酵母双杂交ppt汇编课件

,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,酵母双杂交ppt,酵母双杂交ppt,酵母双杂交系统组成,与BD融合的蛋白表达载体，被表达的蛋白称诱饵蛋白(bait),与AD融合的蛋白表达载体，被表达的蛋白称靶蛋白(prey),带有一个或多个报告基因的宿主菌株,酵母双杂交系统组成 与BD融合的蛋白表达载体，被表达的蛋白称,常用系统：,LexA系统,LexA：作为一个DNA-BD结合lexA操纵子。AD是已克隆到特定载体的异源基因。诱饵蛋白与DNA-BD融合，靶蛋白与AD融合，若两融合蛋白结合即产生一个新的转录因子，其可识别并结合lexA操纵子的特异位点，调控报告基因表达。,LexA系统使用的报告基因：lacZ，LEU2,常用系统：LexA系统,X,GAL4,DNA-BD,GAL1 UAS,promoter,lacZ (or HIS3 etc),reporter gene,GAL4,AD,Y,Promoter activation,Gal4 系统,Gal4蛋白：酵母菌的转录因子，含有DNA-BD和AD两个部分。DNA-BD与诱饵蛋白基因X结合，构建BD-X融合表达载体，DNA-AD与靶蛋白Y结合，构建AD-Y表达载体。两个载体共转化至酵母细胞内，若X和Y互作，BD和AD空间上接近，激活UAS下游启动子调节的报告基因表达。,XGAL4GAL1 UASpromoterlacZ (or,酵母菌株,MATCHMAKER GAIL Two-Hybrid System 3 双杂交系统,酵母菌株 MATCHMAKER GAIL Two-Hybri,质粒,质粒,酵母双杂交ppt汇编课件,实验流程,诱饵质粒的构建及表达,cDNA文库的构建和鉴定,(猎物载体的构建和表达),酵母双杂交筛选,单个文库质粒的自激活检测和阳性克隆的进一步确定,阳性克隆的测序分析,-半乳糖苷酶活性定量分析,实验流程,诱饵质粒的构建及表达,诱饵质粒的构建,重组质粒转化酵母菌株：,醋酸锂法,融合蛋白表达的检测,酵母菌体蛋白抽提,Western Blotting 鉴定,诱饵质粒的构建及表达诱饵质粒的构建,内源性His3蛋白表达抑制检测,某些诱饵质粒转化酵母菌后会诱导产生内源性组氨酸,3-氨基-1，2，4-三唑（3-AT）：抑制内源性组氨酸产生,通过在培养基中加入3-AT抑制内源性组氨酸产生,选择最佳3-AT浓度，抑制背景表达:,诱饵质粒与AD空载体转化酵母菌，涂布于3-AT浓度梯度的SD培养基上，观察菌落生长情况,内源性His3蛋白表达抑制检测某些诱饵质粒转化酵母菌后会诱导,cDNA文库的构建和鉴定,mRNA的制备,合成cDNA第一链,cDNA的LD-PCR的扩增,cDNA文库的构建和鉴定mRNA的制备合成cDNA第一链cD,连接到克隆载体中,转化大肠杆菌,文库质量检测,一个具有良好代表性cDNA文库应具有10,6,以上的库容量,文库滴度（pfu/mL）定义为：菌斑数稀释倍数1000/铺入平板的稀释的菌溶液体积（L）,cDNA插入片断的分析鉴定,连接到克隆载体中转化大肠杆菌文库质量检测一个具有良好代表性c,酵母双杂交筛选,酵母双杂交筛选,单个文库质粒的自激活检测和阳性克隆的进一步确定,1、AD质粒和BD质粒的分离,提取阳性克隆的质粒转化到感受态细胞DH5，涂布于含Amp的,LB平板上,2、单个AD质粒自激活检测,挑取含Amp的LB平板上生长的单菌落培养，提取质粒DNA，同BD,空载体共转化酵母菌株，涂布于相应SD平板上,3、确认阳性互作,将无自激活的单个文库质粒和诱饵质粒共转化酵母菌株，涂布于相,应SD平板上,单个文库质粒的自激活检测和阳性克隆的进一步确定 1、AD质粒,阳性克隆的测序分析,将已验证为阳性克隆的AD质粒测序，通过BLAST进行核酸序列同源性分析,-半乳糖苷酶活性定量分析,阳性克隆SD-2中30培养过夜,NA,2,CO,3,终止反应,转接YPAD培养至OD,600,=1.0-1.5,Z Buffer洗涤,液氮中冻融3次,加入底物硝基苯半乳糖（ONPG），30显色,取上清，测定420nm下OD值,-半乳糖苷酶活性=1000OD,420,/（tVOD,600,）,阳性克隆的测序分析将已验证为阳性克隆的AD质粒测序，通过BL,酵母双杂交系统的应用,验证通过其他方法发现的蛋白质间可能的相互作用,确定蛋白质特异相互作用的关键结构域和氨基酸,筛选文库以得到与已知蛋白质存在特异相互作用的蛋白质,酵母双杂交系统的应用,Functions of OsBZR1 and 14-3-3 proteins in brassinosteroid signaling in rice PNAS 2007,104(34):1383913844,BD,AD,Gal4,Gal4,reporter,full-length OsBZR1,a rice cDNA library,Functions of OsBZR1 and 14-3-3,Sequences of the putative 14-3-3 binding site inOsBZR1 and its mutagenized version S156G.,Interaction between OsBZR1 and GF14c in yeast two-hybrid assays,Three clones of yeast containing each combination of bait(BD)and prey(AD)vectors were grown on complete medium（+Ade）or Ade drop-out selection medium(+Ade).AD-T7,pGAD-T7 empty vector was used as a negative control.,Mutation of the 14-3-3 binding site of OsBZR1 enhances the reporter gene expression in yeast.,The yeast containing GAL4BD-OsBZR1,GAL4BD-OsBZR1S156G,and GAL4BD empty vectors were inoculated,with 10-fold dilutions,onto-Trp and-Trp/His drop-out meda with different 3-amino-1,2,4-triazole concentrations and cultured for 4 days.,OsBZR1 is transcriptionally active in yeast,Interaction with yeast 14-3-3 proteins inhibits the transcriptional activity of OsBZR1 in yeast cells,Sequences of the putative 14-3,传统酵母双杂交系统自身问题和缺陷,并非对所有的蛋白质适用,融合蛋白的相互作用激活报告墓因是在细胞核内发生的，所以表达的融合蛋白在细胞内能否正确折叠并被运至核内是检测蛋白之间有否相互作用的前提条件,不能被转运到细胞核内的蛋白质如细胞桨蛋白、细胞膜蛋白的相互作用就不易使用该系统,假阳性的发生频率较高,传统酵母双杂交系统自身问题和缺陷并非对所有的蛋白质适用融合蛋,Thank You,Thank You,此课件下载可自行编辑修改，仅供参考！感谢您的支持，我们努力做得更好！谢谢,此课件下载可自行编辑修改，仅供参考！感谢您的支持，我们努力,