医学文献检索总论-课件

单击此处编辑标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,医学文献检索,文检基础,医学文献检索,医学文献检索,信息素质教育,信息素质：信息社会中人应具备的基本素质与能力。,美国信息产业协会主席茹可夫斯基,信息意识培养（内在需求：目前、长远）,信息技能训练,信息素质与学科的整合,运用信息技术进行所需信息的识别、获取、利用和创新，学会自主地进行研究性的学习、合作学习，培养创造性思维，把所学的信息技术知识应用到解决现实的实际问题中来。,信息素质教育信息素质：信息社会中人应具备的基本素质与能力。美,医学文献检索,课程特色,以网络信息环境为基础,以获取利用知识信息为前提,以创新知识的创造性应用为目的,本质特征,方法学的工具性,医学文献检索、医学统计学、临床流行病学、医学逻辑学、医学论文写作等,价值体现的间接性,医学文献检索课程特色,教学安排,总论与SinoMed,Pubmed与Embase 实习,中文全文数据库 实习,WOK 实习,外文全文数据库 实习,循证医学信息资源检索 实习,网络信息资源检索,特种文献资源检索,医学论文写作/医学信息综合利用,答疑,教学安排总论与SinoMedPubmed与Embase,文献的概念,记录有知识的一切载体,知识：,是人们通过信息对自然界、人类社会以及思维活动规律的认识与掌握，是人的大脑通过思维重新组合的系统化信息的集合。,信息：,在自然界、人类社会以及人类思维活动中普遍存在，是物质的一种基本属性，是物质存在方式及其运动的规律、特点的外在表现。,世界三大资源：信息、物质、能源,文献的概念记录有知识的一切载体,文献的类型,按文献载体类型分：,印刷型：,便于直接阅读。,缩微型：,以感光材料为载体，通过摄影方法使文献体积缩小。体积小，存贮密度高，成本低，易复制、保存和携带。,视听型：,包括唱片、幻灯、电影、录音录像等制品。闻其声，见其形，存贮、保管能力强。,数字型（计算机阅读型）：,通过一定的编码和程序，把文献存贮在磁带、磁盘或光盘上。信息存贮量大，检索速度快而准确。,文献的类型按文献载体类型分：,文献的类型,按文献的内容性质（级别）分：,一次文献：,作者的原始创作，直接记录科研成果，报道新技术、新发明、新见解的文献。,专著、期刊论文、学位论文、会议论文、科技报告、专利说明书等。,二次文献：,将分散的无组织的一次文献经过收集整理，著录文献的特征（篇名、作者、分类号、文献出处、内容摘要等），并按主题、著者、书名、分类号等依次排列，使其有序，以便查找。,目录、索引、文摘等，又称检索工具。,文献的类型按文献的内容性质（级别）分：,文献的类型,按文献的内容性质（级别）分：,三次文献：,在利用二次文献的基础上，选用大量一次文献，经过阅读研究，并浓缩提练而成（也称为高级情报产物）。,综述、述评、年鉴、进展、百科全书等。,从一次文献到二次、三次文献，是一个由博到约、由分散到集中、由无组织到系统化的过程。从文献检索的角度看，一次文献是检索的主要对象，二次、三次文献是检索的主要手段和工具。,文献的类型按文献的内容性质（级别）分：,文献的类型,按文献的出版形式分：,图书：,图书的特点是内容全面、系统、成熟、可靠，但出版周期长，反映的内容不够新颖、及时。,教科书、专著、丛书、工具书等。,期刊：,是最主要的文献情报源，出版周期短、报道速度快、信息量大、内容新颖、能及时反映学科的最新进展。,资料：,是指图书、期刊以外的各种文献资料，又称非书非刊资料。,专利文献、会议文献、学位论文、科技报告、技术标准等。,文献的类型按文献的出版形式分：,期刊论文,科研工作者对科学领域的现象进行研究，记录探索未知的过程和科学研成果并以科学论文的形式发表在专业期刊上，形成期刊论文。,期刊论文反映科研工作的水平和价值，是科研工作者获取科研信息的主要来源。,随着期刊种类的增多、文献量的激增以及学科的交叉重复，直接从专业期刊获取信息效率太低，借助于各种检索工具获取文献信息或获得文献线索后再从期刊获取原文是目前科研工作者获取信息的主要手段。,期刊论文科研工作者对科学领域的现象进行研究，记录探索未知的过,核心期刊,核心期刊的概念,刊载某学科文献密度大、载文率、被引用率及利用率较高，深受本学科专家和读者关注的期刊中的精华。,确定核心期刊和评价期刊质量的常用方法,载文率法、引文法。,评价期刊的常用工具,中文核心期刊要目总览、中国科技期刊引证报告、JCR,核心期刊核心期刊的概念,期刊影响因子,IF（影响因子）,某年内SCI来源刊引用该刊前二年发表论文总次数 / 该刊前二年发表论文篇数,前二年某刊发表的论文被SCI来源期刊引用的总次数/该刊前二年发表论文的篇数,II（当年被引率）,某刊当年发表的论文被SCI来源刊引用的次数 / 该刊当年发表论文篇数,期刊影响因子IF（影响因子）,期刊联合目录,期刊联合目录,揭示与报道多个文献收藏单位所收藏的期刊目录，是沟通文献信息、实现馆际互借和文献资源共享的重要工具。,全国外文生物医学期刊联合目录,全国高等医药院校图书馆外文期刊联合目录,期刊联合目录期刊联合目录,信息检索与文献检索,信息检索,收集、组织、存储一定范畴的信息，并可供用户按需要查询信息的技术和过程。,信息加工（存储）-信息检索,信息组织的方法即信息加工、标引等（主题词、分类.）-提高查全率、查准率,文献检索,以获取文献信息为目的的信息检索。,信息检索与文献检索信息检索,文献信息检索语言,文献信息检索语言的定义,根据文献信息检索的需要而创制的人工语言。（检索语言、文献存储与检索语言、标引语言、索引语言等）,描述文献外表特征的检索语言：,依据文献外表特征（题名、著者、文献序号、引用文献等）作为文献存储标识和文献检索提问的出发点而设计的索引语言。,描述文献内容特征的检索语言：,分类检索语言、主题检索语言、代码检索语言。,网络环境下的一体化语言,文献信息检索语言文献信息检索语言的定义,文献信息检索语言,描述文献内容特征的检索语言,分类检索语言：,按学科、专业集中文献，从知识分类的角度揭示多种不同文献在内容上的区别和联系，提供以学科分类为出发点的文献信息检索途径。,分类表,主题检索语言：,以反映文献内容的主题词或关键词作为文献存储和检索的标识。,叙词法：严格规范化、可进行概念组配、具有完善参照系统、具有范畴索引等；,关键词法：以出现在文献的标题、摘要或全文中能表达文献实质内容的词或关键性专业名词术语作为检索标识。,文献信息检索语言描述文献内容特征的检索语言,文献信息检索语言,描述文献内容特征的检索语言,代码检索语言：,用代表事物的代码作为标识系统的索引语言。（化合物分子式索引、环状化合物环系索引、化学物质号索引等）,网络环境下的一体化语言,随着网络的发展与普及，人们对网络信息资源的需求与日俱增。为了提高人们获取网络信息的效率，各种一体化语言系统，如分类语言与主题语言一体化、自然语言与人工语言一体化等在网络信息资源的组织和利用中得到了广泛的应用。,文献信息检索语言描述文献内容特征的检索语言,文献信息检索语言,网络环境下的一体化语言,分类主题语言一体化：,对分类表和叙词表中的术语、参照、标识及索引实施统一的控制，使两者有机地融为一体，从而实现分类主题一体化标引和一体化检索的检索语言。,自然语言与人工语言一体化：,分类检索与主题检索途径在一定程度上影响了人们获取信息的效率，而自然语言的检索则更容易为人们所接受。（检索词自动转换系统、智能检索系统 ）,一体化医学语言系统（Unified Medical Language System，UMLS）（1986，美国国立医学图书馆）,文献信息检索语言网络环境下的一体化语言,文献检索效果评价,查全率,被检出相关文献量 / 相关文献总量,查准率,被检出相关文献量 / 被检出文献总量,漏检率,未检出相关文献量 / 相关文献总量,误检率,被检出非相关文献量 / 被检出文献总量,文献检索效果评价,数据库,定义,计算机把大量的数据项有机地集中起来存放在数据文件中，构成一个存放数据的整体，即数据库。,数据结构,各项数据以构成一张横竖对齐的二维表格形式存放于数据文件中，一个以二维表格形式存放在磁盘上的数据文件称为数据库文件（库文件）。,数据库定义,数据库,数据结构,所谓数据库，是由一个或有联系的多个数据库文件组成的集合。此类数据库是以数据项之间的二维关系来处理数据的，也称为关系型数据库,。,数据库数据结构,检索策略的制订,步骤,分析检索课题所包含的概念,对每个概念进行检索,用逻辑运算式表达课题检索要求,涉及问题,逻辑运算,概念的检索,举例,检索有关PCR诊断病毒性肝炎的文献,检索策略的制订步骤,计算机检索的运算符,逻辑运算符,逻辑与 AND,逻辑或 OR,逻辑非 NOT,计算机检索的运算符逻辑运算符,中国图书馆分类法,概念,依一定的思想观点，以学科分类为基础，综合图书资料的内容、特点，分门别类组成分类表。5部类：马克思主义、列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论；哲学；社会科学；自然科学；综合性图书。下分22个大类，用22个汉语拼音字母（A-K、N-V、X、Z）列出：如A为马列毛邓，B为哲学宗教，G为文化、科学、教育、体育，Q为生物科学，R为医药卫生，Z综合性图书等。在字母后用阿拉伯数字表示下位类目的划分。,中国图书馆分类法概念,中国图书馆分类法,R 医药、卫生,1 预防医学、卫生学 2 中国医学,3 基础医学 4 临床医学,5 内科学 6 外科学,71 妇产科学72 儿科学,73 肿瘤学74 神经病与精神病学,75 皮肤病学与性病学76 耳鼻咽喉科学,77 眼科学778 口腔科学,79 外国民族医学 8 特种医学,9 药学,中国图书馆分类法R 医药、卫生,中国图书馆分类法,可细分至六、七级类目，如 ：,R6 外科学,R65 外科学各论,R655 胸部外科学,R655.1 胸壁,R655.2 胸膜,R656 腹部外科学,R656.1 急腹症,R656.2 腹部疝,R656.3 腹壁,R656.31 腹壁炎症,R656.32 腹壁损伤,中国图书馆分类法可细分至六、七级类目，如 ：,中国图书馆分类法,分类号标记：,汉语拼音字母与阿拉伯数字相结合的混合制号码。,复分号：,为了区别于一般图书，对教材、工具书等，在其分类号后加复分号，如R245-61（针灸辞典），R711-43（妇科学教材）。,对于临床各科（R5-R8），有专门复分表：,01 预防、控制和卫生02 病理学、病因学,03 微生物学、免疫学04 诊断学,05 治疗学06 并发症,07 预后08 诊疗器械、用具,09 康复,例：R511.3-05 天花治疗学,中国图书馆分类法分类号标记：汉语拼音字母与阿拉伯数字相结,关键词与主题词,关键词,出现在文献的标题、摘要或全文中能表达文献实质内容的词或关键性专业名词术语,主题词（叙词）,以规范化的词汇来表达文献内容的主题，这种词汇叫主题词(叙词)。,严格规范化、可进行概念组配、具有完善参照系统、具有范畴索引等,主题词表,关键词与主题词关键词,医学主题词表,概念,美国国立医学图书馆邀请专家、学者汇集约16,000多个医学主题词并加以整理，使之规范化，编制成的一个表，即医学主题词表(Medical Subject Headings，简称Mesh)。,MeSH 附有各种参照和注释，它是对生物医学文献进行标引和检索的依据。,英汉对照医学主题词注释字顺表,医学主题词表概念,医学主题词表,作用,在标引人员将情报输入检索系统以及检索者(用户)利用系统内情报这两个过程中，以主题词作为标准用语，使标引和检索之间用语一致，达到最佳检索效果。在手工和联机检索前，查阅医学主题词表是制定检索策略的重要依据。,cancer、carcinoma、tumor、neoplasms,肝癌、肝细胞癌、肝恶性肿瘤,肝疾病：肝炎、肝硬化、肝脓肿,医学主题词表作用,医学主题词表,主题词变更表,年新增主题词,年删去主题词,年累积新增主题词,字顺表(Alphabetic List),字顺表将主题词、次要主题词(非主题词)、款目词(非主题词)按字顺统一排列。,范畴表,(Categories and Subcategories),树状结构,医学主题词表主题词变更表,医学主题词表,主题词的规范与选择,对于自然医学语汇中同义词、近义词、学名与俗名的处理,Cancer *Neoplasms (近义词),German Meales * Rubella (同义词),Vitaman C * Ascorbic Acid (学、俗名),Deoxyribonucleic Acid * DNA (繁、简称),癌症 *肿瘤,脱氧核糖核酸 * DNA,有 * 者为IM规范化主题词,医学主题词表主题词的规范与选择,医学主题词表,主题词的规范与选择,倒置主题词,SHOCK, CARDIOGENIC(心源性休克),SHOCK, HEMORRHAGIC(出血性休克),SHOCK, SEPTIC(败血性休克),SHOCK, SORGICAL(外科性休克),SHOCK, TRAUMATIC(创伤性休克),复合主题词经倒置后，各种有关休克的文献都集中在SHOCK这个主题词下。,医学主题词表主题词的规范与选择,医学主题词表,主题词的规范与选择,倒置主题词,肝炎，甲型,肝炎，乙型,肝炎，丙型,肝炎，丁型,肝炎，戊型,复合主题词经倒置后，各种有关肝炎的文献都集中在肝炎这个主题词下。,医学主题词表主题词的规范与选择,医学主题词表,副主题词,概念,副主题词(Subheadings)又称限定词(Qualifiers)，用它将某一主题词的概念进行复分，使主题词具有更高的专指性。,1989-1990年IM使用的副主题词是77个，1991-1994年是80个。,Adverse Effects, Chemistry, Diagnosis, Pharmacology, Pharmacokinetics, Analysis, Administration & dosage, Drug Therapy, Therapeutic Use, Toxicity, Surgery, Nursing, Metabolism, Drug Effects, Etiology ,医学主题词表副主题词,医学主题词表,副主题词,脑肿瘤的外科手术,脑肿瘤/外科手术,Brain Neoplasms/Surgery,心血管疾病的死亡率,心血管疾病/死亡率,Cardiovascular Disease/Mortality,风湿热的病因学,风湿热/病因学,Rheumatic Fever/Etiology,医学主题词表副主题词,医学主题词表,副主题词,作用,在一个主题词下面往往收录了许多篇文献，用若干副主题词，可以把内容相近的文献集中到相应的副主题词下面，让读者有目的地选择查阅。,减少误组配,病毒性肝炎引起的肝癌的治疗,肝炎，病毒性，人 肝肿瘤 治疗,肝炎，病毒性，人/原发性,肝肿瘤/治疗,肝肿瘤/病因学,医学主题词表副主题词,医学主题词表,副主题词,组配原则,并非每一个副主题词都能与任何一个主题词组配。使用每个副主题词应根据MeSH树形结构标明的范畴恰当地与主题词组配。,Diagnosis(C，F3)，是指Diagnosis只限于与C类(疾病类)，F3类(行为与精神疾病)组配。,医学主题词表副主题词,医学主题词表,范畴表 Categories and Subcategories,概念,范畴表又称树形结构(Tree Structure)。此表是将字顺表中的主题词(主要叙词)、次要叙词按其学科性质、词义范围的上下类属及派生关系，分别划为15大类。依次用A-N，Z代表。在15个类目中，有9类又分若干子类目，加用数字代表，子类目共有101个。子类目下面又分若干更小的类目，这就是通常供检索使用的主题词，共一万六千多个，都按其医学概念的性质分别列入各自所属的类目之下。,医学主题词表范畴表 Categories and Subca,医学主题词表,范畴表 Categories and Subcategories,GASTROINTESTINAL NEOPLASMS 胃肠道肿瘤,INTESTINAL NEOPLASMS 肠肿瘤,CECAL NEOPLASMS 盲肠肿瘤,APPENDICEAL NEOPLASMS 阑尾肿瘤,COLONIC NEOPLASMS 结肠肿瘤,COLONIC POLYPS 结肠息肉,. .,. .,DUODENAL NEOPLASMS 十二指肠肿瘤,ILEAL NEOPLASMS 回肠肿瘤,. .,. .,医学主题词表范畴表 Categories and Subca,医学主题词表,范畴表 Categories and Subcategories,GASTROINTESTINAL NEOPLASMS 胃肠道肿瘤,C4.588.274.476,INTESTINAL NEOPLASMS 肠肿瘤,C4.588.274.476.411,CECAL NEOPLASMS 盲肠肿瘤,C4.588.274.476.411.184,APPENDICEAL NEOPLASMS 阑尾肿瘤,C4.588.274.476.411.184.290,COLONIC NEOPLASMS 结肠肿瘤,C4.588.274.476.411.306,医学主题词表范畴表 Categories and Subca,医学主题词表,范畴表 Categories and Subcategories,ANALEPTICS,D27.505.954.888,兴奋剂,ALMITRINE 阿米三嗪,AMPHETAMINES 苯丙胺类,AMPHETAMINE 苯丙胺,DEXTROAMPHETAMINE 右苯丙胺,METHAMPHETAMINE 甲基苯丙胺,PHENTERMINE 苯丁胺,CAFFEINE 咖啡因,CONVULSANTS 惊厥药,ALLYLGLYCINE 烯丙苷氨酸,BEMEGRIDE 贝美格, ,医学主题词表范畴表 Categories and Subca,医学主题词表,字顺表与树形结构(范畴表)在功能上的关系及利用,查全率与查准率是文献检索的两大要素，这两者关系到词表的科学设计。医学主题词表通过“字顺表”反映主题词之间的横向关系，通过“树状结构”揭示词与词之间的纵向隶属关系。两个表相互配合，形成一个功能完善的检索体系，以满足检索者对文献查准与查全要求。,医学主题词表字顺表与树形结构(范畴表)在功能上的关系及利用,谢谢大家,谢谢大家,