医学文献检索总论课件

医学文献医学文献检检索索总论总论医学文献检索总论教材与参考资料教材与参考资料医药信息素养（胡家荣主编，医药信息素养（胡家荣主编，人民军医出版社）人民军医出版社）各种电子数据库中的各种电子数据库中的 指南指南帮助帮助医学信息检索实习指导（教研室医学信息检索实习指导（教研室自编，网页）自编，网页）教材与参考资料医药信息素养（胡家荣主编，人民军医出版社）检索效果的评价检索效果的评价 用户相关性判断系统匹配性判断相关文献非相关文献总计被检出文献a（命中）b（误检）a+b未检出文献c（漏检）d（正确拒绝）c+d总计a+cb+da+b+c+d查全率（R）=a/(a+c)*100%查准率（P）=a/(a+b)*100%概述检索课检索课文献的获取文献的获取文献管理工具文献管理工具文献综合利用文献综合利用文献筛选评价文献筛选评价图书文献获取期刊文献获取特种文献获取生物信息获取馆藏书目信息全文图书信息摘要库全文库事实数据获取中文摘要库外文摘要库中文全文库外文全文库检索效果的评价 用户相关性相关文献非相关文献总计被检出文献a本课程主要内容本课程主要内容:n绪论（基础概念、理论）绪论（基础概念、理论）n馆藏检索、公共图书馆资源检索馆藏检索、公共图书馆资源检索n中文期刊摘要库、中文书刊全文库中文期刊摘要库、中文书刊全文库n外文期刊摘要库、外文期刊全文库外文期刊摘要库、外文期刊全文库n文献管理工具文献管理工具n网络检索工具、特种文献检索网络检索工具、特种文献检索n信息筛选分析及综合利用案例信息筛选分析及综合利用案例n7次上机实习次上机实习本课程主要内容:绪论（基础概念、理论）n第一部分：基本概念第一部分：基本概念n第二部分：检索技术第二部分：检索技术n第三部分：医学常用数据库第三部分：医学常用数据库n第四部分：检索案例分析第四部分：检索案例分析第一部分：基本概念 世界医学协会赫尔辛基宣言世界医学协会赫尔辛基宣言 涉及人体的医学研究必须遵从普遍接涉及人体的医学研究必须遵从普遍接受的科学原则，受的科学原则，应对科学文献和相关资应对科学文献和相关资料全面了解料全面了解，并有充分的实验和动物试，并有充分的实验和动物试验（如有必要）的基础上进行。验（如有必要）的基础上进行。-世界医学协会赫尔辛基宣言概述世界医学协会赫尔辛基宣言 涉及人体的医学研究必第一部分：第一部分：基本概念基本概念医学文献检索总论课件1、信息与知识、信息与知识n信息（Information）：广义(客观性):信息是事物存在和运动状态及其特性的反映;狭义(主观性):信息是针对一定对象的需要而传递的有参考价值的新信息和新知识。n知识（Knowledge):是信息的一部分,系统化的信息才是知识。概述1、信息与知识信息（Information）：概 信息是使人原有的知识结构发生变化信息是使人原有的知识结构发生变化的那一小部分内容。的那一小部分内容。KS+KS+I I=KS+S=KS+S =KS+KS =KS+KSK=knowledge(K=knowledge(知识知识),S=structure(),S=structure(结构结构)，I I=information=information（信息）（信息）-英英 B.C.Brookes 1980 B.C.Brookes 1980 布鲁克斯信息理论布鲁克斯信息理论概述布鲁克斯信息理论概2、信息素养、信息素养n信息素养（Information Literacy）是人们能够判断确定何时需要信息、并能够对信息进行检索、评价和有效利用的能力。信息素养包括信息意识、信息技能和信息伦理三方面。概述2、信息素养信息素养（Information Literac信息素养信息素养概述信息素养概3、文、文 献献n文献（Document,Literature）是指记录着知识的一切载体；n医学文献就是记录着医学知识、信息的物质载体，如医学图书、期刊、会议录等等。概述3、文 献文献（Document,Literature）印刷印刷型型缩微缩微型型电子文献电子文献按载体形式划分文献的类型（按载体形式划分）文献的类型（按载体形式划分）印刷型缩微型电子文献按载体形式划分文献的类型（按载体形式划分印刷型文献印刷型文献图书图书期刊期刊报纸报纸特种文献特种文献图书图书图书图书图书图书图书图书期刊期刊报纸报纸报纸报纸报纸报纸图书图书图书图书期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊特种文献特种文献特种文献特种文献特种文献特种文献期刊期刊印刷型文献图书期刊报纸特种文献图书图书图书图书期刊报纸报纸报ISBN号内容系统理论成熟新颖性较差图书图书期刊期刊ISSN号内容不系统理论不成熟新颖性较好报纸报纸消息、报道专业性不强不适宜作学术论文引用源ISBN号图书期刊ISSN号报纸消息、报道电子版电子版书、刊书、刊/e-book,e-journal，及其它文献，及其它文献 印刷版印刷版书、刊书、刊/print,及其它文献及其它文献电子版书、刊/香港大学香港大学 馆藏缩微型文献示馆藏缩微型文献示例例香港大学 馆藏缩微型文献示例医学文献检索总论课件医学文献检索总论课件医学文献检索总论课件n一次文献（原始文献)n二次文献(书目文献、索引）n三次文献（教科书、参考工具书、综述等）n零次文献（私人笔记、试验记录、设计草图、口头交流的信息等）按加工层次划分文献的类型（按加工层次划分）文献的类型（按加工层次划分）一次文献（原始文献)按加工层次划分文献的类型（按加工层次划分4、期刊影响因子：反映期刊的、期刊影响因子：反映期刊的整体水平整体水平n期刊影响因子（Impact Factor,IF）指期刊近两年的平均被引用率，最早是由美国情报学家SCI创始人尤金加菲尔德(Eugene Garfield)博士在1972年提出来的。nIF=(C2+C3)/(A2+A3)n以1996年Science杂志为例：nA21995年出版的文献数1037（篇），nA31994年出版的文献数1054(篇)，nC21995年出版的文献在1996年被引用的次数24189(次)，nC31994年出版的文献在1996年被引用的次数25170(次)。nIF23.605(次篇)。概述4、期刊影响因子：反映期刊的整体水平期刊影响因子（Impac一种新的出版模式：公开获取（一种新的出版模式：公开获取（OA）示例示例OA Journal Successes:PLoS Biologynfeatures works of exceptional significance in all areas of biological science,from molecules to ecosystems,including works at the interface with other disciplines,such as chemistry,medicine,and mathematicsnPublic Library of Sciencenimpact factor:14.7概述一种新的出版模式：公开获取（OA）示例OA Journal5 5、核心期刊：、核心期刊：、核心期刊：、核心期刊：反映期刊的反映期刊的整体水平整体水平n核心期刊（Core Journal）是指那些发表该学科（或该领域）论文较多、使用率（含被引率、摘转率和流通率）较高、学术影响较大的期刊。n 它们具有数量少（一般占期刊总数的5-15%），但信息量大（占期刊信息量的50%以上）;n浏览核心期刊可在较短的时间 内掌握较多的信息，了解最新的科研动态等。概述5、核心期刊：反映期刊的整体水平核心期刊（Core Journ国际三大索引：1.SCI科学引文索引:Science Citation Index 2.EI工程索引:The Engineering Index 3.ISTP科技会议录索引:Index to Scientific&Technical Proceedings n国内三大自科核心期刊目录1.中文核心期刊(医学:223种)-北京大学图书馆2.中国科技论文统计源期刊-中国科学技术信息研究所3.中国科学引文数据库(CSCD)-中国科学院文献情报中心 核心期刊核心期刊概述国际三大索引：核心期刊概医学文献的现状和发展趋势医学文献的现状和发展趋势 n数量大、增长快数量大、增长快n出版类型复杂多种出版类型复杂多种n内容分散、交叉、重复内容分散、交叉、重复 n新陈代谢频繁、传播迅速新陈代谢频繁、传播迅速 n文献发表时滞严重文献发表时滞严重 概述医学文献的现状和发展趋势 数量大、增长快概医学文献的增长情况医学文献的增长情况概述医学文献的增长情况概n8000 articles published per dayn25,000 biomedical journals in printn1500 medical articles onto Medline per dayWhats so difficult about medical articles?概述8000 articles published per da6、文献、文献/信息检索信息检索有效地选择和利用信息的科学方法与手段就有效地选择和利用信息的科学方法与手段就是是文献/信息检索。广义：信息存储与信息检索（两个方面）广义：信息存储与信息检索（两个方面）狭义：仅指信息用户查找信息的过程。狭义：仅指信息用户查找信息的过程。6、文献/信息检索有效地选择和利用信息的科学方法与手段就是文7、文献、文献/信息检索的基本原理信息检索的基本原理 信息存储时，将采集到的大量分散的源信息存储时，将采集到的大量分散的源信息（一次文献），经过标引著录，加工信息（一次文献），经过标引著录，加工整理，使之有序化后形成各类信息集合整理，使之有序化后形成各类信息集合（数据库）；（数据库）；信息检索时，将要查找的信息特征标识信息检索时，将要查找的信息特征标识与信息集合中已存储的信息特征标识进行与信息集合中已存储的信息特征标识进行比较、匹配，双方特征标识完全一致或部比较、匹配，双方特征标识完全一致或部分一致时，检索即为命中。分一致时，检索即为命中。7、文献/信息检索的基本原理 信息存储时，将采集到的检索原理示意图检索原理示意图 文献信息检索标识数据库标引存储检索表达式检索提问规范检索语言检索匹配运算输出检索结果采集检索原理示意图 文献信息检索标识数据库标引存储检索表达式检文献文献/信息检索的分类信息检索的分类按检索对象划分：按检索对象划分：数据检索数据检索(data retrieval)事实检索事实检索(fact retrieval)文献检索文献检索(literature retrieval)按检索技术手段划分：按检索技术手段划分：手工检索手工检索 计算机检索计算机检索 网络查询与交流网络查询与交流确定性检索，可确定性检索，可直接获得解答。直接获得解答。文献/信息检索的分类按检索对象划分：确定性检索，可直接获得解数据检索数据检索 又称数值检索，检索对象为特定的又称数值检索，检索对象为特定的数值数据，主要回答数值数据，主要回答“是多少是多少”一类的一类的问题，属于确定性检索的范围。如：问题，属于确定性检索的范围。如：物质的各种参数、电话号码、银行帐物质的各种参数、电话号码、银行帐号、各类统计数字、化学药物的理化号、各类统计数字、化学药物的理化常数，常用计量等。常数，常用计量等。数据检索需借助相关的参考工具书数据检索需借助相关的参考工具书或通过数值型数据库。或通过数值型数据库。数据检索 又称数值检索，检索对象为特定的数值数据，主要事实检索事实检索 又称事项检索，检索对象为特定的事又称事项检索，检索对象为特定的事实，主要回答实，主要回答“是谁是谁”或或“是什么是什么”一类的一类的问题，也属于确定性检索。如：名词、问题，也属于确定性检索。如：名词、概念、标准、法律法规等。概念、标准、法律法规等。事实检索主要借助参考工具书或事实事实检索主要借助参考工具书或事实型数据库。如美国型数据库。如美国MedlinePlus平台的平台的drug information，dictionary等数据等数据库。库。事实检索 又称事项检索，检索对象为特定的事实，主要回答文献（型）检索文献（型）检索 以某些特定的文献为检索对象，检索结果以某些特定的文献为检索对象，检索结果是关于某一课题的切题文献或相关文献。如：是关于某一课题的切题文献或相关文献。如：查国内外近五年关于查国内外近五年关于“早老素与老年痴呆的早老素与老年痴呆的关系关系”方面的研究文献。方面的研究文献。文献检索属于相关性检索，系统仅提供相文献检索属于相关性检索，系统仅提供相关的文献线索、文献摘要或全文以供检索者关的文献线索、文献摘要或全文以供检索者参考阅读和分析研究。参考阅读和分析研究。文献检索借助手工检索工具或大型期刊文文献检索借助手工检索工具或大型期刊文献数据库（书目型或全文型数据库）。献数据库（书目型或全文型数据库）。文献（型）检索 以某些特定的文献为检索对象，检索结果是检索方式检索方式n手工检索手工检索（1879-1879-）（印刷型检索工具）（印刷型检索工具）美国医学索引中文科技资料目录美国医学索引中文科技资料目录n计算机检索计算机检索（1960-1960-）（包括计算机，操（包括计算机，操作系统，数据库，检索软件）如：作系统，数据库，检索软件）如：CBMMEDLINEn网络查询与交流网络查询与交流（1990-1990-）（利用各种搜（利用各种搜索引擎，访问各类信息资源站点、查询索引擎，访问各类信息资源站点、查询网络数据库、通过电子邮件、讨论组等）网络数据库、通过电子邮件、讨论组等）检索方式手工检索（1879-）（印刷型检索工具）美国医学索n数值数据库数值数据库(Numeric Database)(Numeric Database)存储各种统计、实验、测量等方面的存储各种统计、实验、测量等方面的数据。数据。n事实数据库事实数据库(Fact Database)(Fact Database)存储描述事物等信息的情况过程和现存储描述事物等信息的情况过程和现象的事实。（如各类电子版字辞典）象的事实。（如各类电子版字辞典）n文献数据库文献数据库（Literature Database)Literature Database)数据库类型数据库类型数值数据库(Numeric Database)数据库类型文献型数据库文献型数据库n书目数据库书目数据库(Bibliographic Database)(Bibliographic Database)存储文献的外部特征，主要包括文献存储文献的外部特征，主要包括文献的的题名题名、著者著者、著者单位、所载期刊、著者单位、所载期刊刊名刊名，出版年出版年、卷、期和起止页码卷、期和起止页码，可以包括可以包括摘要摘要，但不包括文献的全文。，但不包括文献的全文。n全文数据库全文数据库(Full Text Database)(Full Text Database)与书目数据库相对而言。主要存储原与书目数据库相对而言。主要存储原始文献的全文，如期刊论文、报纸新始文献的全文，如期刊论文、报纸新闻、法律法规、政府出版物等。闻、法律法规、政府出版物等。文献型数据库书目数据库(Bibliographic Dat文献型数据库的一般结构文献型数据库的一般结构n数据库数据库（data bankdata bank）文档文档（filefile，通常按年限划分）通常按年限划分）记录记录（recordrecord，单元单元论文）论文）字段字段（fieldfield）v字段用来记录和描述每篇文献的外表特征字段用来记录和描述每篇文献的外表特征和内容特征。（如：题名、作者、摘要）和内容特征。（如：题名、作者、摘要）文献型数据库的一般结构数据库（data bank）数据库常见字段数据库常见字段题名（题名（Title,Title,TITI）著者（著者（Author,Author,AU AU）著者单位地址（著者单位地址（Address,Address,ADAD）出处（出处（Source,Source,SOSO）摘要（摘要（Abstracts,Abstracts,ABAB）文献类型文献类型（Publication type,Publication type,PTPT）n文献题录三要素（线索）：文献题录三要素（线索）：题名题名 著者著者 出出处处题题录录数据库常见字段题名（Title,TI）题第二部分：第二部分：检索技术检索技术医学文献检索总论课件n不论是最早的不论是最早的单机或联机单机或联机检索，或是目检索，或是目前流行的前流行的网络查询网络查询，一般使用的检索技，一般使用的检索技术主要包括：术主要包括：布尔逻辑检索布尔逻辑检索截词检索截词检索邻近检索（位置检索）邻近检索（位置检索）字段限定检索字段限定检索网络信息检索规则网络信息检索规则不论是最早的单机或联机检索，或是目前流行的网络查询，一般使用1.布尔逻辑检索技术n布尔逻辑检索布尔逻辑检索是建立最早、应用最为广是建立最早、应用最为广泛的检索理论和检索技术，也是最简单、泛的检索理论和检索技术，也是最简单、最基本的计算机检索的匹配模式。最基本的计算机检索的匹配模式。n逻辑检索以布尔逻辑表达式来表达用户逻辑检索以布尔逻辑表达式来表达用户的检索要求，并通过的检索要求，并通过逻辑运算符逻辑运算符连接两连接两个以上的检索词，从而实现两个以上概个以上的检索词，从而实现两个以上概念的逻辑组配检索。念的逻辑组配检索。1.布尔逻辑检索技术布尔逻辑检索是建立最早、应用最为广泛的检布尔逻辑示意图运算符：运算符：AND，*起缩小检索范围，起缩小检索范围，提高查准率的作用。提高查准率的作用。运算符：运算符：OR，+起扩大检索范围，起扩大检索范围，提高查全率的作用。提高查全率的作用。运算符：运算符：NOT，-起缩小检索范围，起缩小检索范围，用于去除检出文献中用于去除检出文献中不需要的部分。不需要的部分。逻辑与逻辑与逻辑或逻辑或逻辑非逻辑非布尔逻辑示意图运算符：AND，*运算符：OR，+运算符：NO布尔逻辑表达式nchild and asthma 小儿哮喘小儿哮喘nlung cancer and smoking 吸烟与肺癌吸烟与肺癌ntrace elements not zinc 除锌以外的微量元素除锌以外的微量元素n肝癌或肝细胞瘤的诊断肝癌或肝细胞瘤的诊断 (肝癌肝癌 or 肝细胞瘤肝细胞瘤)and 诊断诊断n优先级：优先级：（）NOT AND OR布尔逻辑表达式child and asthma 小儿哮喘n布尔运算符在不同的检索系统中有不同的表达方式（在线浏览）清华同方的“中国学术期刊全文库”CBMPubMedGoogleet al.布尔运算符在不同的检索系统中有不同的表达方式（在线浏览）2.截词检索技术n截词检索截词检索(Truncation)是将检索词截断，取是将检索词截断，取其中的一部分片段，再加上截词符号一起其中的一部分片段，再加上截词符号一起输入计算机，系统自动将词片段与数据库输入计算机，系统自动将词片段与数据库中的索引词匹配，凡含有该词片段的文献中的索引词匹配，凡含有该词片段的文献均被检出。均被检出。n截词方式主要有：截词方式主要有：右截词符右截词符“*”（*=0-n个字符）个字符）中间截词符中间截词符“？”(？=0-1个字符个字符)输入输入Pain*Pain*，即可检出：，即可检出：Pain,painPain,painfulful,pain,painlessless,painpainnessness，pain painkillerkiller 2.截词检索技术截词检索(Truncation)是将检索词截3.邻近检索技术（Proximity)n邻近检索是用邻近算符（或叫位置算符）邻近检索是用邻近算符（或叫位置算符）连接两个检索词，要求检出文献中的两个连接两个检索词，要求检出文献中的两个检索词必须同时出现在同一个句子或同一检索词必须同时出现在同一个句子或同一个字段当中。常用于个字段当中。常用于自由词检索自由词检索，起提高，起提高查准率的作用。查准率的作用。nnearnear 要求两词出现在要求两词出现在同一个句子同一个句子中。中。nwithwith 要求两词出现在要求两词出现在同一个字段中同一个字段中，如篇，如篇名、摘要、主题词等。名、摘要、主题词等。3.邻近检索技术（Proximity)邻近检索是用邻近算符（4.字段限定检索技术n多数文献数据库检索系统中都设置了字段多数文献数据库检索系统中都设置了字段限定检索功能限定检索功能LimitLimit，以满足检索用户，以满足检索用户指定检索某一个特定字段或几个字段信息指定检索某一个特定字段或几个字段信息的要求。的要求。AUAU限查作者限查作者 AD AD限查作者机构限查作者机构MHMH限查医学主题词限查医学主题词 PTPT限查文献类型限查文献类型 TA TA限查特定刊限查特定刊名名nJohn SmithAU,CellTAJohn SmithAU,CellTA提示提示:多数文献数据库检索系统中都设多数文献数据库检索系统中都设置了置了字段限定检索字段限定检索功能，以满足检索用功能，以满足检索用户检索某一个特定字段或几个字段信息户检索某一个特定字段或几个字段信息的要求。的要求。4.字段限定检索技术多数文献数据库检索系统中都设置了字段限定5.加权检索（含义）n基本含义基本含义：加权检索是某些检索系统中设：加权检索是某些检索系统中设置的一种定量检索技术。置的一种定量检索技术。n基本方法基本方法：在每个提问词后面给定一个数：在每个提问词后面给定一个数值表示其重要程度，这个数值称为权。在值表示其重要程度，这个数值称为权。在检索时，先查找这些检索词在数据库记录检索时，先查找这些检索词在数据库记录中是否存在，然后再计算存在的检索词的中是否存在，然后再计算存在的检索词的权值总和。权值之和达到或超过预先给定权值总和。权值之和达到或超过预先给定的阈值，该记录即为命中记录的阈值，该记录即为命中记录。5.加权检索（含义）基本含义：加权检索是某些检索系统中设置的加权检索（作用）n加权检索可以命中核心概念文献，因此是一种缩加权检索可以命中核心概念文献，因此是一种缩小检索范围提高检准率的有效方法小检索范围提高检准率的有效方法.n如如:中国生物医学文献数据库中国生物医学文献数据库（CBMCBM）就采用了这）就采用了这种技术种技术,可以将主要论述某一主题概念的医学论可以将主要论述某一主题概念的医学论文检出来，减少命中文献数量，提高文献主题专文检出来，减少命中文献数量，提高文献主题专指度。指度。n在线浏览在线浏览(CBM,PubMed)(CBM,PubMed)加权检索（作用）加权检索可以命中核心概念文献，因此是一种缩小6.聚类检索n聚类检索是在对文献进行自动标引的基础聚类检索是在对文献进行自动标引的基础上，构造文献的形式化表示上，构造文献的形式化表示文献向量文献向量,然后通过一定的聚类方法，计算出文献与然后通过一定的聚类方法，计算出文献与文献之间的相似度，并文献之间的相似度，并把相似度较高的文把相似度较高的文献集中在一起，献集中在一起，形成一个个的文献类的检形成一个个的文献类的检索技术。索技术。n在这样的类目体系中，主题相近、内容相在这样的类目体系中，主题相近、内容相关的文献便聚在一起，而相异的则被区分关的文献便聚在一起，而相异的则被区分开来。开来。6.聚类检索聚类检索是在对文献进行自动标引的基础上，构造文献7、网络信息检索规则n包含或排除检索（加减检索）：包含或排除检索（加减检索）：+，-n词组检索（强制检索）：词组检索（强制检索）：“”n自然语言检索：任意词或句子自然语言检索：任意词或句子n模糊检索：可以自动修正提问错误，给出模糊检索：可以自动修正提问错误，给出正确信息正确信息n概念检索：系统自动对某一概念词及其同概念检索：系统自动对某一概念词及其同义词或近义词加以识别并自动匹配检索义词或近义词加以识别并自动匹配检索n多语种检索：系统自动翻译转换不同语种多语种检索：系统自动翻译转换不同语种7、网络信息检索规则包含或排除检索（加减检索）：+，-检索技术的发展趋势n目前信息检索技术正逐步从书目检索向目前信息检索技术正逐步从书目检索向全文全文检索和检索和多媒体多媒体检索方向发展，检索方向发展，智能智能化化检索将成为未来计算机网络信息检索检索将成为未来计算机网络信息检索的发展趋势。的发展趋势。n在学习应用传统检索技术的同时，也要在学习应用传统检索技术的同时，也要不断地注意学习更先进的检索技术。不断地注意学习更先进的检索技术。检索技术的发展趋势目前信息检索技术正逐步从书目检索向全文检索文献检索语言概述n文献检索语言是根据文献信息检索的需要文献检索语言是根据文献信息检索的需要而创制的一种人工语言，又叫做文献而创制的一种人工语言，又叫做文献存储存储或或检索检索语言。（语言。（标引标引、索引索引、检索检索语言）语言）n文献信息检索语言既是汇集、组织、存储文献信息检索语言既是汇集、组织、存储文献的文献的手段和工具手段和工具，又是沟通文献管理者、，又是沟通文献管理者、文献用户、以及文献作者三方的桥梁。文献用户、以及文献作者三方的桥梁。n系统学习了解有关检索语言的基本知识是系统学习了解有关检索语言的基本知识是提高检索效率的重要环节。提高检索效率的重要环节。文献检索语言概述文献检索语言是根据文献信息检索的需要而创制的检索语言的种类（一）n描述文献描述文献外表特征外表特征的检索语言的检索语言文献文献题名题名索引系统（书名、刊名目录）索引系统（书名、刊名目录）著者著者索引系统（著者索引）索引系统（著者索引）文献文献序号序号索引系统（专利号索引、科技索引系统（专利号索引、科技报告号索引、技术标准号索引）报告号索引、技术标准号索引）引文引文索引系统（以科技论文末尾的参考索引系统（以科技论文末尾的参考文献外表特征（题录）编制的文献外表特征（题录）编制的著者引文著者引文索引系统索引系统，如：美国科学引文索引，如：美国科学引文索引检索语言的种类（一）描述文献外表特征的检索语言检索语言的种类（二）n描述文献描述文献内容特征内容特征的检索语言的检索语言分类法语言分类法语言：又称等级体系分类法，由：又称等级体系分类法，由分类号和等级类目名称组成。如：美国分类号和等级类目名称组成。如：美国国会图书馆图书分类法、杜威十进分类国会图书馆图书分类法、杜威十进分类法、国际十进分类法以及我国的法、国际十进分类法以及我国的中国中国图书馆分类法图书馆分类法。主题法语言主题法语言：叙词法：美国叙词法：美国MEDLINE，中国，中国CBM关键词法：美国关键词法：美国CA，BA，中国期刊中国期刊网网检索语言的种类（二）描述文献内容特征的检索语言叙词（Descriptor）n又称又称主题词主题词（Subject heading），是经），是经过人工干预，严格规范化的词或词组，由过人工干预，严格规范化的词或词组，由词表控制，因此也叫受控检索语言。规范词表控制，因此也叫受控检索语言。规范检索语言突出的特点是：检索语言突出的特点是：词语与概念之间单一对应，确保同一概词语与概念之间单一对应，确保同一概念不同表达的文献能查快、查准、查全；念不同表达的文献能查快、查准、查全；采用等级体系分类法的原理编制词表，采用等级体系分类法的原理编制词表，保证文献查准、查全。保证文献查准、查全。如：艾滋病：如：艾滋病：获得性免疫缺陷综合获得性免疫缺陷综合征征 肝肝 癌：癌：肝肿瘤肝肿瘤 乙型肝炎：乙型肝炎：肝炎，乙型肝炎，乙型 创伤性休克：创伤性休克：休克，创伤性休克，创伤性叙词（Descriptor）又称主题词（Subject hen汉语主题词表n中医药主题词表n 美国医学主题词表Medical Subject Headings,MeSH。有16000多个主题词，分15个大类（A-N,Z），102个小类，还有82个副主题词，Subheadings，分字顺表达式 Alphabetic List和树状结构Tree Structure两部分。概述医学检索系统常用的主题词表概医学检索系统常用的主题词表 对于自然医学语汇中同义词、近义词学名与俗名的处理对于自然医学语汇中同义词、近义词学名与俗名的处理例：例：Cancer，Tumor *Neoplasms (近义词近义词)German Measles *Rubella (同义词同义词)Vitamin C *Ascorbic Acid(学、俗名学、俗名)Apoplexy *Cerebrovascular DisordersDeoxyribonucleic Acid *DNA (繁、简称繁、简称)非典非典 *严重急性呼吸道综合症严重急性呼吸道综合症乙酰水杨酸，阿斯匹林乙酰水杨酸，阿斯匹林 *阿司匹林阿司匹林MeSH作用作用1：规范自由词：规范自由词概 述 对于自然医学语汇中同义词、近义词学名与俗名的处理 MMeSH作用作用2:扩展下位扩展下位(树型结构表树型结构表树型结构表树型结构表)按照学科性质，词义范围的上下类属和派生关系，按照学科性质，词义范围的上下类属和派生关系，将字顺表中的主题词分别划分为将字顺表中的主题词分别划分为15个大类，依次用个大类，依次用A-N及及Z代表。代表。等级关系:Diseases C Neoplasms C4 Neoplasms by Site(NON MeSH)C4.588 Digestive System Neoplasms C4.588.274 Gastrointestinal Neoplasms C4.588.274.476 Intestinal Neoplasms.C4.588.274.476.411 Colonic Neoplasms C4.588.274.476.411.306 Colorectal Neoplasms C4.588.274.476.411.306.416 HereditaryNonpolyposis.C4.588.274.476.411.306.416.250代表疾病代表疾病类类Diseases肿肿瘤瘤消化消化系统肿系统肿瘤瘤C6.240.476概 述MeSH作用2:扩展下位(树型结构表)按照学科性质关键词（Keyword）n关键词是为适应计算机自动编制索引的关键词是为适应计算机自动编制索引的需要而产生的。一般是直接抽自文献的需要而产生的。一般是直接抽自文献的标题、文摘或全文当中的具有实质性检标题、文摘或全文当中的具有实质性检索意义的专业名词术语。索意义的专业名词术语。n例如：一篇题名为：例如：一篇题名为：“癌基因癌基因和和抑癌基因抑癌基因在在肺癌肺癌研究研究中的中的应用应用和和发展趋势发展趋势”的文章，的文章，只有三个词可以作为关键词，其它词如：只有三个词可以作为关键词，其它词如：研究研究、应用、发展趋势应用、发展趋势只是起辅助描述只是起辅助描述的作用，不能作为关键词。的作用，不能作为关键词。关键词（Keyword）关键词是为适应计算机自动编制索引的需关键词索引n用关键词编制的索引，最大的好处是可用关键词编制的索引，最大的好处是可以反映文献中最新的专业术语，易检易以反映文献中最新的专业术语，易检易学。学。n但关键词对词语和概念之间不做规范，但关键词对词语和概念之间不做规范，大量存在大量存在同义词同义词和和近义词近义词以及以及拼写变异拼写变异等现象，容易造成文献漏检和误检。等现象，容易造成文献漏检和误检。n关键词索引不能反映词语间的等级关系关键词索引不能反映词语间的等级关系和相关关系，因此难保文献迅速查全，和相关关系，因此难保文献迅速查全，影响检索效率。影响检索效率。关键词索引用关键词编制的索引，最大的好处是可以反映文献中最新检索步骤检索步骤n1、分析检索课题 n2、选择数据库 n3、选择检索途径 n4、确定检索词 n5、构筑检索提问式并作检索操作n6、调整检索策略 n7、输出检索结果n8、获取原始文献 n9、创建文献跟踪服务 概述检索步骤1、分析检索课题 概检索途径检索途径n文献外表特征的检索途径：文献名称途径、著者途径等n文献内容特征的检索途径：分类途径，主题途径等 概述检索途径文献外表特征的检索途径：概检索效果的评价检索效果的评价 用户相关性判断系统匹配性判断相关文献非相关文献总计被检出文献a（命中）b（误检）a+b未检出文献c（漏检）d（正确拒绝）c+d总计a+cb+da+b+c+d查全率（R）=a/(a+c)*100%查准率（P）=a/(a+b)*100%概述检索效果的评价 用户相关性相关文献非相关文献总计被检出文献a第三部分：第三部分：医学常用数据库医学常用数据库医学文献检索总论课件n n全文型数据库全文型数据库全文型数据库全文型数据库(一次文献一次文献一次文献一次文献)Elsevier(MD consult)Elsevier(MD consult)、Wiley Wiley、SpringerSpringer、EBSCO hostEBSCO host、Proquest Proquest、Karger Karger、BMJBMJ、OVID(LWW)OVID(LWW)BMC BMC、Pubmed centralPubmed central、PLoSPLoS CHKD CHKD、万方数据、维普、万方数据、维普n n文摘型数据库文摘型数据库文摘型数据库文摘型数据库(二次文献二次文献二次文献二次文献)Medline(Pubmed)Medline(Pubmed)、EmbaseEmbase、SCISCI CBMdisc CBMdisc n n事实型数据库事实型数据库事实型数据库事实型数据库(三次文献三次文献三次文献三次文献)Clinical Evidence Clinical Evidence、Cochrane libraryCochrane library常用医学文献数据库的类型常用医学文献数据库的类型概述全文型数据库(一次文献)常用医学文献数据库的类型概广医图书馆网址：广医图书馆网址：210.38.58.8广医医学文献资源广医医学文献资源概述广医图书馆网址：210.38.58.8广医医学文献资源概T-65T-65类图书类图书万方万方技术标准技术标准100100多种多种同方同方/900/900多种报纸的多种报纸的医学类医学类报纸报纸-万方万方法律法规文本法律法规文本-万方万方 同方同方会议论文会议论文本校本校(1985-)(1985-)万方万方 同方同方 本校本校学位论文学位论文中文中文2 2千种千种外文外文7070种种中文中文1 1万种万种外文外文4 4千种千种期刊期刊近近8080万册万册200200万册万册图书图书印刷版印刷版电子版电子版 载体形式载体形式文献类型文献类型1 1、总体情、总体情况况T-65类图书万方技术标准100多种同方/900多种报纸的医2 2、电子期刊（全文型）、电子期刊（全文型）名称开发机构学科范围期刊数量(约数)时间范围检索功能数据类型CBM医科院医药16001978-较完善摘要MEDLINE/PUBMEDNLM医药50001950-好摘要中国学术期刊全文库清华同方各学科/医学7000/10001979-一般全文中文科技期刊全文库重庆维普各学科80001989-一般全文万方数字化期刊万方各学科50001997-一般全文OVIDOVID医学28090年代中-一般全文Springer-LinkSpringer-Verlag医学/人文1149/15090年代中-一般全文ProquestUMI医学10001987-一般全文JohnWilleyJohnWilley&Sons,Inc.医学及相关学科45090年代中一般全文EBSCOhostEBSCOIndustriesInc.医学140090年代中一般全文ScienceDirectElsevierB.V.100090年代中一般全文2、电子期刊（全文型）名称开发学科范围期刊数量时间检索功能数名名 称称数据数据平台平台学科学科范围范围时间时间范围范围学位学位级别级别中国学位论文全文数据中国学位论文全文数据库库 万方万方各学科各学科1977-1977-博、硕博、硕士士中国博士学位论文全文中国博士学位论文全文数据库数据库清华清华同方同方医学医学1999-1999-博士博士中国硕士学位论文全文中国硕士学位论文全文数据库数据库清华清华同方同方医学医学1999-1999-硕士硕士我院硕士学位论文全文我院硕士学位论文全文数据库数据库医学医学1985-1985-硕士硕士3 3、学位论文（全文型）、学位论文（全文型）名 称数据学科时间学位中国学位论文全文数据库 万方各第四部分：第四部分：检索案例分析检索案例分析医学文献检索总论课件检索获取医学专业信息的意义检索获取医学专业信息的意义n1、科学研究的需要确定研究方向借鉴研究方法n2、临床诊疗的需要借鉴同行新的诊疗方法循证医学的需要医疗事故鉴定n3、科研管理、人才评价的需要追踪某一机构,某个团体或个人的研究热点寻求合作方向检索获取医学专业信息的意义1、科学研究的需要案例分析：案例分析：我校组建免疫研究所，引进人才前的准备工作(文献学指标和核心成果的评价)个人信息，工作经历发文情况:发文量SCI发文量F发文量ESI：高引被引情况:关键论文的被引频次专利情况在研项目获得奖项对关键科研成果的分析，形成评价报告案例分析：我校组建免疫研究所，引进人才前的准备工作拟引进人才：拟引进人才：Ferrandon Dominique,FRANCE拟引进人才：Ferrandon Dominique,FRAn个人信息，工作经历,研究兴趣，来源：个人网页，直接接触，沟通交流n发文量等文献学评价信息来源：公开的专业数据库，专业网站n在研项目，获奖情况：个人网页或机构网页n核心成果评析：通过文献学指标和专业知识确定核心文献，研读。个人信息，工作经历,研究兴趣，来源：个人网页，直接接触，沟通个人信息，教育程度，工作经历，个人信息，教育程度，工作经历，研究领域研究领域nBorn 25/3/1963，Maried,2 childrenn法国斯特拉斯堡大学分子与细胞生物学研究所,分子与细胞生物学研究所，昆虫免疫应答和发育实验室（UPR 9022 CNRS）Equipe Fondation Recherche Mdicale,UPR 9022 du CNRS,Universit de Strasbourg,Institut de Biologie Molculaire et Cellulaire,15,rue R.Descartes,F67084 Strasbourg Cedex,France.D.Ferrandonibmc-cnrs.unistra.fr ）n研究领域，research interests：Innate immunity of insects,host-pathogen relationships of bacterial and fungal pathogens个人信息，教育程度，工作经历，研究领域Born 25/3/1各指标情况各指标情况:n发文量：PubMed,40nSCI收录：43（自然科学，含有其它学科）nF1000：6nESI：1n关键论文约8篇,被引频次(见报告)n专利情况:所在团队有19项专利n奖项:重要奖项6项n在研项目:3项各指标情况:发文量：PubMed,40