生物化学中期复习

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单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,生物化学,中期复习,第1章 糖类化合物,糖类化合物的定义,糖的功能,糖的分类,单糖,醛糖/酮糖,还原糖/非还愿糖,呋喃糖/吡喃糖,空间构型:D,L,-,-,,,葡萄糖、果糖、半乳糖(三种结构式),双糖:,糖苷键,乳糖,麦芽糖,蔗糖(三种结构式),三糖,多糖,淀粉(直链/支链),纤维素,第2章 蛋白质化学,蛋白质的化学组成,元素组成/蛋白质的换算系数,20种天然氨基酸,分子结构,氨基酸的分类,氨基酸的解离方程/氨基酸的等电点及其计算,(1) (-NH,2,) , (-COOH)(2),-C(3)构成蛋白质的氨基酸都是,- 氨基酸,L-amino acid,D-amino acid,疏水性氨基酸,不带电荷氨基酸,带电荷氨基酸,极性氨基酸,芳香族氨基酸,脂肪族氨基酸,Arg,Lys,His,Asp,Glu,Phe,Tyr,Try,Gly,Ala,Val, Leu,Ile,Met,Pro,Ser,Thr,Gln,Asn,Cys,兼性离子,中性,AA: pI=1/2(pK,1,+,pK,2,),酸性,AA: pI=1/2(pK,1,+,pK,2,),碱性,AA:pI=1/2(pK,2,+,pK,3,),蛋白质的结构,一级结构:肽键,二级结构:超二级结构、结构域,三级结构,四级结构:,亚基, ,超二级结构,若干相邻的二级结构中的构象单元彼此相互作用,形成有规则的在空间结构上能辨认的二级结构组合体。,结构域,结构域是球蛋白的折叠单位。多肽链在超二级结构的基础上进一步折叠成紧密的近似球状的结构。,对于较大的蛋白分子或亚基,多肽链往往由两个以上的相对独立的结构域缔合而成三级结构。,对于较小的蛋白分子或亚基,结构域和三级结构往往是一个意思。,亚基,多肽链相互以非共价键联结成一个相对稳定的单位,这种肽链就称为该蛋白质的亚基(亚基单独存在,无生物活力或活力很小),蛋白质的性质,变性/影响蛋白质变性的因素,蛋白质的沉淀,活性蛋白的沉淀(三种方法),非活性蛋白的沉淀(三种方法),蛋白质的纯化,原理,纯化过程,原理,溶解性,蛋白分子大小,电荷,特异性的亲和作用,(pI沉淀, 盐析, 有机溶剂, 温度),(透析, 超滤, 密度梯度,凝胶层析),(电泳、离子交换),(亲和层析),蛋白样品的选择,预处理,粗提,纯化,纯蛋白,(离子交换, 凝胶过滤, 亲和层析,电泳等),(有机溶剂, 硫酸铵, 等电点),(均质和溶解,),第3章 脂类和生物膜,脂类的生物学功能,(三个),脂的分类,甘油三酯的分子结构,脂肪酸的结构和性质,饱和脂肪酸(例?),不饱和脂肪酸(例?),必需脂肪酸,(简单脂质/复合脂),单纯甘油酯 混合甘油酯,软脂酸 C,16:0,硬脂酸 C,18:0,油酸 C,18:1,9,亚油酸,Linoleic,acid (C,18:2,9,12,),亚麻酸,Linolenic,acid (C,18:3,9,12,15,),花生四烯酸,Arachidonic,acid (C,20:4,5,8,11,14,),必需脂肪酸,常见脂肪酸,细胞膜,膜的化学组成,膜蛋白,膜脂类,膜糖类,膜的结构,膜蛋白,膜脂,磷脂,固醇,其它脂类,磷脂酰胆碱、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰丝氨酸、磷脂酰肌醇、鞘磷脂等。,膜糖类,糖蛋白/糖脂,在细胞质膜表面分布较多,一般占质膜总量的210左右。,中性糖、氨基糖和唾液酸。,与细胞的抗原结构、受体、细胞免疫反应、细胞识别、血型及细胞癌变等均有密切关系。,流动镶嵌模型,第4章 核酸,几个重要的事件,:,1944,1953,1960,核酸的分类和化学组成,核酸的分类,元素组成,分子组成,核苷与核苷酸的结构,核酸,核苷酸,核苷,磷酸,戊糖,碱基,dA,dAMP,核酸的结构,DNA,一级结构(DNA的书写格式),二级结构,三级结构,RNA,一级结构(RNA的书写格式),二级结构:tRNA的三叶草结构,三级结构:tRNA的倒L型结构,核酸的性质,DNA 的书写格式,AGT,pApGpT,pA-G-T,DNA 二级结构(双螺旋,),核酸的性质,紫外吸收,变性/影响核酸变性的因素:,Tm(解链温度/熔点)/影响Tm的因素,复性,两性解离,结束,解链温度T,m,(熔点),紫外吸收的增加量达最大增量一半时的温度称熔解温度 (,T,m,).,T,m,69.30.41G-C%,G-C%=(T,m,69.3)2.44,影响Tm的因素,G-C含量,溶液的离子强度,离子强度较低的介质中,Tm较低;,分子生物学研究中需核酸变性时,常采用较低的离子强度。,溶液的pH,pH大于11.3时,DNA完全变性。,变性剂,尿素、甲醛、甲酰胺,对单链DNA电泳时,常在凝胶中加入NaOH和变性剂以维持变性状态。,第5章 酶,酶的分类,按照组成(辅因子),按照酶催化反应的性质(酶分类号E.C.3.4.21.4 ),酶的催化特性,高效性,高专一性绝对专一性,相对专一性(基团专一 性,键专一性,立体异构专一性),酶的催化机制,必需基团/活性中心,酶的结构与功能的关系,一级结构是酶活性的基础,。,酶的空间结构保证了酶的活性;,只要酶的活性中心完整,即使酶的一级结构被破坏,仍具有催化活性。,几个学说,中间产物学说,:,锁钥学说,:,诱导锲合学说,:,酶只是提高反应的速率,并不改变反应前后能量的变化,酶的活性中心与底物的形状如锁和钥匙一样完全吻合,两个结构都是刚性的固定的。,底物的结合诱导酶的活性中心构象的改变,使酶与底物能很好,地结合,酶动力学,酶反应的初速度,影响酶反应速度的因素,底物浓度(米氏方程,Km),酶浓度,温度,pH,激活剂,抑制剂,酶的抑制,对于竞争性可逆抑制:,Km值增大,V不变。,可逆抑制,竞争性可逆抑制/非竞争性可逆抑制 不可逆抑制,对于非竞争性可逆抑制:,Km值不变,V减小。,酶的别构效应/别构酶,酶活力的测定,几个重要概念:酶活力、酶单位、比活力、总活力,酶活力的测定程序与注意事项,第6章 维生素和辅酶,维生素的定义,维生素与辅酶,维持机体正常生命活动不可或缺的一类小分子有机化合物。,它们具有相似的生物功能:,对物质代谢过程具有非常重要的调节作用;,需要量很少;,人体不能合成;,非生物体的结构物质;,非能源物质。,
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