核酸的结构原理课件

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,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,核酸的结构原理,核酸包括核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)两大类,它们对生物体的遗传信息的传递、蛋白质的生物合成及生物的发育调控等生命过程起着决定性的作用。,核酸的结构与功能,染色体的结构,基因组,核酸的结构原理核酸包括核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DN,1,核酸的结构与功能,核酸结构的研究简史,核酸的基本结构单位,DNA的结构,DNA的功能,RNA的结构,RNA的功能,核酸的结构与功能核酸结构的研究简史,2,核酸结构的研究简史,1868年,瑞士的Friedrich Miescher从脓细胞核中提取得到结合蛋白质的核酸,称为核素(nuclein),1889年,Richard Altmann得到不含蛋白质的核素,命名为核酸(nucleic acid),1929年,Levene Jacobs得到核酸的化学组成,1938年,Astbury开始DNA纤维衍射的工作,1944年,Avery等完成肺炎球菌转化试验,证明DNA是遗传物质,1950年前后,Chargaff和Markham分析了各种生物DNA的碱基组成,发现了DNA碱基组成规律:A=T, G=C,1953年,James Watson和Francis Crick建立DNA双螺旋结构模型,核酸结构的研究简史1868年,瑞士的Friedrich Mi,3,核酸结构的研究简史(续),1970s年代初,建立DNA重组技术,产生了一门新的学科基因工程。,1970s年代末,开始进行人工合成DNA片段的结晶和晶体衍射的分析工作。,1978年发表了第一个DNA片段晶体结构,是一个四核苷酸片段。,1979年,A.Rich测定了d(CGCGCG)片段的晶体结构,发现是一个左手双螺旋结构。,1980年,R.E.Dickerson测定了12聚核苷酸片段:d(CGCGAATTCGCG)的晶体结构,证实了Watson-Crick模型的正确性,同时也发现了一些不同的结构特征。,1992年,建立了核酸三维结构数据库NDB。,现在,X射线晶体学、NMR和计算机模拟方法都已经用于研究核酸的空间结构。,核酸结构的研究简史(续)1970s年代初,建立DNA重组技术,4,核酸的基本结构单位,核酸是线性的多聚核苷酸(polynucleotide),核苷酸(nucleotide)是核酸的基本结构单位,核苷酸的结构,核苷,戊糖,碱基,磷酸,核酸的基本结构单位核酸是线性的多聚核苷酸(polynucle,5,戊糖,戊糖的类型,b,-D-核糖 RNA,b,-D-2-脱氧核糖 DNA,戊糖戊糖的类型,6,戊糖,糖环的折叠形式,内型(endo)与外型(exo)构象以C5,作为参照,糖环的折叠形式有两大类,信封式(envelope form),C2-endo(,2,E),C3-endo(,3,E),C2-exo (,2,E),C3-exo (,3,E),扭转式(twist form),C2-endo-C3-exo( , , ),又称S式,C2-exo-C3-endo( , , ),又称N式,戊糖糖环的折叠形式,7,内型(endo)与外型(exo),内型(endo)与外型(exo),8,信封式构象,信封式构象,9,扭转式构象,扭转式构象,10,呋喃糖环的折叠形式,呋喃糖环的折叠形式,11,糖环的折叠影响核苷酸的空间构象,单体核苷酸中糖环折叠C3-endo与C2-endo各占一半的比例,B-DNA螺旋中糖环构象为C2-endo,A-DNA螺旋中糖环构象为C3-endo,RNA螺旋中糖环构象为C3-endo,糖环的折叠影响核苷酸的空间构象单体核苷酸中糖环折叠C3-e,12,碱基,腺嘌呤 A,鸟嘌呤 G,胞嘧啶 C,胸腺嘧啶 T,尿嘧啶 U,碱基腺嘌呤 A,13,碱基环的原子编号,碱基环的原子编号,14,碱基的顺式和反式构象,碱基的顺式和反式构象,15,碱基的顺式和反式构象,碱基的顺式和反式构象,16,磷酸基团,磷酸基团,17,核苷酸的构象角,核苷酸的构象角,18,DNA的结构,DNA的一级结构,双螺旋DNA的二级结构,超螺旋DNA的三级结构,三链和四链DNA的结构,DNA的结构DNA的一级结构,19,DNA的一级结构,DNA的一级结构是脱氧核糖核苷酸以3, 5-,磷酸二酯键连接形成的长链,脱氧核糖和磷酸构成DNA的磷酸二酯主链,由糖苷键连接的碱基是DNA的侧链,磷酸基总是离子化的,核酸是聚阴离子,核苷酸链具有极性,方向:5,3,每个核苷酸中有6-7个自由旋转的单键,核苷酸的序列编码了DNA中的遗传信息,Chargaff规则:双链DNA中 A = T & G = C,核苷酸中的碱基可以被修饰:DNA中A和 C有时被甲基化,DNA的一级结构DNA的一级结构是脱氧核糖核苷酸以3, 5,20,DNA序列的测定,Sanger法(双脱氧末端终止法),Maxam-Gilbert法(化学降解法),DNA序列的测定Sanger法(双脱氧末端终止法),21,DNA的双螺旋结构二级结构,双螺旋结构的三种类型,B-DNA,A-DNA,Z-DNA,DNA的双螺旋结构二级结构双螺旋结构的三种类型,22,B型DNA的结构,B型DNA是天然DNA的最常见的构象,Watson-Crick双螺旋模型就是B型DNA的构象,B型DNA的结构特征,两条反平行的多核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕。,磷酸-脱氧核糖主链在外,碱基在内。碱基平面相互平行叠加,与中心轴垂直,碱基平面的间距为3.4,。,每圈螺旋含有10对碱基,螺距34,。相邻两对碱基的夹角为36,螺旋的直径约为20,。,两条链相对的碱基存在A-T, C-G的互补关系,A-T之间有两个氢键,C-G之间有三个氢键。,糖苷键是反式构型,脱氧核糖的折叠是2,内型,在DNA双螺旋分子上交替存在大沟和小沟,B型DNA的结构B型DNA是天然DNA的最常见的构象,Wat,23,核酸的结构原理课件,24,核酸的结构原理课件,25,核酸的结构原理课件,26,核酸的结构原理课件,27,B型DNA的结构,1980年,Dickerson测定了12聚寡核苷酸片段的晶体结构,发现并不象Watson-Crick模型那样均一,在局部结构上有较大的差异。从而对Watson-Crick模型提出了一些补充:,相邻两个碱基之间的夹角可从28到42不等,而不是固定的36。,组成碱基对的两个碱基的分布并非在同一平面上,而是沿碱基对的长轴旋转一定角度,称为螺旋桨状扭曲。,双螺旋局部的构象变化能导致双螺旋结构整体的变化,如弯曲和沟的加宽等。,B型DNA的结构1980年,Dickerson测定了12聚寡,28,B型DNA的结构,Watson-Crick模型的意义,Watson-Crick模型阐明了遗传物质复制和传代的机制,对分子遗传学的形成和发展产生了深远的影响。,B型DNA的结构Watson-Crick模型的意义,29,A型DNA的结构,A-DNA是在相对湿度为75%以下时获得的DNA纤维的结构。后来在DNA的晶体结构中也发现A-DNA的存在。,A-DNA的结构特征,也是右手双螺旋结构,螺旋直径比B-DNA更大。,碱基排列更紧密,碱基平面间距为2.56,,每圈螺旋有11对碱基,螺距28,。,脱氧核糖的折叠形式为C3内型,而B-DNA为C2内型。,碱基对与中心轴的倾角不同,约为20,导致大沟和小构也有细微的差别。,A型DNA的结构A-DNA是在相对湿度为75%以下时获得的D,30,核酸的结构原理课件,31,核酸的结构原理课件,32,Z型DNA的结构,1979年A.Rich等人测定了人工合成的DNA片段d(CGCGCG)的晶体结构,发现它是一个左手双螺旋结构,称为Z-DNA。,Z-DNA的结构特征为:,是左手双螺旋构象。,糖-磷酸主链的走向呈Z字形。,Z-DNA较B-DNA细长,螺旋直径18,,碱基平面间距3.7,。每圈螺旋含12对碱基,螺距45,。,鸟嘌呤碱基是顺式构象,胞嘧啶碱基仍是反式构象。,Z-DNA的糖环的折叠是C3内型,B-DNA是C2内型。,Z-DNA只有一条小沟,较深,含有较高的负电荷密度。,Z-DNA也可存在于天然DNA的特殊区域,可能在调控基因表达中起重要作用。,Z型DNA的结构1979年A.Rich等人测定了人工合成的D,33,核酸的结构原理课件,34,核酸的结构原理课件,35,A-DNA、B-DNA和Z-DNA结构的比较,A-DNA、B-DNA和Z-DNA结构的比较,36,
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