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ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。1.1.现有现有现有现有“生物信息学生物信息学生物信息学生物信息学”的限制：的限制：的限制：的限制：“有眼不识泰山有眼不识泰山有眼不识泰山有眼不识泰山”第一外显子第一外显子第一外显子第一外显子 识别能力识别能力识别能力识别能力 外显子内含子外显子内含子外显子内含子外显子内含子 识别能力识别能力识别能力识别能力2.2.一个基因：不同剪切体一个基因：不同剪切体一个基因：不同剪切体一个基因：不同剪切体 Splicing form (Isoform)Splicing form (Isoform)3.3.一个基因一个基因一个基因一个基因 蛋白质蛋白质蛋白质蛋白质 切割：切割：切割：切割：蛋白质蛋白质蛋白质蛋白质 1 1 肽段肽段肽段肽段人基因组计划已经给了我们多少？人基因组计划已经给了我们多少？人基因组计划已经给了我们多少？人基因组计划已经给了我们多少？人基因有多少个？人基因有多少个？人基因有多少个？人基因有多少个？1010万万万万 3 3万？万？万？万？11.现有“生物信息学”的限制：人基因组计划已经给了我们多ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。4.4.同一个蛋白质同一个蛋白质同一个蛋白质同一个蛋白质 细胞内的不同细胞内的不同细胞内的不同细胞内的不同 “定位定位定位定位”不同功能！不同功能！不同功能！不同功能！5.5.98 98 DNA DNA序列：序列：序列：序列：功能不明功能不明功能不明功能不明!（9595）细胞核细胞核细胞质细胞质细胞质细胞质线粒体线粒体细胞膜细胞膜细胞膜细胞膜蛋白质移位蛋白质移位蛋白质移位蛋白质移位 Translocation Translocation24.同一个蛋白质细胞核细胞质线粒体细胞膜蛋白质移位 ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。E1E1b bb b E1 E1 Exon 2 Exon 3 Exon 2 Exon 3 p16 p16 Ink 4aInk 4a P14 ARF (human)P14 ARF (human)P19 ARF (mouse)P19 ARF (mouse)Cross Talk betweren Oncogenes&tumor suppressorsCross Talk betweren Oncogenes&tumor suppressorsOncogenic SignalsRas,c-myc,E2F p16 p16 Ink 4aInk 4a RbononCell cyclearrestP14 P14 ARFARF (Block MDM-2/p53 binding)(Block MDM-2/p53 binding)p53 p53 ononDNADamage一个基因可编编码两种完全不同的蛋白质一个基因可编编码两种完全不同的蛋白质一个基因可编编码两种完全不同的蛋白质一个基因可编编码两种完全不同的蛋白质3E1 b ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。功能基因组学功能基因组学功能基因组学功能基因组学 Functional Genomics Functional Genomics阐明基因（蛋白质）之间的相互作用阐明基因（蛋白质）之间的相互作用阐明基因（蛋白质）之间的相互作用阐明基因（蛋白质）之间的相互作用 与生命活动的关系与生命活动的关系与生命活动的关系与生命活动的关系 与疾病的关系与疾病的关系与疾病的关系与疾病的关系 与环境、药物的关系与环境、药物的关系与环境、药物的关系与环境、药物的关系基因组测序只是基因组研究的起点基因组测序只是基因组研究的起点基因组测序只是基因组研究的起点基因组测序只是基因组研究的起点“功能基因组学功能基因组学功能基因组学功能基因组学”的含义被的含义被的含义被的含义被“局限地局限地局限地局限地”误解误解误解误解“基因表达谱基因表达谱基因表达谱基因表达谱”的误解或局限性的误解或局限性的误解或局限性的误解或局限性 cDNAcDNA芯片：芯片：芯片：芯片：mRNAmRNA表达表达表达表达蛋白质表达蛋白质表达蛋白质表达蛋白质表达 蛋白质芯片：只知道蛋白质的表达与存在蛋白质芯片：只知道蛋白质的表达与存在蛋白质芯片：只知道蛋白质的表达与存在蛋白质芯片：只知道蛋白质的表达与存在 并不知道蛋白质的功能状态并不知道蛋白质的功能状态并不知道蛋白质的功能状态并不知道蛋白质的功能状态问题：问题：问题：问题：在基因组的水平在基因组的水平在基因组的水平在基因组的水平4功能基因组学 Functional Genomics阐ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。1.1.1.1.糖基化糖基化糖基化糖基化 (1)(1)(1)(1)膜表面蛋白：影响细胞识别，细胞细胞相互关系膜表面蛋白：影响细胞识别，细胞细胞相互关系膜表面蛋白：影响细胞识别，细胞细胞相互关系膜表面蛋白：影响细胞识别，细胞细胞相互关系 (2)(2)(2)(2)细胞表面抗原：细胞表面抗原：细胞表面抗原：细胞表面抗原：(3)(3)(3)(3)细胞内蛋白：细胞内蛋白：细胞内蛋白：细胞内蛋白：特定糖基化与蛋白质叠成为高级结构有关特定糖基化与蛋白质叠成为高级结构有关特定糖基化与蛋白质叠成为高级结构有关特定糖基化与蛋白质叠成为高级结构有关 成熟蛋白质不成熟蛋白质的成熟蛋白质不成熟蛋白质的成熟蛋白质不成熟蛋白质的成熟蛋白质不成熟蛋白质的“质控质控质控质控”表志表志表志表志2.2.2.2.乙酰化：乙酰化：乙酰化：乙酰化：组蛋白：与组蛋白：与组蛋白：与组蛋白：与DNADNADNADNA结合能力、复制、转录结合能力、复制、转录结合能力、复制、转录结合能力、复制、转录 其它蛋白质其它蛋白质其它蛋白质其它蛋白质 （如（如（如（如p53p53p53p53）3.3.3.3.磷酸化：磷酸化：磷酸化：磷酸化：4.4.4.4.蛋白质切割成片段：蛋白质切割成片段：蛋白质切割成片段：蛋白质切割成片段：一个蛋白质多种功能。一个蛋白质多种功能。一个蛋白质多种功能。一个蛋白质多种功能。51.糖基化 (1)膜表面蛋白：影响细胞识别，细胞ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。细胞分子细胞生物学重要问题细胞分子细胞生物学重要问题细胞分子细胞生物学重要问题细胞分子细胞生物学重要问题过度增殖：过度增殖：过度增殖：过度增殖：恶性肿瘤恶性肿瘤恶性肿瘤恶性肿瘤 高血压（内皮细胞、平滑肌细胞）高血压（内皮细胞、平滑肌细胞）高血压（内皮细胞、平滑肌细胞）高血压（内皮细胞、平滑肌细胞）细胞凋亡：细胞凋亡：细胞凋亡：细胞凋亡：神经退行行病变神经退行行病变神经退行行病变神经退行行病变 早老性痴呆早老性痴呆早老性痴呆早老性痴呆 帕金森氏病帕金森氏病帕金森氏病帕金森氏病 “To be or not to be,thats a question”“To be or not to be,thats a question”Hamlet HamletShakespearShakespear细胞细胞细胞细胞增殖增殖增殖增殖细胞细胞细胞细胞凋亡凋亡凋亡凋亡生生生生 死死死死6细胞分子细胞生物学重要问题过度增殖：ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。细胞细胞细胞细胞凋亡基因凋亡基因凋亡基因凋亡基因Apoptotic geneApoptotic gene 原癌原癌原癌原癌 基因基因基因基因Proto-Proto-oncogene oncogene 抑癌抑癌抑癌抑癌 基因基因基因基因 Cancer CancerSuppressorSuppressorDNADNA复制基因复制基因复制基因复制基因细胞周期细胞周期细胞周期细胞周期基因基因基因基因DNADNA转录转录转录转录（抗凋亡）（抗凋亡）（抗凋亡）（抗凋亡）AntiapoptoticAntiapoptotic（促进凋亡）（促进凋亡）（促进凋亡）（促进凋亡）MCheck Points of Cell CycleCheck Points of Cell Cycle GG1 1 S check point S check point G G2 2 M check point M check point M:Mitotic Spindle checkpoint M:Mitotic Spindle checkpoint7细胞 原癌 抑癌DNA细胞周期DNA（抗凋亡）ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。分子分子分子分子 细胞细胞细胞细胞 组织组织组织组织 机体机体机体机体误误误误 区：区：区：区：相互分离。每种疾病均集中于反映出疾病的细胞相互分离。每种疾病均集中于反映出疾病的细胞相互分离。每种疾病均集中于反映出疾病的细胞相互分离。每种疾病均集中于反映出疾病的细胞肿肿肿肿 瘤：瘤：瘤：瘤：集中在癌细胞集中在癌细胞集中在癌细胞集中在癌细胞 误误误误 区：区：区：区：忽视癌细胞以外的细胞忽视癌细胞以外的细胞忽视癌细胞以外的细胞忽视癌细胞以外的细胞心血管疾病：心血管疾病：心血管疾病：心血管疾病：心脏病心脏病心脏病心脏病 心肌细胞心肌细胞心肌细胞心肌细胞 心肌间质血管内皮细胞心肌间质血管内皮细胞心肌间质血管内皮细胞心肌间质血管内皮细胞 高血压高血压高血压高血压 内皮细胞内皮细胞内皮细胞内皮细胞 内皮细胞间质细胞炎症细胞内皮细胞间质细胞炎症细胞内皮细胞间质细胞炎症细胞内皮细胞间质细胞炎症细胞 平滑肌细胞平滑肌细胞平滑肌细胞平滑肌细胞 神经性疾病：神经性疾病：神经性疾病：神经性疾病：神经原细胞神经原细胞神经原细胞神经原细胞 神经原神经原神经原神经原 胶质细胞胶质细胞胶质细胞胶质细胞 间质间质间质间质 内皮细胞（高血压脑病）内皮细胞（高血压脑病）内皮细胞（高血压脑病）内皮细胞（高血压脑病）8分子 细胞 组织 机体误 区：相互ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。间质细胞间质细胞间质细胞间质细胞血管内皮细胞血管内皮细胞血管内皮细胞血管内皮细胞淋巴管内皮细胞淋巴管内皮细胞淋巴管内皮细胞淋巴管内皮细胞淋巴细胞淋巴细胞淋巴细胞淋巴细胞巨噬细胞巨噬细胞巨噬细胞巨噬细胞触突状细胞触突状细胞触突状细胞触突状细胞 Dendritic cellDendritic cellCytokine(Cytokine(细胞因子细胞因子细胞因子细胞因子)Cytokine Receptor Cytokine Receptor 细胞因子受体细胞因子受体细胞因子受体细胞因子受体Chemokine(Chemokine(趋化因子趋化因子趋化因子趋化因子)Chemokine Receptor Chemokine Receptor趋化因子受体趋化因子受体趋化因子受体趋化因子受体恶性肿瘤恶性肿瘤恶性肿瘤恶性肿瘤除肿瘤细胞外，还有重要的细胞：除肿瘤细胞外，还有重要的细胞：除肿瘤细胞外，还有重要的细胞：除肿瘤细胞外，还有重要的细胞：9间质细胞Cytokine(细胞因子)CytokiZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。CANCER:CANCER:Multiple Cross-talk among Cancer,stromal and endothelial CellsMultiple Cross-talk among Cancer,stromal and endothelial CellsCancer cellsCancer cellsCancer cellsStromal Stromal cellscellsEndothelialEndothelialcellscellsIntercellular Cross talk?CancerCancercellscellsMatrix(ECM)Matrix(ECM)Endothelial cellsEndothelial cellsPericytesPericytesStromal cellsStromal cells10CANCER:Multiple Cross-talk amoZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。Stroma:Stroma:1.1.Fibroblasts in tumor:Fibroblasts in tumor:“Activated fibroblast”“Activated fibroblast”GF GF GF R activated GF R activated 2.2.Genetic alteration:Genetic alteration:Juvenile polyposis syndrome(JPS),Cowen syndrome etcJuvenile polyposis syndrome(JPS),Cowen syndrome etc Dominant hereditary Dominant hereditary Stromal cells abnormality,Hamartoma Stromal cells abnormality,Hamartoma High risk for colon cancer High risk for colon cancer PTEN and others PTEN and others“Landscaper”“Landscaper”“Stroma abnormal microenviroment”“Stroma abnormal microenviroment”“Microenviroment of tumor-host interface”“Microenviroment of tumor-host interface”11Stroma:1.Fibroblasts in tZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。ANGIOGENESISANGIOGENESISTwo ProcessesTwo Processes Endothelial Cells(EC)Endothelial Cells(EC)growth growth migration migrationVessel formationVessel formation Tube formationTube formation extension extensionOther cells:Fibroblasts etcOther cells:Fibroblasts etc12ANGIOGENESISTwo Processes12ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。ANGIOGENESIS/CANCER INVASIONANGIOGENESIS/CANCER INVASIONANGIOGENESIS/CANCER INVASIONEC Growth control&Vessel formationEC Growth control&Vessel formationHypoxiaHypoxia Activating hypoxia responses genesActivating hypoxia responses genes (p53)(p53)AcidosisAcidosis VEGF-AVEGF-A(Cancer.EC)(Cancer.EC)(Cancer.EC)13ANGIOGENESIS/CANCER INVASIONZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。Protease/matrix/Cancer cell invasion/Angiogenesis Protease/matrix/Cancer cell invasion/Angiogenesis Proteases:Proteases:Degradation of ECM and Cell Associated Proteins Degradation of ECM and Cell Associated Proteins MMPs (Marix metallo proteinases),membrane-anchored MMPs (Marix metallo proteinases),membrane-anchored MMP 2,MMP 9,(Cancer Cell)MMP 2,MMP 9,(Cancer Cell)Soluble MMP (fibro,EC)Soluble MMP (fibro,EC)Adamalysin related membrane proteinases Adamalysin related membrane proteinases BMP 1 metalloproteinases BMP 1 metalloproteinases Tissue serine proteinases Tissue serine proteinases tPA tPA UK UK Thrombin Thrombin Plasmin Plasmin uPA (EC,fibro.)uPA (EC,fibro.)uPAR uPAR (Cancer)(Cancer)InhibitorsInhibitors PAI PAI TIMPs (Tissue inhibitor of MMPs)TIMPs (Tissue inhibitor of MMPs)PEX (Degradation product of PEX (Degradation product of ECM by MMP 2)ECM by MMP 2)14Protease/matrix/Cancer celZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。Proteases further createProteases further create Plasminogen Angiostatin(38KD)EC ATP synthase(I)Plasminogen Angiostatin(38KD)EC ATP synthase(I)Procollagen XXIII Endostatin(20KD)Procollagen XXIII Endostatin(20KD)Prolaction 16KD prolactinProlaction 16KD prolactinECM PEX EC integrin ECM PEX EC integrin b3b3b3b3(I)(I)RGD fragmentRGD fragment Cancer FAK (S)Cancer FAK (S)Troponin Tn-1 EC ATP Synthase(I)Troponin Tn-1 EC ATP Synthase(I)(Human cartilage)(Human cartilage)?Inhibitors of AngiogenesisInhibitors of AngiogenesisInhibitors of AngiogenesisStimulators of Cancer InvasionStimulators of Cancer InvasionStimulators of Cancer Invasion(I)(I)ANGIOGENESIS/CANCER INVASIONANGIOGENESIS/CANCER INVASION15Proteases further create?InhiZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。EC Receptors:EC Receptors:(EC and Cancer Cell)(EC and Cancer Cell)VEGF R 1(Flt-1)VEGF R 1(Flt-1)VEGF R 2(Flk-1,KDR)VEGF A-D VEGF R 2(Flk-1,KDR)VEGF A-D PLGF PLGF VEGF R 3(Flt-4)VEGF R 3(Flt-4)VEGF C,DVEGF C,D TIE 1TIE 1?TIE 2TIE 2 Ang 1,2Ang 1,2 3?4?3?4?*Integrin Integrin b3b3b3b3*ECM PEX*ECM PEX b5b5b5b5 (Laminin,tenasin)(Laminin,tenasin)CD 36CD 36 Thrombospondin (ECM Glycoprotein)Thrombospondin (ECM Glycoprotein)cell adhesion,motility&growth cell adhesion,motility&growth metallospondinmetallospondin VascularVascularTubuleTubuleformationformation*Eph B1Eph B1 Recognizing some ligands or partnersRecognizing some ligands or partners NHE 3NHE 3?ARNT ARNT?EPA-1EPA-1?Tenasoin:new ECM.Tenasoin:new ECM.ANGIOGENESIS/CANCER INVASIONANGIOGENESIS/CANCER INVASION16EC Receptors:(EC and CancerZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。VEGF RsVEGF RsVEGF 121VEGF 121VEGF 121VEGF 121VEGF 145VEGF 145VEGF 165VEGF 165VEGF 165VEGF 165VEGF 165 VEGF 165VEGF 165 VEGF 165VEGF BVEGF BVEGF CVEGF CVEGF DVEGF DVEGF CVEGF CVEGF DVEGF DPLGF 1PLGF 1PLGF2PLGF2PLGF2PLGF2Semaphorin IIISemaphorin III(Stmulation of phosphorylation of VEG(Stmulation of phosphorylation of VEG R2(KDR)R2(KDR)VEGF R1 VEGF R2 VEGF R3 Neurophilin 1 Neurophilin 2VEGF R1 VEGF R2 VEGF R3 Neurophilin 1 Neurophilin 2 (flt-1)(flk-1 KDR)(flt 4)(flt-1)(flk-1 KDR)(flt 4)Ligands:Ligands:17VEGF RsVEGF 121VEGF 121VEGF 16ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。EC Growth Factors:EC Growth Factors:Specific GFs:VEGF A-D VEGF R2(KDR.Flk-1)Specific GFs:VEGF A-D VEGF R2(KDR.Flk-1)PLGF VEGF R1(flt-1)PLGF VEGF R1(flt-1)Non-specific GFs (Local):Some of them:autocrine(EC,Cancer Fibro,)Non-specific GFs (Local):Some of them:autocrine(EC,Cancer Fibro,)TGF TGF EGF R EGF R TGF TGFb bb b (fibro)(fibro)TGF TGFb bb b R R (Cancer)TGF(Cancer)TGFb bb b/ECM TGF /ECM TGF b bb b released released aFGF aFGF bFGF FGF R bFGF FGF R PDGF PDGF R PDGF PDGF R HGF Met HGF MetANGIOGENESIS/CANCER INVASIONANGIOGENESIS/CANCER INVASIONProteaseProtease18EC Growth Factors:Specific GFsZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。ChemokinesChemokinesCXC chemokines Recruit monocytesCXC chemokines Recruit monocytes (Tumor cell origin)leukocytes (Tumor cell origin)leukocytes or others or othersCXC L12 CXC L-12 enriched tissueCXC L12 CXC L-12 enriched tissueCCR4 metastasisCCR4 metastasisPseudopodia,migration,penetration of ECM,homingPseudopodia,migration,penetration of ECM,homingInduce TNFaCytokines related to EC or Capillary formationCytokines related to EC or Capillary formationIFNIFN Downregulate VEGF production Downregulate VEGF production bFGF bFGFIFNIFNg gg g Inhibit angiogenesis Inhibit angiogenesisIL-12 Upregulate IFN-IL-12 Upregulate IFN-g gg g&IP-10,inhibiting angiogenesis&IP-10,inhibiting angiogenesisANGIOGENESIS/CANCER INVASIONANGIOGENESIS/CANCER INVASION19ChemokinesCXC chemokines ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。Interaction between cancer cells&ECInteraction between cancer cells&ECHypoxiaHypoxiaProteases Degradation of ECMProteases Degradation of ECMVEGFsVEGFsAngsAngsTGETGE b bb bFGF FGF PDGF?PDGF?ChemokinesChemokinescancercancerECECANGIOGENESIS/CANCER INVASIONANGIOGENESIS/CANCER INVASIONANGIOGENESIS/CANCER INVASIONMetastasis20Interaction between cancer celZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。EnigmasEnigmas1.1.Tumor/endothelial cellsTumor/endothelial cells Cross-talkCross-talkCross-talk2.2.Tumor cells Tumor cells endothelia like cells.endothelia like cells.Morphological evidence:yesMorphological evidence:yes Biochemical:?Biochemical:?3.3.Stromal cells/tumor cellsStromal cells/tumor cells Stromal cells/endothelial cells Stromal cells/endothelial cells4.4.Genetic alteration of tumor vascular endothelial cells?Genetic alteration of tumor vascular endothelial cells?Yes or not?Yes or not?5.5.Genetic alteration of tumor stromal cellsGenetic alteration of tumor stromal cells Cross-talkCross-talk21Enigmas1.Tumor/endothelial ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。APOPTOSISAPOPTOSIS1.Death signals:TNF1.Death signals:TNF family family2.Death Receptors:TNF Receptor family,Decoy Receptor2.Death Receptors:TNF Receptor family,Decoy Receptor3.Adaptor molecules:Interact with receptor3.Adaptor molecules:Interact with receptor Caspase(Protocaspase)Caspase(Protocaspase)4.Proto caspases:Activated 4.Proto caspases:Activated Caspases Caspases5.Effector molecules:Other Proteases,DNA degradation enzymes5.Effector molecules:Other Proteases,DNA degradation enzymes6.Inhibitors:For6.Inhibitors:For CaspasesCaspases Adaptors Adaptors Others OthersNew ProgressNew ProgressMolecules inside mitochondria Molecules inside mitochondria release into cytoplasm release into cytoplasm (Procaspases,cytochrome C ctc.)(Procaspases,cytochrome C ctc.)Nuclear/Cytoplamic molecules Nuclear/Cytoplamic molecules translocate to MT membrane translocate to MT membrane22APOPTOSIS1.Death signals:ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。Mitochondrion/CytoplasmMitochondrion/CytoplasmCaspases Other SignalsIn intermembrane In intermembrane space spaceProtocaspaseProtocaspase 2 2 9 9 3 3Latent AIFLatent AIFCytochrcme CCytochrcme CSmac/DIABLOSmac/DIABLOLifeLifeActivation ofActivation ofProtocaspase Protocaspase 3,6,73,6,7Activation of Activation of ProtocaspaseProtocaspase9 9Other targestOther targestMitochondrionProtocaspase-2Protocaspase-2Protocaspase-3Protocaspase-3Protocaspase-9Protocaspase-9Apaf 1Apaf 1Cytochrome cCytochrome cAIFAIFOthers?(Smac/DIABLO)Others?(Smac/DIABLO)Life or Death?Life or Death?Alteration of MolecularAlteration of MolecularCompartmentationCompartmentation(Mitochondrion versus Cytoplasm)(Mitochondrion versus Cytoplasm)Other TargetsOther TargetsIntermembraneIntermembrane Space SpaceAIFAIF (Apoptosis inducing factor)Science,397:3879 1999(Apoptosis inducing factor)Science,397:3879 1999SmacSmac (Second MT-derived activator of caspase)(Second MT-derived activator of caspase)OrOr DIABLODIABLO (Direct IAP-binding protein at Low pI)(Direct IAP-binding protein at Low pI)Bcl 2 Bcl 2 guard?guard?Death23Mitochondrion/CytoplasmCaspaZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。Mitochondria-death Signal IntegratorsMitochondria-death Signal IntegratorsMitochondria-death Signal IntegratorsC.Bremer&G.Koemer(Science.Aug.18.289:1150,2000)C.Bremer&G.Koemer(Science.Aug.18.289:1150,2000)Translocate to mitochondrinTranslocate to mitochondrinStimulation/inductionStimulation/inductionInhibition/block translocationInhibition/block translocation (Keep in cytosol)(Keep in cytosol)PTPC:PTPC:Permeability Transition Pore Complex(Bax etc.Permeability Transition Pore Complex(Bax etc.)Bcl2/Bax/Bid permeabilize the outer MT membrane upon interaction with PTPC Bcl2/Bax/Bid permeabilize the outer MT membrane upon interaction with PTPC Bid may be independent Bid may be independentJNK:JNK:(SAPK,stress activating protein kinase)-(SAPK,stress activating protein kinase)-inactivate Bcl X inactivate Bcl XLL p53:p53:Translocated to MT&interacted with hsp 70Translocated to MT&interacted with hsp 70 PKCPKC :Ttranslocated to MTTtranslocated to MTP P24Mitochondria-death Signal InteZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。Enigmas in ApoptosisEnigmas in ApoptosisTranslocation of nuclear or cytosolic protein molecules into mitochondria Translocation of nuclear or cytosolic protein molecules into mitochondria Translocation of nuclear or cytosolic protein molecules into mitochondria Phosphorylation /dephosphorylationPhosphorylation /dephosphorylationTranslocator Translocator Protein/protein bindingProtein/protein bindingconformational changeconformational changeBinding to mitochondria surface membane proteinBinding to mitochondria surface membane proteinTranslocation or release of proteins or other molecules from mitochordria to cytoplasm Translocation or release of proteins or other molecules from mitochordria to cytoplasm Translocation or release of proteins or other molecules from mitochordria to cytoplasm Permeability transit pore complex Permeability transit pore complex Voltage depedent anion channel(VDAC)Voltage depedent anion channel(VDAC)Apoptosis induced by paradoxical signals Apoptosis induced by paradoxical signals Apoptosis induced by paradoxical signals Growth factor/receptorsGrowth factor/receptorsProtooncogenes:Ras,c-myc etc.Protooncogenes:Ras,c-myc etc.25Enigmas in ApoptosisTranslocatZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。HOT SPOTS OF SIGNALINGHOT SPOTS OF SIGNALING20%of 32,000 human coding gene:Signal transduction20%of 32,000 human coding gene:Signal transductionProtein KinaseProtein Kinase 520520Protein PhosphataseProtein Phosphatase 130130Dominant Oncogenes Dominant Oncogenes 100 PK100 PKTumor SuppressorTumor Suppressor 30 PK30 PKKnown PTKKnown PTKPTK 90(May,2001)PTK 90(May,2001)RPTK 58 (20 families)RPTK 58 (20 families)Non-receptor,PTK 32 (10 families)Non-receptor,PTK 32 (10 families)CytoplasmicCytoplasmic26HOT SPOTS OF SIGNALING20%of 3ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。Human RPTKHuman RPTKHuman RPTK27Human RPTK27ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。c-src:c-src:c-src:Truncated mutation of C to Tyr 530Truncated mutation of C to Tyr 530 autophosphorylation autophosphorylation related to STAT-3related to STAT-3 in colon cancerin colon cancerc-abl:c-abl:c-abl:CS 9 (9:22)abl/BCR in ph1 CSCS 9 (9:22)abl/BCR in ph1 CS DNA damage induced apoptosis.DNA damage induced apoptosis.ATM ATM c-abl bind Rb at G0/G1(released after RB c-abl bind Rb at G0/G1(released after RB phosph.of abl phosph.of abl prevent DNA-damage induced abl phosph.prevent DNA-damage induced abl phosph.PDGF PDGF Induce Induce cell cell motility motility&adhesion(c-abl involved in)&adhesion(c-abl involved in)BCR/ablBCR/abl Cyteplasm Cyteplasm XX nucleus nucleus Human Cytoplasmic PTKHuman Cytoplasmic PTKHuman Cytoplasmic PTKP P28c-src:Truncated mutation ZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。1.1.Class IClass I p110(catalytic)p110(catalytic)Adaptor/regulator Adaptor/regulator IA:RPTK activatedIA:RPTK activated IB:hetero-trimeric G protein coupled Receptor activated.IB:hetero-trimeric G protein coupled Receptor activated.Class IIClass II p1(3)kp1(3)k2.2.Substrate:Substrate:ptd Ins(4.5)P2 ptd Ins(4.5)P2 ptd Ins (3.4.5)p3 ptd Ins (3.4.5)p3 Some P1(3k)(I&III):Some P1(3k)(I&III):+Ser/thr K Ser/thr K 3.3.IsoformIsoform ,b,b,b,b,of p110.Subunitof p110.Subunit p85 p85 ,p85,p85b bb b,p55,p55g gg g of adaptor of adaptor4.4.Binding of protein to lipidBinding of protein to lipid IAIA FVVE domain FVVE domain ptd Ins(3)P ptd Ins(3)P PH(pleckstrin homology)domain PH(pleckstrin homology)domain PH(+)protein:3-phospho-inositide dependent K(PDK 1)(ser/thr PK)PH(+)protein:3-phospho-inositide dependent K(PDK 1)(ser/thr PK)Akt(PKB)Akt(PKB)PI(3)K/Akt&mTOR/p70PI(3)K/Akt&mTOR/p70PI(3)K/Akt&mTOR/p7056k56k56k (rapamycin target)(rapamycin target)(rapamycin target)PI(3k):PI(3k):hetero dimerhetero dimerIAptd Ins(3,4)P2ptd Ins(3,4)P2 ptd Ins(3,4,5)P3ptd Ins(3,4,5)P3291.Class I p110(catalytiZYYZYY制作制作制作制作文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。Akt(PKB)Akt(PKB)Akt:Akt:Akt:v-Akt homologv-Akt homolog PKB PKB ,b,g,b,g,b,g,b,g isoforms isoforms N PH domain N PH domain Central kinase domain activation loop:Thr.308 Central kinase domain activation loop:Thr.308 C Regulatory site:Ser 473 C Regulatory site:Ser 473PDK-1(PDK-1(PDK-1(3-phospho-inositide dependent Kinase 3-phospho-inositide dependent Kinase 3-phospho-inositide dependent Kinase 1 11):Thr 308 Akt kinase
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