DNA的提取方法简介课件

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单击此处编辑母版标题样式,*,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,DNA,的提取方法简介,为了研究,DNA,分子在生命代谢中的作用,常常需要从不同的生物材料中提取,DNA.,由于,DNA,分子在生物体内的分布及含量不同,要选择适当的材料提取,DNA。,动植物中,小牛胸腺动物肝脏鱼类精子,植物种子的胚中都含有丰富的,DNA。,微生物中,谷氨酸菌体含7%10%,面包酵母含4%,啤酒酵母含6%,大肠肝菌含9%10%。,从各种材料中提取,DNA,方法不同,分离提取的难易程度也不同。,对于低等生物。如从病毒中提取,DNA,比较容易,多数病毒,DNA,分子量较小,提取时易保持其结构完整性。,从细菌及高等动植物中提取,DNA,难度大一些。细菌,DNA,分子量较大,一般达210 道尔顿。因此易被机械张力剪断。细菌,DNA,,除核,DNA,外,还有质粒,DNA,等。,1、核酸的理化性质,RNA,和核苷酸的纯品都呈白色粉末或结晶,,DNA,则为白色类似石棉样的纤维状物。除肌苷酸、鸟苷酸具有鲜味外,核酸和核苷酸大都呈酸味。,DNA、RNA,和核苷酸都是极性化合物,一般都溶于水,不溶于乙醇、氯仿等有机溶剂,它们的钠盐比游离酸易溶于水,,RNA,钠盐在水中溶解度可达40,g/L。DNA,在水中为10,g/L,,呈黏性胶体溶液。在酸性溶液中,,DNA、RNA,易水解,在中性或弱碱性溶液中较稳定。,天然状态的,DNA,是以脱氧核糖核蛋白(,DNP),形式存在于细胞核中。要从细胞中提取,DNA,时,先把,DNP,抽提出来,再把,P,除去,再除去细胞中的糖,,RNA,及无机离子等,从中分离,DNA 。,DNP,和,RNP,在盐溶液中的溶解度受盐浓度的影响而不同。,DNP,在低浓度盐溶液中,几乎不溶解,如在0.14,mol/L,的氯化钠溶解度最低,仅为在水中溶解度的1%,,,随着盐浓度的增加溶解度也增加,至1,mol/L,氯化钠中的溶解度很大,比纯水高2倍。,RNP,在盐溶液中的溶解度受盐浓度的影响较小,在0.14,mol/L,氯化钠中溶解度较大。因此,在提取时,,常用此法分离这两种核蛋白。,细菌有坚硬的细胞壁,首先要破碎经胞。方,法有三种:,机械方法:超声波处理法、研磨法、,匀浆法;,化学试剂法:用,SDS,处理细胞;,酶解法:加入溶菌酶或蜗牛酶,都可,使细胞壁破碎。,2.细胞的破碎,由于高等动物,DNA,主要存在于细胞核与线粒体中,所以提取时有两个困难(高等植物与此类似):,破碎细胞难;从处死动物,分离组织器宫到破碎细胞费时长。在此时期间,DNA,可能会被,DN,ase,降解,而动物组织:特别是肌肉组织很难破碎,即使是较易破碎的肝,肾等组织也往往使用组织匀浆器,易造成,DNA,断裂。,分子量大,一般比细菌的大23个数量级,比病毒的大45个数量。对不同生物材料,要根据具体情况选择适当的分离提取方法。,3.,DNA,提取的几种方法,(1).浓盐法,利用,RNP,和,DNP,在电解溶液中溶解度不同,将二者分离,常用的方法是用1,M,氯 纳提取化钠抽提,得到的,DNP,粘液与含有少量辛醇的 氯仿一起摇荡,使乳化,再离心除去蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相及氯仿相中间,而,DNA,位于上层水相中,用2倍体积95%乙醇可将,DNA,钠盐沉淀出来.,也可用0.15,MNaCL,液反复洗涤细胞破碎液除去,RNP,再以1,MNaCL,提取脱氧核糖蛋白,再按氯仿-异醇法除去蛋白.,两种方法比较,后种方法使核酸降解可能少一些.,以稀盐酸溶液提取,DNA,时,加入适量去污剂,如,SDS,可有助于蛋白质与,DNA,的分离。在提取过程中为抑制组织中的,DNase,对,DNA,的降解作用,在氯化钠溶液中加入柠檬酸钠作为金属离子的烙合剂.通常用.15,MNaCL,0.015M,柠檬钠,并称,SSC,溶液,提取,DNA.,(2).阴离子去污剂法:,用,SDS,或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取,DNA .,由于细胞中,DNA,与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,因为阴离子去污剂能够破坏这种价键,所以常用阴离子去污剂提取,DNA.,(3).,苯酚抽提法:,苯酚作为蛋白变性剂,同时抑制了,DNase,的降解作用.用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与,DNA,联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而,DNA,溶于水相。离心分层后取出水层,多次重复操作,再合并含,DNA,的水相,利用核酸不溶于醇的性质,用乙醇沉淀,DNA 。,此时,DNA,是十分粘稠的物质,可用玻璃漫漫绕成一团,取出。此法的特点是使提取的,DNA,保持天然状态 .,( 4).水抽提法:,利用核酸溶解于水的性质,将组织细胞破碎后,用低盐溶液除去,RNA,,然后将沉淀溶于水中,使,DNA,充分溶解于水中,离心后收集上清液.在上清中加入固体氯化钠调节至2.6,M.,加入2倍体积95%乙醇,立即用搅拌法搅出.然后分别用66%,80%和95%乙醇以及丙铜洗涤,最后在空气中干燥,既得,DNA,样品.此法提取的,DNA,中蛋白质含量较高,故一般不用.为除蛋白可将此法加以改良,在提取过程中加入,SDS.,二. 从猪脾中提取,DNA,1. 操作步骤:,取鲜猪脾,去脂、血,称取10,g,用预冷的1,SSC,溶液洗2次,剪碎。,按睥:1,SSC=1; 5W/V,加入50,ml,预冷的1,SSC,,用高速组织,捣碎机破碎8次,每次5秒,中间间隔30秒。,将匀浆液放在烧杯中, 于冰盐浴中冷却30分钟。4000转/分钟离心10分钟。充掉上清。沉淀物中再加2倍体积的1,SSC,搅匀,离心,弃上清,重复2次。,将所得沉淀悬于5倍体积的,PH8.0、0.15MNaCL0.1Na,2,MEDTA,溶液中。边搅拌边漫漫滴加5%,SDS,最终浓度达1%为止。然后加入固体氯化钠使其最终浓度达1,mol/L,,继续搅60分钟,以确保氯化钠全溶。所得混合液倒入磨口塞的锥形瓶中,加入同体积氯仿异戊醇,激烈振荡20分钟,4000,r,离心20分钟,上层水相取出后倒入烧杯,以同积氯仿异戊醇重复去蛋白2次。,取出水相于烧杯中,逐渐加入2倍体积95%乙醇,玻棒搅动,,DNA,纤维绕于璃玻棒上后挤干,用70%乙醇洗,DNA,纤维2次,用95%乙醇洗一次,再用乙醚洗一次,取出并挤干,。,2. 实验材料,仪器和试剂:,(1),实验材料:新鲜猪脾:,(2)仪器:量筒:110、3100烧杯:2100,2250;磨,口锥形瓶:1250、1500;吸管:11、110;滴管、玻棒、,离心机、电动搅拌器、台秤、剪刀、镊子。,(3),试剂:,20,SSC:175.2gNaCL,88.2g,柠檬酸钠2,H,2,O,PH=7.0,加,水至1000,ml;,1SSC,0.1SSC,由做相应的稀释得来;,NaCL-Na,2,EDTA,液:8.77,gNaCL,3.72gNa,2,EDTA,溶于,800,ml,蒸馏水中,用固体,NaOH,调,PH=8,后定容至1000;,5%,SDS(W/V):6gSDS,溶于100,ml45%,乙醇中;,氯仿-异戊醇=24:1(体积比), 其他:95%乙醇,盐冰.,数据:,DNA,重,产率:,待测液中测得的核酸,g,数,DNA%= 100,待测液中制品的,g,数,二苯胺显色法测定DNA含量,强酸、加热条件下,可以使,DNA,中的嘌呤碱基与脱氧核糖间的糖苷键断裂,而产生嘌呤碱基,脱氧核糖与嘧啶核苷酸。其中2脱氧核糖在酸性环境中成为,羟基,酮基戊醛,此物与二苯胺反应生成蓝色化合物,在595,nm,处有最大吸收。,DNA,在40-400,g,范围内光密度与,DNA,浓度成正比。在反应液中加入少量乙醛可提高灵敏度,而且其他化合物的干扰也显著降低。当样品含少量,RNA,时不影响测定,而蛋白质、多种糖及其衍生物芳香,羟基醛都能与二苯胺形成各种有色物质,干扰测定,。,、二苯胺试剂:使用前称取0.8,g,二苯胺(需在70%乙醇试剂中重结晶2次),溶于180,ml,冰乙酸中,再加入8,ml,过氯酸(60%以上),混匀待用,临用前加入0.8,ml 1.6%,乙醛溶液,所配试剂应为无色。,每组需56,ml,共需2800,ml,、DNA,标准溶液:(须经定磷法确定其浓度)取标准,DNA,以0.01,N NAOH,配成200微克毫升的标准液。,每组需12,ml,共需600,ml,、1.6%,乙醛:取47%乙醛3.4,ml,,加重蒸水定容至100,ml(,放于冰箱中,一周之内可以使用)。,共需70,ml,、,(测样品液:准确称取猪脾,DNA,或用紫外分光法中剩下的,DNA,液配成10微克毫升的溶液。,每组需4,ml,共需200,ml,操作方法: 1.,DNA,标准曲线的制定: 取10支试管,分成2组,依次加入0.4、0.8、1.2、1.6和2.0,mlDNA,标准溶液。添加蒸馏水,使之都成为2,ml。,另取2只试管,各加2,ml,蒸馏水作为对照。然后各加入4,ml,二苯胺试剂,混匀。于60 恒温水浴中保温1,h,,冷却后于595,nm,处进行比色测定。取两管平均值,以,DNA,浓度为横坐标,光吸收值为纵坐标,绘制标准曲线。 2. 制品的测定: 取2支试管,各加2,ml,待测液(内含,DNA,应在标准曲线的可范围之内)和4,ml,二苯胺试剂,摇匀。其于操作同标准曲线的制作。 3.根据测得的光吸收值,从标准曲线待测上查出相应该光吸收值,DNA,的含量,计算出制品中的百分含量。,1.为什么在低温下进行?,2.,分别加柠檬酸钠和,EDTA,的作用 ?,3.加,SDS,的作用?,4.加,NaCL,的作用,为什么要加到1,mol/L?,5.,加入异戊醇有什么作用?,
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