二硝基氟苯(二硝基氟苯(DNFBDNFB)法)法)法)法B.B.丹磺酰氯法丹磺酰氯法丹磺酰氯法丹磺酰氯法:在碱性条件下,丹磺酰氯(二甲氨基萘磺酰氯)可在碱性条件下,丹磺酰氯(二甲氨基萘磺酰氯)可以与以与N-N-端氨基酸的游离氨基作用,得到丹磺酰端氨基酸的游离氨基作用,得到丹磺酰-氨基酸。此法氨基酸。此法的优点是丹磺酰的优点是丹磺酰-氨基酸有很强的荧光性质,检测灵敏度可以氨基酸有很强的荧光性质,检测灵敏度可以达到达到1 1 1010-9-9molmol。环境生物化学ppt 二硝基氟苯(DNFB)法环境生物化学ppt33 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡C.C.肼解法:肼解法:肼解法:肼解法:此法是多肽链此法是多肽链C-C-端氨基酸分析法。多肽与肼在无水条端氨基酸分析法。多肽与肼在无水条件下加热,件下加热,C-C-端氨基酸即从肽链上解离出来,其余的氨基酸则端氨基酸即从肽链上解离出来,其余的氨基酸则变成肼化物。肼化物能够与苯甲醛缩合成不溶于水的物质而与变成肼化物。肼化物能够与苯甲醛缩合成不溶于水的物质而与C-C-端氨基酸分离端氨基酸分离。环境生物化学ppt肼解法:此法是多肽链C-端氨基酸分析法。多肽与肼在无水条件下34 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 D.D.氨肽酶法:氨肽酶法:氨肽酶法:氨肽酶法:氨肽酶是一种肽链外切酶,它能从多肽链的氨肽酶是一种肽链外切酶,它能从多肽链的N-N-端逐个的端逐个的向里水解。根基不同的反应时间测出酶水解所释放出的氨基酸种类向里水解。根基不同的反应时间测出酶水解所释放出的氨基酸种类和数量,按反应时间和氨基酸残基释放量作动力学曲线,从而知道和数量,按反应时间和氨基酸残基释放量作动力学曲线,从而知道蛋白质的蛋白质的N-N-末端残基顺序。最常用的氨肽酶是亮氨酸氨肽酶,水解末端残基顺序。最常用的氨肽酶是亮氨酸氨肽酶,水解以亮氨酸残基为以亮氨酸残基为N-N-末端的肽键速度最大。末端的肽键速度最大。E.E.E.E.羧肽酶法:羧肽酶法:羧肽酶法:羧肽酶法:羧肽酶是一种肽链外切酶,它能从多肽链的羧肽酶是一种肽链外切酶,它能从多肽链的C-C-端逐个的端逐个的水解。根基不同的反应时间测出酶水解所释放出的氨基酸种类和数水解。根基不同的反应时间测出酶水解所释放出的氨基酸种类和数量,从而知道蛋白质的量,从而知道蛋白质的C-C-末端残基顺序。目前常用的羧肽酶有四种:末端残基顺序。目前常用的羧肽酶有四种:A,B,CA,B,C和和Y Y;A A和和B B来自胰脏;来自胰脏;C C来自柑桔叶;来自柑桔叶;Y Y来自面包酵母。羧肽酶来自面包酵母。羧肽酶A A能水解除能水解除Pro,ArgPro,Arg和和LysLys以外的所有以外的所有C-C-末端氨基酸残基;末端氨基酸残基;B B只能水解只能水解ArgArg和和LysLys为为C-C-末端残基的肽键。末端残基的肽键。多肽链断裂成多个肽段多肽链断裂成多个肽段,可采用两种或多种不同的断裂方法将多肽样品断裂成两套或多套肽段或肽碎片,并将其分离开来。多肽的选择性降解的方法多肽的选择性降解的方法有:环境生物化学ppt 氨肽酶法:氨肽酶是一种肽链外切酶,它能从多肽链的N-端35 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡A.A.A.A.酶解法酶解法酶解法酶解法:胰蛋白酶,糜蛋白酶,胃蛋白酶,嗜热菌蛋白酶,羧肽酶和氨胰蛋白酶,糜蛋白酶,胃蛋白酶,嗜热菌蛋白酶,羧肽酶和氨肽酶肽酶B.B.B.B.化学法化学法化学法化学法:溴化氰水解法,它能选择性地切割由甲硫氨酸的羧基所形成:溴化氰水解法,它能选择性地切割由甲硫氨酸的羧基所形成的肽键的肽键。环境生物化学ppt酶解法:胰蛋白酶,糜蛋白酶,胃蛋白酶,嗜热菌蛋白酶,羧肽酶和36 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡测定每个肽段的氨基酸顺序。测定每个肽段的氨基酸顺序。测定每个肽段的氨基酸顺序。测定每个肽段的氨基酸顺序。确定肽段在多肽链中的次序:确定肽段在多肽链中的次序:确定肽段在多肽链中的次序:确定肽段在多肽链中的次序:利用两套或多套肽段的氨基酸顺序彼此间的利用两套或多套肽段的氨基酸顺序彼此间的交错重叠,拼凑出整条多肽链的氨基酸顺序。交错重叠,拼凑出整条多肽链的氨基酸顺序。确定原多肽链重二硫键的位置:确定原多肽链重二硫键的位置:确定原多肽链重二硫键的位置:确定原多肽链重二硫键的位置:一般采用胃蛋白酶处理没有断开二硫键的一般采用胃蛋白酶处理没有断开二硫键的多肽链,再利用双向电泳技术分离出各个肽段,用过甲酸处理后,将每多肽链,再利用双向电泳技术分离出各个肽段,用过甲酸处理后,将每个肽段进行组成及顺序分析,然后同其它方法分析的肽段进行比较,确个肽段进行组成及顺序分析,然后同其它方法分析的肽段进行比较,确定二硫键的位置。定二硫键的位置。三三.蛋白质的空间结构蛋白质的空间结构1.蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构 蛋白质的二级(Secondary)结构是指肽链的主链在空间的排列,或规则的几何走向、旋转及折叠。它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。主要有-螺旋、-折叠、-转角。(1).-螺旋螺旋环境生物化学ppt测定每个肽段的氨基酸顺序。三.蛋白质的空间结构环境生物化学37 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 在-螺旋中肽平面的键长和键角一定,肽键的原子排列呈反式构型,相邻的肽平面构成两面角.多肽链中的各个肽平面围绕同一轴旋转,形成螺旋结构,螺旋一周,沿轴上升的距离即螺距为0.54nm,含3.6个氨基酸残基;两个氨基酸之间的距离0.15nm.肽链内形成氢键,氢键的取向几乎与轴平行,第一个氨基酸残基的酰胺基团的-CO基与第四个氨基酸残基酰胺基团的-NH基形成氢键。蛋白质分子为右手-螺旋。左手和右手螺旋左手和右手螺旋环境生物化学ppt 在-螺旋中肽平面的键长和键角一定,肽键的原子38 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 (2)-折叠折叠 -折叠是由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列,通过链间的氢键交联而形成的。肽链的主链呈锯齿桩折叠构象。在-折叠中,-碳原子总是处于折叠的角上,氨基酸的R基团处于折叠的棱角上并与棱角垂直,两个氨基酸之间的轴心距为0.35nm.-折叠结构的氢键主要是由两条肽链之间形成的;也可以在同一肽链的不同部分之间形成。几乎所有肽键都参与链内氢键的交联,氢键与链的长轴接近垂直。-折叠有两种类型。一种为平行式,即所有肽链的N-端都在同一边。另一种为反平行式,即相邻两条肽链的方向相反。环境生物化学ppt (2)-折叠环境生物化学ppt39 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡(3)-转角转角在-转角部分,由四个氨基酸残基组成.四个形成转角的残基中,第三个一般均为甘氨酸残基弯曲处的第一个氨基酸残基的-C=O 和第四个残基的 N-H 之间形成氢键,形成一个不很稳定的环状结构。这类结构主要存在于球状蛋白分子中。()自由回转()自由回转没有一定规律的松散肽链结构,但仍是紧密有序的稳定结构,通过主链间及主链与侧链间氢键维持其构象不同的蛋白质,自由回转的数量和形式各不相同分两类:紧密环 连接条带环境生物化学ppt(3)-转角()自由回转环境生物化学ppt40 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡超二级结构和结构超二级结构和结构域域()超二级结构()超二级结构在蛋白质分子中,由若干相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,形成有规则的、在空间上能辨认的二级结构组合体。几种类型的超二级结构:;超二级结构在结构超二级结构在结构层次上高于二级结构,但层次上高于二级结构,但没有聚集成具有功能的结没有聚集成具有功能的结构域构域 环境生物化学ppt超二级结构和结构域 环境生物化学ppt41 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡()结构域()结构域 对于较大的蛋白质分子或亚基,多肽链往往由两个或两个以上相对独立的三维实体缔合而成三级结构。这种相对独立的三维实体就称结构域。结构域通常是几个超二级结构的组合,对于较小的蛋白质分子,结构域与三级结构等同,即这些蛋白为单结构域。结构域一般由100200 个氨基酸残基组成,但大小范围可达 40400 个残基。氨基酸可以是连续的,也可以是不连续的结构域之间常形成裂隙,比较松散,往往是蛋白质优先被水解的部位。酶的活性中心往往位于两个结构域的界面上结构域之间由“铰链区”相连,使分子构象有一定的柔性,通过结构域之间的相对运动,使蛋白质分子实现一定的生物功能。在蛋白质分子内,结构域可作为结构单位进行相对独立的运动,水解出来后仍能维持稳定的结构,甚至保留某些生物活性环境生物化学ppt()结构域环境生物化学ppt42 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡结构域与功能域的关系:结构域与功能域的关系:有时一个结构域就是蛋白质的功能域,但不总是包含一个但通常是多个结构域蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构是指多肽链在二级结构的基础上进一步盘旋、折叠,从而生成特定的空间结构。包括主链和侧链的所有原子的空间排布一般非极性侧链埋在分子内部,形成疏水核,极性侧链在分子表面环境生物化学ppt结构域与功能域的关系:环境生物化学ppt43 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡蛋白质的四级结构蛋白质的四级结构许多蛋白质是由两个或两个以上独立的三级结构通过非共价键结合成的多聚体,称为寡聚蛋白。寡聚蛋白中的每个独立三级结构单元称为亚基。蛋白质的四级结构是指亚基的种类、数量以及各个亚基在寡聚蛋白质中的空间排布和亚基间的相互作用。如,血红蛋白的四级结构得测定由佩鲁茨1958年完成,其结构要点为:球状蛋白,寡聚蛋白,含四个亚基两条链,两条链,22 链:141个残基;链:146个残基分子量65 000含四个血红素辅基亲水性侧链基团在分子表面,疏水性基团在分子内部环境生物化学ppt蛋白质的四级结构环境生物化学ppt44 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡三蛋白质分子中的共价键与次级键三蛋白质分子中的共价键与次级键一级结构二级结构超二级结构结构域三级结构亚基四级结构环境生物化学ppt三蛋白质分子中的共价键与次级键环境生物化学ppt45 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡维系蛋白质分子的一级结构:肽键、二硫键维系蛋白质分子的一级结构:肽键、二硫键维系蛋白质分子的二级结构:氢键维系蛋白质分子的二级结构:氢键维系蛋白质分子的三级结构:疏水相互作用力、氢键、范德维系蛋白质分子的三级结构:疏水相互作用力、氢键、范德华力、盐键华力、盐键维系蛋白质分子的四级结构:范德华力、盐键维系蛋白质分子的四级结构:范德华力、盐键 a盐键(离子键)b氢键 c疏水相互作用力 d 范德华力 e二硫键 f 酯键环境生物化学ppt维系蛋白质分子的一级结构:肽键、二硫键 a盐键(离子键)46 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡氢键、范德华力、疏水相互作用力、盐键,均为次级键氢键、范德华力虽然键能小,但数量大疏水相互作用力对维持三级结构特别重要盐键数量小二硫键对稳定蛋白质构象很重要,二硫键越多,蛋白质分子构象越稳定离子键离子键氢键氢键范德华力范德华力疏水相互作用力疏水相互作用力环境生物化学ppt氢键、范德华力、疏水相互作用力、盐键,均为次级键离子键氢键范47 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡第四节第四节 蛋白质分子结构与功能的关系蛋白质分子结构与功能的关系一一.蛋白质一级结构与功能的关系蛋白质一级结构与功能的关系 研究蛋白质一级结构与功能的关系主要是:研究多肽链中不同部位的残基与生物功能的关系。进行这方面的研究常用的方法有:同源蛋白质氨基酸顺序相似性分析、氨基酸残基的化学修饰及切割实验等。例例1 镰刀形贫血病镰刀形贫血病l患者血红细胞合成了一种不正常的血红蛋白(Hb-S)l它与正常的血红蛋白(Hb-A)的差别:仅仅在于链的N-末端第6位残基发生了变化l(Hb-A)第6位残基是极性谷氨酸残基,(Hb-S)中换成了非极性的缬氨酸残基l使血红蛋白细胞收缩成镰刀形,输氧能力下降,易发生溶血l这说明了蛋白质分子结构与功能关系的高度统一性环境生物化学ppt第四节 蛋白质分子结构与功能的关系一.蛋白质一级结构与功能的48 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡例例2 一级结构的局部断裂与蛋白质的一级结构的局部断裂与蛋白质的激活激活 体内的某些蛋白质分子初合成时,常带有抑制肽,呈无活性状态,称为蛋白质原.蛋白质原的部分肽链以特定的方式断裂后,才变为活性分子.例:胰岛素,在刚合成时,是一个比成熟的胰岛素分子大一倍多的单链多肽,称为前胰岛素原前胰岛素原的N-末端有一段肽链,称为信号肽.信号肽被切去,剩下的是胰岛素原。胰岛素原比胰岛素分子多一段C肽,只有当C肽被切除后才成为有51个残基,分A、B两条链的胰岛素分子单体.环境生物化学ppt例2 一级结构的局部断裂与蛋白质的激活 环境生物化学ppt49 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡例例3 同源蛋白同源蛋白 同源蛋白:是指在不同有机体中实现同一功能的蛋白质.同源蛋白中的一级结构中有许多位置的氨基酸对所有种属来说都是相同的,称为不变残基;其他位置的氨基酸称可变残基.不同种属的可变残基有很大变化.可用于判断生物体间亲缘关系的远近.例:细胞色素Cl60 个物种中,有 27 个位置上的氨基酸残基完全不变,是维持其构象中发挥特有功能所必要的部位,属于不变残基.l可变残基可能随着进化而变异,而且不同种属的细胞色素 C氨基酸差异数与种属之间的亲缘关系相关。亲缘关系相近者,氨基酸差异少,反之则多(进化树).环境生物化学ppt例3 同源蛋白环境生物化学ppt50 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡黄色:不变残基(invariable residues)蓝色:保守氨基酸(conservative residues)未标记:可变残基(variable residues)二二.蛋白质的构象与功能的关系蛋白质的构象与功能的关系 别构效应:又称变构效应,是指寡聚蛋白与配基结合,改变蛋白质构象,导致蛋白质生物活性改变的现象.它是细胞内最简单的调节方式.例:血红蛋白的别构效应一个亚基与氧结合后,引起该亚基构象改变进而引起另三个亚基的构象改变整个分子构象改变与氧的结合能力增加环境生物化学ppt黄色:不变残基(invariable residue51 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡 第五节第五节 蛋白质的性质蛋白质的性质一一.蛋白质的分子大小蛋白质的分子大小蛋白质是分子量很大的生物分子,相对分子质量大于10 000.最高可达40 000 000(烟草花叶病毒)蛋白质相对分子质量的测定方法蛋白质相对分子质量的测定方法1.根据化学成分测定最小相对分子质量根据化学成分测定最小相对分子质量 此法首先利用化学分析方法测定蛋白质分子中某一特殊成分的百分含量然后,假定蛋白质分子中该成分只有一个,据其百分含量可计算出最低相对分子质量:最小相对分子质量(已知成分的相对分子、原子质量)/已知成分的百分含量如果蛋白质分子中所含已知成分不是一个单位,则真实相对分子质量等于最小相对分子质量的倍数。2.超离心法超离心法在60 00080 000r/min的高速离心力作用下,蛋白质分子会沿旋转中心向外周方向移动用光学方法测定界面移动的速度即为蛋白质的离心沉降速度蛋白质的沉降速度与分子大小和形状有关环境生物化学ppt 第五节 蛋白质的性质一.蛋白质的分子大小环境生物52 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没的了;只要不因愤怒而夸大事态,就没有什么事情值得生气的了。有什么事情值得生气的了。要使理想的宫殿变要使理想的宫殿变成现实的宫殿,须成现实的宫殿,须透过埋头苦干,不透过埋头苦干,不声不响的劳动,一声不响的劳动,一砖一瓦的建造砖一瓦的建造这个这个世界世界上任上任何奇何奇迹的迹的产生产生都是都是经过经过千辛千辛万苦万苦的努的努力而力而得的,得的,首先首先承认承认自己自己的平的平凡,凡,然后然后用千用千百倍百倍的努的努力来力来弥补弥补平凡平凡沉降系数是溶质颗粒在单位离心场中的沉降速度,用S表示。一个S单位,为110-13秒相对分子质量越大,S值越大蛋白质的沉降系数:1200S 由沉降系数S可根据斯维得贝格Svedberg方程计算蛋白质分子的相对分子质量:M=RST/D1i R:气体常数 T:绝对温度 D:扩散系数 :溶剂的密度3.凝胶过滤法凝胶过滤法凝胶过滤所用介质为凝胶珠,其内部为多孔网状结构一定型号的凝胶网孔大小一定,只允许相应大小的分子进入凝胶颗粒内部,大分子则被排阻在外洗脱时大分子随洗脱液从颗粒间隙流下来,洗脱液体积小;小分子在颗粒网状结构中穿来穿去,历程长,后洗脱下来,洗脱体积大测定蛋白质分子量一般用葡聚糖,商品名:Sephadex环境生物化学ppt沉降系数是溶质颗粒在单位离心场中的沉降速度,用S表示。环境生53 凡事只要看得淡些,就没有什么可忧虑凡事只要
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