单细胞基因测序市场分析课件

Titelmasterformat durch Klicken bearbeiten,Textmasterformat bearbeiten,Zweite Ebene,Dritte Ebene,Vierte Ebene,Title, Location, Date,#,Sample to Insight,Titelmasterformat durch Klicken bearbeiten,Textmasterformat bearbeiten,Zweite Ebene,Dritte Ebene,Vierte Ebene,#,Sample to Insight,1,QIAGEN Your Partner in Translational Medicine,单细胞基因测序市场分析,什么叫单细胞,基因,测序（,Single Cell Sequencing,）？,一句话说，就是单个细胞水平上对基因组进行测序。,2013,年，,Nature,杂志把年度技术授予了单细胞基因测序（,Single Cell Sequencing,）,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。,单细胞基因组、转录组分析,单细胞测序通过对单个细胞进行基因组扩增和,测序,解决,了用组织样本无法获得不同单个细胞的异质性信息、样本量太少无法进行常规测序的,难题,研究,解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新,方向,为,早期检测、诊断疾病及疾病的个体化治疗提供指导。,基因组及转录组分析中常遇到的难题：,全,基因组和全转录组分析的难题：,Title, Location, Date,6,单细胞测序应用领域,单细胞全基因组测序：,1,、体外受精的胚胎测序：在把胚胎植回母体之前，先取一个细胞进行测序，确认基因正常后再植回，以保障胚胎是正常的。,2,、,CTC,细胞测序：通过对血液中的肿瘤细胞测序，找到突变位点，针对性能进行靶向药物治疗。,3,、肿瘤亚细胞群测序：肿瘤发生、发展中，细胞不断发生新的突变，形成许多亚细胞群，单细胞测序可以对这些亚细胞群进行分别的测序，并找到对应的治疗方案。,4,、免疫测序：免疫细胞在对抗原发生识别后，免疫细胞的基因组发生重排，并产生对抗原特异的抗体。对免疫细胞的测序，可以找出特异的基因结构。,Title, Location, Date,7,单细胞测序应用领域,单细胞转录组测序：,1,、在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的肿瘤细胞,、,干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。,2,、发现亚细胞成分的基因表达谱，例如对在神经元的轴突或树突部分特异表达的基因的转录组分析。,一、单细胞测序行业,BCC Research,的一项分析报告指出，,2014,年全球单细胞分析（,Single-cell Analysis,）的市场达,5.4,亿美金，预测将从,2015,年的,6.3,亿美金增长到,2020,年的,16,亿美金，复合增长率达,21%,。,根据,GENReports,的报告，关于单细胞分析的文章发表在过去的几年也有着爆发性的增长。,图,2,：单细胞分析的文章发表数量,9,二、单细胞基因测序的基本流程：单细胞分离,-,基因组扩增,-,测序和分析,单细胞测序,，主要,经过如下的步骤,：,单细胞,的,分离,DNA/RNA,的提取和扩增（全基因组扩增和全转录组扩增,）,测序,以及后续的分析和,应用,2.1,单细胞的捕捉和分离,单细胞测序的第一步是单细胞的分离和提取，目前的方法主要,有：,流式细胞术,激光,捕获显微切割,技术,微流控技术,Daniel A. Haber, et al CANCER DISCOVERY JUNE 2014,Title, Location, Date,11,单细胞操作的仪器,Fluidigm C1,单细胞操作,毛细管显微操作,单细胞,10X Genomics,Illumina,与,Bio-Rad,发布,Singel-Cell Sequencing Solution,QIAscout,武汉友芝友,-CTC,捕获仪,强,生,-Cell Reserch,Title, Location, Date,12,C1,单细胞自动制备系统,1,个小时内即可分离,96,个单细胞,Biomarker HD,系统,30,分钟内可进行,9216,个,qPCR,反应,PBMC,单细胞转录组测序结果示例,10X Genomics,Title, Location, Date,13,Illumina, Bio-Rad,Single-Cell,Sequencing,Solution,QIAscout,武汉友芝友,-CTC,捕获仪,CellSearch,2.2,全基因组扩增 （,Whole Genome Amplification. WGA,）,/,全转录组扩增 （,Whole Transcriptome Amplification,，,WTA,）,单细胞,测序的,难点在于扩增,。,全基因组扩增主要的方法：,简并,寡核苷酸引物,PCR,扩增（,DOP-PCR,）,多重,置换扩增（,MDA,）,目前最好的方法,和,基于多次退火和成环的扩增循环（,MALBAC,）,亿康基因,常见,WGA,方法比较,转录组扩增主要的方法：,Clontech,公司的,Smart,方法,一种优秀的单细胞全长,RNA-seq,：起始,RNA,只有约,10pg,EpiCentre,公司的,TargerAmp,方法,TargetAmp,法测单细胞全,RNA,SMART,法测单细胞的全长全,RNA,Title, Location, Date,18,单细胞测序国内相关公司（科研）,公司名称,开展类型,华大基因,单细胞,DNA,测序、单细胞,RNA,测序,诺禾致源,单细胞,DNA,测序、单细胞,RNA,测序,贝瑞和康,单细胞,DNA,测序、单细胞,RNA,测序,安诺优达,单细胞,DNA,测序、单细胞,RNA,测序、单细胞,G&T,测序、单细胞甲基化测序、单细胞,Hi-C,测序,美吉生物,单细胞,RNA,测序,广州锐博,单细胞,DNA,测序、单细胞,RNA,测序,百迈客,单细胞,RNA,测序,杭州壹基因,单细胞,DNA,测序、单细胞,RNA,测序,Title, Location, Date,19,单细胞测序相关报价,类型,单价,备注,单细胞全基因组测序,1.2,万元,/,样本，,90Gb/,样本,从单细胞（含裂解液）到数据分析,单细胞外显子组测序,6000,元,/,样本，,10Gb/,样本,单细胞,mRNA,测序,5000,元,/,样本，,8Gb/,样本,单细胞,lncRNA,测序,7000,元,/,样本，,10Gb/,样本,单细胞测序对样本要求,Title, Location, Date,20,类型,样本要求,单细胞全基因组测序,1),细胞分离：由合作方完成单细胞分离；,2),由公司寄出样品保存液（,MALBAC,裂解液；,MDAPBS,缓冲液）；,3),样品需求量：,1-1000,个新鲜细胞，样本体积尽量不超过,1-2l,。,单细胞转录组测序,1,）细胞分离：由合作方完成单细胞分离；,2,）样品类型：活体新鲜完整细胞；不适于经固定、染色等处理的样本；,3,）样品体积：在显微镜或其他设备辅助下分离，得到的单细胞样本体积以不高于,0.5l,为宜；,4,）送样量：建议重复单细胞样本个数不小于,5,个。,目标客户群,QIAGEN Your Partner in Translational Medicine,21,单位,研究方向,预估课题经费,肺科医院肿瘤科,肺癌,CTC,的小,RNA,检测,5,万,中山医院肝外科,肝癌,CTC,外显子组测序，,CTC,转录组测序,30,万,中山医院肝研所,肝癌,CTC,转录组测序,10,万,瑞金医院,肠癌,CTC,转录组测序,10,万,中科院生化细胞所,生殖细胞的全外显子组测序和转录组测序（已做）,300,万,中科院神经所,神经细胞转录组测序（已做）,30,万,复旦大学脑科学研究院,神经细胞转录组测序（已做）,10,万,以上海市场为例,目标客户群,QIAGEN Your Partner in Translational Medicine,22,以上海为例,主要集中的单位：,中山,医院肝研所、仁济医院干细胞中心、同济大学生科院（干细胞）、上海市肿瘤研究所、中科院生化细胞所、肺科医院肿瘤科、中科院神经所、复旦大学脑科学研究院等,主要集中的领域：,肿瘤（肺癌、肝癌、肠癌、乳腺癌等）、干细胞、神经科学（脑科学）等,单细胞测序相关公司（分子诊断）,QIAGEN Your Partner in Translational Medicine,23,单位,开展项目,亿康基因,PGS,、,PGD,华大医学,PGS,、,PGD,贝瑞和康,PGS,、,PGD,Title, Location, Date,24,Thanks！,