2012DNA的修复

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- T -,-,G - - C -,羟胺类,(,NH,2,OH),T,C,-,T - - A-,-,C - - G -,亚硝酸盐,(,NO,2,),C,U,-,G - - C-,-,A - - T -,烷化剂,如:,氮芥类,,Nitromins,G,m,G,DNA,缺失,G,9,10,DNA,的修复,2024/9/23,11,DNA,修复系统,直接修复,错配修复,切除修复,重组修复,SOS,修复,11,DNA,直接修复(,direct repair,),生物体内存在多种,DNA,损伤以后而并不需要切除碱基或核苷酸的机制,这种修复方式称为,DNA,的直接修复,。,12,嘧啶二聚体的产生,类型:,TT,二聚体 ( )、,CC,二聚体( )、,CT,二聚体( ),TT,CC,CT,相邻的胸腺嘧啶,C,C,C,C,13,光复活,(photoreactivation),可见光存在的条件下,在光复活酶作用下将,UV,引起嘧啶二聚体,分解为单体的过程。,过程,光复活酶与,T=T,结合形成复合物;,复合物吸收可见光切断,T=T,之间的,C-C,共价键,使二聚体变成单体;,光复活酶从,DNA,链解离。,14,DNA,紫外线损伤的光复合酶直接修复,15,PR,光复活(,photo reactivation,)直接修复,-TT-,-AA-,-,TT-,-,-AA-,-TT-,-AA-,-,TT-,-,-AA-,复制前、不容易出错,400 nm,蓝光、,PR,酶,(photo-reactivation enzyme),光敏裂合酶(,photolyase,),可见光激活,16,烷基化碱基的直接修复,在 大肠杆菌中,O,6,-,甲基鸟嘌呤,-DNA,甲基转移酶,(,Ada,),,通过从,O,6,-,甲基鸟嘌呤上把甲基直接转移到酶的半胱氨酸残基上来直接回复,DNA,的损伤,可修复甲基化的碱基和甲基化的磷酸二酯键。(自杀性酶),17,DNA,断裂口直接修复:,在,DNA 5,-P,端和,3,-OH,端未受损害的情况下,连接酶能够直接修复,DNA,的断裂口。,18,切除修复,1,、内切酶识别损伤部位,并在,5,端切开;,2,、外切酶作用下连同受损伤的部位,从,5,端到,3,端切除;,3,、合成新链填补缺口;,4,、连接酶连接。,碱基切除修复:,BER,可以去除因脱氨基或碱基丢失及其它因素产生的,DNA,损伤。,形成去,AP,位点,AP,核酸内切酶切除受损片段,DNA,聚合酶,I,和,DNA,连接酶修复,DNA,链,19,DNA,糖苷酶,(glycosylase),能识别,DNA,受损核酸位点,特异性切开受损核苷酸上的糖苷键,在,DNA,链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,称为,AP,位点。,DNA,分子中一旦产生了,AP,位点,,AP,核酸内切酶就会,切开,Ap,位点附近的磷酸二酯键,,并移去包括,AP,位点核苷酸在内的小片段,DNA,。,20,21,Base Excision Repair,22,-TAGC-,-ATCG-,-TAGC-,-A CG-,U,-TAGC-,ung-ase,G,C,U,A,U,-TAGC-,-A CG-,AP,内切酶,(,Apurinase),-TAGC-,-ATCG-,DNApol,Ligase,23,核苷酸切除修复,DNA,切割酶切割移去,12-13,个核苷酸(原核)或,27-29,个核苷酸(真核)的单链,DNA,,再由,DNA,聚合酶和,DNA,连接酶修复,DNA,链,24,二聚体,25,DNA mismatch,+,- A-,-,-,C,-,错配修复系统,(MRS,Mismatch,Repair,System),错配修复碱基来源:,校正活性所漏校的碱基,+,- A-,-,-,T,-,错配修复(,Mismatch repair),26,错配修复(,Mismatch repair),原核细胞内存在,Dam,甲基化酶,能使位于,5GATC,序列中,腺苷酸的,N,6,位甲基化,。,复制后,DNA,在短期内(数分钟)为半甲基化的,GATC,序列,一旦发现错配碱基,即将未甲基化链切除一段包含错误碱基的序列,并以甲基化的链为模板进行修复。,27,DNA,合成过程中的甲基化变化,DNA,中的,GATC (palindromic seq,.),为,m,6,A,甲基化敏感位点,平均每,2kb,左右有一,GATC,seq.,错配修复系统受甲基化的引导,28,2024/9/23,29,错配修复,一旦在,DNA,复制过程中发生错配,通过该系统几乎能完全修正。该系统对,DNA,复制忠实性贡献很大。,修复过程:,识别错配,,复合物的形成,甲基化及非甲基化链的切开,,切除含错配的部分,DNA,链,,合成新链,新链再度甲基化,29,错配修复系统组成(,Mismatch repair system,),DNA,腺嘌呤甲基化酶,(m6A,甲基化酶,),DNA polymerase ,填补单链,DNA,缺口,Helicase SSB,外切核酸酶,(,和,),连接酶,MCE,(mismatch correct enzyme),扫描新生链中错配碱基,识别新生链中非,m,6,A,的,GATC,序列,酶切含错配碱基的,DNA,区段,3 subunits,mut H, L, S,30,错配修复,大肠杆菌,DNA,甲基化位点,新合成的,DNA,31,Mis-paired bases,32,DNA突变,突变(,Mutation,),:,DNA,碱基序列水平发生永久的可遗传的改变称为突变。,突变体:携带突变的个体,群体或株系叫突变体。,突变型:,突变类型,点突变,(point mutation),:,移码突变,(frame shift mutation),:,33,突变的类型,1,、碱基对的置换(,substitution,),转换,(Transition),:,最普通的一种点突变,指一种嘧啶被另一种嘧啶代替,一种嘌呤被另一种嘌呤代替。使,GC,对被,AT,对替换,或者相反。,颠换,(Transversion),:,另一种不常见的点突变,嘌呤被嘧啶代替或者相反,如,AT,对变成了,TA,、,CG,对。,2,、移码突变(,frameshift mutation,),由碱基的缺失或插入造成。,34,A G,T C,35,DNA,突变的类型,-T-C-G-G-C-T-G-T-A-C-G-,-A-G-C-C-G-A-C-A-T-G-C-,转换,-T-C-G-A-,G,-C-T-G-T-A-C-G-,-A-G-C-T-,C,-G-A-C-A-T-G-C-,插入,A,-T-C-G-C-T-G-T-A-C-G-,-A-G-C-G-A-C-A-T-G-C-,缺失,T,野生型基因,-T-C-G-A-C-T-G-T-A-C-G-,-A-G-C-T-G-A-C-A-T-G-C-,-T-C-G-T-C-T-G-T-A-C-G-,-A-G-C-A-G-A-C-A-T-G-C-,颠换,碱基对的置换,(substitution),移码突变,(framesshift mutation),36,编码区突变类型,突变,同义突变,错义突变,无义突变,中性突变,无声突变,37,同义突变,Synonymous mutation,虽然,,DNA,上碱基发生了变化,但仅仅是改变了某种氨基酸的,同义密码子,,基因表达的,氨基酸序列不变,,生物活性不变。,属于“,无声突变,”。,38,38,e.g.,亮,aa CUU CUA UUA,对应的,DNA CTT CTA TTA,e.g.,亮,aa CUC CUG UUG,对应的,DNA CTC CTG TTG,39,错义突变,(Missense mutation,):,密码子的第一、二位碱基改变导致对应的,aa,改变,G,A,A,G,T,A,40,中性突变,Neutral mutation,虽然,,DNA,的碱基发生了改变,但突变体的,性状,几乎,不变,,蛋白质的,活性,几乎,不变,。,属于,“,错义突变,”,中的一种形式,也属于,“,无声突变,”,Silent mutation。,41,41,无义突变,Nonsense mutation,因,DNA,上碱基的改变,或者碱基插入、缺失造成移码现象,使原氨基酸密码子,变为终止密码子,的过程。这种突变会使得,翻译,过早的,中断,,表达的蛋白质失去了活性。,42,42,43,移码突变 Frameshift mutation,当,DNA,中插入或缺失核苷酸,或加入嵌合剂时,造成,阅读框的移动,,使基因转录的,mRNA,三联密码改变,表达的,氨基酸序列面目全非,,或,部分改变,或不表达,甚至造成,生物致死,(,Lethal,),的现象。,44,45,回复突变,回复突变:,基因第二次突变时,在第一次突变位点上,恢复成原来碱基,的现象。这种几率在自然界,很小,。,A-a a-A,习惯上说的“回复突变”,确切地说是 “校正,突变,”。,46,基因校正,基因的,第二个位点突变,,来,抑制,第一个位点突变的表现型效应。使第二次表现型,恢复为野生型,、,或成为,有活性的突变体。,47,47,校正方式:,基因,内校正,(两次突变位点,在同一条染色体上。),基因,间校正,(两次突变位点,在不同染色体上。),48,48,基因,内校正,5 -CAGGACAACACTGC,ATG,CCCAAATA,C,TTTGGGTGA-3 ,3 -GTCCTGTTGTGACGTACGGGTTTATGAAACCCACT-5 ,5 -CAGGACAACACTGC,ATG,CCCAAA,T,A,G,TTTGGGTGA-3 ,3 -GTCCTGTTGTGACGTACGGGTTTATCAAACCCACT-5 ,5 -CAGGACAACACTGC,ATG,CCCAAA,C,A,G,TTTGGGTGA-3 ,3 -GTCCTGTTGTGACGTACGGGTTTGTCAAACCCACT-5 ,49,野生型,+,-,第一次突变,第二次突变,有几种情况,1.回复突变,-,2.同点抑制突变,-,3.异点抑制突变,有活性的突变体,+,+,+,+,失活,50,基因内抑制突变,Lys,Glu,Lys,Glu,50,第二次突变并不恢复已突变的蛋白质结构,而是,改变另一个,蛋白质,来,补偿,原来突变造成的,缺陷,。使第二次表现型恢复为野生型,或成为有活性的突变体。,51,基因间校正,51,基因,间,直接校正,结构基因突变,转录,。,tRNA,基因也突变,转录,突变,mRNA,突变,mRNA,。,翻译,野生型蛋白,突变的,tRNA,,识别突变的,mRNA,,带入原来的氨基酸。,突变的,tRNA,52,52,错义突变的基因间校正,53,基因,间,间接校正,野生型酶蛋白,第一次突变,失活酶蛋白,第二次突变,有活性突变体,的酶蛋白,它们成了,同工酶,54,The End,55,
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