2009年医学文献检索

医学信息检索与利用医学信息检索与利用n n 文献检索是一门关于如何查询，获取文献资料知识文献检索是一门关于如何查询，获取文献资料知识和信息的工具性课程。是培养人们独立学习能力的和信息的工具性课程。是培养人们独立学习能力的一种专门知识。由于科学技术发展的日新月异及新一种专门知识。由于科学技术发展的日新月异及新知识的快速增长，独立学习能力成为对信息时代新知识的快速增长，独立学习能力成为对信息时代新型劳动者素质的必然要求。调查研究表明，一个科型劳动者素质的必然要求。调查研究表明，一个科技人员应用的知识总量大约只有技人员应用的知识总量大约只有20%20%是在学校学习是在学校学习中获取，而中获取，而80%80%是在工作和生活中为适应需要而获是在工作和生活中为适应需要而获得的。得的。n n科学技术的飞速发展导致了文献资料的急剧增长。科学技术的飞速发展导致了文献资料的急剧增长。而它的开放性而它的开放性.平等性和交叉性为人们广泛而快捷地平等性和交叉性为人们广泛而快捷地获取信息提供了极大的便利。但是，信息的过量，获取信息提供了极大的便利。但是，信息的过量，信息垃圾的产生等等弊端也给人们带来了巨大困惑。信息垃圾的产生等等弊端也给人们带来了巨大困惑。而通过文献检索这一门学科，可以帮助人们从浩瀚而通过文献检索这一门学科，可以帮助人们从浩瀚而深邃的文献信息中吸取适用的知识。并且为你节而深邃的文献信息中吸取适用的知识。并且为你节约了宝贵的时间。约了宝贵的时间。第一节第一节 信息与信息类型信息与信息类型一一 基本概念基本概念n n 信息信息 信息可以认为是生物体或有一定功能的机器通过感觉器官或相应的设备同外界进行交流的一切内容的总括。人们可以把信息的概念分为三大类：第一类是有关客观物质世界的信息，既信息是事物存在的方式及其运动规律.特点的外在表现形式。第二类是有关人类主观精神世界的信息，它反映人类所感受的事物运动状态及其变化方式，处于意识和思维状态的信息。第三类是有关概念世界的信息，它反映人类所表述的事物运动状态及其变化方式，用语言.文字.图象.影视数据等各种载体来表示。n n信息社会的特征是：1 在信息社会里起决定作用的不是资本而是信息和知识。信息已成为生产力.竞争力和科技成就的象征；2 生产价值的增长主要靠知识和信息；3 从事信息产业的人员占相当大的比例。n n知识知识 知识是人们通过信息 对自然界.人类社会以及思维活动规律的认识与掌握，是人的大脑通过思维重新组合的系统化信息的集合。n n情报情报 情报来源于知识，而知识又来源于信息。任何情报都具有一定的知识和信息，但并非所有的知识.信息都能构成情报，只有那些经过加工并为用户所需要的特定的知识或信息，才称得上情报。情报是一种活化的信息和知识，是一种动态的信息和知识，他能被利用.被活化，否则它仍然是知识.信息的客观存在。n n文献文献 凡属于人类的知识，用文字.图形.符号.声频等手段记录保存下来，并用以交流传播的一切物质形态的载体，都统称为文献。n n信息与知识、文献、情报的关系信息与知识、文献、情报的关系信息与知识、文献、情报的关系信息与知识、文献、情报的关系信息知识 情报 文 献二二 文献的种类文献的种类按文献载体形式分：按文献载体形式分：n n 纸张型 缩微型 声像型 机读型按文献发布的类型分：按文献发布的类型分：n n 图书 期刊 资料按揭示信息内容分：按揭示信息内容分：n n一次文献 二次文献 三次文献n n一次文献是检索的主要对象，而二次检索是检索的手段和工具，三次文献两者兼备。三三 文献检索的基本原理文献检索的基本原理1文献检索文献检索n n文献检索可分为两部分，加工整理.使之能够被利用：利用。一句话，就是将文献按一定方式组织存储在某种载体上，并利用相应的方法或手段，从中找出符合需要的文献的过程。2文献检索语言及检索途径文献检索语言及检索途径n n名称途径名称途径 是以书名.刊名或文章的题名（篇名）作为检索标志，利用书名目录（索引）.刊名目录（索引）或题名索引查找文献的途径。n n 著者途径著者途径 它是以文献上署名的著者.译者.编者的姓名或机关团体名称作为检索标识，利用著者索引或机构名称索引查找文献的途径。n n检索时一般是著者姓在前，用全称。名在后，用首字母。n n分类途径分类途径分类途径分类途径 分类途径是以文献内容在分类系统中所属分类途径是以文献内容在分类系统中所属的类别（其表现形式为分类号）为检索标识，利用分类的类别（其表现形式为分类号）为检索标识，利用分类索引查找文献的途径。索引查找文献的途径。n n分类法分类法 是一种直接体现知识分类的等级制概念标识系是一种直接体现知识分类的等级制概念标识系统。其主要特点是按学科统。其主要特点是按学科.专业集中文献专业集中文献 ，从知识，从知识 分类分类的角度揭示多种不同文献在内容上的区别和联系，提供的角度揭示多种不同文献在内容上的区别和联系，提供以学科分类为出发点的文献信息检索途径。以学科分类为出发点的文献信息检索途径。n n分类法的类目用一种具有自然顺序的标记符号来代表，分类法的类目用一种具有自然顺序的标记符号来代表，这就是分类号。分类号的主要作用在于明确各个类目之这就是分类号。分类号的主要作用在于明确各个类目之间的先后顺序，以便排列目录和组织藏书。同时，分类间的先后顺序，以便排列目录和组织藏书。同时，分类号也是分类检索语言的语词。它代表一个类目，也就表号也是分类检索语言的语词。它代表一个类目，也就表示这个类目的含义，分类号系统也在一定程度上表达各示这个类目的含义，分类号系统也在一定程度上表达各类之间隶属类之间隶属.并列关系。并列关系。中图法中图法的R类简表如下n n：n nR R 医药医药.卫生卫生n n R1R1预防卫生预防卫生n n R2R2中国医学中国医学n n R3R3基础医学基础医学n n R4R4临床医学临床医学n n R5R5内科学内科学n n R51 R51 传染病传染病n n R52 R52 结核病结核病n n R53 R53 寄生虫病寄生虫病n n R54 R54 心脏心脏.血管（循环系）疾病血管（循环系）疾病n n R55 R55 血液及淋巴系疾病血液及淋巴系疾病n n R56 R56 呼吸系及胸部疾病呼吸系及胸部疾病n n R57 R57 消化系及腹部疾病消化系及腹部疾病n n R58 R58 内分泌腺疾病及代谢病内分泌腺疾病及代谢病n n R59 R59 全身性疾病全身性疾病（4）主题途径）主题途径n n主题途径是以表征文献内容特征的并经过规范化主题途径是以表征文献内容特征的并经过规范化了的主题词为检索标识了的主题词为检索标识.利用主题索引查找文献的利用主题索引查找文献的途径。途径。n n主题词按字顺排列，便于查找与主题词相关内容主题词按字顺排列，便于查找与主题词相关内容的文献。非常适合对相互交叉的文献。非常适合对相互交叉.相互渗透的课题进相互渗透的课题进行检索。行检索。n n主题词主题词 它是一种多元性检索用词。它是按照每它是一种多元性检索用词。它是按照每篇文献内容及其学科性质，从特定事物的整体着篇文献内容及其学科性质，从特定事物的整体着眼，选定主题词表中能代表事物概念的眼，选定主题词表中能代表事物概念的.确切的确切的.规范化的名词术语。它是代表文献内容的几个基规范化的名词术语。它是代表文献内容的几个基本单词或词组（即主题词）。并把它作为检索标本单词或词组（即主题词）。并把它作为检索标志。把这些主题词按字顺排列起来，就构成主题志。把这些主题词按字顺排列起来，就构成主题词词主题索引主题索引主题索引主题索引。n n主题词有单级主题和多级主题两种。单级主题在主题词下就可以找到所需文献。而多级主题则采用一级主题.二级主题.三级主题。一级主题就是主题词。二级主题也叫做副主题词。它是对主题词起限定作用的。三级主题也可以说是说明语，它对上面的主题词或副主题词做一补充说明。n n主题词表是标引和检索人员的共同依据。各种检索工具有各自的主题词表，并通过参照系统做规范化处理，使同义词.近义词.同族词.相关词.主题词与非主题词在主题词表中都一目了然。也可通过参照系统指引读者，查找作为主题词的词和主题有关的主题词，扩大检索范围。（5）关键词途径）关键词途径n n关键词途径是以文献的篇名.摘要.以及正文部分出现的具有实质意义的语词为检索标志，利用关键词索引查找文献的途径。n n关键词未经规范化处理，不受主题词表控制，所以又称自由词。n n关键词又可以分题内题外关键词。主题词与关键词的优缺点比较主题词与关键词的优缺点比较 n n主题词主题词n n 采用的词语有较严格的采用的词语有较严格的“规范规范”，主要是对，主要是对一个概念的同义词一个概念的同义词.近义词及变异词等进行适当归近义词及变异词等进行适当归并，以保证词语与概念的一一对应。并，以保证词语与概念的一一对应。n n 进行概念组配检索。（进行概念组配检索。（主题词与副主题词组主题词与副主题词组配，用副主题词对主题词进行限定）配，用副主题词对主题词进行限定）n n 采用参照系统将某些非主题词指向采用的主采用参照系统将某些非主题词指向采用的主题词，并显示相关主题词之间的相互关系。题词，并显示相关主题词之间的相互关系。n na a 用代参照用代参照 seeseen nb b 相关参照相关参照 see relatedsee relatedn nc c词根参照词根参照 n na a 用代参照，揭示等同关系，规范词意。用用代参照，揭示等同关系，规范词意。用“see”see”和和“X”X”表表示。示。n nBirth Control see Family PlanningBirth Control see Family Planningn n生育计划生育计划 （见）（见）计划生育计划生育n n（非主题词）（非主题词）（主题词）（主题词）n nb b 相关参照，揭示相关关系。其作用是扩大选词范围。用相关参照，揭示相关关系。其作用是扩大选词范围。用“see see related”related”（参见）和（参见）和“XR”XR”（反参见）表示。在该主题词下列出（反参见）表示。在该主题词下列出相关参照相关参照n nFamily PlanningFamily Planning（计划生育）（主题词）（计划生育）（主题词）n nsee relatedsee relatedn nContraceptionContraception（避孕）（主题词）（避孕）（主题词）n nXR ContraceptionXR Contraceptionn n“see related”“see related”前后都是主题词，两主题词之间有相关关系前后都是主题词，两主题词之间有相关关系n nc c 词根参照，一般用于解剖学用词。词根参照，一般用于解剖学用词。Consider also terms atConsider also terms atn nglomervlglomervl_n n(肾小球肾小球)n n 采用类似分类的方法编制主题词分类索引和等采用类似分类的方法编制主题词分类索引和等级索引。（树状结构表）级索引。（树状结构表）n n 主题词表每年都进行修改。保证了用词的准主题词表每年都进行修改。保证了用词的准确性。确性。n n 采用主题倒置，便利在同一主题下进行检索。采用主题倒置，便利在同一主题下进行检索。n nAnemia,Anemia,AplasticAplastic (贫血，再生障碍性贫血，再生障碍性)n nAnemia,Hemolytic Anemia,Hemolytic（贫血，溶血性）（贫血，溶血性）n nAnemia,Hemolytic Anemia,Hemolytic AutoimuneAutoimune （贫血，自（贫血，自身免疫性溶血性）身免疫性溶血性）n nAnemia,Anemia,HypochromicHypochromic （贫血，低血色素性）（贫血，低血色素性）n nAnemia,Neonatal Anemia,Neonatal （贫血，新生耳）（贫血，新生耳）n nAnemia,pernicious Anemia,pernicious （贫血，（贫血，恶性）恶性）n n 查全率较高。查全率较高。n n 由于它的由于它的“规范规范”，所以缺乏灵活性。，所以缺乏灵活性。n n关键词n n 关键词使用方便。易被人接受。n n 大大节省了检索系统的存储时间，缩短了检索工具出版的时差。n n 随着现代科技发展.新概念.新名词的不断出现，关键词能很好地适应这种变化。n n 它不显示词与词之间的等级关系和相关关系，增加了检索文献的难度。n n 查全率不高。第二节第二节 计算机检索与数据库计算机检索与数据库n n一一一一 计算机计算机计算机计算机检索发展简史检索发展简史n n 1 1脱机检索脱机检索n n 2 2连机检索连机检索n n 3 3光盘检索光盘检索n n 4 4网络检索网络检索n n二二 数据库的类型与结构数据库的类型与结构n n 1 1数据库的类型数据库的类型n n书目数据库书目数据库n n事实数据库事实数据库n n数值数据库数值数据库n n全文数据库全文数据库n n图象数据库图象数据库2 数据库的结构数据库的结构1.文档(File)2.记录(Record)3.字段（Field）n n题名、著者、文献来源三个字段构成题录。题录是检索结果显示和文献后所列参考文献的常用格式，也是获取原文所需要的基本信息。题录基本格式n n药物流行病学研究方法n n王永铭等n n复旦大学药学院药理教研室n n药物流行病学杂志 2004.12.10 10（5）527531由题录索取原文的途径n n图书馆n n全文数据库n n作者n n馆际互借n n等.三三 计算机计算机检索的途径n n 1自由词检索n n 2主题词检索n n 3分类检索n n 4著者检索n n 5引文检索n n 6机构检索n n 7刊名检索 n n 8默认检索n n默认检索又称缺省检索.隐含检索，它是指在检索系统预先设定的多个字段中进行检索。列如Medline 数据库中，Search 状态为默认检索所有非限制字段，包括标题.著者.文献出处.文摘.主题词等字段，但不包括语种.出版年等限制字段；CBMdisc 中的“缺省”检索是在中文标题.文摘.主题词.关键词.特征词.刊名6个字段中搜词检索；SCI 光盘数据库中有Basic Index 选项，供检索标题（Title word）,关键词（Keyword）和文摘（Abstractword.）n n9限定检索n n不少数据库提供“limit”检索功能，用来对检索出结果进行数量限定。n n10其他检索途径三三 文献检索的方法和步骤文献检索的方法和步骤n n 1 基本方法n n 常用法 n n 顺查法，倒查法，抽查法n n 追溯法n n 分段法n n 浏览法 四四 检索的步骤n n 1 分析检索课题，明确检索要求n n 2选择数据库n n 3选择检索途径n n 4确定检索词n n 5构筑检索提问式上机检索操作n n 6调整检索策略n n 7输出检索结果n n 8获取原始文献n n 9创建文献跟踪服务第三节第三节 检索式编写与检索策略调整检索式编写与检索策略调整一一 运算符运算符n1布尔算符布尔算符n布尔算符有布尔算符有and,or,not 3 种种n n （1）and nand称为称为“逻辑与逻辑与”，表示，表示“相交相交”关系，可用来缩小检索范关系，可用来缩小检索范围。围。n 如如：检索式：检索式 A and Bn（2）or n or 称为称为“逻辑或逻辑或”，表示，表示“并列并列”关系，可用来扩大检索范关系，可用来扩大检索范围。围。n 如：检索式如：检索式 A or B n （3）notn not称为称为“逻辑非逻辑非”，表示，表示“排斥排斥”关系。关系。n 如如：A not B（4）布尔算符用法 n n 3个布尔算符中，not 优先运算，and其次运算，or最后运算。如果要改变运算次序，用括号来表示括号内的运算符先运算。n n例如：检索式 甲肝 and 婴儿 or 乙肝and婴儿n n表示检索婴儿患甲型肝炎或乙型肝炎方面的文献记录。上述检索式也可以写成：（甲肝or乙肝）and婴儿。但写成甲肝or乙肝and婴儿它的检索结果就大不相同了。n n2 位置算符n n位置算符又称邻近符表示检索词在记录中的间隔距离。n n位置算符适用于自由词检索。不同的检索系统的位置算符不尽相同。常见的有 near,N,W,adj 等。在WinSPIRS WinSPIRS 是运行Windows环境下的美国“银盘公司信息检索系统”(The Silver Platter Information System)WinSPIRS检索系统供检索银盘公司出版的Medline,EMBase,BA等多种光盘数据库。系统中位置算符的表达意思是：n n near表示左右两个检索词出现在同一句句子中（有的数据库用same 表示）；n n near 1表示左右两个检索词紧相邻；n nnear 2表示左右两个检索词之间可以有一个单词或没有单词；n nnear 3表示左右两个检索词之间可以有两个或两个以下单词；n n依此类推。n n 比较检索“舌根”的几个检索词n n tongue near1 base 只能出现 tongue base的记录n ntongue near2 base 可以命中出现tongue base和 base of tongue 的记录n ntongue near3 base 可以命中出现 tongue base.base of tongue 和 basen nof the tongue 的记录。n n3 3 字段限定符字段限定符n n 不用字段限定检索时是在默认的几个基本字段中进行检索，不用字段限定检索时是在默认的几个基本字段中进行检索，字段限定检索则是在指定字段中进行检索。字段限定检索使检索字段限定检索则是在指定字段中进行检索。字段限定检索使检索趋向于查准。字段限定检索的表达形式有：趋向于查准。字段限定检索的表达形式有：“字段标识符检索字段标识符检索词词”，“字段标识符（检索词）字段标识符（检索词）”，“检索词、字段标识符检索词、字段标识符”，最常见的形式是最常见的形式是“检索词检索词 in in 字段标识符字段标识符”。例如：。例如：n n hepatomahepatoma in in ti ti-检索标题中含有检索标题中含有hepatomahepatoma的记录；的记录；n n smith-b in au-smith-b in au-检索著者字段中出现该著者的记录；检索著者字段中出现该著者的记录；n n 顾玉东顾玉东 in au-in au-同上；同上；n n anemia in anemia in ti ti ，mesh-mesh-检索标题字段或检索标题字段或MeSHMeSH字段中出现字段中出现anemiaanemia的记录；的记录；n n animal in animal in tgtg-检索特征词字段中出现检索特征词字段中出现animalanimal的记录；的记录；n n nature in so-nature in so-检索期刊检索期刊NatureNature上发表的文章；上发表的文章；4.截词符（truncation）n n 在英语中，有不少含义相同或相近的词与词干相同，词尾不同，如单复数词、英美不同拼词法、同一单词派生出来的名词、动词、动名词和分词等。为了查全，有时这些词都应编入检索式，用运算符or相连接。但这样做大大增加了键盘的输入工作，况且许多同根词未必都能记住。截词符的应用，简化了这一问题。常用的截词符有“*”和“?”。n n*称为“无限截词”，表示任何数量的字符，用来查相同词根的所有词。例如，输入immun*，可一次性查出含有immun，immune，immunal，immunity，immunology，immunization，immunizations的记录。n n?称为“有限截词”，表示一个字符或零个字符。例如，输入computer?来检索，可以查到含有computer，computers，computering，computerize 的记录，但对含有computerization的记录检索无效。用pe?diatrics检索，可检索到含有pediatrics和peadiatrics的记录。二、检索式编写n n 检索式又称检索提问式（query），是情报用户向检索系统表达文献需求的句式。简单提问式和复合提问式。简单提问式只含一个检索词，只表达一个简单的检索概念，例如：n nSARSn nhepatitis b virus in tin n（乙型肝炎病毒）n n 舒喘灵n n 吴阶平 in aun n n n 复合提问式含有两个或两个以上的检索词，用布尔算符或位置算符相连接。n n 【例1】acute near3 pancreatitis and(mice or mouse)（急性胰腺炎的小鼠实验）n n “胰腺炎”之间用位置算符near3是因为其间有可能出现以下词汇：necrotizing（坏死型），biliary（胆汁型），gallstone（结石型），severe（严重型），and chronic（及慢性）等词汇。Mice是mouse（小鼠）的复数。n n 【例例2 2】(renal calculi or kidney calculi or kidney(renal calculi or kidney calculi or kidney stone*)and(surgery or operation)stone*)and(surgery or operation)（肾结石的（肾结石的手术治疗）手术治疗）n n Kidney stoneKidney stone后用截词符表示同时需要检索含有后用截词符表示同时需要检索含有kidney stoneskidney stones的文献记录。的文献记录。n n 为了使文献查全，本检索式列出了为了使文献查全，本检索式列出了“肾结石肾结石”的的3 3个个同义词同义词 和和“手术治疗手术治疗”的两个同义词。在无主题词的的两个同义词。在无主题词的数据库中，提问式中的检索词只检索命中与著者用词完数据库中，提问式中的检索词只检索命中与著者用词完全一致的文献记录，即不命中同义词。检索式中列全同全一致的文献记录，即不命中同义词。检索式中列全同义词，是用于检索无主题词字段的数据库。对于有主题义词，是用于检索无主题词字段的数据库。对于有主题词字段的数据库，不必如此。例如通过词字段的数据库，不必如此。例如通过MedlineMedline检索此检索此课题，提问式应写成：课题，提问式应写成：n n kidney calculi-surgerykidney calculi-surgeryn n其中其中kidney calculikidney calculi是是Medline Medline 的主题词，的主题词，surgerysurgery是是副主题词。副主题词。n n 【例例3 3】Asthma-chemically-induced and Asthma-chemically-induced and aspirin-adverse-effectsaspirin-adverse-effects（阿司匹林诱发哮喘）（阿司匹林诱发哮喘）n n 本例是检索本例是检索MedlineMedline数据库的检索式。其中数据库的检索式。其中asthmaasthma（哮喘）是主题词，（哮喘）是主题词，chemically chemically inducedinduced（化学诱导）是副主题词，（化学诱导）是副主题词，AspirinAspirin是主题是主题词，词，adverse effectsadverse effects（副作用）是副主题词。副主（副作用）是副主题词。副主题词必须紧跟在主题词后面使用。题词必须紧跟在主题词后面使用。n n 主题词和副主题词在不同的数据库中未必相同。主题词和副主题词在不同的数据库中未必相同。在数据库在数据库EMBaseEMBase中，中，“阿司匹林阿司匹林”所用主题词是所用主题词是acetylsalicylic acidacetylsalicylic acid，而不是，而不是aspirinaspirin，药物，药物“副作副作用用”方面的副主题词是方面的副主题词是adverse drug reactionadverse drug reaction（用于药物主题词后面）和（用于药物主题词后面）和side-effectside-effect（用于疾病（用于疾病主题词后面）。主题词后面）。n n 【例例4 4】心脏瓣膜疾病的综述文献心脏瓣膜疾病的综述文献n n 本例如果查本例如果查CBMdiscCBMdisc，检索式可能用：心脏瓣膜，检索式可能用：心脏瓣膜疾病疾病 and and 综述综述 in ptin pt；如果检索；如果检索MedilineMediline，有人会，有人会用检索式：用检索式：heart valves diseases and review in heart valves diseases and review in ptpt。这两个检索式都会造成明显的漏检。这两个检索式都会造成明显的漏检。n n “心脏瓣膜疾病心脏瓣膜疾病”是数据库是数据库CBMdiscCBMdisc中的主题词，中的主题词，heart valves diseasesheart valves diseases是是 MedlineMedline的主题词。该主的主题词。该主题词还有题词还有1010多个下拉位主题词，如：主动脉瓣关闭多个下拉位主题词，如：主动脉瓣关闭不全、主动脉瓣狭窄、二尖瓣闭锁不全、三尖瓣闭不全、主动脉瓣狭窄、二尖瓣闭锁不全、三尖瓣闭锁等。要查全各种心脏瓣膜疾病方面的文献，应当锁等。要查全各种心脏瓣膜疾病方面的文献，应当使用下拉位词扩检（见第三章第一节和第三章第三使用下拉位词扩检（见第三章第一节和第三章第三节）。检索式中的综述节）。检索式中的综述 in ptin pt和和review in ptreview in pt表示检表示检索综述文献。索综述文献。n n 检索要领与检索策略的调整检索要领与检索策略的调整 n n当文献量过少时如何进行扩检：n n删除某个用and连接的不重要的检索词。n n增加用or连接的检索词。n n位置算符放宽。n n检索词后用截词符。n n多用副主题词。n n用下位类主题词扩检。n n同时用主题词和关键词检索，用or连接。n n用著者检索、分类检索进行检索补充。n n多选几个数据库检索。n n当文献量过多时如何进行缩检：n n增加用and连接的检索词、或用二次检索。n n用特定的副主题词进行限定。n n用字段限定检索。n n进行文献类型、语种、核心期刊、年份等的限定检索。n n进入更专指的分类范围内输词检索。