生物工程生物技术专业英语课文翻译

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.第一章导论1.1 生物工程的特征生物工程是属于应用生物科学和技术的一个领域,它包含生物或其亚细胞组分在制造业、效劳业和环境管理等方面的应用。生物技术利用病毒、酵母、真菌、藻类、植物细胞或者哺乳动物培养细胞作为工业化处理的组成局部。只有将微生物学、生物化学、遗传学、分子生物学、化学和化学工程等多种学科和技术结合起来,生物工程的应用才能获得成功。生物工程过程一般包括细胞或菌体的生产和实现所期望的化学改造。后者进一步分为:(a) 终产物的构建 例如,酶,抗生素、有机酸、甾类;(b) 初始原料的降解例如,污水处理、工业垃圾的降解或者石油泄漏。生物工程过程中的反响可能是分解代谢反响,其中复合物被分解为简单物质葡萄糖分解代谢为乙醇,又或者可能是合成代谢反响或生物合成过程 ,经过这样的方式,简单分子被组建为较复杂的物质抗生素的合成。分解代谢反响常常是放能反响过程,相反的,合成代谢反响为吸能过程。生物工程包括发酵工程X围从啤酒、葡萄酒到面包、奶酪、抗生素和疫苗的生产,水与废品的处理、某些食品生产以及从生物治疗到从低级矿石种进展金属回收这些新增领域。正是由于生物工程技术的应用多样性,它对工业生产有着重要的影响,而且,从理论上而言,几乎所有的生物材料都可以通过生物技术的方法进展生产。据预测,到2000年,生物技术产品未来市场潜力近650亿美元。但也应理解,还会有很多重要的新的生物产品仍将以化学方法,按现有的生物分子模型进展合成,例如,以干扰为根底的新药。因此,生命科学与化学之间的联系以及其与生物工程之间的关系更应阐释。生物工程所采用的大局部技术相对于传统工业生产更经济,耗能低且更加平安,而且,对于大局部处理过程,其生产废料是经过生物降解的,无毒害。从长远角度来看,生物工程为解决世界性难题提供了一种方法,尤其是那些有关于医学、食品生产、污染控制和新能源开发方面的问题。1.2 生物工程的开展历史与一般所理解的生物工程是一门新学科不同的是,而是认为在现实中可以探寻其开展历史。事实上,在现代生物技术体系中,生物工程的开展经历了四个主要的开展阶段。食品与饮料的生物技术生产 众所周知,像烤面包、啤酒与葡萄酒酿造已经有几千年的历史;当人们从创世纪中认识葡萄酒的时候,公元前6000,苏美尔人与巴比伦人就喝上了啤酒;公元前4000,古埃及人就开场烤发酵面包。直到17世纪,经过列文虎克的系统阐述,人们才认识到,这些生物过程都是由有生命的生物体,酵母所影响的。对这些小生物发酵能力的最确凿的证明来自1857-1876年巴斯得所进展的开创性研究,他被认为是生物工程的始祖。其他基于微生物的过程,像奶制品的发酵生产如干酪和酸乳酪及各种新食品的生产如酱油和豆豉等都同样有着悠久的开展历史。就连蘑菇培养在日本也有几百年的历史了,有300年历史的Agarius蘑菇现在在温带已经有广泛养殖。所不能确定的是,这些微生物活动是偶然的发现还是通过直观实验所观察到的,但是,它们的后继开展成为了人类利用生物体重要的生命活动来满足自身需求的早期例证。最近,这样的生物过程更加依赖于先进的技术,它们对于世界经济的奉献已远远超出了它们缺乏为道的起源。有菌条件下的生物技术 19世纪末,经过生物发酵而生产的很多的重要工业化合物如乙醇、乙酸、有机酸、丁醇和丙酮被释放到环境中;对污染微生物的控制通过慎重的生态环境操作来进展,而不是通过复杂的工程技术操作。尽管如此,随着石油时代的降临,这些化合物可从石油生产的副产品中以低本钱进展生产,因此,进展这类化合物生产的工业就处于岌岌可危的境地。近年来,石油价格的上涨导致了对这些早期发酵工艺的重新审视,与前面所讲的食品发酵技术相比,这类发酵工艺相对简单而且可进展大规模操作生产。其它关于有菌生物技术的典型例子有废水处理和都市固体垃圾堆肥。长期以来,人们利用微生物来分解和去除生活污水中的有毒物质,及像化工业产生的小局部工业毒害垃圾。目前世界上进展的发酵工程中,利用生物工程进展污水处理的规模是最大的。将无菌消毒技术引入生物工程 20世纪40年代,由于大规模微生物培养这个复杂的生物技术的引入,生物工程的开展开场了新的方向,从而确保那些需要将污染微生物排除的特殊生物过程得以进展。因此,通过对培养基和生物反响器的提前灭菌消毒以及用来消除新进入的污染物的工程供给,生物反响中就只留有所选的生物催化剂。诸如此类,在生物工程中占有极大份额的产品有抗生素、氨基酸、有机酸、酶、多糖和疫苗。大局部这样的过程是复杂的,本钱昂贵,仅适于高附加值产品的生产,尽管这类产品的产量较大,但采用食品与酿造生产中较老的生物技术,它们的规模与商业回报都是很小的。生物工程的新领域 在最近的十年里,分子生物学和过程控制取得了长足的开展,不见开创了生物工程应用的新领域,同时还大大提高了已有生物工程工业的效率和经济性。正是由于这些发现和开展,才会有对于未来生物工程在世界经济中所扮演角色的良好评价。(a) 基因工程 对于重要的工业用生物基因组的有性重组或突变操作一直是工业遗传学家革新目录中的组成局部。重组DNA新技术包括温和的进展活细胞破碎、DNA提取、纯化和利用高度专一性的酶进展随后的有选择性切割;对目的基因片断分类、鉴定、筛选和纯化;用化学方法将目的基因连接到载体分子的DNA上及将重组DNA分子导入选择的受体细胞进展增值和细胞合成。重组DNA技术可较简便的进展基因组操作,而且可防止物种间与属间的不相容性。无限可能性是存在的,人类胰岛素与干扰素基因已导入了微生物细胞并进展了表达。原生质融合、多克隆抗体制备和组织培养技术包括从细胞培养上清液中进展植物的再生的广泛应用对生物工程的开展有着深远的影响。(b) 酶工程 酶别离工程一直是许多生物技术过程的组成局部,而且随着允许对生物代谢产物进展重新利用的更适合的固定化技术的开展,它们的代谢产物可被进一步利用。利用固定化细菌的葡萄糖异构酶生产高果糖浆,其开展具有特殊的重要意义年产300万吨。基于生物催化的目的,未来的开展是细胞整体的固定化。(c) 生物化学工程 生物反响器在生物工程过程中扮演了核心角色,它在初始原料或底物与终产物之间建立了联系。生物反响器设计、过程调控技术与发酵过程的计算机监控方面取得了重要进展。尽管如此,许多年来,过程控制在生物工程工业领域中的应用落后其在化学工程工业领域操作中的应用,对生物工程产品新的处理方法下游工程将提高所有处理过程的经济性。因此,对高效回收工艺的设计的需求不断增加,尤其对于具有高价值产品例如L-天冬酰胺酶,其回收与发酵生产的本钱比例约为3.0,而乙醇为0.16。然而,下游处理过程仍是生物工程中被无视的局部。(d) 工程化产品和系统 利用蛋白质和细胞固定化技术可进展如抗体和酶这类生物分子的大量生产,这使应用于生物诊断和生物解毒的新型传感器得到了开展。这样的系统可以与微电子装置和终端计算机相连,从而在很多生物工程工业与效劳业领域进展精细的程序控制。生物工程有两个典型的特点:与实际应用的联系和各学科间的合作。从事生物工程的人员采用的技术来源于化学、微生物学、遗传学、生物化学、化学工程和计算机原理。他们的主要任务是对生物工程进展革新、开展并对过程操作进展优化,其中生化代谢体制有着根本和不可取代的位置。生物工程不是一门新的学科,而是一种实践活动,不同学科的专家学者们都将做出奉献。我们对生命科学与生物工程必须清楚的区分开,生命科学所涉及的是生物知识的获得,而生物工程那么是生物知识的应用。生物工程过程在大多数情况下是低温下操作,耗能少,总体上依赖廉价的原料为底物。不同专业的生命学家和工程师将个人的努力奉献于生物工程,生物工程学家这一术语作为涵盖那些应用自身技能知识进展生物材料处理的科学家或工程师。 然而,这个术语它只能导致混淆,必须停顿采用 。我们比拟一下,一名生化工程师是一名过程工程师,他的职责是将生物学家的知识转移到生产实际操作中去。一名生化工程师应当在生物过程的设计和操作方面受过科学和工程原理的训练。一个完美的生物工程师是不存在的,因为没有一个人同时成为微生物学、生物化学、分子生物学、化学工程等专业的专家。然而,从事这方面工作的人员必须努力去学习了解其他组成学科的语言,不同专业的科学家之间共同语言的缺乏势必会成为完全发挥生物工程潜在价值的主要阻力。1.3 生物工程的应用生物工程过程可在其规模和价值的根底上进展评估。因此,大规模、低价值的产品或效劳包括有水的净化、废水和垃圾处理及甲烷、乙醇、菌体和动物饲料的生产;相对大容量、高价值的中间体产品包括氨基酸与有机酸、食品、面包酵母、丙酮、丁酮和某些多聚物,然而那些小规模、价值高的产品包括抗生素、干扰素、疫苗、单克隆抗体、酶和维生素。从工业开展规模角度进展考虑,而不是单个生产单元大小的角度,现在和未来的生物工程可简单的分为三个领域:(a) 小规模生物工程是专指那些只利用生物学方法就可比拟经济的进展生化产品的生产,这类生物工程开展时间久,并且开展迅速,尤其是新产品领域方面,但他们造成了工业企业与市场开展的严酷竞争。其产品有抗生素、单克隆抗体和干扰素。(b) 中等规模的生物工程与基于石油的技术竞争生产目前的化学原料同时与农业竞争,生产天然产品包括蛋白质和脂肪酸。(c) 大规模的生物工程与石油和煤竞争,提供主要的有化合物原料作为燃料和大量的工业产品。尽管中等和大规模的生物工程技术目前只取得了很小局部的经济效益,但可以确定的是在未来的20年里,将要建立利用植物原料作为原料的大规模微生物处理工程图1.2。针对该类产品的市场已存在,同时也刺激了节约型生物工程的开展。1.4 生物工程的开展未来生物工程的开展在很大程度上取决于以下三个前提:(a) 利用传统工艺与基因工程技术体系,扩大对有价值产品的生产X围。(b) 从再生资源获得粗原料的能力。(c) 要意识到,很多情况下生物工程的处理过程比现有的化学工程处理植物原料更加经济。中等规模与大规模生物工程开展的一个最重要的方面是过程中,适宜原材料与底物的利用率。原料本钱可以占到终产物本钱的30-70%。原料的利用受技术与政治因素的影响。因此,从各种有机原料中生产酒精汽油未能带来可观的经济效益。但从政治角度,可以议价以抵抗不断增长的石油进口。来自农业、林业和工业有机废料的再生资源越来越重要,经过生物工程处理,为食品、畜牧饲料、化学原料试剂的生产提供了政治策略上的重要根底。然而,为了实现这样的目标,不仅需要扩大生物工程工程,而且国家管理方面的工程X围也要扩大。1.5 生物工程的开展策略蓝图每个生物工程方案都一直需要对可利用资源、经济效益与对环境的影响及操作和使用者的安康与平安性进展评价。生物工程如果能够正确地加以设计,就能够在自然资源、人类需求与环境间建立良好的平衡关系。对生物工程开展尤为重要的是,适宜的训练有素的工作队伍的可利用性。必须认识到,生物工程出发点是在校的所有学生,经过有选择的进展技术等级水平培训,就可培养出一支工业与研究中心需要的专家。没有适宜的和经过充分培训的人员,生物工程将无法发挥其潜在价值,特别是只有拥有经过良好培训的工作队伍,高水平的生物工程才能顺利开展。而且,当我们考虑将生物学发现应用于未来工业开展的时候,不能忽略时间的重要性。从一个新的发现到成功生产出商业产品,这中间经过5-20年的时间。因此新的生物技术可望到90年代才能有较大的开展。这些不是试图描述或分析目前生物工程实践中不同的处理过程,而是试图去证实围绕着根本原理的生物技术的核心局部已经得到了开展。1.6 总结 生物工程是将生物体和过程处理应用于制造工业的技术。生物工程涵盖的学科X围广泛,尽管今天,它的实际操作非常复杂,但是许多新的处理过程已经记载在历史的新篇章中。这种特殊的处理过程是经过微生物、植物或动物细胞,或者是它们自身的产物如酶进展催化反响的。生物工程的生物体可被收集,它们可实现化学改造,可作为生物活性分子如酶和单克隆抗体的来源。基因工程技术开辟了应用遗传学的新领域,并未最新工业处理过程的使用创造了时机。例如,利用细菌细胞生产人干扰素。过程控制工程于发酵工程也取得了重要的进展,这将进一步加快生物工业的开展。生物工程就如一个不断扩X和充满机遇的领域,它涉及了许多产业,包括农业、食品与饲料加工业、医药业 、能源与水处理工业。生物工程在新药、激素、疫苗和抗体生产方面,提供廉价可靠的能源以及从长远来看在化学饲料方面、环境控制体系的改良提高与废物管理方面都将扮演重要的角色。生物工程主要以可再生与可回收资源为根底,由于能源愈来愈贵并且供给缺乏,从而它将更好的满足世界的需求。第二章 生长与代谢的生物化学2.1 前言一个微生物以生产另一个微生物为目的。在某些情况下,利用微生物的生物学家们希望这样的情况能够快速频繁的发生。在另外一些产物不是生物体自身的情况下,生物学家必须对它进展操纵使微生物的目标发生变化,这样以来,微生物就要努力的挣脱对它们繁殖能力的限制,生产出生物学家希望得到的产物。生物体的生长过程及其生产出的各种产物与微生物代谢的本质特点是密不可分的。代谢过程是两种互相严密联系又以相反方向进展的活动过程。合成代谢过程主要是细胞物质的生成,不仅包括构成细胞的主要组成物质蛋白质、核酸、脂质、碳水化合物等等,同时也包括它们的前提物质氨基酸、嘌呤与嘧啶、脂肪酸、各种糖与糖苷。合成代谢不是自发进展的,必须由能量所推动 ,对大多数微生物来说,是通过一系列的产能分解代谢过程来供给能量。碳水化合物分解为CO2和水的过程是最为常见的分解代谢反响,然而微生物以这样的方式还能够利用更大X围的复原性含碳化合物。分解代谢与合成代谢所有微生物生物化学的根底,可以从两者的平衡关系或者分别对它们进展讨论。实际中,我们要有效的区分那些需要空气中的氧进展需氧代谢的生物与那些进展厌氧代谢的生物。复原性含碳化合物与O2反响生成水和CO2,这是一个高效的放热反响过程。因此,一个进展需氧代谢的生物要使用一小局部底物进展分解代谢以维持某一水平的合成代谢,即成长过程。对于厌氧型生物,其底物的转化的过程根本上是一个不匀称的反响氧化复原反响,产生很少的能量,因此,大局部底物都要被分解从而维持一定水平的合成代谢。在生物体中这种差异能够明显的表达出来,比方酵母,它属于兼性厌氧生物,即它可在有氧条件下生长也可在无氧环境下生存。需氧酵母使糖以同样的速度转化为CO2和水,相对产生高产量的新酵母。而厌氧条件下,酵母菌生长缓慢,此时酵母被有效的转化为酒精和CO2。2.2 代谢与能量分解代谢与合成代谢间的有效联系在于,各种分解代谢过程促进少量反响物的合成,而后又被用来促进全面的合成代谢反响。在这种重要的中间产物中,其中最为重要的是ATP,其含有生物学家所说的“高能键。在ATP分子中,酐与焦磷酸残基相联。高能键在水解过程中所产生的热量就被用来克制在其形成过程中需要摄入的能量。像ATP这类分子,为细胞提供了流通能量,当将ATP用于生物合成反响时,其水解产物为ADP腺苷二磷酸或者某些时候为AMP腺苷一磷酸:反响式仍含有一个高能键的ADP通过腺苷酸激酶反响也可生成ATP:反响式。磷酸化作用是生物体中普遍的反响,通常由ATP作用而发生。经过磷酸化生成的物质通常比最初的化合物更具有反响活性,用无机磷酸进展磷酸化反响是无法进展的,因为,平衡反响式的相反方向生成大量的水55M。ATP+0.5 ADPATP+ ADP+AMP细胞的“能量状态认为是由占有优势的组分:ATP、ADP、AMP作用形成的。为了给出一个量值,Daniel Atksirson提出了“能荷这个概念,定义一个细胞的能荷为:在“满荷细胞中,仅含有ATP一种腺嘌呤核苷酸,它的能荷值定义为1.0。如果三种核苷酸的量相等,即ATP=ADP=AMP,那么细胞的能荷为0.5。与所有的习惯用法一样,能荷概念的使用是有限制的,没有人能够确定假设一个细胞的能荷是0.7而不是0.8或者0.6到底是什么意思。这个概念没有考虑细胞中核苷酸确实切数量,也没有说明对于单体酶和ATP与其镁复合物之间的显著差异。它也无法解释细菌、酵母菌与霉菌中能荷值的差异。尽管如此,这个概念对于给定的细胞类型如生长期细胞中随后的能量与酶活性的改变来讲是有所帮助的。当细胞迅速生长时,能荷处于最低值;ATP以它重新合成的最快速度被消耗,在生长末期,生长速度开场变慢,相对于ADP和AMP,ATP组分开场增大,因此,能荷值开场增大,当细胞停顿生长时,所有的ADP和AMP都已经转化为ATP,此时能荷值到达最大。2.3 分解代谢途径尽管微生物可以利用不同的含碳化合物进展生长,但我们主要关心的是葡萄糖的代谢,鉴于乙醇和其它C2化合物、烃和脂肪酸、甲烷和甲醇这些物质的不断增长的重要的经济价值。2.3.1 葡萄糖和其它糖几乎在所有的生命细胞中,最重要的两种糖代谢途径是二磷酸己糖途径与一磷酸己糖途径,它们常常同时发生,为合成代谢过程提供重要的联系,它们之间的相互作用受关键控制机制的支配。二磷酸己糖途径常被称为恩伯纳-迈耶霍夫或者糖酵解途径如图2.2所示。这个过程将葡萄糖转化为丙酮酸,碳原子数量无变化,复原2分子NAD+辅酶生成2分子ATP。生成的丙酮酸是合成代谢重要的前提物质的来源,在好氧有机体中,它还是氧化复原反响的底物,而在厌氧有机体中,丙酮酸或者它转化的产物是NADH的氧化剂。一磷酸己糖途径即磷酸戊糖途径如图2.4。作为氧化过程,它将葡萄糖转化为戊糖和CO2,复原2分子NADP+生成NADPH。NAD+ NADP+和NADH/NADPH都是通过H转移而作用,但它们是有差异的;NADH主要在于能量相关的氧化复原反响中发挥作用,而NADPH主要作用于合成代谢过程中的复原反响步骤。经过一系列可逆互变过程,如图2.4所示,磷酸戊糖与其它含有3-7个碳原子的磷酸糖相平衡,并根据环境条件,扮演不同的代谢角色。磷酸丙糖与糖酵解过程中所生成的一样,而且跳过糖酵解途径的cleavage step生成二磷酸己糖;磷酸丁糖是重要的合成代谢生产芳香环氨基酸的前体,而磷酸戊糖也是合成核苷酸所必需的物质。对大多数有机体而言,66-80%的葡萄糖是经过恩伯纳-迈耶霍夫途径进展代谢的,剩下的那么通过磷酸戊糖途径进展代谢。每个代谢途径中碳原子流向的控制点通常是恩伯纳-迈耶霍夫途径中,当6-磷酸果糖被磷酸果糖激酶PFK催化发生磷酸化作用生成1,6-二磷酸果糖时候。这种酶分子组成可以根据细胞所进展的主要代谢情况而对酶活性进展调节:当需要更多能量的时候,PFK的活性就增大;而如果细胞中有足够的能量或者足够的C3代谢产物,那么PFK的活性就降低。这种通过调节催化活性从而对酶进展控制的原那么是很普遍。代谢途径是一直被控制的,对细胞来说,必须协调并最有效的行使它的整体活动。对于PFK的控制通过两种手段。第一,酶的激活。在存在有ATP或ADP时,酶催化反响的速度被增大。因此,当细胞能荷低时,PFK将以高速率催化反响地进展。第二,酶被中间产物一般为磷酸烯醇式丙酮酸或者柠檬酸抑制,从而代谢过程被减缓。因此,如果它们其中的一种不能被有效转化为其它物质的话,就无法使细胞继续进展生长。葡萄糖代谢的其他可控制点根据有机体的不同而不同。但是分解代谢必须尽可能的满足合成代谢的需求。恩伯纳-迈耶霍夫途径与磷酸戊糖循环途径不是葡萄糖仅有的代谢过程,尽管它们是非常普遍的代谢途径。相对于恩伯纳-迈耶霍夫途径,另一种主要的代谢途径是恩特纳道德洛夫途径,见于某些假单孢菌与细菌中,如图2.5所示。磷酸戊糖途径中的酶对C5和C4糖的产生来说仍是必需的,但代谢方向与图2.4中所示的相反。磷酸酮醇酶是另一种较重要的酶,也许比人们一般上了解到的使用X围更加广泛。这类酶不是一个作用于磷酸C5和C6糖,产生乙酰磷酸和3-磷酸甘油醛或者4-磷酸赤藓糖取决于是C5还是C6糖被利用如图2.6。这些酶最早见于进展异型发酵的乳酸杆菌与醋酸杆菌中,它们取代恩伯纳-迈耶霍夫途径而发挥作用。产生的乙酰磷酸可以被转化为乙酰或者乙醇。最近发现在酵母菌中,当大多数酵母以木糖作为单一碳源进展好氧生长时,磷酸酮醇酶是一种诱导酶。木糖经过最初代谢由木糖醇转化为木酮糖,然后以5-磷酸木酮糖进展磷酸酮醇酶反响,如图2.6所示在以利用木糖进展生长的细菌中,有一种异构酶可直接将木糖转化为木酮糖。在这种情况下,C5-磷酸酮醇酶不取代恩伯纳-迈耶霍夫途径而仅仅是为有机体将戊糖转化为C2或者C3单元进展进一步代谢提供一种有效的途径。这类酶从而存在于很多微生物中而不单单是酵母,当利用木糖或其它戊糖进展生长代谢。2.3.2 三羧酸循环目前所讨论的代谢途径其终产物为C3或者C2化合物,称为丙酮酸酯或者乙酰,前者如乙酰CoA是一种硫酯如图2.7,具有酐的反响性脱氢反响活性。丙酮酸酯与乙酰CoA的进一步有氧代谢经过一个循环过程,具有两种作用。它产生的中间产物用来进展生物合成反响,化合物最终被氧化为CO2和水,它将氧化反响与能量转移相联系。乙酰CoA氧化反响循环过程普遍存在于所有好氧细胞中被称为三羧酸循环,克雷布斯循环。在真核生物细胞中,三羧酸循环与产生能量的反响是在线粒体内完成的,而在细菌体内,产生能量的酶位于细胞质膜上。由于线粒体内的代谢过程首先七十于将丙酮酸转运到线粒体中,从而更容易的使丙酮酸进展三羧酸循环反响。丙酮酸转化为乙酰CoA的整个过程是由一种多酶复合物所催化的,丙酮酸脱氢酶。乙酰CoA接下来通过图2.8所示的三羧酸循环反响而代谢。这个循环的作用包括:(i) 生产可用于其它生物合成途径的中间产物例如:天冬氨酸与谷氨酸反响是非常重要的代谢途径,细胞通过该途径同化氨。(ii) 从氧化反响中回收能量。异柠檬酸脱氢酶、-酮戊二酸脱氢酶、琥珀酸脱氢酶和苹果酸脱氢酶这些酶催化中间产物的进一步氧化反响,同时辅酶有氧化型转为复原型。辅酶INAD+和FAD分别转变为NADH和FADH.,然后又经氧化磷酸化作用重新氧化为最初形式的辅酶,每摩尔NADH产生3摩尔ATP,而摩尔FADH2产生2摩尔ATP。琥珀酸激酶反响也可获得能量。尽管这种循环自身是永不停顿的,一旦从草酰乙酸启动将不断进展下去,但实际上这种情况是不存在的。就像已经说明的那样,这个循环同时为生物合成反响储藏中间产物,一旦任何一种中间产物从循环中被除去,草酰乙酸与柠檬酸的合成就无法进展。因此,额外的草酰乙酸就必须独立自主的合成,这主要通过丙酮酸的羧化作用。这个反响由丙酮酸羧化酶催化,但是由于经过循环反响过程也合成了草酰乙酸,因此,必须对丙酮酸的羧化反响进展调控,以使得乙酰CoA于草酰乙酸的含量保持均等,主要通过丙酮酸羧化酶实现对它的控制。乙酰CoA是丙酮酸羧化酶的正效应物,也就是说它可以提高酶的活性。乙酰CoA含量越高,草酰乙酸的合成速度就越快。当草酰乙酸与乙酰CoA合成了柠檬酸,乙酰CoA的浓度就减少;丙酮酸羧化酶的活性随之下降,但由于丙酮酸脱氢酶仍旧存在,将会产生更多的乙酰CoA。这样,柠檬酸合成不仅不会停顿,这两个物质也使柠檬酸的前提物质始终保持平衡。其它辅助控制也能实现对循环过程的调节,其中的有些酶的活性受ATP抑制,而有些那么受到AMP浓度的影响。因此,循环反响过程可以通过ATP与AMP相应的比例来进展调控,也就是细胞的能荷。这种控制机制没有广泛采用,但对于单个有机体或一群有机体是被证实的,在这里不详细讨论,但控制机制的普遍原那么如对糖酵解过程的控制仍被应用。2.3.3 乙醛酸途径以C2化合物为碳源如果一个有机体利用C2化合物或者脂肪酸或烃进展生长,那么产物主要为C2单元,三羧酸循环不能完全满足有机体的生长代谢,像前面内容中所讲过的,任何用来进展合成代谢的化合物,一旦在三羧酸循环中缺少,那么草酰乙酸的生成便会停顿,由于C2化合物不能转化为丙酮酸丙酮酸脱氢酶的反响是不可逆反响,因此,没有一种途径可将草酰乙酸或者更准确地说是任何一种C4化合物通过目前已经所述的反响由C2化合物合成。如果被作为碳源而利用,乙酰CoA可直接由乙酰生成,或者来源于复原性比乙酰更强的C2化合物,如乙醛或者乙醇。通过的乙醛酸途径如图2.9,乙酰转化为C4化合物,这个过程需要用到在三羧酸循环中作用的酶:异柠檬酸裂解酶与苹果酸合成酶。两种酶都是可被诱导的,当微生物利用C2化合物生长代谢;在这样的生长条件下,酶的活性可提高到20-50倍。乙醛酸途径不会取代三羧酸循环;例如:必须合成-酮戊二酸用来为蛋白质的合成提供谷氨酸等。琥珀酸、柠檬酸裂解酶的另一个产物,同以前代谢生产的产物一样为苹果酸,然后是草酰乙酸。因此, 经过乙醛酸循环,C4化合物就由C2单元进展合成,然后用来合成所有的细胞代谢物。它们转化为糖的过程在2.4局部中详细介绍。2.3.4 脂肪酸和烃 利用烃进展生长的情况并不多见,但却见于细菌、酵母和霉菌中,这种利用脂肪酸或油和脂肪这种含有脂肪酸的物质进展代谢的现象是比拟常见的。烃类可作为生产单细胞蛋白的唯一碳源,也可用于其它代谢过程,如柠檬酸的生产。常在抗生素生产中参加脂肪酸和植物油作为辅料。为了利用油和脂肪,有机体必须用脂肪酶水解细胞内或细胞外酯键,而生成3摩尔游离脂肪酸和1墨尔甘油;甘油在恩伯纳迈耶霍夫途径中被利用,很多微生物也可利用游离脂肪酸,但无论这类酸是被摄入到细胞内还是就此形成,它们都是剧毒性的由于它们具有外表活性剂的性质从而必须立刻转化为其辅酶A的硫酯形式。硫酯又经过如图2.10的循环过程活化,用来降解脂肪链。每轮循环,都将产生1摩尔乙酰CoA,与此同时,其链上少了2个碳原子的酯酰基CoA又开场了新一轮的氧化循环。这个过程即为-氧化循环,它将一直持续到反响终产物为C4化合物,乙酰乙酰CoA,此时产生2摩尔的乙酰CoA。如果脂肪酸含有的碳原子数为奇数,那么该降解过程不断延续直到生成丙酸CoA,它将通过2.7.3局部中所讲反响的可逆反响转化为丙酮酸。微生物利用烷烃进展生长通常由攻击两个甲基基团中的一个而开场,利用这种攻击机制,烷烃羟化酶包含氧分子和含铁的氧化辅因子,这个辅因子是经氧化的,而它的复原型重新生成过程最终与氢化物载体相关,或者是NADH或者是NADPH。经过两部脱氢作用,脂肪醇被氧化为相应的脂肪酸:反响式一般来说,所有的参与烷烃降解作用的酶都具有底物专一性,而且容易与C10-C18的底物起作用。某些微生物可作用于更短或更长的链。少数情况下,对烷烃作用后生成甲基酮,它最终经过进一步氧化被裂解为甲酸和比初始烷烃少2个碳原子的脂肪酸。尽管在某些有机体中,存在一种产生二羧酸的-氧化,但烷烃一般上都是经过-氧化循环而被降解为脂肪酸,这些脂肪酸又从一个终点开场,经过-氧化而降解。脂肪酸也被细胞用来直接合成自身脂肪,因此,细胞中脂肪酸链的长度就代表了烷烃链的长度。烷烃和某些支链烃也可能进展代谢;它们不是从商业角度进展利用而是作为饲料中的微小局部。它们的氧化反响过程同样涉及转化为脂肪酸的过程。2.3.5 甲烷和甲醇少数细菌和酵母被称为甲基营养菌的微生物能够利用甲醇作为唯一的碳源;到目前为止,只发现一小局部细菌具有利用甲烷的能力,称为甲烷营养菌。极少数微生物能利用甲酸为碳源。这三种化合物的代谢是相关的,被最终氧化为CO2,它们合成细胞物质的机制与自养CO2固定化作用机制是不同的。能够利用CO2作为唯一碳源的包括进展光合作用的植物与微生物和很少一局部无机化能营养型细菌,其是利用无机化合物的反响作为能量的来源。这些生物目前在生物工程中的应用较少。假设想进一步了解CO2自养固定化的读者可参阅任何一本生物化学课本,但必须注意到,至少有两种不同的代谢途径:卡尔文循环和复原性羧酸循环。甲烷的氧化过程为:反响式第一步是通过一种氧合酶与NADH或NADPH辅因子来进展,与上述高级烷烃的氧化相比拟。氧合酶3种蛋白质复合物也可以氧化其它多种化合物,包括多种烷烃甚至甲醇本身。接下来的第二步反响由甲醇脱氢酶催化,以一种新发现的物质吡咯并喹啉醌为辅因子。在某些细菌中,甲醛进一步转化为甲酸的过程被同种酶催化;而在另一些细菌中,有一种独立作用的甲酸脱氢酶,NAD是它的辅因子。最后一步反响是将甲酸转化为CO2,它是通过甲酸脱氢酶来催化进展的,伴有NAD+的复原过程。来自甲醇或甲烷中的碳同化为细胞物质甲醛,经过两种独立的代谢途径:一磷酸核酮糖循环和丝氨酸途径,分别如图2.11和2.12所示。单磷酸核酮糖循环与卡尔文循环相似,都是通过磷酸戊糖途径的反响进展CO2自养固定化而生成以后的C1化合物受体,只多了两种酶:磷酸己糖合成酶和3-磷酸己糖异构酶。丝氨酸途径中的关键酶是:生成乙酰CoA和甘油的苹果酰CoA以及丝氨酸转甲基酶,这是一种广泛存在的酶,作用于四氢叶酸四氢叶酸是一种辅因子,可形成必需的活化C1中间产物,N10-甲酰四氢叶酸,而后乙醛酸途径利用乙酰CoA。所以细胞就可在C2底物上进展生长。异柠檬酸裂解酶去阻遏从而确保C3单元的生成。酵母中,磷酸戊糖循环又进一步发生了一些变化,甲醛与5-磷酸木酮糖反响生成了3-磷酸甘油醛和2-羟基丙酮。此反响过程由转酮酶催化,完成甲醛循化同化过程唯一需要另外参加的酶是一种新的激酶,它将二羟基丙酮转化为二羟基磷酸丙酮。2.4 葡糖异生作用当一个有机体利用C2和C3化合物进展生长,或者利用经过代谢过程能够生成C2或C3这种化合物的物质进展生长的时候,在丙酮酸的代谢水平或者低于该水平例如脂肪烃、乙酸、乙醇或者乳酸,对有机体来说,就必须合成各种糖类以满足其代谢需求。这被称为葡糖异生作用。尽管糖酵解途径中的大局部反响都是可逆的,但那些被丙酮酸激酶和磷酸果糖激酶催化地反响那么是不可逆的,对细胞来说,就要避开这种阻碍。一般而言,磷酸烯醇式丙酮酸不能由丙酮酸形成,尽管在少数有机体内存在一种磷酸烯醇式丙酮酸合成酶可以催化这个反响。通常,草酰乙酸作为磷酸烯醇式丙酮酸的前体物质。这个反响由磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶催化进展,它是葡糖异生作用中的关键酶。已经讲过草酰乙酸的生成,果糖二磷酸化酶的作用可避开磷酸果糖激酶的不可逆作用的性质其作用产生1,6-二磷酸果糖。从这一点来看,通过终止糖酵解途径可积累己糖,通过磷酸戊糖循环又可生成C3和C4糖,葡萄糖不是葡糖异生作用的终产物, 然而6-磷酸葡萄糖被用来合成细胞壁组分,和各种细胞外物质及储藏多糖。2.5 好氧生物的能量代谢在葡萄糖代谢和三羧酸循环中已经讲过,如何把各种代谢中间产物的氧化过程与辅因子NAD+、NADP+、FAD+复原为其复原型NADH、NADPH、FADH的复原反响过程联系起来的。这些产物的复原性是由一系列复杂的反响过程而是释放。这个反响过程最终与空气中氧气的复原相关。在这个反响过程中,由电子传递上的ATP或者2-3个具体位点上的无机磷而生成ATP,这取决于最初复原剂的性质。如图2.14,总反响式如下:。每摩尔葡萄糖经过恩伯纳-迈耶霍夫途径所生成的ATP和丙酮酸经三羧酸循环产生的ATP总结于表2.1。能够被生物利用的ATP形式的能量是在膜上产生的,可以是真核细胞的线粒体膜或者是细菌细胞的细胞质膜,其产生过程大致一样。具体差异根据个体差异而不同。电子传递链的主要成分是黄素蛋白,醌和细胞色素。细胞色素具有复原性承受氢离子或者电子,经过氧化可以有效释放电子到下一个载体上。每个载体都有不同的氧化-复原能,大约可以从NADH/NAD+反响的320摩尔到1/2O2/H2O终反响的800mV。在电子传递链上的特定位点,两个相邻电子载体的氧化-复原能差就已足够进展可逆反响:。向合成ATP的方向进展。这个过程需要一种复杂的多亚基酶ATPase的协助。有两种原理来说明ATPase是怎样作用的。在化学渗透学说中,过去二十年里米歇尔对其进展了开展,认为电子传递上的各组分是跨膜排列的,由于质子从一边向另一边移动,这样便产生了pH和电子浓度梯度。质子跨膜运动就推动了ATPase反响合成ATP。ATPase是定向作用的,质子只能从一边靠近催化位点,图2.15对这个概念进展了简单说明。ATP合成的第二种解释为,电子传递链上的载体与假设的将要被活化的中间产物相互作用使ATP磷酸化。这种中间产物称为偶联因子。两种理论个具有优缺点,都可以解释不成对氧化磷酸化作用产生的影响,如鱼藤酮、安必妥、抗霉素A等。它们可以阻止ATP的合成。2.6 厌氧生物能量生成过程在2.5局部中所说的ATP生成过程需要供给氧气。某些有机体那么可以用磷酸盐,另一些那么用硫酸盐或铁离子来代替氧气分子,而且如果在培养集中,这些物质被大量供给,那么有机体利用电子传递体在没有空气的条件下仍可以生成ATP,从而进展厌氧生长。如果没有适宜的电子受体,或者如大多数细菌有机体缺少这类物质,那么一旦缺少氧气,有机体将不能以这样的方式合成ATP。所以,进展厌氧生长的有机体就必须将ATP 合成反响与能量生成反响相联系,才能获得ATP,这被称为底物水平磷酸化。这只发生在有限数量的反响中。反响自由能的变化必须能够进展ATP磷酸化反响。其中最为重要的反响归纳于表2.2。这6种反响,其中后3种只对少数生物体来说是重要的。表2.2中其它的3个反响中,反响1与反响2涉及糖酵解的中间产物,涉及乙酰磷酸的反响3广泛存在于厌氧有机体中。乙酰磷酸由乙酰CoA与无机磷反响而合成,它还是被磷酸酮醇酶作用的。乙酰CoA可以由乙酰乙酰CoA 降解而生成,或者由丙酮酸经3种反响中的一种而生成:丙酮酸脱氢酶反响,丙酮酸甲酸裂解酶反响,铁氧还蛋白氧化复原酶反响,该反响与丙酮酸脱氢酶反响产生同样的产物,但是用到了一种铁硫蛋白,铁氧还蛋白不是NAD+作为复原剂复原型铁氧还蛋白被氢化酶复原为铁氧蛋白,释放出氢气这三种酶中,后两种对氧敏感,当含有它们的有机体被暴露于空气中的时候,它们便会迅速失活。越来越多的证据说明,电子传递磷酸化同样可以进展延胡羧酸复原酶的反响。这种酶对于某些产甲烷菌,复原硫酸盐的有机体及进展氢气与二氧化碳发酵的氢化菌来说大概是重要的。反响:。,氢原子可以由各种辅因子提供,包括NADPH,而某些有机体如大肠杆菌、其氢原子的生成经过了电子传递链,即使与好氧有机体中的电子传递链不同,但也至少是类似的。因此,尽管没有氧气,有机体仍通过偶联不同的反响从而生成ATP。所有的厌氧有机体都面临两个问题:第一,在氧化磷酸化作用中,缺少将NADH或NADPH的再氧化与ATP的生成相联系。每摩尔底物所生成的ATP量比好氧代谢产生的少。第二,不能将NADH的氧化与氧气的复原相联系,这样如何进展这个重要的反响就成为一个问题,当所有的NAD+不可逆的转化为NADH,代谢过程也就很快被停顿。厌氧生物采用很多方法使复原型辅因子重新被氧化。其中的核心局部为:。这里,由AH2 A这步是厌氧生物利用底物时所采用的途径中的一局部。通常,底物B是补充复原反响所必需的,也直接来源于底物;BH2一旦形成,就不再进一步代谢。AH2的代谢与BH2的补偿性生成在化学计量上相关。这样以来,厌氧生物必须积累复原型代谢产物从而能够进展任何底物的降解过程。而且,就像已经说明的那样,既然厌氧生物从降解底物后获得极少的ATP,那么复原型代谢产物的积累与合成的细胞物质必将有极大的联系。以这种方式进展的厌氧代谢将在后面内容中讲述。2.7 厌氧代谢选择底物来氧化复原剂,例如NADH、NADPH、FADH2是非常普遍的现象,同时产生相应的各种终产物,因此对厌氧代谢途径的描述也就是个体将积累何种终产物的描述。这些终产物例如乙醇有着很高的商业价值。即使是在厌氧条件下,葡萄糖仍是生成丙酮酸,但是只有小局部丙酮酸进入三羧酸循环从而生成用来合成主要的细胞物质的中间体。三羧酸循环反响只提供这些中间体而不生成能量,通常,三羧酸循环不会完全发挥作用,尤其是-酮戊二酸脱氢酶不作用,因此,这个循环成为一个铁蹄形,其中草酰乙酸转化为琥珀酸,而柠檬酸转化为-酮戊二酸。2.7.1发酵产酒精在酿酒酵母这样的酵母菌中,氧化剂是缩醛;从葡萄糖转化的丙酮酸大局部转化为酒精。反响式1摩尔葡萄糖可生成2摩尔丙酮酸;产生的酒精可以重新氧化在磷酸丙糖脱氢酶反响过程中生成的NADH,总的化学计量如下式:ATP为酵母细胞的生长提供能量,但是由表2.1中比拟得知,每摩尔葡萄糖在好氧条件下转化的量少于5%。葡萄糖通过磷酸戊糖途经主要的代谢产物为必需的C5和C4糖,经过这个过程摩尔葡萄糖仅能生成1摩尔的丙酮酸,同时产生2摩尔NADPH和1摩尔NADH。这些附属的复原性物质必须与其它反响相连从而被重新氧化。这些反响中最重要的反响过程是脂肪酸的形成,它们是化学合成的复原性化合物,其合成过程需要大量的相应的复原性物质。某些细菌也可进展生产酒精,通常还伴有其他终产物的生成,某些霉菌也能生产酒精,而且厌氧条件一般对生产最大量的酒精来说是必需的。如果产酒精的有机体可以像酿酒酵母那样进展好氧生长,那么一旦通入氧气,积累的酒精就常常被细胞吸收并以醋酸的形式作为生长底物而被利用。2.7.2 乳酸发酵发酵产乳酸的过程是仅次于酒精发酵的过程,对于食品工业均具有重要的历史意义。除乳酸外,杂发酵乳酸菌生产各种复原性化合物,而且没有主要的糖酵酶-醛缩酶;而使用磷酸酮醇酶,它是生成乙酰磷酸的酶。在厌氧条件下,乙酰磷酸经过生成ATP的过程而转化为酒精和乙酸,酒精重新生产NAD+。磷酸酮醇酶的另一个反响产物是3-磷酸甘油,其通过普遍的糖酵解系列反响转化为丙酮酸,然后经过乳酸脱氢酶的作用转化为乳酸。单纯乳酸菌也进展这样的反响过程;这类有机体没有磷酸酮醇酶,结果乳酸是位的终产物。某些乳酸杆菌生产D-乳酸,其他的那么生产L-乳酸,而另一些乳酸杆菌那么生产两种乳酸的混合物,主要是乳酸脱氢酶的不同。2.7.3 丙酸发酵丙酸菌,例如在格鲁耶尔奶酪中发现,经过一系列以甲基丙二酰CoA为中间产物的反响,可将丙酮酸转化为丙酸。在特殊的转羧化反响中,被用作丙酸的直接来源。甲基丙二酰CoA经过内部转羧化作用,由琥珀酸CoA形成,可由草酰乙酸重新生成经苹果酸、延胡羧酸和琥珀酸,同时2摩尔NADH被氧化NAD+。在某些羧状芽孢杆菌中,丙酸可由丙酮酸经乳酸和丙烯酸直接生成;这个转化过程又将2摩尔NADH重新氧化。2.7.4 丁二醇发酵。2摩尔丙酮酸经过浓缩最终生成2,2-丁二醇, 只有最后一步反响与NADH的氧化相联系,因此,1摩尔丙酮酸只生成0.5摩尔NAD+,这些有机体也可将丙酮酸转化为其他产物包括乳酸和甲酸。2.7.5 甲酸发酵在不同的细菌体内,丙酮酸局部转化为乳酸,局部转化为乙酰CoA+甲酸。后一种反响被称为磷酸裂解反响,甲酸能够少量积累但常常被甲酸水解酶转化为CO2+H2。这种从丙酮酸到乙酰CoA的途径,其优点是它不生成NADH从而防止了必需的再氧化过程。乙酰CoA经过醛脱氢酶作用转化为乙醛。将乙醛复原为乙醇的过程通过进一步的NADH来完成。注意这种生成酒精的过程与酵母产酒精过程是不同的。2.7.6 丁酸发酵历史上,丁酸、丙酮和propan-2-ol的生产过程是最古老的精细发酵过程,i.e.从利用单菌株进展的发酵过程规律开展而来。这类葡萄糖代谢的终产物经过图2.17的代谢流程,由羧状芽孢杆菌进展生产。有一些不同的是,某些羧状芽孢杆菌生产丁酸、乙酸、CO2和H2;而另一些那么主要生产丙酮而不是propan-2-ol,由于所选用的物种和菌株以及培养条件的不同,终产物所占的比例也就发生变化。2.7.7 miscellaneous2.8 生物合成与生长微生物细胞可以利用简单的营养物进展自身的繁殖,生物细胞用以完成这个过程所利用的途径数目是巨大的。一个细菌细胞可能包含有100多种酶,而真核生物细胞含有的酶的种类大约为细菌中的2倍。细胞中所有的大分子物质是由100多种单体而组成的蛋白质、核酸、多糖等。图2.18总结概括了这些单体物质生物合成途径氨基酸、嘌呤、嘧啶、脂肪酸、糖等。这些生物合成途径是相互联系的,都依赖于有足够量的必要的中间体。然而,我们无法说明这些途径的特点,关于它们研究普通生物学的局部,这方面的参考书也较多。因此,由于特定的代谢途径与具体的发酵过程相联系,我们将在适宜的章节中进展讲述。由于细胞所进展的代谢活动是以平衡方式进展的,因此所产生的终产物不会过量也不会缺乏,这种过量与缺乏都是不利的。为生物细胞必须能够对周围环境的变化做出调整,同时也要充分利用供给的氨基酸、嘌呤和嘧啶。这是自然习惯常会发生的情况,也是一个复杂的营养物作为生长底物被利用的场所。这些营养物含有大量的含碳化合物,因此,细胞可以通过停顿合成已经足量的物质来保存碳和能量,而且通过停顿合成多余的酶进一步实现节约,因此就有了两种完全不同的作用方式酶活性的调控和酶合成的调控,通过这两种方法,细胞就能够调控各种化合物的合成过程。一样的调控机制也用来对合成过程进展平衡,甚至在没有天然物质供给的情况下。这种控制机制在这个局部讲述。2.8.1 控制机制2.8.1.1营养物的吸收细胞代谢控制从细胞吸收营养物的调控开场。大局部营养物,除了氧气与极少数含碳化合物以外,都是通过特定的传递机制而被吸收的,因此,这些营养物在细胞外的稀释液在细胞中得到浓缩,这种“主动传递过程需要能量供给。这个过程是可以控制的,一旦吸收到细胞内的营养物的含量到达了所需要的浓度,就会停顿后面营养物的摄入。2.8.1.2 区分第二种形式的代谢控制是利用细胞间隔或是细胞器以实现对代谢产物库的分隔,最明显的例子是真核细胞的线粒体把三羧酸循环反响与细胞质中的反响分隔开来。另一个例子是,过氧化物酶体,它包含降解脂肪酸所有的酶。然而同时有些相似的酶可催化并合成脂肪酸。其他细胞器相类似的控制细胞中的其他反响液泡、细胞核、叶绿体等。2.8.1.3 酶合成控制细胞中的许多酶作为细胞的根本组成局部而存在,处于生长条件下。其他酶那么在需要的时候“出现,例如乙醛酸途径中的异柠檬酸裂解酶是在当细胞在C2底物上生长的时候才出现的,这被称为酶的诱导合成。相反的,当不再需要它们的时候,就会“消失,例如,如果已经有足够的组氨酸满足细胞的生长需要,那么于组氨酸合成的酶就不再被合成,这被称为阻遏;如果化合物的供给一旦消失,进展物质合成的酶又将会重新出现,其合成过程称为去阻遏。为了理解这样的控制是如何作用的,就有必要概述一下蛋白质的合成过程。蛋白质包括所有的酶通过核糖体组织的酶复合物和RNA系列添加氨基酸而合成图2.19。确保氨基酸的正确顺序的密码位于信使RNA上,而信使RNA是DNA的一个片断进展复制而在细胞染色体内合成的。这个过程由依赖DNA的RNA多聚酶催化,被称为转录。众所周知,染色体是由DNA双螺旋按照准确排序的碱基组成的:腺嘌呤A,胞嘧啶C,胸腺嘧啶T和鸟嘌呤G。DNA的两条链只是通过相邻碱基间的氢键相连接。由于A总是与T配对,而C总是与G配对,那么从一条单链就可生成一条新的DNA链,这条单链与最初原来的那条链互补。DNA以这样的方式进展复制,从而保存遗传信息或者密码;信使RNA也是来自于DNA的一条单链。除过用尿嘧啶代替胸腺嘧啶,RNA互补于DNA而且其自身的碱基同样携带者遗传密码。尽管许多mRNA读取整条DNA链,但是每个mRNA只是DNA链上的一小局部。核糖体附着于mRNA上,而且在核糖体中,mRNA上的碱基每次被读取3个,转译为特定的氨基酸密码。这个密码称为密码子。例如,密码子UCA就至代表着丝氨酸而CAG代表谷氨酸;因此,当黏附于核糖体的mRNA遇到 UCACAG那么就会生成丝-谷氨酸。以共价键连接在特殊转移RNAtRNA上的每个氨基酸都可识别mRNA上与其相对应的3个碱基。氨酰- tRNA是反响单元,它被核糖体利用从而合成不断增长的肽链。每个单一的mRNA分子编码一个蛋白质,它来源于染色体上的一个基因某些功能酶由不只一个蛋白质构成,例如丙酮酸脱氢酶。每个基因都可以被屡次转录,染色体中就不是仅有这个基因的一个拷贝,从而遗传信息就被扩大了。经过整个转录与转译过程,合成了蛋白质,对于这个过程的调控是非常复杂的。原核生物与真核生物尤其是在具体的细节上是不同的,而且很多方面还无法解释。尽管如此,细菌系统中的调控机制是可以说明的。由DNA生成mRNA的过程是由染色体上编码诱导蛋白或者阻遏蛋白的那局部控制的。这种机制如图2.20所示。DNA上被称为调节基因的局部生成调控阻遏蛋白,它的作用是结合到另一个通常是相邻的基因上。将这个蛋白结合到操作基因上就阻止了一段基因的转录过程。这段基因是一个或多个构造基因,它负责编码酶蛋白的mRNA的合成。如果有诱导物存在,诱导物结合到调控蛋白上,从而阻止了调控蛋白结合到操纵基因上,自由的操纵基因就允许构造基因进展转录而合成相应的蛋白质。这就是如何将一个新的代谢途径引进到操作中。只要有诱导分子的存在,那么酶的和成就一直进展,如果除去诱导物,或者诱导物被消耗完常常是它诱导的代谢途径,那么酶将停顿合成。当某个分子常常是代谢终产物与阻遏蛋白作用生成一种封锁操纵基因产物的时候,酶合成阻遏就会发生。如果这个产物被除去或者消耗完,那么阻遏蛋白将不再结合到操纵基因上,构造基因开场转录,同时终产物又重新开场合成。2.8.1.4 分解代谢阻遏这种代谢调控是对已建立的酶的诱导与阻遏调控的这种想法的延伸,通过向微生物培养液中添加外来营养物来实现。分解代谢阻遏这个术语涉及许多普遍的现象,来看这个例子,当一个微生物可从同时提供给它的一种或多种碳源中进展选择的话,它们那么选择利用其偏好的那种底物。例如,如果给一个微生物同时供给葡萄糖和乳糖,那么乳糖被忽略直到所有的葡萄糖被消耗完。假设供给多种可利用的氮源,那么会出现项类似的情况。对细胞来说,分解代谢物阻遏的优点在于能够以最少的能量消耗对其进展利用。分解代谢物阻遏的具体机制以生物体发生较大的变化。图2.21所示的一系列事件是大肠杆菌中发生的分解代谢物阻遏过程。对这个过程来讲,最关键的是化合物环化腺苷酸cAMP,它的磷酸基团连接在核糖局部的3和5-羟基上,从而形成磷酯。cAMP,经腺苷酸环化酶作用由ATP生成,它与特定的受体蛋白作用CRP=环化腺苷酸受体蛋白,其正向促进一个操纵子的转录。磷酸二酯酶将cAMP转化为AMP,cAMP的水平与2.2内容中提及的“能荷严密相关。葡萄糖代谢的各种产物看上去都是腺苷酸环化酶的强抑制剂参考2.8.1.5b,只要这些物质存在于细胞中暗示有连续的可利用的葡萄糖存在,那么基于cAMP- CRP复合物控制的某些操纵子的转录将无法进展。分解代谢阻遏对控制厌氧代谢方式有重要影响,尤其在“次级代谢生物合成现象中。2.8.1.5 酶活性修饰一旦酶被合成,它的活性就可以通过很多手段进展修饰。(a) 转录后修饰某些酶的存在是有活性的或者低活性的形式,这通过与特定基团的共价吸附作用来相互转化常常是磷酸,有时是AMP或者UMP。这种吸附作用由一种单独酶作用,它没有其它的功能,其活性反过来由各种代谢产物来调控。被第一个酶催化的反响可通过细胞的主要代谢状况来调节如图2.22。进展这种代谢的例子有大肠杆菌中的谷氨酸合成酶谷氨酸合成酶对细胞精细调节主要代谢中间产物谷氨酸与谷氨酰胺的库容量来说是非常重要的,它们分别是酶的底物和产物。和粗糙脓胞杆菌中的
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