医学数据管理_Epidata课件

医学研究数据管理与医学研究数据管理与统计分析统计分析Data management&analysis1医学研究数据管理与统计分析Data management 搜集资料整理与分析资料调查（研究）项目分析表（指标）研究目的回答统计分析步骤调查研究步骤研究设计思路与数据管理分析步骤研究设计思路与数据管理分析步骤研究设计思路与数据管理分析步骤研究设计思路与数据管理分析步骤解释、呈现结果2搜集资料整理与分析资料调查（研究）项目分析表（指标）研究目的 确定调查和研究的目的是选定研究指标的依据确定调查和研究的目的是选定研究指标的依据 研究指标又是研究目的的具体体现研究指标又是研究目的的具体体现一、明确调查和研究的目的一、明确调查和研究的目的一、明确调查和研究的目的一、明确调查和研究的目的n了解了解参数参数参数参数，用以说明总体。，用以说明总体。n 研究研究变量间的关系变量间的关系变量间的关系变量间的关系，通过确立统计学联系来，通过确立统计学联系来 探索病因或验证疗效等。探索病因或验证疗效等。3 确定调查和研究的目的是选定研究指标的依据一、明确调查和二、确定研究对象和观察单位二、确定研究对象和观察单位二、确定研究对象和观察单位二、确定研究对象和观察单位 n n研究对象研究对象研究对象研究对象：对象来源总体是什么？：对象来源总体是什么？n n抽样方法：抽样方法：抽样方法：抽样方法：如何抽样？代表性？如何抽样？代表性？n n观察单位观察单位观察单位观察单位：个体？群体？：个体？群体？4二、确定研究对象和观察单位 研究对象：对象来源总体是什么？三、研究设计类型的选择三、研究设计类型的选择三、研究设计类型的选择三、研究设计类型的选择 根据研究目的选择合适的设计类型：描述疾病的或健康状况的三间分布描述疾病的或健康状况的三间分布探讨病因探讨病因验证预防和控制措施的效果验证预防和控制措施的效果评价疫苗的效果评价疫苗的效果新药上市前临床试验新药上市前临床试验5三、研究设计类型的选择 根据研究目的选择合适的设计类型：566四、确定研究项目，拟定调查表（问卷）四、确定研究项目，拟定调查表（问卷）四、确定研究项目，拟定调查表（问卷）四、确定研究项目，拟定调查表（问卷）n n调查和研究项目的确定调查和研究项目的确定调查和研究项目的确定调查和研究项目的确定：分析项目、备选项目分析项目、备选项目分析项目、备选项目分析项目、备选项目n n调查表和原始数据记录表的设计调查表和原始数据记录表的设计调查表和原始数据记录表的设计调查表和原始数据记录表的设计7四、确定研究项目，拟定调查表（问卷）调查和研究项目的确定：p根据研究设计类型确定所需样本量计算公式。p相关参数：一类错误的概率：即检验水准，越小所需样本含量越多，对于相同的检验水准，双侧检验比单侧检验所需的样本含量更大，通常取0.05。把握度(power)1-,一般0.8-0.9单侧检验还是双侧检验，单侧检验所需样本量小，双侧检验所需样本量大。五、样本含量的估计五、样本含量的估计五、样本含量的估计五、样本含量的估计8根据研究设计类型确定所需样本量计算公式。五、样本含量的估计8常用样本含量的估计样本含量的估计样本含量的估计样本含量的估计软件：EpiCalc 20009常用样本含量的估计软件：EpiCalc 20009常用软件：EPI INFO10常用软件：EPI INFO10常用软件：OPENEPI11常用软件：OPENEPI11 直接观察法 采访法 包括面访、调查会及信访、电话访问等 六、原始资料的收集六、原始资料的收集六、原始资料的收集六、原始资料的收集 原始资料的收集方式12 直接观察法六、原始资料的收集 原始资料的收集方式七、调查和研究的质量控制七、调查和研究的质量控制七、调查和研究的质量控制七、调查和研究的质量控制n 真实性真实性（效度）（效度）n 可靠性可靠性（信度）（信度）偏倚及其如何控制？偏倚及其如何控制？偏倚及其如何控制？偏倚及其如何控制？如何评价？如何评价？如何评价？如何评价？13七、调查和研究的质量控制 真实性（效度）偏倚及其如何控制？录入前的核对录入前的核对录入前的核对录入前的核对 录入计算机，建立数据库（录入计算机，建立数据库（录入计算机，建立数据库（录入计算机，建立数据库（databasedatabase）Excel、Access、EpiData、STATA、SPSS、SAS软软件等件等 录入后的核对和整理录入后的核对和整理录入后的核对和整理录入后的核对和整理逻辑检查、核对逻辑检查、核对 排序（排序（sorting）建立新变量建立新变量数据的编码和转换数据的编码和转换缺失值的处理缺失值的处理八、八、八、八、数据资料的整理数据资料的整理数据资料的整理数据资料的整理14 录入前的核对八、数据资料的整理14Dbase,FoxBase，Visual FoxPro，Lotus数据录入和管理软件数据录入和管理软件数据录入和管理软件数据录入和管理软件15Dbase,FoxBase，Visual FoxPro，L用Epidata构建调查表数据库16用Epidata构建调查表数据库1617用Epidata录入调查表17用Epidata录入调查表统计分析常用软件统计分析常用软件18统计分析常用软件18让我们从一个简单的调查开始.研究目的研究目的：了解本班同学年龄、性别、身高等信息。Step1:建立调查表 文本编辑软件：Word19让我们从一个简单的调查开始.研究目的：了解本班同学年龄、性Step 2:调调查查表表数数据据录录入入20Step 2:调查表数据录入20EpiData软件概述一、EpiData的设计 设计者：丹麦的Jens M、Michael Bruus和英国的Mark Myatt 编程者：丹麦的Michael Bruus 开发思路和原理：基于Epi Info 6.0二、软件下载和登记注册 下载地址：http:/www.epidata.dk/download.htm三、版本信息 EpiData 1.5（2001年2月22日）；EpiData 2.1a（2002年）EpiData 3.02（2004）；EpiData 3.10（NOW）四、安装和系统要求 可在Windows 95/98/NT/2000/XP/7等操作系统下运行21EpiData软件概述一、EpiData的设计21EpiData软件概述uEpiData软件安装如同拷贝程序文档一样简单。例如，它可以从U盘运行，并且占用内存很小（2.5M）。u由于捐助和志愿者的工作，软件免免费费发布。22EpiData软件概述EpiData软件安装如同拷贝程序文档EpiData程序下载与安装http:/www.epidata.dk/23EpiData程序下载与安装http:/www.epidaEpiData程序下载与安装24数据录入EpiData程序下载与安装24数据录入EpiData 软件EpiData 软件是在吸收 DOS版的Epi Info 6.0 软件优点基础上开发研制的 Windows版软件。25EpiData 软件EpiData 软件是在吸收 DOS版的EpiData 软件它一方面吸收了Epi Info软件的长处，同时又极具自身特色。与 视窗版Epi Info软件相比，占用空间小，更加简单易学，且界面友好，可以很方便的对数据进行储存、核对和管理等，26EpiData 软件它一方面吸收了Epi Info软件的长处用EpiData软件进行数据录入和管理，将产生三种基本的文件；每种文件具有固定的后缀，在数据录入和管理中发挥不同作用。（1）调查表文件：后缀为.QES。通过建立调查表文件，系统根据特定规则自动定义数据文件的结构，包括变量名、变量类型和长度等，用于数据录入。（2）数据文件：后缀为.REC。数据文件包含录入的数据信息以及已经定义好的编码，用于数据的统计分析。（3）核对文件：后缀为.CHK。通过建立核对文件，系统将定义数据录入的有效性规则。EpiData Entry 的文件组成27用EpiData软件进行数据录入和管理，将产生三种基本的文E Ep pi iD Da at ta a E En nt tr ry y 的的特特点点调查表设计便捷调查表设计便捷 数据核查功能强大且实现简便数据核查功能强大且实现简便 与调查表形式一致的可视数据录入界面与调查表形式一致的可视数据录入界面 数据转换功能强大数据转换功能强大 28EpiData Entry 的特点调查表设计便捷 28讲了半天，EpiData究竟长什么样？29讲了半天，EpiData究竟长什么样？29请打开电脑上EpiData主程序为何我的电脑上没有欢迎使用EpiData?30请打开电脑上EpiData主程序为何我的电脑上没有欢迎使用EpiData软件的窗口介绍31EpiData软件的窗口介绍31编辑过程工具条工具栏数据表预览粘贴字段编辑器编码编辑器32编辑过程工具条工具栏数据表预览粘贴字段编辑器编码编辑器32调查表文件的建立数据文件：原始数据 文件结构（库结构）字段名 字段类型 字段长度 调查表信息 数据文件33调查表文件的建立数据文件：调查表信息 建建立立调调查查表表文文件件 建立调查表文件是建立数据库、实现数据录入和管理的第一步。34建立调查表文件 建立调查表文件是建立数据库、实现数据录入和管建立调查表文件有以下几种方法：建立调查表文件有以下几种方法：第一种：在菜单中，点击“文件”（File）“生成调查表文件QES文件”第二种：在工作栏的工作流程中，点击“1.打开文件”（1.Define Data）“建立新QES文件”第三种：在按钮栏中，点击,这时窗口中会在工作区显示一个空白的文档，你可以在此文档中键入调查表内容和框架，编辑完成后，将调查表文件保存，文件的扩展名统一为.QES。35建立调查表文件有以下几种方法：第一种：在菜单中，点击“文件假定现有一调查表如下，如何建立.QES文件？调查表调查表姓名：姓名：_性别：（性别：（1）男）男 （2）女）女身高：身高：_._ CM出生日期：出生日期：_年年_月月_日日36假定现有一调查表如下，如何建立.QES文件？调查表36如如果果按按原原调调查查表表格格式式直直接接建建立立数数据据库库，结结果果会会怎怎样样？37如果按原调查表格式直接建立数据库，结果会怎样？37必须定义字段名和字段类型必须定义字段名和字段类型38必须定义字段名和字段类型38调用字段编辑器：第一种方法：直接按CTRL-Q键。第二种方法：在编辑器工具条上点击字段编辑器图标。手工输入或使用字段编辑器39调用字段编辑器：手工输入或使用字段编辑器39字段类型介绍字段类型介绍数值型字段：#，#.#；仅接受数字和空格，不输按空格处理，分析时作缺失值处理，以“.”显示。数字位数由“#”个数决定，小数位数由小数点右边的“#”个数确定。最长可达14位，小数点按1个字符计算。40字段类型介绍数值型字段：#，#.#；仅接受数字文本型字段：包括三种。一种是常用的文本（或下划线、或底线）型字段：_；该型字段由连续下划线来定义，长度由下划线字符个数决定，最大值为80，空白字段（字段内容空缺）时，数据管理时将按缺失值处理。另一种为大写文本型字段：。41文本型字段：包括三种。一种是常用的文本（或下划线、或底线）日期型字段：包括两种。一种为常用日期字段：、，分美式、英式两种，输入时即进行合法性检验；只需输入日期，系统自动插入斜杠。另一种为自动日期型字段：、；储存或修改数据时该字段自动输入系统日期，如系统日期正确，也即当天日期。42日期型字段：包括两种。一种为常用日期字段：MM/DD/Y自动ID号型字段：；这是一种专用字段，用作记录识别号，文件的第一个记录为1，以后记录自动赋值顺次较前增加1，并自动保证编号的唯一性。输入数据时光标跳过此字段。如需使第一个记录号大于1，则可在“文件”菜单“选择项”中的“高级设置”中设置。逻辑型字段（即布尔函数型字段）：；只接受Y、N、空格或回车键。后两者作缺失值处理。Y、N字符输入后即转为大写字母。43自动ID号型字段：；这是一种专用字段，用作记我们按照这些要求重新建立数据库，这次应该成功了吧？先预览一下先预览一下44我们按照这些要求重新建立数据库，这次应该成功了吧？先预览一下怎么会这样？45怎么会这样？45定定义义字字段段名名（F Fi ie el ld d N Na am me es s）以调查表中字段的第一个词命名（First word in question is field names）使用 内的内容自动添加字段名（Automatic field names）46定义字段名（Field Names）以调查表中字段的第一个词定定义义字字段段名名（F Fi ie el ld d N Na am me es s）“文件”（File）“选项”（Option）“生成REC文件”（Create data file）在“如何生成字段名”（How to generate field names）中选择字段的命名方式。47定义字段名（Field Names）“文件”（File）“更新问题为实际文件名更新问题为实际文件名”如果未勾选如果未勾选48“更新问题为实际文件名”如果未勾选48预览显示的并非真实的预览显示的并非真实的字段名字段名如如“姓名姓名”,真实的字真实的字段名是段名是Field149预览显示的并非真实的字段名如“姓名”,真实的字段名是Fie5050按 命名规则修改调查表，然后预览生成REC文件51按 命名规则修改调查表，然后预览生成REC文件51别忘了修改别忘了修改“选项选项”，否则否则会是这样的52别忘了修改“选项”，否则会是这样的52制作调查表文件可用EpiData编辑器进行。也可用Word或其它文本编辑器编写。注意，必须以纯文本格式存盘，文件后缀名必须是“.qes”。也可在其它文本编辑器编写，再粘贴到EpiData编辑器窗口。如何编写调查表文件53制作调查表文件可用EpiData编辑器进行。如何编写调查表编写调查表文件注意事项（一）编写过程中及时保存文件，文件类型为编写过程中及时保存文件，文件类型为.qes文件文件。系统只会根据系统只会根据“特殊符号特殊符号”来定义一个输入字段（包括类型和来定义一个输入字段（包括类型和长度），并根据符号前的字符给字段命名。建议在编写过程中利长度），并根据符号前的字符给字段命名。建议在编写过程中利用用“字段快速清单字段快速清单”插入插入“特殊符号特殊符号”，即：选择字段类型，定，即：选择字段类型，定义好长度后，按义好长度后，按“插入插入”图标，可避免由于图标，可避免由于“特殊符号特殊符号”输入错输入错误而不能产生有效的输入字段。误而不能产生有效的输入字段。调查表用中文编写时，可用调查表用中文编写时，可用定界符（定界符（“”）将字段名定义为将字段名定义为英文字符（英文字母或英文字母阿拉伯数字），有利于数据库英文字符（英文字母或英文字母阿拉伯数字），有利于数据库的管理和其他软件的统计分析。注意：的管理和其他软件的统计分析。注意：“”必须为半角型，而必须为半角型，而不能是全角型不能是全角型(“”)。54编写调查表文件注意事项（一）编写过程中及时保存文件，文件类尽可能把字段定义尽可能把字段定义数值型数值型，有利于统计分析。如糖尿病史，有利于统计分析。如糖尿病史“dmhis”可定义为数值型字段，可定义为数值型字段，“1”表示表示“有有”，“0”表示表示“无无”。调查表文件调查表文件格式尽可能和原调查表一致格式尽可能和原调查表一致，有利于直观录入数据。，有利于直观录入数据。如果用其他文本编辑器编写如果用其他文本编辑器编写.qes文件，在运行文件，在运行EpiData后，打开该后，打开该.qes文件即可编辑。文件即可编辑。调查表文件的编写是否符合要求，可通过调查表文件的编写是否符合要求，可通过“数据表预览数据表预览”来查看。来查看。编写调查表文件注意事项（二）55尽可能把字段定义数值型，有利于统计分析。如糖尿病史“dmh数据文件的产生和修改 主菜单主菜单选择数据导入选择数据导入/导出菜单导出菜单“根据根据QES文文件生成件生成REC文件文件”在工作过程工具条按第二个按钮在工作过程工具条按第二个按钮“生成生成REC文文件件”在编辑器菜单在编辑器菜单REC文件菜单文件菜单选择选择“生成生成REC文件文件”56数据文件的产生和修改 主菜单选择数据导入/导出菜单“根生成生成REC文件文件57生成REC文件575858请大家根据EPIDATA建立调查表库data.qes,生成数据库，保存为data.rec59调查表调查表姓名：姓名：_性别：（性别：（1）男）男 （2）女）女身高：身高：_._ CM出生日期：出生日期：_年年_月月_日日请大家根据EPIDATA建立调查表库data.qes,生成数现在我们已经有了两个文件：*.QES 调查表文件*.REC 数据文件*.REC文件是根据QES文件生成的，用于数据录入万一我的QES文件丢了怎么办？60现在我们已经有了两个文件：万一我的QES文件丢了怎么办？60数据文件结构的修改61数据文件结构的修改61调调查查表表结结构构重重新新修修改改后后怎怎么么办办？数据库建立后，录入了一部分分数据，发现漏掉了一数据库建立后，录入了一部分分数据，发现漏掉了一个字段，于是重新修改调查表，这里可以根据修改后个字段，于是重新修改调查表，这里可以根据修改后的的QES文件更新文件更新REC文件。文件。62调查表结构重新修改后怎么办？数据库建立后，录入了一部分分数据我一边我一边QQ聊天，一边录入数据，万一聊天，一边录入数据，万一录错了，软件会通知我吗？录错了，软件会通知我吗？63嗨！有第嗨！有第3种人吗？种人吗？我一边QQ聊天，一边录入数据，万一录错了，软件会通知我吗？6核对文件的建立 核对文件核对文件：CHECK文件或文件或 .CHK文件文件 n 范围范围/合法值（合法值（Range/Legal）n 跳转（跳转（Jumps）n 必须输入（必须输入（MustEnter）n 重复输入（重复输入（Repeat）64核对文件的建立 核对文件：CHECK文件或 .CHK文件6565光标悬停，会提示你命令格式66光标悬停，会提示你命令格式66录入错误时，软件会弹出警告67录入错误时，软件会弹出警告67试试，如果将试试，如果将1 1改为改为2020会怎样？改为会怎样？改为1515会会怎样？怎样？关键字段的定义以编号code2为例，这个编号具有唯一性，为避免重复输入，可在CHK文件中定义：code2 KEY UNIQUE 1 MUSTENTEREND68试试，如果将1改为20会怎样？改为15会怎样？关键字段的定义练习请大家根据下列调查表内容，利用EPIDATA建立调查表数据库,保存为data1.qes，并生成data1.rec用于录入资料。69练习请大家根据下列调查表内容，利用EPIDATA建立调查表数调查表1.地区号：N J 2.调查表编号：3.录入ID号：4.姓名：_ 5.性别：（1）男 （2）女 6.你吸烟吗？（1）否跳问7 （2）是 续问6.1 6.1 你多在年龄开始吸烟的？_ 岁 6.2 平均每天吸烟支数？_ 支 7.身高：_._ CM8.血压值(收缩压/舒张压)：_/_mmHg 9.出生日期：_月_日_年 10.你是否具有下列症状？如有请在相应症状前打勾。咳嗽 咳痰 发热 胸痛 呼吸困难 咯血 11.调查表录入日期：_月_日_年 70录入时自动编码调查表70录入时自动编码请大家根据data1.rec数据库，建立CHK文件，保存为data1.chk要求：（1 1）地区号自动录入）地区号自动录入（2 2）编号、姓名必须录入）编号、姓名必须录入（3 3）性别只能填）性别只能填1 1或或2 2（4 4）是否吸烟只能填）是否吸烟只能填1 1、2 2或或9 9（5 5）是否吸烟能够实现跳转）是否吸烟能够实现跳转（6 6）平均每天吸烟支数的范围在）平均每天吸烟支数的范围在1-401-40之间或填之间或填9999并请尝试录入35份调查表，存盘。71请大家根据data1.rec数据库，建立CHK文件，保存为d记录删除此处仅是在记录加上删除标记，彻底删除需至“工具”清理REC文件”点击点击72记录删除此处仅是在记录加上删除标记，点击72如果研究对象是（如果研究对象是（1）男性，而我）男性，而我却录成了（却录成了（2）女性，软件好象）女性，软件好象不会弹出警告嘛不会弹出警告嘛！73如果研究对象是（1）男性，而我却录成了（2）女性，软件好象不双录入核对 double entry为了确保录入质量，可以采用双人录入法进行核对。首先利用工具-复制REC文件结构，复制已建立好的数据库（包括CHK文件），另存为一新库，但已录入的数据不会被复制。74双录入核对 double entry为了确保录入质量，可以采双录入核对 double entry如需要，可不复制字符型变量因为家庭住址、工作单位等很少有人愿意录入两次。75双录入核对 double entry如需要，可不复制字符型变两次录入的一致性检验 双轨录入完成后可进行一致检验比较两次录入不同的地方注意选择两数据库中的匹配字段用于比较76两次录入的一致性检验 双轨录入完成后可进行一致检验7677777878调查表录入两次，比较后发现错调查表录入两次，比较后发现错误再修改，好象太麻烦！误再修改，好象太麻烦！有没有边录入边比较的方法？有没有边录入边比较的方法？79调查表录入两次，比较后发现错误再修改，好象太麻烦！79双录入实时校验先点击工具-准备双录入实时校验80双录入实时校验先点击工具-准备双录入实时校验80双录入实时校验指定第1 次已录入的REC文件创建1新的REC文件，用于双录入81双录入实时校验指定第1 次已录入的REC文件81双录入实时校验82应注意录入调查表的顺序双录入实时校验82应注意录入调查表的顺序显示数据83浏览数据库显示数据83浏览数据库其它一些常用功能打印调查表（在数据录入窗体下）文件-打印数据表84其它一些常用功能打印调查表84将数据库存档工具-创建压缩文件可以将指定目录下所有文件、仅EPIDATA文件或单个文件压缩、打包和保存。（ZIP）需要的时候再利用“工具-解压缩文件”解压缩85将数据库存档工具-创建压缩文件85描述数据86简单描述和分析数据描述数据86简单描述和分析数据数据文件的导出和导入 87数据文件的导出和导入 87数据库的纵向追加与横向合并 88数据库的纵向追加与横向合并 88数据库的纵向追加（头-尾）一般用于追加记录，如同学甲录了50份，同学乙录入了60份，现将两数据库合并成个库，共110份记录。注意选项89数据库的纵向追加（头-尾）一般用于追加记录，如同学甲录了50数据库的横向合并（肩-肩）如一份调查表包括两部分，同学甲录了Part 1，同学乙录入Part 2，现将两数据库合并成个库，包含Part 1和Part 2。选择关键字段用于匹配，一般用记录号NO作为关键字段，注意需保证其唯一性90数据库的横向合并（肩-肩）如一份调查表包括两部分，同学甲录请大家将数据库data3与data4合并，保存为data34.rec请大家将数据库data5与data6合并，保存为data56.rec请大家将数据库data5与data7合并，保存为data57.rec比较异同点91请大家将数据库data3与data4合并，保存为data34Data3+data492追加记录（注意变追加记录（注意变量是否增加）量是否增加）Data3+data492追加记录（注意变量是否增加）Data5+data693追加变量Data5+data693追加变量Data5+data794追加变量及记录Data5+data794追加变量及记录EpiData软件的工具菜单 95EpiData软件的工具菜单 95EpiData软件的选项 96EpiData软件的选项 96有有了了数数据据库库，那那就就得得考考虑虑如如何何分分析析了了统计描述统计推断97有了数据库，那就得考虑如何分析了统计描述97