文摘索引型数据库

,Click to edit Master title style,Click to edit Master text styles,Second level,Third level,Fourth level,Fifth level,*,*,Click to edit Master title style,Click to edit Master text styles,Second level,Third level,Fourth level,Fifth level,*,*,Click to edit Master title style,Click to edit Master text styles,Second level,Third level,Fourth level,Fifth level,*,*,Click to edit Master title style,Click to edit Master text styles,Second level,Third level,Fourth level,Fifth level,*,*,Click to edit Master title style,Click to edit Master text styles,Second level,Third level,Fourth level,Fifth level,*,*,Click to edit Master title style,Click to edit Master text styles,Second level,Third level,Fourth level,Fifth level,*,*,单击此处编辑母版标题样式,*,*,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,*,Click to edit Master title style,Click to edit Master text styles,Second level,Third level,Fourth level,Fifth level,*,文摘索引型数据库,内容提要,文摘库概述,PubMed,2,文摘索引型数据库概述,报道和提醒文献的外部特征题名、著者、出处、卷期、页码、时间、文献类型、语种，同时对文献的内容进展摘要性描述的检索工具。,文摘报道和提醒的一般是单篇文章,3,生物医学领域中外文摘索引数据库,美国全科医学文献数据库(Medline),荷兰医学文摘数据库(Embase),美国生物学文摘数据库(BIOSIS Previews),美国化学文摘数据库(SciFinder),美国科学引文索引数据库SCI,中国生物医学文献数据库CBM,中文生物医学期刊文献数据库CMCC,4,5,6,7,8,9,10,文摘索引数据库特点,提供原文的摘要信息,摘要信息包括：题目、作者、刊名，或同论文相关信息,数据量大，文献类型多、信息量大,收录文献回溯年代长,收录文献期刊种类多,出版形式多样,11,文摘索引数据库使用情况,12,文摘数据库的作用,1.,可了解和把握某课题领域研究动态和研究现状,2.,找到全文的重要和必要线索,3.,判断自己课题的新颖性,对不熟悉的语种文章，看英文摘要即可,科研评价,学位论文选题、开题、课题查新时文献调研的重要途径,13,文摘索引数据库掌握要领,1.数据库的概况,2.数据库的构造,3.数据库的检索界面,4.数据库的检索技巧与方法,14,PubMed,数据库,15,主要内容,1. 数据库概况,2. 数据库检索机制,3. 数据库的组成构造,4. 检索界面,5. 检索方法与技巧,16,PubMed,概况,1.创立机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI),2.类型：Web数据库,3.,4.特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，局部文献还可在网上直接免费获得全文。,5. 学科范围：生物医学、生命科学、行为科学、生物工程、化学等学科。,6.与Medline光盘数据库的区别：检索机制、检索界面、检索方法以及收录文献数量不同。,17,PubMed,数据来源,：包括OLDMEDLINE,2.In Process Citations：每天收录，尚未经标准处理的数据。,3.Publisher-Supplied Citations：由出版商提供的电子文献，每条记录标有PubMed-as supplied by Publisher。,18,PubMed,检索机制,1自动截词转换匹配功能(Automatic Term Mapping),对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进展对照匹配和转换，再进展检索。词表匹配转换顺序是：MeSH表(MeSH translation table)、期刊刊名表(Journal translation table)、全体作者表(Full author translation table)、作者索引(Author Index)、全体调查者表(Full investigator translation table)、调查者索引(Investigator Index)。如果在以上6个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。,2短语检索(Phrase Searching),也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作为一个词组进展检索，可用双引号“ 将其引起来。如：“drug therapy作为词组进展检索的词，系统不进展自动转换匹配，也不进展MeSH词的扩检。,19,1.逻辑运算符：,逻辑与：AND，逻辑或：OR，逻辑非：NOT。当一个检索表达式中同时含有三个运算符时，运算顺序从左至右，括号可以改变运算顺序。,2.截词符：*，一个词或字拼写出局部字母后面加上一个截词符，chem*表示用词根进展检索。,Heart attack* 会关闭自动转换匹配检索词，myocardial infarction, myocardial stunning, shock等词,3.双引号：“ ，表示对引号中的短语进展检索。,4.检索字段标识符：tag，tag为字段名称。,ti，au，ta，so，la，pt。,PubMed,检索运算符,20,常用字段组成,标识符 字段名称,TI Title,AU Author,AD Affiliation,AB Abstract,DP Publication Date,EDAT Entrez Date,SO Source,TA Journal Title Abbreviation,MH MeSH Terms,PT Publication Type,21,检索界面,根本检索,高级检索,MeSH Database检索,限定检索,期刊查询(Journals Databases ),引文匹配器(Citation Matcher),临床查询(Clinical Queries),22,翻开搜狗浏览器,用户名：jf20210001,密码：123456,23,24,PubMed,检索方法,1.根本检索：在根本检索界面下完成的检索方法,2.高级检索：高级检索界面下进展的检索方法,3.MeSH Database检索：MeSH主题词界面下进展的检索方法,25,根本检索,26,根本检索,1.关键词、词(词组)或短语：,2. Smith JS 或 Smithau,3.期刊刊名：GENE THERAPYTA，JAMATA,4.截词：CHEMO*,5.复杂表达式：CANCER AND THERAPY,6.#1 AND #2,27,艾滋病的药物治疗,Aids drug therapy,28,Search details,检索过程,(acquired immunodeficiency syndromeMeSH Terms OR (acquiredAll Fields AND immunodeficiencyAll Fields AND syndromeAll Fields) OR acquired immunodeficiency syndromeAll Fields OR aidsAll Fields),(drug therapySubheading OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields) OR drug therapyAll Fields OR drug therapyMeSH Terms OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields),29,修改后的检索结果,30,高级检索,31,高级检索,32,MeSH Database,检索,33,输入查找的主题词,Aids drug therapy,34,主题词注释,35,树状构造表,36,款目词,37,检索步骤,38,39,查看检索历史,40,限定检索,1.限制检索或条件检索：Limits,(1)日期：Date of publicationDP原始文献出版日期；Entrez DateEDAT文献首次录入PubMed日期；MeSH DateMHDA文献被MeSH词条标引日期。,(2)地址：单个词加标识符ad,(3)带有摘要文献的检索 ：CANCER AND hasabstract,(4)数据库子集的限定：特殊主题的检索 AMERICAN AND history sb,2.限定检索完毕后，及时取消限定条件,41,限定检索,42,限定检索,43,点击取消,44,PubMed,几种检索方法的选择,根本检索,高级检索,MeSH Database检索,45,举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献,根本检索,1.检索表达式： children asthma drug therapy,2.直接输入检索框中，进展检索,46,47,检索过程Search details,(childMeSH Terms OR childAll Fields OR childrenAll Fields),AND,(asthmaMeSH Terms OR asthmaAll Fields) AND,(drug therapySubheading OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields) OR drug therapyAll Fields OR drug therapyMeSH Terms OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields),修改检索式：,childMeSH,Terms AND asthmaMeSH,Terms AND drug therapySubheading,48,49,举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献,MeSH,Database,检索,1.,确定主题词：,child asthma,drug therapy(,副主题词,),2.,查找主题词,50,51,52,53,54,55,56,举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献,高级检索,1.,确定检索词：,child asthma drug therapy,2.,选择检索字段,3.,输入检索词,57,58,59,60,Journals Databases,主题、刊名全称或缩写、,ISSN,61,单篇文献匹配器,62,临床咨询,63,特殊专题咨询,64,检索结果,显示,保存,打印,65,显示格式,Summary(简要格式),Abstract文摘格式,MEDLINE,66,保存格式,1.File(文件),格式,67,检索策略的存储和调用,使用,My NCBI(Cubby),首先要登记注册,保存检索策略,定期浏览新的检索结果,68,注册或登录个人帐号,69,注册后的功能,保存、修改、删除检索式,70,其它功能,全文链接,相关文献链接,相关数据库的链接,RSS,阅读器的使用,71,全文链接,72,全文链接,73,检索练习,1.检索有关“禽流感(bird flu)预防控制方面的文献,2.检索微量元素缺乏(trace elements)与皮肤病(skin diseases)关系的文献限英文综述,3.利巴韦林ribavirin治疗SARS方面的综述文献,4.眼结核(ocular tuberculosis)引起失明(blindness)的文献,5.北京大学韩济生教授发表的英文文献,6.CANCER LETTERS期刊上查找有关基因治疗方面的文献,74,1.,检索过程和步骤,2024/9/29,75,1分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念之间的相互关系如下：,预防控制,禽流感,事物与特征的关系,75,2024/9/29,76,2选择检索方式为叙词检索，在PUBMED数据库中即为选择MeSH入口进展检索。,3编制检索策略。,Influenza in Birds / prevention and control 禽流感 / 预防控制,其中 主题词为： Influenza in Birds禽流感,副主题词为： prevention and control 预防控制,76,2.,检索过程和步骤,2024/9/29,77,1分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念之间的相互关系如下；,皮肤病,微量元素缺乏,因果关系,此外，课题还要求只要英文综述文献。,综述,英文,+,77,2024/9/29,78,2选择检索方式为叙词检索，在PUBMED数据库中即为选择MeSH入口进展检索。,此外， PUBMED数据库提供有检索结果滤镜Result Filters，可对检索结果按照不同分面进展显示，其中有按照文献语种、文献类型等分面的显示。,2024/9/29,78,78,2024/9/29,79,3编制检索策略。,Trace Elements / deficiency 痕量元素 / 缺乏,Skin Diseases / etiology 皮肤疾病 / 病因学,其中 主题词为： Trace Elements 、 Skin Diseases,副主题词为： deficiency 、 etiology,79,PubMed,检索小结,1.任何一项研究主题都有多个检索途径，要比较多个检索途径的结果，那个更适合该项研究主题,Details描述检索过程,3.*关闭自动转换匹配功能,4.限定检索条件要及时关闭，否那么会影响后续的检索结果,80,谢谢！,81,谢谢大家！,结 语,82,Thank You !,不尽之处，恳请指正！,