EASYspin Plus 植物RNA快速提取试剂盒操作方法及步骤说明书

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资源描述
版本号:160120EASYspin Plus Plant RNA KitEASYspin Plus植物RNA快速提取试剂盒目录号:RN38 适用范围:适用于快速提取植物组织细胞总RNA,使用独有基因组DNA清除柱技术可有效清除电泳可见gDNA残留,RNA可用于反转录PCR,荧光定量PCR等。 试剂盒组成、储存、稳定性:试剂盒组成保存50 次(RN3802)裂解液RLT室温50 ml裂解液CLB室温8 ml裂解液RLT Plus室温25 ml去蛋白液RW1室温40 ml漂洗液 RW室温10 ml第一次使用前按说明加指定量乙醇RNase-free H2)室温10 mlPLANTaid室温5 ml基因组DNA清除柱和收隼管室温50套RNase-free吸附柱RA和收集管室温50套本试剂盒在室温储存 12 个月不影响使用效果。储存事项:1. 不合适的储存于低温(4C或者一20C )会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运 输和储存均在室温下(15C25C)进行。2. 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时 盖紧盖子。 注意事项1. 所有的离心步骤均可在室温完成(4C离心也可以),使用转速可以达到13,000 rpm 的传统台式离心机,如Eppendorf 5415C或者类似离心机。2. 需要自备乙醇,研钵(可选)。3. 样品处理量绝对不要超过基因组清除柱DA和和RNA吸附柱RA处理能力,否则造 成DNA残留或产量降低。开始摸索实验条件时,如果不清楚样品DNA/RNA含量 时可使用较少的样品处理量,将来根据样品试验情况增加或者减少处理量。4. 裂解液RLT和RLTPlus和去蛋白液RW1中含有刺激性化合物,操作时戴乳胶手 套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理 盐水冲洗。5. 关于DNA的微量残留:一般说来任何总 RNA 提取试剂在提取过程中无法完全避免 DNA 的微量残留(DNase消化也无法做到100%无残留),本公司的EASYspin Plus RNA提取产品, 由于采取了本公司独特的缓冲体系和基因组DNA清除柱技术,绝大多数DNA已 经被清除,不需要DNase消化,可直接用于反转录PCR和荧光定量PCR。个别 特殊情况如DNA含量过于丰富造成残留或者要进行严格的mRNA表达量分析荧 光定量PCR,我们建议在进行模板和引物的选择时:1)选用跨内含子的引物,以穿过mRNA中的连接区,这样DNA就不能作为模板参与 扩增反应。2)选择基因组DNA和cDNA上扩增的产物大小不一样的引物对。3)将RNA提取物用RNase-free的DNase I处理。本试剂盒还可以用于DNase I处理后 的RNA清洁(cleanup),请联系我们索取具体操作说明书。4)在步骤去蛋白液RW1漂洗前,直接在吸附柱RA上进行DNase I柱上消化处理。购 买DNA酶柱上消化试剂盒(货号:RN34)前可先索取具体操作说明书。6. 仔细阅读补充说明2,如果裂解液CLB效果好,可以联系我们单独订购裂解液 CLB。以后可直接订购RN53 EASYspin Plus多糖多酚复杂植物RNA快速提取试 剂盒。 操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)提示:第一次使用前请先在漂洗液RW瓶加入指定量无水乙醇!1. 直接研磨法(提取简单植物样品推荐此法,但是简单样品也可以用液氮研磨法):a. 新鲜植物组织称重后取lOOmg迅速剪成小块放入研钵(冰冻保存或者液氮保 存样品可直接称重后取lOOmg放入研钵),加入10体积(1ml) RLT和1体积(100回)PLANTaid室温下充分研磨成匀浆,注意应该迅速研磨让组织和裂解 液RLT立刻充分接触以抑制RNA酶活性。注:PLANTaid是提取多糖多酚次级代谢产物色素含量丰富的困难样品不可缺少 成分。b. 将裂解物转入离心管,剧烈摇晃振荡15秒,13, OOOrpm离心5-10分钟,沉 淀不能裂解的碎片和结合有多糖多酚的 PLANTaid。c. 取4800裂解物上清(在不超过基因组DNA清除柱能力的情况下可以取更多 的上清,这样可以提高产量)转到一个新离心管。加入上清体积一半的无水乙醇 (0.5 体积),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。d. 立刻接操作步骤的步骤 3。2. 液氮研磨法(提取复杂,易降解样品时推荐此法) :a. 取500皿裂解液RLT,转入1.5ml离心管中,加入50皿PLANTaid混匀备用。b. 液氮中研磨适量植物组织成细粉后,取 50mg 细粉转入上述装有 RLT 和 PLANTaid的离心管,立即用手剧烈振荡20秒,充分裂解。c. 用吸头吹打混匀帮助裂解或者剧烈涡旋震荡直到得到满意匀浆结果 (或者电 动匀浆30秒),可以剪切DNA,降低粘稠度和提高产量。d. 将裂解物13,000 rpm离心5-10分钟,沉淀不能裂解的碎片和结合有多糖多酚 的 PLANTaid。e. 取裂解物上清(在不超过基因组 DNA 清除柱能力的情况下可以取更多的上清,这样可以提高产量) 转到一个新离心管。加入上清体积一半的无水乙醇(0.5 体积),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。f. 立刻接操作步骤的步骤 3。注意:以上液氮研磨法用户可以根据需要加倍处理,可以提高产量。也就是使用1ml的裂解液RLT和lOOpl PLANTaid和100mg的样品。3. 将混合物(每次小于720皿,多可以分两次加入)加入一个基因组清除柱中,(清除 柱放入收集管中)13,000 rpm离心2分钟,弃掉废液。确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心 时间。4. 将基因组DNA清除柱子放在一个干净2ml离心管内(不用RNAse free或者DEPC 处理,一般干净的新离心管即可。也可使用RNA吸附柱配套的新的干净收集管), 在基因组清除柱内加500皿裂解液RLTPlus,13,000 rpm离心30秒,收集滤液(RNA在滤液中),用微量移液器较精确估计滤过液体积(通常为450-500M左 右,滤过时候损失体积应该减去),加入0.5 倍体积的无水乙醇,此时可能出现沉 淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。5. 立刻将混合物(每次小于720皿,多可以分两次加入)加入一个吸附柱RA中,(吸 附柱放入收集管中)13,000 rpm离心2分钟,弃掉废液。确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心 时间。6. 加700皿去蛋白液RW1,室温放置1分钟,13,000rpm离心30秒,弃掉废液。7. 加入500皿漂洗液RW(请先检查是否已加入无水乙醇!)13,000 rpm离心30秒, 弃掉废液。加入500皿漂洗液RW,重复一遍。8. 将吸附柱RA放回空收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免 漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。9. 取出吸附柱RA,放入一个RNase free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的 中间部位加30-50皿RNase free water (事先在70-90C水浴中加热可提高产量), 室温放置1分钟, 12,000 rpm 离心1分钟。10. 如果预期RNA产量30昭,加30-50皿RNase free water重复步骤9,合并两次洗 液,或者使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍 (如果需要 RNA 浓度 高)。洗脱两遍的 RNA 洗脱液浓度高 ,分两次洗脱合并洗脱液的 RNA 产量比前者高 15 30%,但是浓度要低,用户根据需要选择。补充说明 1:一般植物种类非常复杂,不同的植物种类和部位的样品使用本试剂盒(RN38 EASYspin Plus植物RNA快速提取试剂盒)效果不同。部分的样品在经过基因 组DNA清除柱清除残留DNA的同时可能会严重降低产量。该种情况下,建议客户可 以尝试按照RN09 EASYspin植物RNA快速提取试剂盒的操作步骤进行提取。略去基 因组DNA清除柱子的步骤。RN09和RN38相比少一个基因组DNA清除柱的步骤, 部分情况下可能会提高产量。如果RN09提高产量的同时DNA残留也增多的情况下, 客户可以根据实验需要加一个DNA酶柱上消化的步骤(货号:RN34)来清除残留DNA 或者用传统的DNA酶消化来清除DNA残留。附录1: RN09 EASYspin植物RNA快速提取试剂盒操作步骤RN09 EASYspin植物RNA快速提取试剂盒和RN38 EASYspin Plus植物RNA快 速提取试剂盒的操作完全相同,就是省略了步骤3和4,在步骤1和2后直接接步骤5。 也可以找我们索取RN09 EASYspin植物RNA快速提取试剂盒详细说明书或者公司的补充说明2:有一些特别复杂的样品使用裂解液RLT提取失败或者产量很低想提高产 量的情况下,可以尝试使用裂解液CLB,裂解液CLB是本公司最新研发配方,测试 的松针、丹参叶、胡杨叶、番茄叶表明可以提高产量一倍甚至数倍。附录2: RN38 EASYspin Plus植物RNA快速提取试剂盒使用新裂解液CLB操作步骤O 第一次使用前请先在漂洗液RW瓶加入指定量无水乙醇!O 取lml裂解液CLB至离心管内(如果CLB有析出或者沉淀需先置于65 C水浴重 新溶解),在裂解液CLB中加入5%卩-巯基乙醇(1ml CLB加50皿卩-巯基乙醇)。 颠倒混匀后65 C水浴中预热。1. 液氮中研磨新鲜或-70 C 冷冻的材料至细粉。2. 转移100-150mg细粉(水分少的样品如种子叶片等可加100mg,水分多的样品如 西瓜可多加一些)加至预热的裂解液CLB (已加有B-巯基乙醇)离心管中,立即 激烈涡旋3060秒或者用吸头吹打混匀裂解,短时放回65 C水浴中(5 min-10 min,时间稍长一点10分钟产量可能提高一些),中间偶尔颠倒1-2次帮助裂解。B-巯基乙醇是裂解液CLB的关键成分,必要的时候可以提高终浓度到10-20%。3. 振荡混匀后室温13,000rpm离心10分钟。4. 取裂解物上清(在不超过基因组 DNA 清除柱能力的情况下可以取更多的上清, 这样可以提高产量)转到一个新离心管。加入上清体积一半的无水乙醇(0.5体积), 此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。 若上清表面有漂浮物,用吸头挑开吸取下面液体即可。5. 立刻接操作步骤的步骤3。附录3:使用RN38 EASYspin Plus植物RNA快速提取试剂盒和RN09 EASYspin植物RNA快速提取试剂盒发表的部分文章已经超过130篇:1. 桃 果实、花 、根、 叶: Isolation, characterisation and phylogenetic analysis of resistance gene analogues in a wild species of peach (Prunus kansuensis).Canadian Journal of Plant Science, 2011, 91(6): 961-9702. 樱桃花、叶、颚等各部位: Over-expression of the PaAP1 gene from sweet cherry (Prunus avium L.) causes early floweri.Journal of Plant Physiology, 2012,Available online 1 December 20123. 洋葱根、茎、蕾、叶、雌雄蕊等各部位:Cloning and Expression Analysis of A Putative B Class MADS-box Gene of AcPI in Onion. Scientia Agricultura Sinica, 2012, 45(23):4759-47694. 芜 菁 : Isolation and Functional Characterisation of the Genes Encoding8-SphingolipidDesaturase from Brassica rapa. Journal of Genetics and Genomics Volume39, Issue 1, January 2012, Pages 47-595. 芜 菁 1 : EXPRESSION, DIVERGENCE AND EVOLUTION OF THE CALEOSIN GENE FAMILY IN BRASSICA RAPA. Arch. Biol. Sci., Belgrade, 65 (3), 863-876, 2013 DOI:10.2298/ABS1303863H6. 番茄叶: Effect of Low Temperature Stress on the Expression of ProDH Gene and the Activities of the Proline Dehydrogenase in Leaves of Tomato Seedling. Chinese Agricultural Science Bulletin 2012,28(10):132-1357. 栀 子 叶 : Isolation of High Quality Total RNA from Gardenia jasminoides Eills.Chinese Agricultural Science Bulletin.2012, 28(27):194-1988. 油 桐 果 实 : Cui Qinqin, Han Xiaojiao, Chen Yicun, Zhan Zhiyong, Lin Liyuan, Wang Yangdong. Isolation and Expression Characteristics of Biotin Carboxyl Carrier Protein Coding Gene(VfBCCP) from Vernicia fordii.SCIENTIA SILVAE SINICAE. 2012, 48(8): Available online August9. 油桐果实 1 : Selection of Reliable Reference Genes for Gene Expression Studies Using Real-Time PCR in Tung Tree during Seed Development. PLoS ONE, 2012, 7(8): e4308410. 紫 菜 : Molecular cloning and expression analysis of ribosomal protein S7 gene from Porphyra haitanensis. JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA, 2011, 35(12): 1814-182111. 石 斛 : Molecular characterization of a mitogen-activated protein kinase gene DoMPK1 in Dendrobium officinale. Acta Pharmaceutica Sinica, 2012, 47 (12): 1703-170912. 石斛 1 : ESTs Analysis Reveals Putative Genes Involved in Symbiotic Seed Germination in Dendrobium officinale. Symbiotic Germination Genes in D. officinale. August 2013 | Volume 8 | Issue 8 | e7270513. 大豆: RNA-seq Analysis Reveals Ethylene-Mediated Reproductive Organ Development and Abscission in Soybean(Glycine max L. Merr.). Plant Mol Biol Rep, 2012, published online: 4 Dec, 201214. 大豆 1 : Construction of ethylene regulatory network based on the phytohormones related gene transcriptome profiling and prediction of transcription factor activities in soybean. Acta Physiol Plant, 2012, published online: 12 Dec, 201215. 红花玉兰: Expression Analysis of MAwuAG in Different Organs and Developmental Stages of Magnolia wufengensis. Chinese Bulletin of Botany, 2013, 48 (2): 1-516. 毛桃: Cloning and Phylogeny Analysis of PpAP2 Floral Homologous Genes in Peach. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2013, 29(7): 99-10417. 五倍子: Cloning and characterisation of a phenylalanine ammonia-lyase gene from Rhus chinensis. Plant Cell Rep, 2013, published online:15 March, 201318. :五倍子 1:Cloning, characterization and expression of chalcone synthase from medicinal plant Rhus chinensis.J. Plant Biochem. Biotechnol. DOI 10.1007/s13562-013-0231-919. 青杄 :cDNA Cloning and Bioinformatic Analysis of the sPPa1 Gene form Picea wilsonii. Plant Science Journal, 2012, 30(40): 394-40120. 青杄 1:cDNA Cloning and Bioinformatic Analysis of PsbO Gene from Picea wilsonii.Life Science Research, 2012, 16(3): 201-20621. 青杄 2:Cloning and Tissue Expression Analysis of PwPSAF in Picea wilsonii. SCIENTIA SILVAE SINICAE. Vol. 49,No. 10, Oct. 2013.22. 洋葱:Molecular Cloning and Transcriptional Analysis of the Putative AGAMOUS Homolog AcAG in Onion (Allium cepa. Plant Mol Biol Rep, DOI 10.1007/s11105-013-0607-y23. 木瓜: XsFAD2 gene encodes the enzyme responsible for the high linoleic acid content in oil accumulated in Xanthoceras sorbifolia seeds. JOURNAL ARTICLE. 2013-6-17.24. 木瓜 1: Two novel diacylglycerol acyltransferase genes from Xanthoceras 2 sorbifolia are responsible for its seed oil content. GENE-38688; No. of pages: 9; 4C:25. 柑橘: Efficient auto-excision of a selectable marker gene from transgenic citrus by combining the Cre/loxP system and ipt selection. Plant Cell Rep, DOI 10.1007/s00299-013-1470-x26. 柑橘 1: Expression Analysis of Three Phloem-specific Promoters in Transgenic Poncirus trifoliata. Acta Horticulturae Sinica. 2014, 41(1): 1-8.27. 柑橘 2: Activation of three pathogen-inducible promoters in transgenic citrus (Citrus sinensis Osbeck) after Xanthomonas axonopodis pv. citri infection and wounding. Plant Cell Tiss Organ Cult. DOI 10.1007/s11240-013-0423-y.28. 茶梅花瓣: Comparison and Analysis of Methods of Extracting Total RNA from Petals of Camellia sasanqua. Chinese Agricultural Science Bulletin.2013,29(28):129-133.29. 栀子: Isolation of High Quality Total RNA fromGardenia jasminoides Eills. Chinese Agricultural Science Bulletin. 2012, 28(27):194-19830. 丹参: Genome-wide analysis and molecular dissection of the SPL gene family in Salvia miltiorrhiza. 2014 Jan;56(1):38-50. doi: 10.1111/jipb.12111. Epub 2013 Nov 20.31. 牡丹: Transcriptome Comparison Reveals Key Candidate Genes Responsible for the Unusual Reblooming Trait in Tree Peonies. Genes Responsible for Reblooming in Tree Peonies. November 2013 | Volume 8 | Issue 11 | e7999632. 东南景天: Role of sulfur assimilation pathway in cadmium hyperaccumulation by Sedum alfredii Hance. Ecotoxicology and Environmental Safety.Volume 100, February 2014, Pages 159-165.33. 山苍子: Identification of appropriate reference genes for normalizing transcript expression by quantitative real time PCR in Litsea cubeba. TECHNICAL NOTE. Mol Genet Genomics (2013) 288:727-737, DOI 10.1007/s00438-013-0785-134. 木本植物: Heterologous gene silencing induced by tobacco rattle virus (TRV) is efficient for pursuing functional genomics studies in woody plants. ORIGINAL PAPER. Plant Cell Tiss Organ Cult, DOI 10.1007/s11240-013-0393-035. 棉花: Analysis of sea-island cotton and upland cotton in response to Verticillium dahliae infection by RNA sequencing. Sun et al. BMC Genomics 2013, 14:852 /1471-2164/14/852.36. 桃子:Biochemical changes and defence responses during the development of peach gummosis caused by Lasiodiplodia theobromae. Eur J Plant Pathol (2014) 138:195-207, DOI 10.1007/s10658-013-0322-4.37. 桃 子 1 : Carbohydrate metabolism changes in Prunus persica gummosis infected withLasiodiplodia theobromae. PhytopathologyFirstLook paper http:/dx.doi.org/10.1094/PHYTO-01-13-0025-R posted 11/27/2013.38. 海棠: The Malus crabapple transcription factor McMYB10 regulatesanthocyanin biosynthesis during petal coloration. Scientia Horticulturae 166 (2014) 42-49.39. 海藻: A rapid and sensitive method for field detection of Prorocentrum donghaiense using reverse transcription-coupled loop-mediated isothermal amplification. Harmful Algae 29 (2013) 31-39(. 篇 幅有限,以下仅列出植物种类名称,发表文章全文可联系我们索取: 40 油茶,41 亚洲百合,42 毛 泡桐,43人参,,44雪莲,45柑橘3,46菊花,47荞麦和拟南芥,48油松,49玫瑰花,50棉花 和拟南芥,51 棉花和拟南芥1 ,52白杨,53毛果杨,54葛根,55百合,56百合1 ,57黄鹌菜, 58棉花1 ,59苹果,60毛果杨)
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