文摘索引型数据库检索与利用课件

20172017年年9 9月月文摘索引文摘索引 型数据库检索与利用型数据库检索与利用第第2讲讲内容提要内容提要PubMed实习实习BIOSISPreviewsPubMed练习1.检索有关检索有关“禽流感预防控制方面禽流感预防控制方面”的文献的文献2.检索微量元素缺乏与皮肤病关系的文献（限英文综检索微量元素缺乏与皮肤病关系的文献（限英文综述）述）3.利巴韦林（利巴韦林（ribavirin）治疗）治疗SARS方面的综述文献方面的综述文献4.眼结核眼结核(oculartuberculosis)引起失明引起失明(blindness)的的文献（比较基本检索和主题词检索的结果）文献（比较基本检索和主题词检索的结果）5.北京大学韩济生教授发表的英文文献北京大学韩济生教授发表的英文文献6.CANCERLETTERS期刊上查找有关基因治疗方面的期刊上查找有关基因治疗方面的文献文献1.检索索过程和步程和步骤2024/6/244（1 1）分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念）分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念之间的相互关系如下：之间的相互关系如下：预防控制禽流感事物与特征的关系2024/6/245（2 2）选择检索方式为叙词检索，在）选择检索方式为叙词检索，在PUBMEDPUBMED数据库中即为数据库中即为选择选择MeSHMeSH入口进行检索。入口进行检索。（3 3）编制检索策略。）编制检索策略。Influenza in Birds/prevention and controlInfluenza in Birds/prevention and control （禽流感（禽流感 /预防控制）预防控制）其中其中 主题词为：主题词为：Influenza in BirdsInfluenza in Birds（禽流感）（禽流感）副主题词为：副主题词为：prevention and control prevention and control（预防控（预防控制）制）2.检索索过程和步程和步骤2024/6/246（1 1）分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念）分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念之间的相互关系如下：之间的相互关系如下：皮肤病微量元素缺乏因果关系 此外，课题还要求只要英文综述文献。综述英文+2024/6/247（2 2）选择检索方式为叙词检索，在）选择检索方式为叙词检索，在PUBMEDPUBMED数据库中即为数据库中即为选择选择MeSHMeSH入口进行检索。入口进行检索。此外，此外，PubMedPubMed数据库提供有检索结果滤镜（数据库提供有检索结果滤镜（Result Result FiltersFilters），），可对检索结果按照可对检索结果按照不同不同分面进行显示分面进行显示，其，其中有按照文献语种、文献类型等分面的显示。中有按照文献语种、文献类型等分面的显示。2024/6/2472024/6/248（3 3）编制检索策略）编制检索策略 Trace Elements/deficiency Trace Elements/deficiency （痕量元素（痕量元素 /缺缺乏）乏）Skin Diseases/etiology Skin Diseases/etiology （皮肤疾病（皮肤疾病 /病因学）病因学）其中其中 主题词为：主题词为：Trace Elements Trace Elements、Skin Diseases Skin Diseases 副主题词为：副主题词为：deficiency deficiency、etiologyetiologyPubMed检索小索小结1.1.任何一项研究主题都有多个检索途径，要比较多任何一项研究主题都有多个检索途径，要比较多个检索途径的结果，那个更适合该项研究主题个检索途径的结果，那个更适合该项研究主题2.Search2.Search DetailsDetails描述检索过程描述检索过程3.3.*关闭自动转换匹配功能关闭自动转换匹配功能4.4.限定检索条件要及时关闭，否则会影响后续的检限定检索条件要及时关闭，否则会影响后续的检索结果索结果BIOSISPreviews数据数据库BIOSISPreviews主要内容主要内容l数据库概况数据库概况l数据库特色数据库特色l检索技巧和方法检索技巧和方法l检索结果处理检索结果处理l检索实习检索实习概况概况出版单位出版单位：美国生物科学信息服务社美国生物科学信息服务社(BIOSIS,现已已隶隶属于属于ClarivateAnalytics)组成：成：BiologicalAbstracts与与BiologicalAbstracts/RRM(Reports,Review,Meetings)整合整合收收录范范围：来自：来自90多个国家生命科学多个国家生命科学领域的域的6000多种期多种期刊、刊、1500多个国多个国际会会议及与生命科学相关的及与生命科学相关的21000多条多条美国美国专利信息利信息BIOSISPreviews学科范学科范围传统生物学传统生物学如：分子生物学、植物学、生如：分子生物学、植物学、生态与与环境科学、微生物学、境科学、微生物学、医学、医学、药理学、理学、动物学物学交叉学科交叉学科如：如：农业、生物化学、生物医学、生物技、生物化学、生物医学、生物技术、实验医学、医学、临床医学、床医学、兽医学、医学、遗传学、学、营养学、养学、药物学、公共物学、公共卫生生相关领域相关领域如：如：仪器、器、实验方法等方法等BIOSISPreviews文献文献类类型型期刊期刊图书图书专利专利综述综述会议会议关联性索引和生物学分类BIOSISPreviews特色特色BIOSISPreviews关关联联性索引性索引关联关联性性索引索引(RelationalIndexing)在文献标引过程中采用在文献标引过程中采用独有独有的的标引方法标引方法，其特色在于能够，其特色在于能够标引出每一个检索字段和控制字汇之间的关联性。这个标标引出每一个检索字段和控制字汇之间的关联性。这个标引系统使研究人员能快速而准确地找到数据引系统使研究人员能快速而准确地找到数据。关关联联的原的原则则研究主研究主题(majorconcepts或者或者conceptcodes)被研究的生物体被研究的生物体（1）生物自然分）生物自然分类系系统中上位分中上位分类名（名（SuperTaxa）（2）生物分）生物分类注注释（TaxaNotes）（3）生物系）生物系统代代码（BiosystematicCodes）（4）生物体）生物体结构（构（Organism,Part&Structures)被研究生物体的所在地（被研究生物体的所在地（GeopoliticalLocation)用什么方法做研究（用什么方法做研究（Mothods&Equipment)RelationalIndexing关关联性性标引引例如：Coronavirus 冠状病毒的关联性标引词冠状病毒Coronavirus上位分类名Positive Sense ssRNA Viruses生物体分类代码Coronaviridae 03613描述词pathogen;strain-TOR2在BIOSIS Previews全记录中有关Coronavirus的标引生物学分生物学分类类采用自然主题分类法，按照生物界的自然分类系统分类。采用自然主题分类法，按照生物界的自然分类系统分类。全部生物体按照类、门、纲、目、科、属、种的顺序排全部生物体按照类、门、纲、目、科、属、种的顺序排列。大类分为微生物、植物、古生物、动物，每大类分列。大类分为微生物、植物、古生物、动物，每大类分为四级类目（门、纲、目、科）为四级类目（门、纲、目、科）使用任一生物体的科以上类目，都可以查出与该生物相使用任一生物体的科以上类目，都可以查出与该生物相关的文献关的文献。生物分类代码生物分类代码/名称是一个五位的代码，代表种级别以名称是一个五位的代码，代表种级别以上的分类组。点击上的分类组。点击list连接可以看到生物系统学代码连接可以看到生物系统学代码。如检索如检索冠状病毒冠状病毒主要概念主要概念主要概念是涉及生命和生物科学领域的相关词汇主要概念是涉及生命和生物科学领域的相关词汇BIOSISPreviews有有168个主要概念词个主要概念词可通过主要概念的列表找到所需概念词汇。列表中可通过主要概念的列表找到所需概念词汇。列表中分为两种格式：字顺列表和按照概念的层级排列分为两种格式：字顺列表和按照概念的层级排列可以输入要查找的学科分类的部分字符，点击查找在选中的学科分类前点击添加后，选择确定,系统会自动跳转到检索界面中主概念检索字段的检索框里主要概念索引辅助工具例例检检索索传传染性疾病患者染性疾病患者护护理的文献理的文献输入检索词选择主要概念字段概念代概念代码码学科编码是一个五位数的编码，代表生命科学中的广泛学科编码是一个五位数的编码，代表生命科学中的广泛的学科领域，每一个编码对应着一个学科名称。点击相的学科领域，每一个编码对应着一个学科名称。点击相应的连接可以看到学科编码和相应的名称。应的连接可以看到学科编码和相应的名称。学科编码与名称用于标引自学科编码与名称用于标引自1993目前年的目前年的BIOSIS的的纪录纪录。共计共计571个五位的学科编码代表了生命科学的大类。个五位的学科编码代表了生命科学的大类。检索代码和名称结果相同检索代码和名称结果相同。概念代概念代码辅码辅助助检检索索找到后，点击学科名词前的添加按钮，返回到检索界面的检索框中可以浏览要查找的学科分类代码可以输入学科名称或代码查找所学的学科词汇例如例如检检索艾滋病患者心理行索艾滋病患者心理行为为的文献的文献检检索技巧索技巧1布尔逻辑运算符布尔逻辑运算符通常使用的运算符有通常使用的运算符有AND、OR、NOT。不区分大小写。不区分大小写如在如在标题字段字段输入入asthmadrugtherapy（系（系统默默认转换为asthmaANDdrugANDtherapy进行行检索）可以索）可以检索索出出标题同同时含有哮喘、含有哮喘、药物和治物和治疗的文献的文献但在但在“出版物名称出版物名称”或或“来源出版物来源出版物”字段中却不能使用字段中却不能使用逻辑运算符运算符检检索技巧索技巧2.位置运算符位置运算符NEAR/x：连接的接的检索索词之之间相隔指定数量的相隔指定数量的单词记录。用数字取代。用数字取代“x”可指定将可指定将检索索词分开的最大分开的最大单词数。数。NEAR=NEAR/15。SAME：连接的两个接的两个检索索词在同一句子内，前后在同一句子内，前后顺序没有要求。在序没有要求。在“地地址址”检索中，使用索中，使用SAME将将检索限制索限制为出出现在在“全全记录”同一地址中的同一地址中的检索索词。NEAR可以用在多数字段中，但不要在可以用在多数字段中，但不要在“出版年出版年”字段中使用。字段中使用。SAME只能用在只能用在“地址地址”字段中，不能用在其他字段中。字段中，不能用在其他字段中。检检索技巧索技巧3 3.通配符通配符通配符通配符可以用在开可以用在开头、中、中间和和结尾。但是特殊字符和出尾。但是特殊字符和出版年不得使用通配符。通配符的使用版年不得使用通配符。通配符的使用规则会随着字段的会随着字段的不同而不尽相同不同而不尽相同。“*”，代表代表0到多个字母，例如到多个字母，例如输入入gene*，可可检索出索出gene、genetics和和generation。“$”，代表代表0到到1个字母，例如个字母，例如输入入disease$，可可检索出索出disease和和diseases。“？”，代表代表1个字符，例如个字符，例如输入入colo?r，可，可检索出索出color和和colour。多个运算符的先后次序：多个运算符的先后次序：SAMENOTANDOR括号可以改变优先运算顺序，并最优先运行，一个括号可以改变优先运算顺序，并最优先运行，一个检索提问中最多可使用检索提问中最多可使用5050个运算符号个运算符号检检索方法索方法基本检索基本检索高级检索高级检索基本检索界面检索框中输入检索词或短语，选择检索字检索框中输入检索词或短语，选择检索字段段的检索方法的检索方法如果检索内容多，可添加多个检索框如果检索内容多，可添加多个检索框例如例如查查找板找板蓝蓝根治根治疗应疗应用的文献用的文献板板蓝根拉丁学名根拉丁学名Isatistinctoria生物学分生物学分类如下：如下：界界植物界植物界门种子植物种子植物门Spermatophyta亚门被子植物被子植物门Angiospermae纲双子叶植物双子叶植物纲Dicotyledones亚纲原始花被原始花被亚纲Archichlamydeae目目罂粟目粟目Rhoeadales科科十字花科十字花科Cruciferae属属菘菘蓝属属Isatis种种板板蓝根根Isatistinctoria板板蓝蓝根治根治疗应疗应用用板板蓝蓝根治根治疗应疗应用用高高级检级检索索例如例如检检索索维生素生素C与与维生素生素E对中中华鳖生生长发育与免疫的影响方面的文献育与免疫的影响方面的文献分析内容：分析内容：维生素维生素C、维生素维生素E、中华鳖中华鳖中华鳖拉丁文中华鳖拉丁文TrionyxSinensis生物学分类如下生物学分类如下Animalia(动物界动物界)Chordata（脊索动物门）（脊索动物门）vertebrata（脊椎动物亚门）（脊椎动物亚门）reptilia(爬行纲爬行纲)testudinata(龟鳖目龟鳖目)chelonia(海龟科海龟科)维生素生素C与与维生素生素E对中中华鳖生生长发育与免疫的影响文献育与免疫的影响文献检检索索结结果果处处理理结果分析结果分析结果显示结果显示结果保存与打印结果保存与打印检检索索结结果分析功能果分析功能多层次的限定与精确的检索多层次的限定与精确的检索发现某研究某研究领域的域的隐含的含的发展展趋势把握学科把握学科领域的最新域的最新动态了解某特定了解某特定课题在不同学科的分布情况在不同学科的分布情况获取某学科取某学科领域的核心研究人域的核心研究人员的信息的信息检检索索结结果分析方法果分析方法8个字段的深入分析：个字段的深入分析：著者著者出版年出版年研究机构研究机构来源期刊来源期刊学科领域学科领域国家与地区国家与地区 文献类型文献类型文献语种文献语种例如分析艾滋病疫苗的相关研究文献例如分析艾滋病疫苗的相关研究文献专专利利权权人分析人分析发发表表论论文最多的作者文最多的作者涉及的研究涉及的研究领领域域发发表文献的主要表文献的主要类类型型检检索索结结果果显显示示简要格式简要格式详细格式详细格式简简要格式要格式记录详细记录详细格式格式详细详细格式超格式超链链接接全文超链接WOS数据库链接检检索索历历史史保存保存检检索索历历史史打开打开/管理保存的管理保存的检检索式索式定定题题跟踪服跟踪服务务保存保存记录记录保存记录的方法检检索索练习练习1.检索检索“禽流感防治方面禽流感防治方面”的文献的文献2.检索硫普罗宁对类风湿性关节炎治疗效果方面的文检索硫普罗宁对类风湿性关节炎治疗效果方面的文献献3.检索嗜肺军团菌的临床微生物学方面的文献检索嗜肺军团菌的临床微生物学方面的文献4.检索氨基乙酰丙酸脱水酶（检索氨基乙酰丙酸脱水酶（aminolevulinate dehydratase）的分离提取研究的文献）的分离提取研究的文献写在最后写在最后成功的基成功的基础在于好的学在于好的学习习惯The foundation of success lies in good habits60 结束语当你尽了自己的最大努力时，失败也是伟大的，所以不要放弃，坚持就是正确的。When You Do Your Best,Failure Is Great,So DonT Give Up,Stick To The End演讲人：XXXXXX 时 间：XX年XX月XX日