疾病的基本病理过程课件

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Teaching Experience of Molecular Biology Software,Li Shaowei,(School of Life Sciences,Xiamen University,National Diagnostics Infectious Diseases and Vaccine Research Center,Xiamen361005,China),Abstract:Molecular biology and biotechnology,life science based subjects,especially the experiment of teaching in all institutions of higher education has been widespread attention,but for the application of strong molecular biology software,teaching has long been neglected.I first summer in the short term Xiamen University in the creation ofcommon software applications of molecular biologycourse has been five years,this article summarizes the molecular biology software,teaching experience,teaching suggestions for improvement put forward to explain the software applications and experimental design of the necessary links for the biomedical disciplines,software,teaching classes to provide a reference for the software to further improve the quality of teaching and teaching reform lay the foundation for the implementation of the software.,Keywords:Molecular biology;Software teaching;Innovative thinking,目前,许多生命科学的研究已经深入到了分子水平,分子生物学已经渗透到了各个研究领域中:从微观的细胞生物学到宏观的生态学,从理论计算为主的生物信息学到解析分子机制的结构生物学,从药物筛选和改造到基因工程疫苗研制。分子生物学的研究从生命的遗传物质DNA的信息开始,探索生命现象的内在本质,形成了生物信息,进而利用这些信息改造生命,基因工程技术就是分子生物学实践的最重要体现1。而分子生物学的实验设计和基因信息资源的利用需由计算机软件辅助进行,因此,软件教学是学生更好地理解分子生物学理论和掌握基因工程技术的重要途径。笔者2005年始在厦门大学夏季的短学期课程中开设分子生物学常用软件的应用课程,以下浅谈教学过程中获得的体会和经验,并提出些教学改进的建议,可供其他理学学科的软件教学参考。,一、分子生物学实验软件教学的内容,分子生物学常用软件的教学任务是培养一批能够把生命科学与计算机科学有机相结合的科研人才,他们将能够迅速适应分子生物学、生物化学、生物信息学和结构生物学等领域的研究工作。教学的目的是介绍分子生物学软件涉及的相关理论知识,结合具体的实务应用,引导学生利用互联网资源进行分子生物学软件的学习,从而让学生掌握重组克隆子构建的设计、PCR引物设计、序列特征和蛋白质性质与基因表达的关系,以及了解基本的生物信息学和结构生物学的原理。主要教学内容2包括:互联网上分子生物学信息资源的获得、DNA和蛋白质序列分析、PCR引物设计、DNA和蛋白质序列比对分析、蛋白质性质分析、蛋白质二级结构预测、生物大分子三维结构的分子图形学、生物信息软件GCG和分子模拟软件Insight II的介绍等。,可见,分子生物学实验教学的内容是以分子生物学的实验为基础,培养学生的分子生物学实验设计的能力,并加强对理论的理解。软件学习具有很好的实用性:如PCR反应的条件取决于基因的长短、序列特征和所使用的引物,软件可以提供引物退火温度的预测,直接可作为实验条件的依据;软件学习的素材又不能脱离于实验的内容,如果没有考虑实验中的多种影响因素,软件的设计就过于理想化甚至在实际中无法实现。因此,在软件教学时需时常让学生联系实验的实际情况,培养学生理论联系实际、设计基于实践的分子生物学研究思想。,二、分子生物学软件教学的经验,分子生物学常用软件的教学与通常的软件教学不同,是基于对分子生物学实验原理的理解和对实验结果的思考而进行的软件应用,要求深入浅出讲解软件计算的原理和使用功能,方能取得较好的教学效果。,(一)教学方式,软件教学主要以软件原理和实例分析、应用为主要授课内容,并涉足计算机技术、网络和数据库应用、生物信息学、分子模拟和基因工程等。课堂上除了讲授形式以外,还采用知识回顾、实验模拟、流程设计等新颖的教学方式,结合实验教学中学生常常碰到的问
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