兽医流行病学讲义

兽医流行病学第一章 绪言兽医流行病学主要研究动物群体中疾病的频率分布及其决定因素，是预防兽医学的一门重要学科。研究范围是群体中的一切疾病，包括传染病和非传染病；研究对象是动物群体，主要是畜禽群体，但也涉及到人群和野生动物群体；研究方法是对群体中的疾病进行调查研究，收集、分析和解释资料，并作生物学推理；研究任务是确定病因、阐明分布规律、制定防制对策并评价其效果，以达到预防控制和消灭动物疾病的目的。兽医流行病学的研究内容分为定性调查研究和定量调查研究两个方面。前者主要是确定疾病的自然史，形成病因假设并进行定性检验；后者涉及到疾病的数量及数字资料的表达和分析，包括调查、监测、观察研究、实验研究、建模及疾病控制的生物学和经济学评价等。兽医流行病学主要采用描述流行病学、分析流行病学、实验流行病学和理论流行病学等研究方法，此外还有血清流行病学、遗传流行病学、分子流行病学等方法。兽医流行病学有下列几方面的用途：确定病因已知疾病的来源；研究病因未知疾病的防制对策；获取有关疾病自然史的资料，确定疾病的分布和感染的传播和维持的生态学机理，及宿主、致病因子和环境病因因素；制定和监测疾病防制规划；估价疾病防制的经济影响。复习思考题1简述兽医流行病学的定义。2简述兽医流行病学的研究内容和研究方法。3兽医流行病学有哪些用途?教案：PPT1：流行病学发展简史来源于人类与动物传染病流行长期斗争经验来源于流行病学研究方法的发展和进步 由单纯描述向描述加分析 由定性向定量研究两个方面的相互渗透和相互结合，使流行病学研究内容和方法更加丰富、应用更广泛。PPT2：一 发展史学科形成前期自有文明史以来至18世纪公元前460377古希腊 希波克拉底（Hippocrates）空气、水及地点 “Epidemic”我国 “疫”、“时疫”、“疫疠”PPT3:15世纪中叶意大利 威尼斯 海港检疫法规我国 隋朝 “疠人坊”1662年 英国 John Graunt 第一章寿命表 设立比较组思想PPT4：（二）学科形成时期 18世纪末至20世纪初1747年 英国 James Lind VitC治疗坏血病开创流行病学临床试验1796年 Jenner 接种牛痘预防天花开创传染病控制的主动免疫PPT5：詹姆斯.琳德 (James Lind1716-1795) 是一名英国海军外科医生, 他进行了一项相当于流行病学实验的研究，证实新鲜水果柠檬和柑橘等可预防坏血病。爱德华.琴纳 （Jenner Edward, 1749-1823）英国医生和博物学家，他观察到得过牛痘的牛奶场女工不再得天花。根据这一现象，他在1796年给一个10岁男孩接种牛痘，随后又接种了22人，均可抵抗天花的感染。这个给人和人群免疫以预防天花的成功方法直接为1977年全世界天花的最终根除开辟了道路。PPT6：第二节 定义PPT7:第三节 原理和应用一 基本原理疾病与健康在人群/动物中分布原理疾病发展过程动物与环境的关系病因论病因推断原则疾病防治原则和策略疾病发展数学模型等PPT8:疾病与健康在人群/动物中分布原理冰山现象(图片)PPT9:生态学研究生态学是研究人群/动物群体与环境关系的科学,观察单位是人群/动物群体而不是个体,描述不同群体中某因素的暴露状况与疾病的频率,分析该暴露因素与疾病的关系。生态学研究方法易行，分析技巧简单，但进行生态学推断时难以深入解释，易出现生物学谬误。PPT10：病因论流行病学三角轮状模型生态学模型PPT11：第四节 研究方法按设计类型：描述性研究分析性研究实验性研究理论性研究横断面调查描述流行病学监测PPT12：产生假设生态学研究研究方法观察法分析流行病学病例对照研究检验假设队列研究研究方法实验法现场实验流行病学动物实验流行病学实验流行病学验证假设自然实验研究理论流行病学数理法PPT13：第五节 特征群体的特征对比的特征概率论和数理统计学的特征预防为主的特征发展的特征PPT14：第六节 与其它学科的关系及展望与流行病学有关的主要学科临床医学基础医学统计学流行病学方法广泛应用的学科 以学科名称命名的分支药物流行病学 以学科概念命名的分支分子流行病学PPT15：第二章 疾病分布疾病分布是指疾病在畜群间、时间和空间的频率分布状况，又称三间分布。描述疾病的分布涉及到群体中疾病发生的形式和量度。疾病在群体中有散发流行、地方流行、流行、大流行、等形式。疾病在不同时间、不同地区和不同畜群中的频率分布，可用动态率和静态率来表示。动态率是在一定时间内群体中新发生某事件的频率，以发病率为代表，其譬如死亡率、罹患率、治愈率、出生率等；静态率是在一定时间内存在某事件的频率，以患病率为代表，其他如感染率、携带率等。疾病的畜群分布是指对不同年龄、性别、种和品种等特征的畜群，进行发病率、患病率和死亡率水平的描述和比较。搞清疾病的畜群分布，有助于了解影响疾病分布的因素和探索病因，为防制工作提供依据。疾病发生的频率随时间的推移而不断变化，流行形式由散发而流行，乃至变为地方流行或被消灭。描述疾病的时间分布和变化，有助于判断传染病疫情的发展动态，探索原因不明疾病的病因。疾病时间分布的表现形式可以分为短期趋向、周期趋向和长期趋向。疾病的分布往往带有明显的地区性。研究疾病的地区分布，可以阐明引起疾病分布差异的原因，有助于制定防制对策；对于一些原因不明的疾病，通过对发病率有显著差异的不同地区进行多方面的比较，可以获得有关病因的线索，证明或否定病因假设。复习思考题1什么是疾病的三间分布?研究它有何意义?2疾病流行和地方流行的主要区别是什么?3以发病率和患病率为例，说明动态率和静态率的主要区别。第三章 疾病的自然史疾病的自然史包括疾病的生态学和疾病的病因因素两个方面。疾病的生态学又包括疾病的分布以及感染的传播和维持的机理。研究疾病在动物群体中的分布，需要了解宿主、致病因子和环境之间的生态学关系，这些关系支配了疾病的空间和时间分布。动物群体的分布和大小受生态环境影响，而食物链对疾病传播有重要意义。小生境的流行病学干预可影响疾病的发生，媒介传播疾病比其他传染病有更精确的地理界限。传染病是宿主被病原体侵入的结果，病原体的持续存活能否引起疾病取决于它们能否传递到易感宿主，能否在其中引起感染并复制病原体以维持感染循环。感染的传播可以分为水平传播和垂直传播两种。水平传播又可分为直接传播和通过中介载体的间接传播；垂直传播又可分为遗传性传播和先天性传播。传染性病原体在体内和体外对不利因素有不同程度的抵抗力，这对建立感染是必要的，对感染的维持也是很重要的。此外病原体通过产生抵抗型、传播过程的“快进快出”、在宿主的持续感染、在媒介昆虫体内持续和宽广的宿主范围等，而使感染长期维持。病因因素是指与疾病有因果联系的决定因素，可以分为宿主决定因素，致病因子决定因素和环境决定因素。复习思考题1什么是疾病自然史?2举例说明食物链对疾病传播的重要性。3什么是水平传播?什么是垂直传播?第四章 病因推断在流行病学中，因果关系研究是为了确定病因。病因理论在历史上曾经历了从单一病因到多元病因的变化，这分别反映在Koch氏假说和Evans氏假说里。Koch氏假说提出，一种微生物作为某种传染病病因必须符合的条件是：它必须存在于该病的所有病例中；它不作为偶然性和非致病性寄生物存在于其他疾病中；它可以从患有该病的动物体内被分离成纯培养，并能在易感动物复制出同样疾病。Evans氏假说提出了需要确定假设病因因素与所研究疾病之间的联系是统计学上显著的，且是因果性的，这涉及到动物组群之间的比较，而不是个体的联系。Evans假说克服了Koch氏假说的不足，不仅适用于传染病，而且也适用于非传染病。在研究疾病和假设病因的联系时，我们应区分统计学联系和非统计学联系，因果联系和非因果联系。根据因果关系可以把原因分为充分原因和必要原因。充分原因是指不可避免要产生结果的原因，实质上包括一系列原因组分；必要原因是产生结果所必须存在的原因组分。混杂因素可产生研究因素与疾病之间的伪联系，应在研究设计时予以考虑和控制。病因推断的第一步是用求同法、求异法、伴随变异法或类推法形成病因假设；第二步是通过分析流行病学、实验流行病学和发病机理研究对病因假设进行检验。作出病因推断的一般原则是因先于果的时间顺序、统计学联系强度、联系的一致性、联系的特异性、联系的普遍性、剂量应答关系和联系与现有知识相符。复习思考题1简述Evans病因假说的内容。它与：Koch氏假说的主要区别是什么?2解释统计学联系和非统计学联系，因果联系和非因果联系。3什么是必要原因? 它与充分原因的关系如何?4何谓混杂因素? 它对研究的病因因素与疾病之间的联系起什么作用? 试举例说明。5简述病因推断的方法和应遵循的原则。第五章 兽医流行病学资料流行病学定性和定量调查研究的第一步都是收集资料，它可能与临诊症状、治疗和死亡剖检及实验室检查有关。病因推断涉及将动物个体分为无病组和有病组，因此疾病的命名和分类以及诊断评价是最重要的资料要素。疾病一般按特异病因、病变或症状3个不同水平命名。以表现命名时，如划归有病的动物都只有一个共同的充分原因，则有利于病因推断。按病因命名则更有利于病因推断，因为共同的充分原因可能在被归入有病的所有病例中显现。诊断评价主要包括诊断指标和标准、敏感性和特异性、可靠性和真实性。资料通常用文字和数字来表示，也可以用编码来表示，如数字编码、字母数字编码和符号编码等。资料的来源有很多，包括政府兽医机构、基层兽医、畜禽屠宰场、产业部门(畜禽生产单位、药品销售部门等)、血清库、其他机构(计划、经济和统计等非兽医政府机构、医学卫生部门、大专院校和科研机关的兽医诊断实验室等)。不同的来源其资料性质、合作程度、偏倚程度、追溯情况和收集费用有很大差异，这些都应考虑。资料收集分为常规数据资料收集和专门安排的流行病学调查资料收集。后者包括死亡和发病统计资料以及其他背景资料。收集的原始资料经检查、设计分组、拟整理表和归组等过程进行科学整理，使之系统化，以便作进一步研究分析。归组资料可按一定程序输入电脑贮存并供随时调用，亦可作普通书写记录或打孔卡片记录。任何流行病学调查研究的第一步都是收集资料,不论是定性或定量调查研究。本章将介绍兽医流行病学资料的性质、来源以及收集和整理。资料的性质兽医流行病学研究不同组群动物疾病的频率分布，这涉及资料的收集和分析。资料是指收集在一起用作参考或信息的事实，尤其是数字事实。资料可能与生产性能、临诊症状、治疗和死亡剖检及实验室检查有关。资料要素病因推断涉及将动物个体分为无病组和有病组，因此疾病的命名和分类以及诊断评价是最重要的资料要素。疾病一般按特异病因、病变或症状3个不同水平命名。以表现命名时，如划归有病的动物都只有一个共同的充分原因，则有利于病因推断。按病因命名则更有利于病因推断，因为共同的充分原因可能在被归入有病的所有病例中显现。诊断评价诊断评价主要包括诊断指标和标准、敏感性和特异性、可靠性和真实性。金标准是指目前临床应用的敏感性和特异性都最高的标准方法，按金标准诊断最接近真实情况。诊断方法的真实性和可靠性真实性可以用正确诊断指数r来表示。 ad-bcr=1-(假阳性率+假阴性率) = (敏感性 + 特异性) 1= (a+c)(b+d)诊断方法的可靠性是指在重复时产生相似的结果。可靠方法的特征是可重复性。影响因素有两方面；方法本身和观察差异。资料的来源资料的来源有很多，包括政府兽医机构、基层兽医、畜禽屠宰场、产业部门(畜禽生产单位、药品销售部门等)、血清库、其他机构(计划、经济和统计等非兽医政府机构、医学卫生部门、大专院校和科研机关的兽医诊断实验室等)。不同的来源其资料性质、合作程度、偏倚程度、追溯情况和收集费用有很大差异，这些都应考虑。资料收集分为常规数据资料收集和专门安排的流行病学调查资料收集。后者包括死亡和发病统计资料以及其他背景资料。资料整理收集的原始资料经检查、设计分组、拟整理表和归组等过程进行科学整理，使之系统化，以便作进一步研究分析。复习思考题1为什么说疾病的命名和分类与诊断评价是流行病学研究中最重要的资料要素?2简述资料编码的几种方法。3简述兽医流行病学研究的资料来源。4资料整理有哪些步骤?第6章 动物疾病的防制及其经济评价摘要一切兽医活动都是以预防、控制和消灭动物疾病为最终目的。制定疾病防制对策，实行疾病监测，搞好畜禽保健，并对疾病防制作出经济评价是兽医流行病学工作者的主要任务。动物疾病可以通过预防、控制或消灭的对策来解决。动物疾病的防制措施，针对传染源的有检疫、扑杀、治疗性和预防性给药等方法；针对传播途径的有改变放牧制度，控制传染媒介、宿主迁移、消毒、最少疾病法、改善环境条件和饲养管理等方法；针对易感畜群的有疫苗接种、小生境填充和遗传改善等方法。制定疾病的控制或消灭规划时应考虑对该疾病病因认识的程度、兽医内部结构、诊断技术的可行性、是否有替换动物、公众的理解、疾病的公共卫生意义、立法补偿、生态学后果、财政支持等。制定畜群保健和生产计划的目的是：鉴别畜群中存在的疾病问题；按技术和经济指标确定各种疾病问题的重要性；启用合适的控制方法，并在技术上和在资源利用的经济效益上度量其成功的程度，指出那种方法应增强，那些方法应减弱。在保健和生产计划中，兽医流行病学工作者的主要任务是：诊断与预防主要的流行性疾病；对环境决定因素（营养、畜舍和管理）提出咨询；对畜禽生产技术和一般政策提出指导意见。疾病监测是对某种或某些具体疾病（包括传染病和非传染病）进行系统、完整、连续和定期的观察，调查其分布动态和影响因素，以便及时采取有效防制对策。监测可分为大范围的畜群的监测和个别畜群的监测两种形式。与医学流行病学不同的是，兽医流行病学必须对畜禽疾病防制作出经济评价。畜禽疾病造成经济损失，而疾病的预防和控制措施也是要花钱的，因此，疾病防制的净结果不是避免由疾病造成的经济损失本身，而是避免由疾病造成的经济损失减去防制疾病的费用。所以对动物保健应作财务评价，对疾病防制应做成本效应分析。要确定一个农场是否从一项畜禽保健改进中获益，可进行毛利分析。重点：疾病防制方案制定的社会、经济效益的估计。要求：掌握制定疾病防制方案的原则与方法。主要内容：动物疾病的防制对策畜禽保健和生产计划动物疾病的监测疾病防制的经济评价第一节 动物疾病的防制对策一、 基本概念1、预防（Prevention）采取一切措施，将疾病排除于未受害的畜群之外。途径：病因预防，针对病因，如消毒杀虫；畜群预防：保护宿主，如疫苗接种。2、控制（control）采取各种措施降低已出现于畜群中疾病的发病数和死亡数，并把疾病限制在局部范围内。途径：治疗、处理病畜。阻止新病例出现与疫病蔓延。3、消灭（eradication）(1) 一种传染性病原体的消灭，与病原体生物学特征有关，少见。1980年WHO宣布消灭天花。宿主单一，潜伏期不排毒，康复后终身免疫不带毒、病原体只有一个血清型、无隐性带毒者、有稳定而效果好的疫苗。(2) 一种传染性病原体的地区性消灭：常见形式，如我国消灭了牛瘟、牛肺疫。(3) 一种传染性病原体的现患率（prevalence rate）减少到不发生传染的水平。(4) 现患率减少很低的水平，不再是主要的保健问题。二、 动物疾病的防制措施针对传染病流行的三个环节：传染源、传播途径、易感动物采取的疾病防治方法。1、针对传染源检疫（quarantine）是指利用各种诊断和检测方法对动物及其相关产品和物品进行疫病或病原体或抗体检查。检疫的目的是查出传染源、切断传播途径，防止疫病传播。在我国执行检疫的技术和执法部门有两大系统，一是中华人民共和国出入境检验检疫局（简称检验检疫局），下设各级分局，专门负责进出口动植物及其相关产品和物品的检疫；二是国家畜牧兽医总站，下设各级分站（简称动检站），隶属于各级畜牧兽医局，专门负责国内动物及其产品的各种检疫。扑杀（slaughter）外来疫病、烈性传染病（一类动物疫病和危害严重的二类疫病如猪2型链球菌和高致病性猪蓝耳病）2、针对传播途径（1）混合放牧、交替放牧和顺序放牧。根据病原对不同动物致病力来确定放牧的动物种类。（2）控制媒介（control of vector）（3）宿主迁移(movement of host)（4）消毒 (disinfection)（5）最少疾病法(minimal disease methods): SPF鸡、猪剖腹产，主要针对垂直传播和呼吸道传播的疾病。（6）改善饲养管理条件。3、针对易感畜群（1）疫苗接种（2）药物预防和治疗（3）抗病育种4、生物安全体系（bio-security）养殖生产中疫病防控方面的生物安全（Biosecurity）主要是采取必要的有效措施，最大限度地消除各种理化和生物性致病因子对人畜的危害，是动物生产中的一种安全保障体系。它涉及诸多方面，包括养殖场的设计与控制、人员和物品流动的控制、无规定疫病区的建立和疫病控制等。其中疫病控制又包括对动物的控制、环境控制和病原体控制。三、 制定疾病防制计划应考虑的因素1、对病因的认识，疾病的自然史等。2、兽医机构能力：人员、诊断设施、研究设施。3、诊断技术的可行性4、是否有替换动物，以免对生产造成动荡。5、公众的理解：扑杀动物与动物保护等6、疾病的公共卫生意义；人畜共患病7、立法补偿：禽流感、口蹄疫、结核病畜的扑杀。8、生态学后果9、财政支持四、 动物疾病地区性消灭实例以美国消灭猪瘟为例。1961年美国国会批准消灭猪瘟计划。计划的阶段性：（1）准备立法阶段（2）初级阶段：疫苗接种、隔离封锁、限制猪流动，达到减少猪瘟流行的目的。（3）消灭阶段：将感染猪全群扑杀。（4）保护抵抗再感染阶段1967-1975年美国猪瘟的新病例数检测方法：使用适用于大群检测的简便、敏感的试验；疾病新的变化：通过胎盘传递。1978年1月31日，宣布消灭了猪瘟。费时15年，耗资1.4亿美圆。第二节 畜禽保健和生产计划一、制定保健和生产计划的目的1、 鉴别畜群中存在的疾病问题2、 按技术和经济指标确定各种疾病问题的重要性3、 启用合适的控制计划兽医流行病学工作者的主要任务(1) 诊断与预防主要的流行性疾病(2) 对环境决定因素（营养、畜舍和管理）提出咨询(3) 对畜禽生产技术和一般政策提出指导意见二、保健和生产计划内容1、组成部分(1). 农场的概貌：动物数、密度、疾病状态、生产水平(2). 鉴别生产短缺(3). 监测生产的各个方面(4). 鉴别主要的疾病问题(5). 针对疾病的主要预防措施(6). 确定生产指标、再进行校正(7). 提出知道意见2、奶牛保健计划目的：最大限度提高奶牛产量和质量，提供生产效益途径：有效繁殖、减少重要疾病，最佳生产措施：制定与实施奶牛保健计划从经济学观点考虑畜禽生产 一个奶牛场要达到每头牛的最高产奶量，只有当牛饲料是免费的，从经济学观点上讲才是有效的。如果计算饲料费，每头牛奶产量小于技术上可能达到的最高产量时可得到最佳经济效益。疾病防治的经济分析根据疾病防治中得到的收益来衡量防治措施的成本，以确定防治措施的经济活力。重大动物疾病(如牛瘟和口蹄疫)对生产影响显著，防治措施的净经济收益是明显的。但是，常存在于集约化养殖业系统的复杂疾病对产生的影响更微妙。如奶牛乳房炎对奶产量的影响，在采取合理的控制措施之前需要精确计算成本。第7章 描述性流行病学主要内容1.描述性研究的概念及常用研究方法。2.现况研究3.暴发调查4.生态学研究5.疾病的报告与登记描述性研究是观察性流行病学研究中的一种类型， 主要用于描述疾病或者某种特征在时间、地点、动物群体中的分布以及发生、发展的规律。描述性研究常用的方法有：现况调查；暴发调查；生态学研究 ；纵向研究；筛检。现况研究现况研究的概念、特点、种类。抽样调查的抽样方法。调查表的编制、调查变量的规定。现况研究中常见的偏倚及其控制。一、定义现况研究又称为横断面研究（cross-sectional study），是研究特定时点或时期和特定范围内动物群体中的有关变量（因素）与疾病或健康状况的关系。即在某一时点或短时间内，对一个特定动物群体疾病（或某些特征）及有关因素进行的调查。二、现况研究的目的 1）掌握目标群体中疾病的患病率及其分布状态。2）提供病因线索。3）利用普查或筛检可实现疾病的二级预防。4）确定高危动物群体。5）进行疾病监测、预防接种效果及其他资料质量的评价。现况研究的特点1.一般不设对照组2.关心的是某一特定时点或短时期内某一群体中暴露和疾病的状况或联系。3.不能确定暴露与疾病的因果关系。4.对固定的暴露因素可作因果推论。5.在现在暴露水平与既往变化不大或存在良好相关性；或已知其变化规律时，可用现在的暴露状态来代替或估计过去的暴露状态。 6.定期重复可获得发病率资料。1.普查（census） （1）概念：在特定时间、对特定范围内的所有个体进行全面调查。（2）普查目的:对某些疾病早发现、早诊断、早治疗。了解动物群体中疾病和健康状况的分布或制定某生物学检验标准。（3）普查原则：所普查的疾病患病率不宜太低。检测手段和方法应简易而准确。有足够的人力、物力和财力进行调查。（4）普查优缺点：能发现动物群体中的全部病例。一次调查可观察多个因素和疾病的关系。不适用于患病率很低和诊断技术复杂的疾病。质量不易控制。抽样调查（sampling survey ）指从某动物群总体中按一定原则抽取部分有代表性的个体（样本）进行调查，用这部分样本的调查结果推算出该动物群体某病的患病率或某些特征的情况，这是以小窥大，以局部估计总体的调查方法。抽样方法1单纯随机抽样：最基本的抽样方法，将所有研究对象排列编号，利用随机数字表或抽签、计算机等抽出进入样本的号码。 2分层抽样：用于分布不均匀的研究群体，先按不同的特征（如性别、年龄、生产性能等）将研究群体分为若干层，然后从每层抽取一个随机样本。要求层内变异越小越好。“层”：具有某种特征或共同暴露于某一因素的群体称为层。3系统抽样：按照一定的顺序机械地每隔一定数量的单位抽取一个单位。4整群抽样：将总体分为若干群组，抽取其中部分群组作为观察单位组成样本，对被抽到的群体内的所有个体都进行调查。 5多级抽样：多用于大型调查，从总体中先抽取一级单元，再在抽中的一级单元中抽取范围较小的二级单元。3）样本大小：样本大小的影响因素：对调查结果精确性的要求：精确性要求高则样本大。预期的患病率：患病率高则样本小。确定样本大小的计算：前人的经验公式计算：第二节 现况调查的设计与实施一、明确调查目的和类型（本次调查要达到什么目的；普查还是抽样）二、确定研究对象三、确定抽样方法和样本含量四、确定研究变量和制定调查表：1.变量的规定调查表所列项目就是需研究的因素。变量可分为：疾病指标（发病、死亡），生产性能（产蛋、产奶、日增重），相关因素（饲料、免疫、环境等）2.调查表编制1）调查表编制注意事项：调查表问题的排列：先易后难，先一般后隐密。问句措辞要明确易懂。表式“闭关式”调查表：将各种可能的答案列在调查表上由回答者选择其中一个答案。便于分类编码和资料的计算机处理：“开放式”调查表：被调查者对问题的回答不受限制。适合难于限定答案尺度的问题。编码调查表：在每个问题的右边留出适当位置，注出标号，供编码用。适用于计算机处理资料 应有核实被调查者回答问题是否正确的项目。多角度询问同一问题。时间记录和调查员签名；可核查调查员的调查质量。预试 正式开始调查前应对拟好的调查表进行预试验，以确定调查表的可行性。2）调查表的编制内容：（1）一般项目：为动物属性资料（性别、年龄、品种等）。（2）研究项目：包括研究的疾病指标或相关因素变量。调查表设计原则：不能缺项与多项、先易后难、先一般后隐私、多客观定量少主观感觉。五、资料收集：（1）掌握背景资料：了解该课题现有的知识水平，国内外进展。（2）暴露测量：暴露必须有明确的定义和测量尺度。可用调查表、实验室检查、体检等手段来测量。（3）确定收集资料的手段：可采用现场调查、信访、电话调查等。（4）培训调查员：六、资料分析（1）描述分布：对疾病发病率、患病率、死亡率等进行三间分布描述。（2）关联分析：可运用统计学分析、逻辑分析、专业知识的推理分析等分析影响疾病分布的因素及因素与疾病的关联性。七、现况研究中常见的偏倚与质量控制偏倚：在流行病学研究中样本群体所测得的某变量值系统地偏离了目标群体中该变量的真实值，使研究或推论结果与真实情况之间出现了偏差。这种系统误差可以发生于研究设计、实施和分析的各个阶段，可由设计的失误、资料获取的失真、分析方法不正确或推断不符合逻辑等所引起。常见偏倚：l选择偏倚 选择偏倚 无应答偏倚 幸存偏倚等2信息偏倚 报告偏倚 回忆偏倚 测量偏倚等3混杂偏倚八、质量控制1）确保抽样过程的随机化原则2）提高研究对象的依从性和受检率3）正确选择测量工具和检测方法4）培训好调查员，统一标准和认识5）作好资料的复查、复核等工作6）选择正确的统计分析方法，注意混杂因素的影响。 第三节 暴发调查outbreak investigation暴发调查是对地区或养殖单位在较短时间内发生较多同一种疾病所进行的调查。暴发调查主要用于急性传染病和中毒病。l对病因已知的疾病，通过流行病学调查分析，确定暴发的具体原因。l对病因未知的疾病暴发，探求病因线索，制定控制流行的对策，为进一步研究指明方向。l最终目的是控制和消灭流行，总结经验和教训，防止类似事件发生。暴发调查的步骤：l速赴现场2提出假设3进一步调查研究和核实4检验结论：根据调查得出的结论，采取相应的措施，观察暴发的进展情况，进一步验证结论的正确性。暴发调查的方法：l.临床和病理学观察、作出临床诊断。2.全面调查：首先鉴别所有可能的变量。调查疾病的三间分布、受害畜群和未受害畜群以及个体的有关资料。确定第一头（批）病畜的来源和不同群体中病畜之间的联系。调查外来病和消灭计划后期疾病的来源。3.分析和解释资料。形成图表、统计分析、形成和检验假设。4.报告结果，采取防制措施。这是暴发调查的最后一步。但对于新发外来病或烈性传染病要当机立断、采取防止疾病蔓延的措施。第四节 生态学研究ecological study以群体为观察和分析单位，通过描述不同动物群体中某因素的暴露状况与疾病的频率，分析该暴露因素与疾病之间的关系。二、生态学研究的目的1.提供病因线索，产生病因假设2.常用于慢性病的病因学研究和环境变量与畜群疾病或健康状态的关系研究。3.评估畜群干预措施的效果二、 基本原理描述某疾病或健康状况在各畜群中所占的百分数或比数，以及各有关特征者在各畜群中所占的百分数或比数。 从上述二类群体数据可以分析某疾病或健康状态的分布与畜群中的哪个特征分布相接近，从而探索病因线索。二、生态学研究的种类1探索性研究：观察不同群体中疾病的分布差异。 2多群组比较研究： 比较同一时间内不同地区的发病率及其相关因素，以探索环境与疾病的关系。 3时间趋势研究：观察不同年龄或不同出生时间的畜群中某种状态的变动趋势与疾病的关系。4混合研究：将多群组比较研究与时间趋势研究结合起来的研究方法。 第五节 疾病的报告与登记l.我国的疾病报告与登记制度：由县逐级向农业布报告，直接向农业布报告动物疾控中心汇报。2.国际上疾病报告与登记制度：由农业部畜牧兽医局负责向国际兽疫局报告。 A类疾病15种：24小时内向OIE报告。 B类疾病78种：一年或一季度向OIE报告。第8章 分析流行病学摘 要分析流行病学包括病例一对照研究和队列研究，主要用于鉴别疾病的主要病因或特定因素的致病作用，估价各种病因因素的定量效果。分析流行病学方法与描述流行病学的区别在于前者涉及动物组群的比较，以辨明某因素与某病是否有统计学联系，确定联系是否有因果性。分析流行病学是主动研究病因，积极探索动物群体中影响疾病频率分布的因素，直接把因素和疾病联系起来的研究方法。另一方面，分析流行病学方法依据对群体中自然存在疾病的观察数据进行研究，这一点与实验研究不同，所以又称观察研究。证明因素与疾病是否有统计学联系的主要方法是t检验和卡方检验。而确定联系的强度则需要通过危险性估计，才能衡量因素引起疾病的危险性大小。危险性估计通常用相对危险性(RR)、 归依危险性(AR)、归依危险百分比(AR%)等来表示。在此基础上，还可以进一步分析因素间的相互作用，即当两个或多个因素联合作用的效果大于或小于各因素单独作用相加的期望效果，就表明因素间存在相互作用。如疾病频率大于期望值则存在协同作用；如疾病频率小于期望值，则存在拮抗作用。一般说，发病率的相互作用最适合于用加法模型进行分析。观察研究中存在很多偏倚，它们严重影响研究结果的真实性，甚至得出完全错误的结论。主要的偏倚有3种；由研究群体和目标群体在特性方面的系统差异引起的选择偏倚；由数据收集、记录、编码、分析过程中的缺点造成的信息偏倚；由混杂因素引起的混杂偏倚。应在调查设计阶段及研究和分析过程中控制这些偏倚。病例一对照研究是以现在确认的患有特定疾病的动物个体组成病例组，以不患该病，具有可比性的动物个体组成对照组，通过询问、实验检查或复查病史查明两组中动物曾否暴露于某因素及暴露程度，经统计分析确定疾病与因素之间的联系，进而借助生物学推断方法确定因素和疾病间的因果关系，最后完成病因假设的检验。本研究方法是由疾病探索可能的病因，即从果推因，是后向的，所以又称回顾性研究。病例一对照研究中最重要的是病例组和对照组的选择，因为病例组和对照组在真正危险因素暴露比例上的差异，可能蕴藏着疾病病因学的本质。病例一对照研究能否成功的另一个关键是有没有把真正的病因因素包括在调查项目之内。队列研究又称定群研究，根据是否暴露于某假设因素选择两群(队列)动物，追踪观察并记录每一群动物疾病发生和发展情况，比较其发病率，确定假设因素对疾病的危险程度。所以队列研究是由因推果，前向的，故又称前瞻性研究。队列研究分为并存队列研究和非并存队列研究两种类型。队列追踪是队列研究的关键环节，为减少因观察带来的偏倚，应采用双盲试验的方法。队列研究通过对某一群体在某种病尚未明显发生前，某个（或某些）可能起病因作用或保护作用的事件的后果进行随访监测，进行从“因”观“果”的流行病学研究。暴露(exposure)：指接触过某种物质、具备某种特征或处于某种状态。队列(cohort)：原意是指古罗马军团中的一个分队，流行病学家加以借用，表示有共同经历或共同状态的一群体。队列研究的基本原理：根据研究对象是否暴露于某研究因素或其不同水平将研究对象分成暴露组与非暴露组。随访一定时间，比较两组之间所研究结局(outcome)发生率的差异，研究暴露因素与研究结局之间的关系。队列研究的特点：观察法、设立对照、由因到果，符合时间顺序、确证暴露和结局因果关系。队列研究的目的：检验病因假设 ( hypothesis)、评价预防效果 (effect of prevention)、研究疾病自然史( natural history of disease)。队列研究的设计和实施：一 确定研究因素二 确定研究结局：结局是研究队列中预期结果事件，包括发病或死亡、某些血清指标、分子标志的变化、定性或定量。三 确定研究现场和研究人群四 确定队列大小五 资料收集六 质量控制七 资料的整理和分析：资料整理表、率的计算、率的显著性检验、效应估计相对危险度（relative risk，RR）：暴露组发病或死亡的危险是非暴露组的多少倍。RR值越大，暴露的效应越大，暴露与结局关联强度越大。归因危险度(Attributable risk，AR)：暴露与非暴露群体比较，所增加的疾病发生数量，AR值越大，暴露因素消除后所减少的疾病数量越大。队列研究的优点：直接获得暴露组和非暴露组的发病率或死亡率直接估计危险度符合时间顺序，验证病因的能力较强获得一种暴露与多种结局的关系收集的资料完整可靠，不存在回忆偏倚可研究疾病的自然史队列研究的缺点：不适于发病率很低的疾病的病因研究 易发生失访偏倚 耗时，耗人力、物力、财力 设计要求严密，资料的收集和分析难度较大 随访过程中，已知变量的变化或未知变量的引入增加分析难度第9章 实验流行病学提 要实验流行病学是通过分配实验对象(动物)到不同的处理组群，随机地将所研究的因素施加于所研究的动物个体，而且还可以直接控制影响结果的其他外来因素。实验流行病学研究的不是自然发生的疾病情况，而是受到人为控制影响的疾病情况，因此在阐明疾病流行和分布规律、验证病因因素和评价防制效果方面更直接、更简单、更准确。对动物群体进行现场实验流行病学研究比在人群中进行同类研究的限制要少得多，在很多情况下，兽医流行病学研究直接从描述阶段过渡到实验阶段，而不对自然发生的疾病进行分析性研究。实验流行病学研究分为现场实验流行病学研究和实验室实验流行病学研究，前者是指在现场条件下，即自然生存的环境或者畜群实际饲养条件下进行实验研究，观察某因素对某疾病的作用效果大小和影响程度。由于实验研究在现场条件下进行，所以比实验室研究能更确切地反映疾病自然发生的规律。另一方面，在现场进行实验研究时，所遇到的干扰因素比实验室多得多，而且不易完全控制。实验室实验流行病学是指在实验室条件下，用实验动物或本动物(对象动物)进行的流行病学研究，在医学上又称动物实验流行病学。在这类研究中，研究者可以对几乎所有的因素进行严格的控制，可以保证试验组动物和对照组动物除施加的研究因素外在其他方面完全一致，可以根据不同的设计要求，将动物分为不同的处理组，比较各组动物对所施加因素的应答，得出符合科学的结论、必须指出，实验室实验流行病学研究是在不同于现场的除施加的因素外其他因素都完全控制的条件下进行的，所得研究结果应用于现场时需十分慎重。除上述两种实验流行病学研究外，在少数情况下，自然发生的疾病和其他条件十分接近理想设计的实验，这时也可进行自然实验研究，以节省大量的人力和物力。我国规定在评价生物制品或其他药品的安全性和效力时，必须用实验动物和本动物进行实验室试验，然后用实验室产品对现场动物进行田间试验，最后还要用中间试制产品在现场对不同品种的对象动物进行区域试验，根据实验室试验、田间试验和区域试验的一致结果，才能作出肯定或否定的评价。这里田间试验和区域试验都属于现场实验流行病学研究的范围。实验流行病学概念前瞻性，从假设的“因”出发，观察所产生的“果”。是研究者对因素进行直接控制的队列研究，所研究的疾病非自然发生的疾病情况，而是受人为控制影响的疾病情况。分为两类：现场实验流行病学和实验室实验流行病学。第一节 现场实验流行病学 掌握实验流行病学研究与观察性研究的主要区别 了解现场实验设计的原则和内容 了解现场实验流行病学与动物实验流行病学的主要区别一、概念科学地和人为地选择某因素进行现场实验，比较分析某因素对某疾病的作用和关系。按随机分配的原则，将现场实验的动物分为两组或多组，对其中的一组或数组人为地施加某因素，设一组为不施加该因素的对照，观察该因素对某疾病的作用效果大小和影响程度。二、实验设计1、设计原则 (1)现场条件：发病率高，相对稳定； 较好的兽医服务条件；试验畜群的数量固定； (2)样本含量：保证获得显著差异结果所需的最少动物数；新生物制品有特殊的要求； (3)试验分组：随机性、均衡性，必须有对照组； (4)观察指标和期限：定量指标为优，结果判断应盲试； (5)整理资料和鉴定效果：指标应有特异性与可重复性，并有近期与远期效果评价。2、实验设计内容 (1)确定目的：目的明确且最好单一 观察生物制品(疫苗)免疫学效果 病因研究 临床实验 (2)确定观察动物和动物数 动物选择 疫苗免疫效果观察：健康与易感动物，最近未接触过与该病有关的其他生物制品或药物 病因研究：健康动物 临床研究：病畜或有效接触动物 （3）对照组的选择 原则：均衡性和可比性 试验条件：饲养方式 易感性： 暴露水平： 诊断方法和标准： (4)确定观察期限 获得结果即可结束，不宜过长 (5)整理资料及分析卡方试验， t检验，保护率等，同分析流行病学第二节、自然试验(field trial)自然存在的疾病与理想设计的试验很接近，称为自然试验。构成自然试验的基本条件：(1)自然存在两个动物群体且有较大数量(2)均衡性和可比性(3)暴露水平有差异(4)观察指标和期限相同第三节 动物实验流行病学掌握动物实验流行病学与现场实验流行病学的主要区别动物实验流行病学的概念在实验室条件下，用实验动物或本动物进行的流行病学研究，又称实验室流行病学研究。实验条件可以严格控制，容易得出正确的结论。使用本动物的实验结果对现场发生的疾病有直接的指导意义。(一)设计原则(1)动物选择均衡性和可比性：排除其它疾病的影响；实验动物的标准：遗传标准；微生物标准(2)动物分组试验组与对照组，可分为多个组如疫苗安全效力试验至少应设空白组(接种安慰剂)、疫苗对照组(接种疫苗但不攻强毒)、强毒对照组(不接疫苗但攻强毒)；试验组为接种疫苗及攻强毒(3)动物数大样本和小样本，见前述样本数的估计；保证试验结果能进行统计学分析，并产生显著检验。(4)动物实验的环境恒定的饲养条件； 对环境没有污染的可能性； 感染性动物试验，应严格隔离，防交叉污染；(二)结果观察与分析评价1、结果观察：采用双盲法，判定标准应相同；2、分析评价 使用实验动物：常是确定病因最直接与最经济的方法，但应注意实验结果的适应范围：使用本动物：有较高的应用价值，但实验室应用的是小群体，单一品种，受控的干扰因素，因此，在推广应用实验结果时仍需慎重。第10章 血清流行病学摘要血清流行病学是用血清学(免疫学)和流行病学的原理和方法来研究血清中各种成分出现和分布的规律,以阐明疾病在畜群中的分布和原因,并在采取相应措施后,检验其效果。血清中特异抗体的测定可以提供畜群在现在和过去是否暴露于传染性病原体的证据，对传染病的流行病学研究具有很重要的意义。血清流行病学可用于查明疾病在动物群体中流行的情况；探讨某些疾病的地理分布；检查疫苗免疫效果；研究病因，特别是在暴发调查中确定传染病的病因；疫情的预测和疾病监测。血清抗体的测定往往以倍比的滴度数据为准。平均滴度最好以对数平均滴度表示，不用算术均数，因为这样的频率呈正态分布，适合用t检验和F检验对结果作差异显著性分析。抗体测定的结果判定常采用全或无应答方式，例如凝集或不凝集、感染或未感染。常用的测定系统有两种，即单系列稀释系统和多系列稀释系统。前者每一稀释度测一次，后这每一稀释度测58个重复。多系列稀释测定常用50终点滴定估计抗体滴度，如用法测定血清样品对病毒的中和滴度。在对血清学试验作解释时应注意其精密性（抗体针对病原体抗原的不同表位）、准确性（假阳性和假阴性）、敏感性和特异性，预测值（试验阳性动物实际也是阳性的概率）、可重复性（试剂的标准化程度和试验员的技术熟练程度）等。血清流行病学第一节 概述1概念血清流行病学是用血清学(免疫学)和流行病学的原理和方法来研究血清中各种成分出现和分布的规律,以阐明疾病在畜群中的分布和原因,并在采取相应措施后,检验其效果。2用途血清流行病学可用于查明疾病在动物群体中流行的情况；探讨某些疾病的地理分布；检查疫苗免疫效果；研究病因，特别是在暴发调查中确定传染病的病因；疫情的预测和疾病监测。3方法（1）调查方法：A现况（横短面）调查：疾病的诊断，暴发调查时测发病前后的双份血清。B长期（纵项）调查：畜群的多次跟踪调查。（2）检测的方法：血凝抑制试验（HI）、琼脂扩散试验（AGP）、酶联免疫吸附试验（ELISA）、中和试验（NA）、凝集试验（AA）、间接免疫荧光试验（IFA）（3）检测结果的分析：第二节 血清抗体的测定1抗体量的表示试验前常将抗体做倍比系列稀释，因此常用对数表示：2n动物抗体水平用滴度表示时呈正态分布。2抗体测定(1) 单系列稀释测定样品每稀释度测定一次，如：HI测定NDV抗体。（2）多系列稀释测定样品每稀释度测定多个重复，如中和试验测定抗体中和效价。一般重复数为4-8。ED50:半数有效量，抑制50%的试验组样品产生特定结局的血清稀释度。计算方法：Spearman-karber 法；Reed-Muench法。Log10ED50 =L-d(Ep-0.5) L=所有单层都未出现病变的最高稀释度对数D=稀释系数的对数Ep=从显示全部阳性结果（所有单层都未出现病变）的最高稀释度开始的各稀释度试验阳性比例总和。血清稀释度Log10稀释度病变孔数正常孔数阳性比例（P）1-P1/2-0.3051.001/4-0.6051.001/8-0.9140.80.21/16-1.2140.80.21/32-1.5320.40.61/64-1.8410.20.81/128-2.15001Log10ED50 =-0.6-0.3(1.0+0.8+0.8+0.4+0.2)-0.5= -1.4ED50 =25.1即0.1mL血清含25.1个ED50，则1mL血清含251个ED50。3.畜群中血清抗体水平的估计和比较（） 检测抗体的存在能否检测到抗体阳性动物取决于动物对特定病抗原的暴露水平，样本的含量、和检测方法的检测能力（灵敏度）。（） 抗体水平的比较 不同群体的比较可用t检验进行差异显著性分析。第三节 血清学试验结果的解释一、 精密性（refinement）病原体有各种抗原成分位于表面和内部，在病毒复制过程中还可产生非结构蛋白。同一病原的不同型、亚型、毒株间存在抗原表位的差异。试验能够区分病原、抗体细微差别的能力称为精密性。单克隆抗体的出现极大地提高的检测方法的精密性。例如，禽流感病毒病毒及其抗体的检测方法。二、 准确性（accuracy）检测结果与实际情况的符合程度，其影响因素主要为假阳性、假阴性。阳性结果的可能原因：A真阳性 实际感染、疫苗接种、母源抗体B假阳性 群交叉反应、非特异抑制剂、非特异凝集素阴性结果的可能原因：A真阴性 实际未感染B假阴性非特异抑制物、采样时间不当、免疫耐受、试验不敏感检测方法的敏感性检测方法敏感性琼脂扩散0.11mg凝集试验1g酶联免疫试验0.1g放射免疫试验1pg三、 敏感性（Sensitivity）和特异性（Specificity）敏感性是一种试验所能检出某指标为阳性的动物数占被检动物中实际阳性（患病/感染/免疫）动物的比例或概率。特异性是一种试验所能检出某指标为阴性动物数占被检动物中实际（未患病/感染/免疫）阴性动物的比例或概率。试验检测结果的解释试验结果真实状态总计阳性阴性阳性aba+b阴性cdc+d总计a+cb+da+b+c+d敏感性Se=a/(a+c)特异性Sp=d/(b+d)四、 预测值（Predictive value）当用血清学试验或其他筛检试验确定一个群体是否存在疾病时，很重要的一个问题是知道试验阳性动物实际也是阳性的概率，或试验阴性动物实际也是阴性的概率，这些概率就是试验的预测值。阳性结果预测值= a/(a+b)阴性结果预测值=d/(c+d)预测值取决于试验的特异性、敏感性和群体的发病率。如果一动物群体按某试验缺定某种疾病的比例为PT，而真正发病率为P，则PT有两个部分组成：真阳性+假阳性。PT=PSe + (1-P) (1-Sp) P= PT+Sp-1Se+Sp-1阳性结果预测值= PSe/ PSe + (1-P) (1-Sp)阴性结果预测值= (1-P)Sp/(1- P)Sp +P(1-Se )五、 可重复性血清学试验的可重复性是可靠性的表现，取决于多种因素，包括试验用试剂的标准化程度和试验者的技术熟练程度。一般抗体抗体滴度发生4倍以上的变化反映有真正的变化，2倍变化不认为是显著变化。