微生物分类鉴定

第 九 章 微 生 物 分 类 鉴 定 什 么 是 微 生 物 分 类 学(microbialtaxonomy): 按 照 微 生 物 的 亲 缘 关 系 将其 安 排 成 条 理 清 楚 的 各 种分 类 单 元 和 分 类 群 的 科 学 微 生 物 分 类 的 目 的 把 各 种 微 生 物 按 照 它们 的 亲 缘 关 系 分 群 归类 ， 排 成 系 统 ， 以 便于 人 们 对 微 生 物 进 行鉴 定 和 交 流 微 生 物 分 类学 的 主 要任 务 分 类 (classification)即 根 据 相 似 性 或 亲缘 关 系 ,将 一 个 有 机体 放 在 一 个 单 元 中命 名(nomenclature)鉴 定 (identification)确 定 一 个 新 的 分 类 物是 否 归 属 于 已 经 命 名的 分 类 单 元 的 过 程 第 一 节 微 生 物 分 类 的 单 位第 二 节 微 生 物 的 命 名第 三 节 微 生 物 在 生 物 界 中 的 地 位第 四 节 微 生 物 的 分 类 鉴 定 方 法 一 、 微 生 物 的 分 类 单 位界门纲目科属种 常 用 的 几 种 分 类 概 念种 ： 亲 缘 关 系 较 近 的 微 生 物 有 机 体 的 集 合 ， 它 们 在 进化 发 育 阶 段 上 有 一 定 的 共 同 形 态 和 生 理 特 征 。 现 代 分类 学 上 规 定 种 内 菌 株 的 DNA同 源 性 70%小 种 （ 亚 种 ） ： 实 验 室 中 获 得 的 微 生 物 变 异 型 称为 小 种 或 亚 种 。菌 株 （ 品 系 ） ： 来 源 不 同 的 同 种 微 生 物 的 纯 培养 ， 均 可 称 为 菌 株 。 大 肠 杆 菌 的 分 类 地 位 命 名 的 方 法 ： 国 际 法 规 命 名 ， 即 林 奈 所 创 立 的双 名 法 。双 名 法 的 规 则 ： 微 生 物 的 学 名 依 属 和 种 而 命 名 ，由 两 个 拉 丁 字 或 希 腊 字 或 拉 丁 化 了 的 其 它 文 字组 成 ， 属 名 在 前 ， 为 名 词 ， 开 头 字 母 大 写 ， 是该 微 生 物 的 主 要 特 征 。 种 名 在 后 ， 为 形 容 词 。如 ： Stapylococcus aureus, Streptomyces albosporeus(Krainsky) Waksman et H enrici, Micrococcus sp.(spp.), Bacillus subtilis var.niger二 、 微 生 物 的 命 名 需 要 牢 记 的 一 些 微 生 物 学 名大 肠 杆 菌 : Escherichia coli枯 草 杆 菌 Bacillus subtilis金 黄 色 葡 萄 球 菌 Staphylococcus aureus酿 酒 酵 母 : Saccharomyces cerevisiae灰 色 链 霉 菌 Streptomyces griseus粗 糙 链 孢 霉 ： neurospora crassa产 黄 青 霉 :penicillium chrysogenum 三 、 微 生 物 在 生 物 界 中 的 地 位 三域学说 四 、 微 生 物 的 分 类 鉴 定 方 法 1. 经 典 鉴 定 分 类 法 2.数 值 分 类 法 3.化 学 分 类 法 4.遗 传 分 类 法 经典鉴定分类法 个 体 :细 胞 形 态 ,大 小 ,排 列 方 式 ,染 色 ,运 动 等形 态 特 征 :菌 落 形 态营 养 要 求 :碳 源 ,氮 源 ,矿 质 元 素生 理 生 化 特 征 :代 谢 产 物 种 类 ,产 量 ,现 色 反 应酶 :产 酶 种 类 和 反 应 特 征生 态 学 特 征 :生 长 温 度 ,氧 需 求 ,酸 碱 度 ,宿 主 种类血 清 学 反 应噬 菌 体 的 敏 感 性其 他 :全 细 胞 蛋 白 的 分 析 等 数值分类法 测 定 100项 以 上 的 各 种 性 状 ， 利用 计 算 机 进 行 菌 株 的 相 互 比 较 ，并 得 出 总 的 相 似 值 。一 般 认 为 同 种 微 生 物 菌 株 之 间的 相 似 值 80%。 化学分类法 细 胞 成 分 分 析 内 容 在 分 类 水 平 上 的 作 用 细 胞 壁 肽 聚 糖 结 构 多 糖 种 和 属 胞 壁 酸 脂 肪 酸 膜 极 性 类 脂 种 和 属 霉 菌 酸 蛋 白 质 氨 基 酸 序 列 分 析 血 清 学 比 较 属 和 属 以 上 单 位 电 泳 图 酶 谱 代 谢 产 物 脂 肪 酸 种 和 属 全 细 胞 成 分 分 析 热 解 -气 液 色 谱 分 析 种 和 亚 种 热 解 -质 谱 分 析 遗传分类法 1.DNA碱 基 比 例 的 测 定每 一 个 微 生 物 物 种 的 DNA中 的 (G +C)mol%的 数值 是 恒 定 的 ,不 会 随 着 环 境 及 培 养 条 件 等 的 变 化而 变 化 ,而 且 在 同 一 个 属 不 同 种 之 间 ,G C含 量 不 会差 异 太 大 ,具 有 一 定 的 范 围 ,因 此 可 以 作 为 判 定 的微 生 物 间 亲 缘 关 系 的 依 据 2. 核 酸 分 子 杂 交 法遗传分类法 3.rRNA寡 核 苷 酸 编 目 分 析遗传分类法 一 种 通 过 分 析 原 核 或 真 核 细 胞 中 最 稳 定 的 rRNA寡 核 苷 酸 序 列 同 源 行 程 度 ,乙 确 定 不 同 生 物 间 的亲 缘 关 系 和 进 化 谱 系 的 方 法 五、微生物的快速分类鉴定方法