肿瘤分子诊断学课件

,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,肿瘤分子诊断学,41、实际上，我们想要的不是针对犯罪的法律，而是针对疯狂的法律。马克吐温,42、法律的力量应当跟随着公民，就像影子跟随着身体一样。贝卡利亚,43、法律和制度必须跟上人类思想进步。杰弗逊,44、人类受制于法律，法律受制于情理。托富勒,45、法律的制定是为了保证每一个人自由发挥自己的才能，而不是为了束缚他的才能。罗伯斯庇尔,肿瘤分子诊断学肿瘤分子诊断学41、实际上，我们想要的不是针对犯罪的法律，而是针对疯狂的法律。马克吐温,42、法律的力量应当跟随着公民，就像影子跟随着身体一样。贝卡利亚,43、法律和制度必须跟上人类思想进步。杰弗逊,44、人类受制于法律，法律受制于情理。托富勒,45、法律的制定是为了保证每一个人自由发挥自己的才能，而不是为了束缚他的才能。罗伯斯庇尔 肿瘤的分子诊断本章主要内容,一、分子诊断概述,二、肿瘤的分子诊断,三、分子诊断在肿瘤研究中的应用,四、分子诊断发展前景及存在的问题,在长期的语文教学实践中，笔者深感作文教学是长期困扰广大师生的重要问题。从学生方面来说，他们不喜欢作文，不想写作文，觉得无话可说，谈到写作就头痛；写出来的作文也是生搬硬套，缺乏生活体验，内容空洞，言之无物，且书写潦草、错别字多、语句不通顺等现象相当普遍。更有甚者，全盘抄袭范文或同学的作文以应付交差。从教师方面来说，他们常常埋怨学生的作文能力低，批改作文草草了事，而很少深入探讨原因。结果是，班级中写作水平较高的学生寥寥无几。,一、造成作文教学水平下滑现状的原因,1.思想不端正。在指导思想上，教学效果仍以期中、期末考试成绩作为奖罚的依据。多数教师都从教学“实惠”的角度出发，主要抓基础知识教学和阅读能力教学，而挤掉了作文指导课和写作课，忽视了作文教学。许多教师都认为，作文指导课见效不大，不能收到较好的效果；作文主要靠学生自己的积累和情感体验；教师指导的多寡和写作练习次数的多少，在一个学期或一个学年里对学生作文水平的影响不明显，努力难见成效。此外，在期末考试的作文评卷时，由于时间紧、任务重，教师多以卷面字迹的好坏、作文的长短来作为评分的主要标准，而作文水平的高低未能拉开距离，这就严重挫伤了学生的学习兴趣和写作的积极性。,2.指导未到位。作文指导课大打折扣，可以说对作文指导不得力，未落实。有些教师由于准备不充分，随随便便取一个作文题目，就叫学生作文。却不指导学生怎样确定写作目的和中心思想，不教会学生掌握搜集材料和取舍材料的方法，不帮助他们拟写作文提纲，不讲解关于文章谋篇布局的知识。这样，对于怎样写开头、结尾，如何锤炼语言，如何突出重点等问题，学生都不太清楚。此外，对于学生上交的作文，也是马虎地批阅了事，而不作详细的评价指导，不提出恰当的建议。在评讲课上，读优秀文章多，分析不成功的文章少。由于学生在写前、写中以及写后均未得到老师强有力的指导，因此，他们很少有成功的体验，就更谈不上培养浓厚的写作兴趣了。,3.数量不达标。众所周知，质的飞跃是从量变的积累开始的，没有量的积累就不可能有质的飞跃。同理，学生要写好作文也是从多写开始的。在实践中运用所学的知识，并逐渐形成技能、技巧，从而提高作文水平，这是学生写好作文的必由之路，所谓熟能生巧就是这个道理。但现在，一些学生作文的篇数以及每篇作文的字数均未达到标准要求。有个别严重的，一个学期只写了一两篇作文，课外练笔几乎是零。这样的练习量怎能使学生提高作文水平呢？,凡此种种弊端和积习都严重影响了学生作文素养的提高。新课程标准强调：写作要感情真挚，力求表达自己对自然、社会、人生的独特感受和真切体验；有独立完成写作的意识，注重写作过程中搜集素材，构思立意，列纲起草，修改加工等环节。由此可见，作文教学亟待改革。广大语文教师应切实加强作文教学，以适应新课程标准的要求，只有这样，才能培养出适应社会发展需要的人才。,二、从情感教育入手，激发学生的写作兴趣,怎样提高学生的写作能力？笔者认为，应首推情感教育，“感人心者，莫先乎情”（白居易）。,1.培养学生热爱生活的情感。心理学原理告诉我们，情感是人对客观事物的一种态度，反映了客观事物与人的需要之间的关系。这表明，写作离不开生活，作文的素材应来源于生活。因此，培养学生热爱生活的情感是提高他们的写作能力的前提，也是解决有写作“活水”的问题的有效途径。教师应教育学生做生活中的有心人，并注意撷取生活中的朵朵浪花，捕捉生活细节。,2.激发学生喜欢作文的激情。激情是一种迅速强烈地爆发的情感，应不失时机地、多形式地激起学生的写作冲动。首先，应改革命题，以引发写作情感。情感是作文实现双重转化的催化剂。引发情感的途径很多，而改革命题最为重要。好的命题能拨动心弦，使学生产生不吐不快的冲动；好的命题是点燃情感的火种，激发心中之“物”的药剂，启动心中之“意”，并向外宣泄的闸门。说自己想说的话，写自己想写的人、事、景，抒自己内心蕴藏的真挚感情。其次，教师还应发掘习作中的闪光点、成功处，坚持鼓励的原则，每次都挑选部分优秀习作进行讲评和修改，然后积极向有关报刊推荐，以扩大影响，树立榜样。,3.改革评语，慎用评语。言为心声，作文包含着丰富的感情，积聚着学生创作的心血，学生的每一篇文章都希望得到老师的好评。“大红勾+阅”或程式化的评语常会使学生望而生厌。“文学”即“人学”，处于青春期的学生渴望被人关怀，被人理解；渴望得到别人的肯定和赞赏；渴望老师在适当的时候给予点拨。因此，教师应根据不同的学生的个性、情况，从人出发，做到因文而异，并相机而言，晓之以理，动之以情。此外，在给作文下评语时，还得下工夫，要求得师生间在心理上的沟通，以取得良好的教育效果。,作为教师，如果只给学生讲述一些空洞的理论知识，就很难提高他们的写作能力和写作兴趣。因此，教师也应“与生同乐”，“了解民情”，采取下水作文和同步作文等方式。下水作文，就是在每次作文前后，自己也写一篇同题作文，并对学生讲评，以起到引导或总结的作用。同步作文，则是与学生在课堂上同做一道题目，时间相等，以体会学生写作的甘苦。实践证明，这两种方法都备受学生的欢迎，写作课往往在热烈的掌声中结束，教师也在学生中树立了威信。“亲其师，信其道”。学生热爱写作的情感培养起来了，整个语文作文教学也就省力多了。,现代社会要求公民具备良好的人文素养和科学素养，具备创新精神和开放的视野。教师应为社会负责，为个人的发展负责；并切实履行自身的职责，做到爱岗敬业。此外，由于作文是学生人文素养的一面镜子，因此，语文教师应醉心于作文教学，并不断探索和改革作文教学方法，以提高学生的写作能力。,Junior high school language teachers in rural areas under the New Criteria on,how to carry out the language classroom,Tan Ye-xi,Abstract: language classroom teaching to be distinguished from a simple language teaching. Here that the language classroom teaching is a teacher he taught language classes in his entire teaching process strategies and methods adopted to achieve so that students want to learn music learn, and ultimately achieving improving the teaching quality. Rather than simply the study of teaching languages. However, in the New Curriculum, rural junior high school language teachers will be how to carry out classroom teaching? The author in the rural junior high school language teaching in recent years has done some exploration: a junior high school students to help clear learning objective, and correct attitude toward learning. 2 concerns individual differences, opportunities for each student. Three serious participation in the classroom into a pleasant relaxed into the classroom. This practice will enable students interested in language courses so that students want to learn music learn in order to achieve the purpose of improving the teaching quality.,语文课堂教学要区别于单纯的语文教学。这里说的语文课堂教学,是指教师他所教的语文课,在他的整个教学过程中所采取的策略和方法,以达到让学生想学乐学,最终达到提高语文教学质量。而不是单纯的研究语文文本的教学。这里为什么只谈农村初中语文教师如何开展语文课堂教学呢?只是因为农村初中语文教学更为困难。如农村初中学生生活与阅读知识面窄,同一个班的学生成绩参差不齐,相距甚远。客观事实上农村学习环境差,几乎多数家长对孩子的学习不管不问。加之学生主观上不知自己读书学习为何?因此,学生学习毫无兴趣,教师上课启而不发。课堂教学难以展开,提高语文教学质量困难重重。面对农村这种初中语文教学的现象,我和许多农村初中语文教师一样彷徨茫然。然而在新课标下,我们又将如何开展农村初中语文课堂教学呢?笔者在农村初中近几年的语文教学中,做了一些探索,为培养学生对语文课的兴趣和主动学习意思,达到想学乐学,来提高语文教学质量的目的,取得了一定的成效。,一、帮助初中新生明确学习目的,端正学习态度,怎样帮助初中新生明确学习目的,端正学习态度,其实许多教师对这个问题并不怎么重视,甚至,近些年来一些著作和杂志对此也论述的很少。然而,我却以为这个问题很重要,学生之所以不爱学习的症结也就在这个节骨点上。对于刚从小学升入初中的学生来说,他们虽然成了初中的学生,但他们还并不知道读书学习是为何,所以学习毫无目的,不当一回事,养成了许多坏的习惯。发现这种情况,我在七年级新生入学的第一节语文课堂上,从不急于开始上新课文。一贯以来,我的这个第一节课,总是要从许多方面跟他们讲为什么要读书,我说特别是我们来自农村的孩子更应该要知道读书的道理。对于这个貌视很简单的问题,我不只在第一节课上讲,而是把它贯穿在整个学期甚至几个学期中,用不同的时间,举不同的例子,细致入微的,晓之以理的,跟他们讲这些道理。在老师的耐心教导下,他们终于明白了读书学习的重要性,慢慢的一个一个学生转变了,他们端正了学习态度。开始上课认真听讲,上课积极举手发言,作业能认认真真的写好每一个字,努力的开始向上爬了。他们虽然知道的晚了一点,但老师心里还是兴慰不已。,二、关注个体差异,机会给予每个学生,在一个班的几十个学生中,除了他们的成绩不一样外,他们的性格爱好更是有很大的不同。作为当教师的特别要细心观察他们的每一点动向,关爱每一个学生,保护他们的学习积极性至关重要。语文课程标准指出:“语文课程必须根据学生身心发展和语文学习的特点,关注学生的个体差异和不同的学习需求,爱护学生的好奇心、求知欲,充分激发学生的主动意识和进取精神。”学生的积极性有许多方面都可以调动。如:一个学生他今天把字写好了,你老师就要对他肯定并进行表扬。这个学生他明天,回答对了一个问题,那你就当即给予表扬进行鼓励。再例如,课堂上教师提问不能太难,有时要让大多数同学都能答得到。当一个平时不爱举手的同学他偶然举手时,你一定要及时点他回答,不管他回答对与不对都要给他鼓励。总之,教师要给机会这些学生,能让他们能够表现,使他们能像班里的优生那样自尊心得到满足。只有这样他们的自信心才从此开始产生,他们心灵的那扇窗户才能启开。这样的故事我有很多。班里有个叫张远鸿的同学听说他在小学时就经常不做作业,一个连作业都不经常做的学生他的成绩就可想而知了。然而在我的引导下,他不但每次能完成作业,而且作文也能认真的写。在一次写我的母亲的作文里有一段,他写道:“母亲在家里早晚总忘不了到镜子前照一下镜子里的她,嘴里连说老了,老了。她饭吃了以后就到附近去玩,跟母亲玩的好的女人们都说,母亲越变越年轻了,还是跟以前一样漂亮。母亲的心里乐开了花。”这篇作文把生活中的母亲写的可见可感,如在眼前。语言清新,不加修饰,朴素自然。于是我在评讲作文时,把他的作文拿到班里念,作为优秀作文进行评讲。此同学在这节作文评讲课里,始终全神贯注,精神饱满,看上去仿佛变了一个人似的,对学习充满了渴望。班里的其他同学也跟他一样,个个鸦雀无声,好像都被他的作文所感染带进了作文的意境中。这节课在我看来,对他来说非常不平常,是他告别对学习毫无兴趣转而对学习充满神秘的憧憬的一个分水岭。从此后,他在学习上一天一个进步。在以后的作文课里,我用同样的方式,激励和转化了好多个这样学生的例子。如有上课注意力常常不集中好讲小话,作业完成不了的涂阳鑫、上课以前从不带笔和本子的张学贵等等 说来也巧,我就是用这种方式让这个上课注意力不集中,好讲小话,连作业都不能完成的涂阳鑫在第十届“新世纪”杯全国中学生作文大赛中获得了二等奖。通过这些例子,我反思道:对于学生做教师的我们要投入感情,给与关注;对于学习中取得荣誉的机会要均等,要让有不同差异的学生都能有机会得到;对于课堂,要让它变为知识与感情的交融,教师与学生的信任。,肿瘤分子诊断学41、实际上，我们想要的不是针对犯罪的法律，而,1,肿瘤分子诊断学课件,2,肿瘤分子诊断学课件,3,肿瘤分子诊断学课件,4,肿瘤分子诊断学课件,5,分子诊断目前主要应用于,人类遗传病的基因诊断和产前诊断,肿瘤,感染性疾病病原体（细菌、病毒）,多基因病,组织器官移植配型,性别鉴定,法医学,医学分子生物学基础研究应用,分子诊断目前主要应用于人类遗传病的基因诊断和产前诊断,6,肿瘤的分子诊断,肿瘤的分子诊断,7,与肿瘤相关的基因,癌基因,抑癌基因,DNA错配修复基因,与肿瘤相关的基因癌基因,8,癌基因：,是存在于致瘤病毒、人和动物细 胞中能导致细胞恶性转化，促进 细胞生长和增殖的一类基因。,Ras C-Met,Myc Mdm2,Neu Bcl-2,癌基因：是存在于致瘤病毒、人和动物细,9,抑癌基因：,是正常细胞内存在的能够抑制细胞恶性转化， 对正常细胞的增殖起负性调节作用的基因， 抑癌基因失活后正常细胞增殖失控，转化形 成肿瘤细胞。,Rb PTEN APC MCC VHL,P53 FHIT WTI DPC4,P16 BRCA NF1NF2 nm23,P15 DCC HNPCC,抑癌基因：是正常细胞内存在的能够抑制细胞恶性转化，,10,肿瘤分子诊断的基础 ,基因改变,点突变,基因扩增,基因缺失、易位或重排,DNA甲基化,DNA多态,肿瘤分子诊断的基础,11,原癌基因,恶,性,肿,瘤,激活方式 abl 慢性粒细胞白血病,易位,bcl2 B细胞淋巴瘤,易位 bcl3 慢性粒细胞白血病,易位,cerbB 鳞状细胞癌、星形细胞瘤,扩增,cerbB,2,乳腺癌、卵巢癌、胃癌,扩增,lym1 B细胞淋巴瘤,易位,pml 急性前髓白血病,易位,myc Burkitt淋巴瘤、肺癌、乳腺癌、子宫癌,易位,Lmyc 肺癌,扩增,Nmyc 神经母细胞瘤、视网膜母细胞瘤,扩增 Hras 膀胱癌、胃癌、鼻咽癌、宫颈癌、黑素瘤、,点突变,Kras 肠癌、肺癌、胰腺癌、卵巢癌、胆囊癌、甲状腺癌、黑素瘤,点突变,Nras 急性粒细胞白血病、急性淋巴细胞白血病、 点突变,生殖泌尿道癌、 甲状腺癌、肝癌、黑素瘤,ret 甲状腺癌,重排,Ksam 胃癌,扩增,sis 星形细胞瘤、骨肉瘤、横纹肌肉瘤,？,src、,fes,肠癌、急性早幼粒细胞白血病,？,tal1 急性淋巴细胞白血病,易位,trk 甲状腺癌,重排,ros 急性粒细胞白血病、急性非淋巴细胞白血病,？,fms 绒癌、外阴癌、畸胎瘤,扩增,常见原癌基因的激活方式和人类肿瘤,原癌基因 恶 性 肿 瘤,12,点突变,指基因在特定位置发生一个核苷酸的改变，使相应蛋白质的一个氨基酸改变，继而改变了蛋白质的空间构型和生物学功能。,点突变 指基因在特定位置发生一个核苷酸的改,13,点突变,1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11,12,13 14,蛋 苏 谷 酪 赖 亮 缬 缬 缬 甘 丙,甘,甘 缬,ATG ACG GAA TAT AAG CTG GTG GTG GTG GGC GCC,GGC,GGT GTG,GTC,缬,H-ras基因的点突变,正常P21蛋白,细胞H-ras基因,EJ/24膀胱癌H-ras基因,肿瘤H-ras编码的P21蛋白,点突变ATG ACG GAA TAT AAG,14,Ras基因点突变及导致的肿瘤,基,因,密码子,点突变,氨基酸改变,肿瘤,Hras 12 GGC,GTC,甘氨酸,缬氨酸,膀胱癌、胃癌、鼻咽癌、宫颈癌,GGC,GAC,甘氨酸,门冬氨酸,乳腺癌、肠癌,61 CAG,CTG,谷氨酰胺,亮氨酸,膀胱癌、肺癌、黑素瘤,CAG,CGG,甘氨酸,精氨酸,肾癌,Kras 12 GGT,CGT,甘氨酸,精氨酸,膀胱癌,GGT,AGT,甘氨酸,丝氨酸,胃腺癌、胆囊癌,GGT,TGT,甘氨酸,半胱氨酸,肺癌、肠癌、慢性粒细胞白血病,GGT,GAT,甘氨酸,门冬氨酸,胰腺癌,GGT,GTT,甘氨酸,缬氨酸,结肠癌、卵巢癌,13 GGC,GAC,甘氨酸,门冬氨酸,乳腺癌,61 CAA,CAT,谷氨酰胺,组氨酸,肺癌,CAA,CTA,谷氨酰胺,亮氨酸,肺癌,Nras 12 GGT,AGT,甘氨酸,丝氨酸,髓样增生综合征,GGT,GTT,甘氨酸,缬氨酸,急性粒细胞白血病,GGT,GAT,甘氨酸,门冬氨酸,急性粒细胞白血病、畸胎瘤,13 GGT,CGT,甘氨酸,精氨酸,肺腺癌,GGT,GTT,甘氨酸,缬氨酸,急性粒细胞白血病,GGT,GAT,甘氨酸,门冬氨酸,急性粒细胞白血病,61 CAA,AAA,谷氨酰胺,赖氨酸,神经母细胞瘤、纤维肉瘤、黑素瘤,CAA,CAT,谷氨酰胺,组氨酸,横纹肌肉瘤,CAA,CTA,谷氨酰胺,亮氨酸,早幼粒细胞白血病,Ras基因点突变及导致的肿瘤,15,基因扩增,是细胞原癌基因在细胞基因组内拷贝数的增加及其表达水平的增高。,基因扩增是由于基因DNA的过度复制所致，常引起细胞核型改变，表现为出现无着丝点的双微粒体(DMs)和缺乏正常明暗交替染色带的均匀染色区（HSRs)。,基因扩增 是细胞原癌基因在细胞基因组内拷贝,16,基因扩增,8,c-myc,HSR,DMs,扩增,基因扩增8c-mycHSRDMs扩增,17,原癌基因的扩增激活与人类肿瘤,扩增的,原癌基因 肿瘤,cmyc 白血病、乳腺癌、胃癌、肺癌、肠癌、,神经母细胞瘤、胶质细胞瘤,Nmyc 神经母细胞瘤、视网膜母细胞瘤、肺癌,Lmyc 肺癌,erbB 胶质细胞瘤、鳞状细胞癌,erbB,2,乳腺癌、唾液腺癌、卵巢癌,int2 乳腺癌、膀胱癌、胃鳞状细胞癌,hst 乳腺癌、膀胱癌、胃癌,abl 慢性粒细胞白血病,myb 肠癌、白血病,ets1 淋巴瘤,Hras 膀胱癌,Kras 肺癌、卵巢癌、膀胱癌,Nras 乳腺癌,原癌基因的扩增激活与人类肿瘤,18,基因缺失,基因片段的缺失是另一种主要的基因变异形式，缺失的范围差别较大，可以是1-2个碱基，也可以是一个片段或一个外显子的缺失。,基因缺失 基因片段的缺失是另一种主要的基,19,*,杂合型缺失,杂合型缺失,(loss of heterozygosity, LOH),同一患者正常细胞,DNA,存在两个等位基因，而肿瘤组织,DNA,中仅存在一个等位基因，因为肿瘤细胞单条染色体中一个等位,基因,缺失，把这种改变称为杂合型缺失。,* 杂合型缺失 杂合型缺失 (loss of hetero,20,图 13p25 LOH电泳图Fig 1LOH at 3p25 by electrophoresis1：癌旁肺组织；26：NSCLC组织。其中3、4、6存在LOH。1:paracancerous lung tissue;26:NSCLC tissues.LOH at 3p25 occur in lane 3,4 and 6.,21,图 23p14 LOH电泳图Fig 2LOH at 3p14 by electrophoresis1：癌旁肺组织；26：NSCLC组织。36存在LOH。1:paracancerous lung tissue;26:NSCLC tissues.LOH at 3p14 occur in lane 36.,22,正常组织杂合状态下等位基因有两条电泳带，当肿瘤组织等位DNA两条带中的一条较正常等位基因带明显减弱(70)则认定为LOH(图1)。,*,杂合型缺失,正常组织杂合状态下等位基因有两条电泳带，当肿瘤组织等位DNA,23,用PCR微卫星多态性分析检测肝癌LOH。,图1肝癌肿瘤组织等位基因杂合性丢失图例。方框下方示微卫星Marker名称，上方N-癌旁正常肝组织，T-肿瘤组织，箭头 示肿瘤组织DNA其中一条等位基因条带丢失或明显减弱，即发生LOH。图示1号HCC病人在D10S1220，D10S1223，D10S2327和D16S539等位点发生LOH，35号病例在D1S482，D1S165，D16S2624和D16S413等位点发生LOH。,24,某一基因在肿瘤细胞中从染色体的正常位置转移到其他染色体的某个位置上称为易位或重排。,基因易位、重排,某一基因在肿瘤细胞中从染色体的正常位置转,25,基因易位、重排,在一些肿瘤中可以见到异常的染色体，有的长些，有的短些。通过基因部分定位研究，证明在这些异常的染色体中发生了某些基因的易位和重排。,由于基因基因的易位和重排，原来无活性的原癌基因被移到某些强的启动基因或增强子附近而被活化，以致原癌基因表达增强，导致肿瘤的发生。,基因易位、重排在一些肿瘤中可以见到异常的染色体，有的长些，有,26,基因易位、重排,相互易位,c-myc,IgH,8,14,8,14,正常染色体,重排染色体,IgH/c-myc,Burkitt淋巴瘤C-myc基因的易位,基因易位、重排相互易位c-mycIgH814814正常染色体,27,人肿瘤中细胞癌基因的易位,细胞癌,染色体,染色体,人类肿瘤,基因 定位 易位,N-myc,2p25 t(,2,;,8,),Burkitt淋巴瘤,raf 3p25 t(,3,;,8,),肺癌和肾癌,yes 6 t(,6,;,14,),急性淋巴细胞白血病、卵巢癌,myc 8q24 t(,8,;,14,),(,8,;,21,),急性淋巴细胞白血病、,Burkitt,淋巴瘤,abl 9q34 t(,9,;,22,),(,6,;,9,),慢性粒细胞白血病、急性非淋巴细胞白血病,fes 15q25 t(,15,;,17,),慢性粒细胞白血病,sis 22q12 t(,9,;,22,),(,8,;,22,),慢性粒细胞白血病、,Burkitt,淋巴瘤,人肿瘤中细胞癌基因的易位,28,DNA多态性,群体中的不同个体或同一个体的不同染色体DNA核苷酸序列存在许多差异，尤其是非编码区域，大约每几百个碱基中就有一个存在着碱基取代或碱基替代现象，但表型并未改变，这种现象称为DNA多态性。实际上是染色体DNA中核苷酸排列顺序的改变。,DNA多态性 群体中的不同个体或同一个体,29,DNA多态性,RFLP,VNTR,小卫星DNA多态,微卫星DNA多态,单核苷酸多态,DNA多态性RFLP,30,RFLP,数量可变的串联重复序列,variable number of tandem repeat, VNTR,人类基因组中含有一些重复序列家族，有些序列分散在基因组中，有些是以一系列短的重复序列排列组成高变区，其串联重复序列拷贝数可相差很多，约占单倍体DNA的10%，基本上位于非编码区。重复单位以670bp为多，重复次数约6100次，称为数量可变的串联重复序列。,RFLP 数量可变的串联重复序列,31,RFLP,限制性片段长度多态性,（restriction fragment length polymorphism）,当DNA序列的差异发生在限制性内切酶识,别位点或当DNA片段的插入、缺失或重复可使,基因组DNA经限制性内切酶水解后发生片段长,度改变。因这些特异基因片段是限制性内切酶,产生的，在不同个体间可出现不同长度的限制,性片段类型，故称为限制性片段长度多态性。,概念,RFLP 限制性,32,小卫星DNA,细胞内基因组含有大量的碱基重复序列，一般将670bp的串联重复称为小卫星DNA。,小卫星DNA 细胞内基因组含有大量的碱基重,33,微卫星DNA,将14bp的串联重复序列称为微卫星DNA，又称简单重复序列（simple repeat sequence, SRS)。,微卫星DNA 将14bp的串联重复序列,34,微卫星不稳定性,microsatelite instability,MI,是指简单重复序列的增加或丢失，特别是在DNA错配修复系统（DNA mismatch system, DNAMMR)缺损的肿瘤基因组中常显示大量的MI。,微卫星不稳定性 microsateli,35,微卫星不稳定性与肿瘤,微卫星不稳定性,MI,与癌基因或抑癌基因的变化之间无明显关系，即癌基,因或抑癌基因的突变并不增加微卫星的不稳定性。,MI,与肿瘤的发展有关，,MI,仅在肿瘤细胞中发现，从未在,正常组织中检测到。,在原发与转移性肿瘤中，,MI,均匀分布于整个肿瘤。在晚期胃癌的,MI,频率显著高于早期胃癌。,微卫星不稳定性与肿瘤微卫星不稳定性MI与癌基因或抑癌基因的变,36,端粒酶与肿瘤的关系及检测,端粒酶与肿瘤,端粒：,是位于细胞染色体末端的一种由220kb串联的短片段重复,序列（TTAGGG)n及一些结合蛋白组成的特殊结构，在染色,体定位、复制、保护和控制细胞生长寿命等方面具有重要作,用， 并与细胞凋亡、细胞转化和永生化密切相关。,端粒酶：,为由RNA和蛋白质组成的一种核糖核蛋白复合物（RNP)，,含有端粒重复序列的模板，即以自身RNA组分为模板，复,制合成端粒序列。,目前有关端粒酶活性表达的研究已覆盖了人类大部分的实体瘤。,端粒酶与肿瘤的关系及检测 端粒酶与肿瘤,37,基因变异及其检测,基因变异及其检测,38,一、点突变,指基因在特定位置发生一个核苷酸的改变，使相应蛋白质的一个氨基酸改变，继而改变了蛋白质的空间构型和生物学功能。,一、点突变 指基因在特定位置发生一个核苷酸的改,39,点突变的检测,等位基因特异性寡核苷酸分析法（allele-specific oligonucleotide, ASO）；,等位基因特异性扩增法（allele-specific amplification, ASA）；,限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphisim, RFLP）分析；,DNA测序；,基因芯片,一、已知点突变,的检测,点突变的检测等位基因特异性寡核苷酸分析法（allele-sp,40,点突变的检测,二、未知点突变,的检测,单链构象多态性（single-strand conformational polymorphisim, SSCP）分析；,杂合双链分析法（HA)；,变性梯度凝胶电泳法（denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE）；,突变体富集PCR法；,DNA测序；,基因芯片,点突变的检测 二、未知点突变的检测单链构象多态性（singl,41,二、基因扩增,是细胞原癌基因在细胞基因组内拷贝数的增加及其表达水平的增高。,二、基因扩增 是细胞原癌基因在细胞基因组内拷贝数,42,基因扩增的检测,核酸分子杂交,原位杂交,(in situ hybridization),和,荧光原位杂交,(fluorescence in situ hybridization),DNA杂交,(Southern blot),原位PCR,(in situ PCR),DNA的检测,基因扩增的检测,43,原位杂交分类,基因探针和靶核苷酸不同,DNA-DNA杂交,DNA-RNA杂交,RNA-RNA杂交,探针的标记物是,否能被直接检测,直接法,间接法,原位杂交分类基因探针和靶核苷酸不同探针的标记物是,44,原位分子杂交技术优点,特异性强、灵敏度高，具有组织细胞化学染色的可见性,既可用新鲜组织，又可用石蜡包埋组织作回顾性研究,所需样本量少，可用活组织细针穿刺和细胞涂片,应用范围广，可对特定的基因（如癌基因、病毒基因）DNA、mRNA的表达进行定位、定性、定量、组织细胞分布和杂交电镜的亚细胞定位研究,原位分子杂交技术优点特异性强、灵敏度高，具有组织细胞化学染色,45,基因扩增的检测,核酸分子杂交,Northern blot；,RT-PCR；,基因芯片等,。,mRNA的检测：,基因扩增的检测,46,基因扩增的检测,免疫组织化学法（immunohistochemistry） ；,联免疫吸附实验（enzyme-linked immunosorbent,assay, ELISA）；,蛋白印迹（Western blot） ；,流式细胞仪测定法（flow cytometry）；,影像细胞测试法（image cytometry）,蛋白质表达产物的检测：,基因扩增的检测 蛋白质表达产物的检测：,47,三、基因缺失、易位与重排,三、基因缺失、易位与重排,48,杂合型缺失的检测,PCR-RFLP法;,MI标记；,杂合型缺失的检测PCR-RFLP法;,49,基因缺失、易位、重排的检测,荧光原位杂交,（fluorescent in situ hybridization,FISH,）,比较基因组杂交,（comparative genomic hybridization,CGH,）,基因缺失、易位、重排的检测 荧光原位杂交,50,四、基因甲基化改变的检测,限制性酶切结合电泳方法；,UvrABC,切割试验,四、基因甲基化改变的检测限制性酶切结合电泳方法；,51,五、DNA多态性及其检测,五、DNA多态性及其检测,52,DNA多态性,RFLP,MI,Telomere,DNA多态性RFLP,53,RFLP,Southern blot,；,PCR-RFLP,检测,RFLPSouthern blot ；检测,54,微卫星不稳定性的检测,基本方法：,首先用PCR技术扩增所需的双核苷,酸重复序列，然后用凝胶电泳分析,DNA序列。,优 点：,比RFLP及其他Southern杂交方法,简易快速；,可对单个细胞进行检测；,可对石蜡包埋的组织进行回顾性研,究，使检测目的更明确。,微卫星不稳定性的检测 基本方法：首先用PCR技术扩增所需,55,端粒酶活性的检测,基本方法,TRAP法,接近闪烁分析法,TRAP-ELISA法,原位杂交法,端粒酶活性的检测基本方法,56,分子诊断在肿瘤研究中的应用,肿瘤的早期诊断,肿瘤的分类,肿瘤的个体化和预见性治疗,肿瘤的预后判断及检测,分子诊断在肿瘤研究中的应用肿瘤的早期诊断,57,肿瘤的早期诊断,胰腺癌：K-Ras基因的第12位编码子突变检出率达100%,结肠癌：PCR-RFLP方法检测结肠癌患者粪便中Ras基因突变率达33.3%,高危人群的筛选和临床检测：结肠癌,肿瘤的早期诊断胰腺癌：K-Ras基因的第12位编码子突变检出,58,肿瘤易感基因的检测,已明确的肿瘤易感基因及其相关肿瘤,Rb1（视网膜母细胞瘤）,WT1（肾母细胞瘤）,P53（Li-Fraumeni综合征）,APC（家族性腺瘤性息肉病）,HNPCC（遗传性非息肉病性结肠癌）,NF1（神经纤维瘤病）,VHL（Von Hippel-Lindau综合征）,PTEN（Bannayan-Riley-Ruvalcaba综合征和Cowden综合征）,BRCA1（乳腺癌）,肿瘤易感基因的检测已明确的肿瘤易感基因及其相关肿瘤,59,肿瘤的分类,限制性酶切片段多态性 (restriction fragment length polymorphism， RFLP)：用于判断淋巴细胞增生与淋巴细胞性肿瘤及其克隆起源,Bcr区基因重排：可对慢性粒细胞白血病作出诊断并可与急性粒细胞白血病进行鉴别诊断,Myc基因检测：通过对N-Myc和C-Myc的扩增和表达检测，对鉴别神经母细胞瘤和神经上皮瘤具有应用价值,肿瘤的分类限制性酶切片段多态性 (restriction f,60,肿瘤的个体化和预见性治疗,基因的变化和基因间的信号传递与肿瘤临床治疗的敏感性密切关联，如能在分子水平上对肿瘤基因变化提供指标，对肿瘤的个体化和预见性治疗具有指导意义。,肿瘤的个体化和预见性治疗 基因的变化和基因,61,肿瘤的预后判断,P53基因突变与乳腺癌、肝癌、结肠癌等多种肿瘤预后有关,Nm23的状态与肿瘤转移有关,肿瘤的预后判断P53基因突变与乳腺癌、肝癌、结肠癌等多种肿瘤,62,肿瘤的预后检测,在白血病的临床治疗缓解期的白血病细胞仍达10,11。,应用细胞遗传学,肿瘤的预后检测在白血病的临床治疗缓解期的白血病细胞仍达101,63,分子诊断存在的问题,1 操作复杂,2 结果受多方面因素的影响,（技术性假阳性和假阴性）,3 费用昂贵,4 局限于研究领域,分子诊断存在的问题,64,研究方向,探索新途径,诊断技术标准化,诊断指标标准化,设置严格的阴、阳性对照,结果的判定严格遵守科学的原则,研究方向 探索新途径,65,肿瘤分子诊断学课件,66,41,、学问是异常珍贵的东西，从任何源泉吸收都不可耻。,阿卜,日,法拉兹,42,、只有在人群中间，才能认识自己。,德国,43,、重复别人所说的话，只需要教育；而要挑战别人所说的话，则需要头脑。,玛丽,佩蒂博恩,普尔,44,、卓越的人一大优点是：在不利与艰难的遭遇里百折不饶。,贝多芬,45,、自己的饭量自己知道。,苏联,41、学问是异常珍贵的东西，从任何源泉吸收都不可耻。阿卜,67,