DNA序列分析blast法培训ppt课件

文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。生物信息学 生物信息学生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、处是研究生物信息的采集、处理、存储、传播，分析和解释等各方面的学科，也是理、存储、传播，分析和解释等各方面的学科，也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展，生命科学和随着生命科学和计算机科学的迅猛发展，生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利计算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利用生物学，计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂用生物学，计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。的生物数据所赋有的生物学奥秘。其研究重点主要体现在基因组学（其研究重点主要体现在基因组学（Genomics）和蛋白）和蛋白质组学（质组学（Proteomics）两方面，具体说就是从核酸和蛋）两方面，具体说就是从核酸和蛋白质序列出发，分析序列中表达的结构功能的生物信白质序列出发，分析序列中表达的结构功能的生物信息。息。文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。研究方向 序列比对序列比对 基因识别基因识别 基因重组基因重组 蛋白质结构预测蛋白质结构预测 基因表达基因表达 蛋白质反应的预测蛋白质反应的预测 建立进化模型建立进化模型文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。方法方法序列同源性序列同源性分析分析基因编码产基因编码产物预测分析物预测分析蛋白质功能蛋白质功能域分析域分析文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。Blast程序 BLAST 是一个基于序列相似性的数据库搜索程序。是“局部相似性基本查询工具”(Basic Local Alignment Search Tool)的 缩写。Blast 是一个序列相似性搜索的程序包，其中包含了很多个独立的程序，这些程序是根据查询的对象和数据库的不同来定义的。文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。Blast结果 Blast结果会列出跟查询序列相似性比较高，符合限定要求的序列结果，根据这些结果可以获取以下一些信息。查询序列可能具有某种功能 查询序列可能是来源于某个物种 查询序列可能是某种功能基因的同源基因文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。Blast程序评价序列相似性的两个数据 Score：使用打分矩阵对匹配的片段进行打分，这是对各对氨基酸残基（或碱基）打分求和的结果，一般来说，匹配片段越长、相似性越高则Score值越大。E value:在相同长度的情况下，两个氨基酸残基（或碱基）随机排列的序列进行打分，得到上述Score值的概率的大小。E值越小表示随机情况下得到该Score值的可能性越低。序列同源性分析文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。检索结果匹配序列列表详细比对上的序列文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。基因编码产物预测分析文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。检索结果文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。匹配序列列表文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。BCR/ABL fusion protein isoform X9 Homo sapiensBCR/ABL fusion protein isoform X9 Homo sapiens氨基酸序列文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。蛋白质功能域分析 蛋白质功能域分析，是根据目的DNA序列，得到其编码的蛋白质的可能序列，再将该蛋白质序列与已知的蛋白质库中的序列进行比对，分析其可能为何种蛋白质，则目的DNA序列就是编码该蛋白质的基因。操作时，我们用NCBI的ORF Finder工具进行了DNA序列到氨基酸序列的转化，又用protein blast对氨基酸序列进行了分析。文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。检索结果文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。谢谢谢谢!