20071016质粒dna的提取及定量定性分析

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单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,Q&A,关于PCR结果分析,关于产物回收漂洗作用:换缓冲液,除杂乙醇:保存目的产物离心:去乙醇,除液体,保证后续工作补救:勿轻易弃置; 高盐结合,重复漂洗。,关于,1,1 2 3 4 5 6 M 7 8 9 10 11 12,Fig. 1 Agarose Electrophoresis analysis of the PCR products.,Lane 1Lane 12:products of PCR M:DNA marker (from top to bottom:2000bp,1000bp,750bp,500bp,250bp,100bp),引物或其二聚体,问题:,10泳道:上样错位?错误模板?引入污染?热启动不够? 回收,重新电泳鉴定。,1、12泳道:未加引物或模板。,2,相邻泳道溢出污染,非特异性!,Good,!PCR仪中的位置,3,边缘效应?,4,!,5,胶融!外溢,胶融!,6,质粒DNA的提取及其定性定量分析,基因的克隆与表达专题之二,7,主要内容,一、质粒,DNA,提取,二、琼脂糖电泳鉴定及半定量,三、紫外吸收定量及纯度检测,8,基本原理,结构差别,分子量差别,变性复性,SDS碱裂解,9,碱裂解,碱变性,一、质粒DNA的提取流 程,接含pETBlue-2(质粒的单菌落于4mL LB 羧苄(50ug/mL )和四环素(12.5ug/mL)液体培养基中,37,0,C,190rpm振荡培养过夜,4000rpm、离心1min,收集所有菌体,150uL溶液I悬浮菌体(旋涡混匀),室温10min,加入200uL溶液II(轻轻混匀!),室温静置菌液裂解变清,接菌,培养,收菌,碱裂解,10,加入200uL溶液III(,轻轻混匀!,),冰上静置15min质粒DNA复性,12000rpm,离心10min,上清加,等体积,的酚:氯仿:异戊醇(,旋涡混匀,),12000rpm,离心5min,上清加,等体积,的氯仿:异戊醇(,旋涡混匀,),12000rpm,离心5min,复性回收,纯化,11,上清加2倍体积的无水乙醇(,旋涡混匀,),室温 30min,12000rpm,离心10min,沉淀用75%乙醇1mL洗涤两次(,振荡混匀、离心,),12000rpm,离心5min,沉淀于超净台中风干,(5min20min),沉淀加入20uL RTE,60,0,C水浴30分钟溶解,-20,0,C保存,醇沉回收,溶解,保存,离心标识,12,碱裂解,溶液,冰浴,pH 8.0,剧烈振荡,10,min,溶液粘稠混浊,13,碱裂解,溶液,现用现配,切勿振荡!颠倒混匀,T 5min,SDS,包被,!,14,复性回收,溶液,冰上预冷,切勿振荡!颠倒混匀,15,min,仅质粒复性?在哪相?,!,15,制 胶:,1%,琼脂糖(,20,mL,,,1xTAE),缓冲液:,1,xTAE,,,130,mL,制 样:质粒,DNA 2L 10xloading 0.5L,Marker,:,5L,电 泳:,80,伏恒压,结果分析:鉴定(定性,纯度);半定量,二、质粒DNA的电泳,16,测定流程:质粒,DNA,稀释,100,倍(用,TE,缓冲液稀释),总体积300, L,检测波长:,定量:,C=OD,260,*50*,稀释倍数(,g/,mL,),纯度指标:,三、质粒DNA的紫外吸收检测,260nm核酸280nm蛋白,OD,260,/OD,280,比值范围:1.82.0,污染成分:蛋白,酚 质粒DNA RNA,17,下次实验的简介与准备,18,DNA 重 组酶切和连接,基因的克隆与表达专题之三,19,预习:在实验中如何进行对照?,思考:工程菌的常用种类及用途? 质粒的种类及特性? 分子生物学中常用的内切酶?连接酶? 抗生素种类?为什么应用抗生素?,灭菌:,1,mL,、,200,L,、,10,L,枪头各一盒,1.5,mL,小指管,40,个,20,加油啊!,21,2000,1000,750,500,200,100,M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 C,关于PCR退火条件摸索,22,
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