系统进化树的制作课件

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,打开,ClustalX,打开ClustalX,系统进化树的制作课件,系统进化树的制作课件,系统进化树的制作课件,进行完全比对,进行完全比对,系统进化树的制作课件,系统进化树的制作课件,由于后面无法用,aln,格式转化的,meg,格式打开，,所以此改用,fasta,格式保存并命名为,cob2,由于后面无法用aln格式转化的meg格式打开，,系统进化树的制作课件,选择此项可打开比对过的文件,选择此项可打开比对过的文件,系统进化树的制作课件,系统进化树的制作课件,系统进化树的制作课件,系统进化树的制作课件,系统进化树的制作课件,系统进化树的制作课件,系统进化树的制作课件,选择邻接法（,NJ,法）构建系统发育树,选择邻接法（NJ法）构建系统发育树,设置,Bootstrap,值为,100,设置,Gap,处理为两两删除,设置模型为,Kimura-2-Parameter,设置Bootstrap值为100设置Gap处理为两两删除设置,此为原始的树,此为原始的树,此为经过,Bootstrap,计算的树,并选择左边图标,Place Root on Branch,选择,NC 006081,为外群,此为经过Bootstrap计算的树,此为树根，即所有物种最近共同祖先,外群,树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这一支的可能性越高，图上属于同一支的即代表在进化上相对较近。,此为树根，即所有物种最近共同祖先外群树上的数字代表自展支持率,选择最大简约法（,MP,法）构建系统发育树,选择最大简约法（MP法）构建系统发育树,设置,Bootstrap,值为,100,设置Bootstrap值为100,此为原始的树,此为原始的树,此为经过,Bootstrap,计算的树,并选择左边图标,Place Root on Branch,选择,NC 006081,作为外群,此为经过Bootstrap计算的树,此为树根,外群,树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这一支的可能性越高，图上属于同一支的即代表在进化上相对较近。,此为树根外群树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这,对比,NJ,法和,MP,法做出来的树，,NJ,法的自展支持率相对较高，且两树中个别序列的位置也不同。,对比NJ法和MP法做出来的树，NJ法的,以同样的方法制作,cox1,序列的系统发育树,结果如下,以同样的方法制作,此为,NJ,法的原始树,此为NJ法的原始树,此为,NJ,法经过,Bootstrap,计算的树,并选择左边图标,Place Root on Branch,选择,NC 006081,作为外群,此为NJ法经过Bootstrap计算的树,此为树根,外群,树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这一支的可能性越高，图上属于同一支的即代表在进化上相对较近。,此为树根外群树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这,此为,MP,法原始的树,此为MP法原始的树,此为,MP,法经过,Bootstrap,计算的树,并选择左边图标,Place Root on Branch,选择外群,此为MP法经过Bootstrap计算的树,此为树根,外群,树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这一支的可能性越高，图上属于同一支的即代表在进化上相对较近。,此为树根外群树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这,