6月11日 免疫共沉淀

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,扬州大学生物科学与技术学院,生物化学精品课程,*,免疫共沉淀,细胞生物学,免疫共沉淀（,Co-Immunoprecipitation,）是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。 其原理是：当细胞在非变性条件下被裂解时，完整细胞内存在的许多蛋白质蛋白质间的相互作用被保留了下来。如果用蛋白质,x,的抗体免疫沉淀,x,，那么与,x,在体内结合的蛋白质,y,也能沉淀下来。这种方法常用于测定两种目标蛋白质是否在体内结合；也可用于确定一种特定蛋白质的新的作用搭档。,原理,优点,相互作用的蛋白质都是经翻译后修饰的，处于天然状态；,蛋白的相互作用是在自然状态下进行的，可以避免人为的影响；,可以分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物。,缺点,可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质蛋白质相互作用,两种蛋白质的结合可能不是直接结合，而可能有第三者在中间起桥梁作用；,如用,western blot,检验，必须在实验前预测目的蛋白是什么，以选择最后检测的抗体，若预测不正确，实验就得不到结果。,实验的关键,实验最需要注意点就是抗体的性质。抗体不同和抗原结合能力也不同，免染能结合未必能用在,IP,反应。建议仔细检查,抗体,的说明书。特别是多抗的特异性是问题。,为防止蛋白的分解，修饰，溶解抗原的缓冲液必须加蛋白酶抑制剂，低温下进行实验。,考虑抗体,/,缓冲液的比例。抗体过少就不能检出抗原，过多则就不能沉降在,beads,上，残存在上清。缓冲剂太少则不能溶解抗原，过多则抗原被稀释。,Co-IP,工作示意图,Co-immunoprecipitation,binding,wash,elution,Y,Y,Y,Y,Y,利用,western blot,确定捕获蛋白,通过质谱确定捕获的蛋白,收获细胞，加入适量细胞裂解缓冲液（含蛋白酶抑制剂），冰上裂解,30min,细胞裂解液于,4c,， 最大转速离心,30 min,后取上清；,取少量裂解液以备,western blot,分析，剩余裂解液加,1g,相应的抗体加入到细胞裂解液，,4c,缓慢摇晃孵育过夜；,取,10l protein a,琼脂糖珠，用适量裂解缓冲液洗,3,次，每次,3,000 rpm,离心,3 min,；,将预处理过的,10l protein a,琼脂糖珠加入到和抗体孵育过夜的细胞裂解液中,4c,缓慢摇晃孵育,2-4h,，使抗体与,protein a,琼脂糖珠偶连；,免疫沉淀反应后，在,4c,以,3,000 rpm,速度离心,3 min,，将琼脂糖珠离心至管底；将上清小心吸去，琼脂糖珠用,1ml,裂解缓冲液洗,3,4,次；最后加入,15l,的,2sds,上样缓冲液，沸水煮,5,分钟；,sds-page, western blotting,或质谱仪分析。,实验步骤,扬州大学生物科学与技术学院,生物化学精品课程,实验注意事项,（,1,）细胞裂解采用温和的裂解条件，不能破坏细胞内存在的所有蛋白质蛋白质相互作用，多采用非离子变性剂（,np40,或,triton x-100),。每种细胞的裂解条件是不一样的，通过经验确定。不能用高浓度的变性剂（,0.2 sds),，细胞裂解液中要加各种酶抑制剂，如商品化的,cocktailer,。,（,2,）使用明确的抗体，可以将几种抗体共同使用,（,3,）使用对照抗体：,单克隆抗体：正常小鼠的,igg,或另一类单抗,兔多克隆抗体：正常兔,igg,(4),确保共沉淀的蛋白是由所加入的抗体沉淀得到的，而并非外源非特异蛋白，单克隆抗体的使用有助于避免污染的发生；,(5),要确保抗体的特异性，即在不表达抗原的细胞溶解物中添加抗体后不会引起共沉淀；,(6),确定蛋白间的相互作用是发生在细胞中，而不是由于细胞的溶解才发生的，这需要进行蛋白质的定位来确定。,