《简单使用说明》PPT课件.ppt

1,化学绘图软件,ChemDrawChemWindow主要功能：绘制二维和三维化学结构式、化学反应方程式、化工流程图、实验装置图以及相关文本的编辑,商业软件,一.概述,2,ChemDraw：当前最常用的结构式编辑软件，除了以上所述的一般功能外，其ultra版本还可以预测分子的常见物理化学性质如：熔点、生成热等；对结构按IUPAC原则命名；预测质子及碳13化学位移等。ChemWindow：最突出的特点是与光谱结合，它的6.5Spectroscopy版本包括了一个约五万张13CNMR的数据库(达250兆)，因而其预测更加精确；除了根据化合物的结构预测13CNMR化学位移外，还能预测红外图谱、质谱等，更可以读入标准格式的NMR、IR、Raman、UV及色谱图。,3,美国CambridgeSoft公司的重要产品之一专业的集成化学桌面办公软件标准界面的菜单简明，易于操作；方便快捷具有化学计算、化学分析和化学建模等实用功能,二.ChemOffice,4,(1)ChemDraw是一个化学结构绘图软件，可绘制和编辑高质量的化学结构图，识别和显示立体结构、部分物性，将结构和名称进行转换。(2)chem3D是一个用于设计化学模型的应用软件，可将二维平面的有机分子结构图形转化成三维的空间结构，可辅助计算分子半径的几何构象和单个点的能量以及相关的性质，例如优化模型、构象搜索、分子动力学和计算分子的单点能量等。(3)ChemInfo是基于国际互联网络技术开发的智能型数据管理系统。可以建立分子结构的数据库。(4)chemFinder是一个化学信息管理系统，可以用它来管理化学信息。,组成,5,ChemOffiee的安装,6,7,Chemdraw简介,Chemdraw是一个方便快捷的化学绘图工具，可以迅速画出各种各样的化学结构及化学反应式，以及与化学有关的其它图形表示。具有多种输入输出功能，可以直接将所绘制的图片等以常见的格式输出,可由word等文字处理器识别的，便于一般的文档处理,8,Chemdraw简介,具有预测1HNMR和13CNMR(核磁共振)谱图的功能，不仅可以生成图谱，还可以直接计算出各个峰的位置和面积(高度)，为化学研究带来了极大的方便。CheroDraw已经成为化学工作者撰稿和进行学术交流公认的化学结构输入软件。化学软件的泰斗,9,ChemDrawUltra80(超级版)ChemDrawPro80(标准版)ChemDrawStd80(专业版)ChemDrawLtd8.0（受限版）四种版本功能由强到弱。,10,ChemDraw起始界面,11,图形工具板,状态/信息栏,编辑区,滚动栏,菜单栏,工具栏,12,13,套索实键双键虚键切割键切割楔键黑体键黑体楔键空心楔键波浪键表格长链环丙烷环环戊烷环环庚烷环环己烷椅式环戊二烯环,蓬罩橡皮文本笔箭头轨道绘图元素基元化学符号弧形原子反应模板环丁烷环环己烷环环辛烷环环己烷椅式苯环,14,键工具,模板工具,箭头工具,轨道工具,画图工具,基元工具,符号工具,弧形工具,原子反应工具,15,16,具体用法为：用鼠标左键点中所选择的工具箱中的工具，然后在右边用鼠标拖动，至到画出你所需要的碳链,画碳链,17,便捷地画出各种各样的环状结构,18,模板按钮,氨基酸(AminoAcids)，芳族(Aromatics)，双环(Bicyclics)，生物与胶体(Bioart)，仪器1(Clipware,part1)仪器2(Clipaware,part2)构型(Conformers)，五元环(CpRings)，环烃(Cycloalkanes)，DNA(Templates)，功能团(FunctionalGroups)，杂环(Hexoses)，苯环(PhRings)，多方体(Polyhedra)，RNA(Templates)，立体异构体(Stereocenters)，超分子(Supramolecules),19,模板工具,氨基酸模板工具,17类,20,模板工具,芳香化合物模板工具,21,模板工具,双环模板工具,22,模板工具,生物模板工具,23,模板工具,玻璃仪器模板工具(I),24,模板工具,玻璃仪器模板工具(II),25,模板工具,构象异构体模板工具,26,模板工具,环戊二烯模板工具,27,模板工具,脂环模板工具,28,模板工具,DNA模板工具,29,模板工具,官能团模板工具,30,模板工具,己糖模板工具,31,模板工具,苯环模板工具,32,模板工具,多面体模板工具,33,模板工具,RNA模板工具,34,模板工具,特殊符号模板工具,立体中心模板工具,35,36,37,38,39,40,41,42,快捷键,命令,灰色表示命令未激活,小三角表示子菜单,省略号表示新对话框,工具栏,43,文档设置,页面规划,44,页眉页脚,45,绘图,46,字体,47,原子格式,48,颜色,设置背景颜色,49,国外化学刊物默认文档格式,50,优选项,51,优选项,显示设置,错误警告,52,优选项,打开/存盘,默认路径,默认打开文件格式,默认存盘文件格式,53,元素周期表,54,55,符号窗口,56,符号窗口,57,打开文件,不同文件格式,58,文件格式介绍,1CDTemplate(*.ctp,*.ctr)用于保存模板文档,2ChemDraw(*.cdx)ChemDraw原本格式，是一个公共标记的文件格式，易被其它程序建立和解释。常用格式,3ChemDrawSteylSheet(*.cds)用于存储文件设置和其它物体,4ConnectionTable(*.ct)一种实例格式，存储关于原子与元素、系列编号、X和Y轴、键序、键类型等的连接和联系的列表。是用于多类应用程序间互换信息的通用格式,59,5DARC-F1(*.fld)QuestelDARC系统中存储结构的原本文件格式,7ISISReaction(*.rxn)MDL开发的格式，用于存储元素反应信息,8ISISSketch(*.skc)在Windows或Macintosh环境下，存储并传输到另外的ISIS应用程序中,6DARC-F1Query(*.flq)QuestelDARC系统中存储查询的原本文件格式,60,9MDLMolFile(*.mol)MDL(分子设计有限公司)MolFile文件格式用于其它一些在Windows、Macintosh和Unix环境下的化学数据库和绘画应用软件,11JcampSpectra(*.jdx，*.dx)图谱文件格式，可读入紫外、质谱、红外、核磁等数据文件,12MSIChemNote(*.msm)一种ASCII文本文件，可以用于像ChemNote一类的应用程序,10GalacticSpectra(*.spc)银河图谱文件格式,61,13SMD4.2(*.smd)ASCII文本文件，一般用于检索化学文摘数据库,14WindowsMetafile(*.wmf)图片文件格式，可以将ChemDraw图片传输到其它应用程序中，如Word。WMF文件格式含有中ChemDraw的结构信息，可被ChemDraw早期版本编辑,62,点位：移动鼠标直到鼠标的光标放到所要进行操作的位置，如果选择的位置在图形结构中的键、原子、线等的上面，一般出现黑方块，称之为光标块，选择块或操作块。,光标块,常用术语,63,单击：快速按下鼠标键(左或右键)，然后快速抬起；,双击：快速操作两次单击；,拖动：由三部分动作组成按下鼠标左键选择对象，移动鼠标，将被选的对象移动到指定位置后抬起鼠标；,选择：用鼠标的光标选中某种选择，使对象产生光标。选择对象并不意味着动作，只是标记要操作的对象和点位；,64,“键单击”：按下特殊的键和单击鼠标键同时进行。如，“Shift单击”意思是按下”Shift”键和单击鼠标键；,“键拖动”：按下特殊的键和鼠标键，移动鼠标。如，“Shift拖动”意思是按下”Shift”键和拖动鼠标光标。,65,示例1：阿司匹林的结构,66,优化结构CleanUpStructure；旋转和缩放；图形存盘；粘贴至word或ppt；检查结构错误CheckStructure,67,示例2：根据化合物名称得到结构式,Structure/ConvertNametoStructure-InsertStructure输入：阿司匹林可输入2-acetoxybenzoicacid或aspirinEDTA;吗啡morphine,68,示例3：根据结构得出化合物命名,绘制肾上腺素的结构式，选中结构，执行【sturucture】/【convertstructuretoname】,69,将名称转化成结构,70,示例：三肽分子的绘制,71,示例4：预测核磁共振化学位移,心得安结构式,72,1HNMR预测,1HNMR位移,73,1HNMR预测结果,74,预测结果,75,13CNMR预测,13CNMR位移,76,13CNMR预测结果,77,部分预测结果,78,H-NMR,C-NMR,79,示例5：分析结构估计性质,80,81,分析结果窗口,分子式,精确质量,分子量,质谱分析,元素分析,结果粘贴,两位小数,质谱图,82,示例6：显示分子化学性质,83,84,“View/ShowChemicalPropertiesWindow”菜单,85,示例6：反应方程式,86,选择,点位,拖动,定位,单击,单击,定位,单击生成双键,拖动生成双键,反应方程式,87,双击生成文本框,输入字母,按Ctrl键,拖动复制,反应方程式,88,反应方程式,定位,单击生成一单键,再定位,连续单击生成三单键,定位,双击后输入OH,89,反应方程式,用套索或蓬罩进行部分选择,90,反应方程式,按Ctrl键,拖动复制,生成独立的两个分子,91,反应方程式,选择反应箭头,在两个分子中单击生成一反应箭头,92,反应方程式,箭头上方建立文本框,输入反应条件,93,反应方程式,选择电荷,定位,添加负电荷,94,反应方程式,选择居中,分子下方建立文本框,95,反应方程式,依次输入文本信息,96,反应方程式,选择阴影框,将反应方程式全部罩上,97,练习：绘制化学反应式,98,示例7：绘制中间体结构,99,绘制中间体结构,选择环己烷以建立六员环模型,选择橡皮，擦去六员环一部,100,绘制中间体结构,选择单键定位,连续单击生成新的单键,单击单键中央，生成双键,101,绘制中间体结构,在原子上定位建立标记,102,绘制中间体结构,选择笔工具,在曲线菜单中选择箭头位于末端,103,绘制中间体结构,定位拖动鼠标左键,定位单击生成曲线箭,按Esc键退出绘制模式,104,单击箭头,绘制中间体结构,用小手形光标移动造另一虚线,105,小手形光标选中虚线柄,绘制中间体结构,拖动改变虚线箭形状,按Esc键,106,示例8：复杂环结构,107,示例8：复杂环结构,选择环己烷；并添加第一个环,添加第二个环,108,复杂环结构,橡皮擦去多余部分,109,复杂环结构,选择键工具；单击生成新的单双键,110,复杂环结构,在原子上定位建立标记,111,示例9：Fischer葡萄糖结构图,112,Fischer葡萄糖结构图,选择键工具；连续单击生成五连键,113,Fischer葡萄糖结构图,建立与五连键垂直的水平键,114,Fischer葡萄糖结构图,在原子上定位建立标记,115,示例10：透视图形,116,透视图形,选择环己烷,旋转环己烷,在原子上定位建立标记,旋转指示箭头,117,透视图形,添加垂直键,按Alt键，任意键长,118,透视图形,选择套索工具，阴影右下脚按Shift键,向上按动，垂直压缩50,119,透视图形,在原子上定位建立标记,120,透视图形,选择黑体楔键,单击下部两侧键的中央,121,透视图形,选择黑体键,单击底键的中央,122,六、Newman结构,123,六、Newman结构,选择键工具；连续单击生成三键对称结构,按Ctrl键,拖动复制,124,六、Newman结构,选择键工具；按住Alt键，连接两个结构,125,六、Newman结构,选择轨道工具,定位中心原子；按住Alt键，按下鼠标键，向外按动建立轨道,126,六、Newman结构,部分选择上面分结构,右上脚双击旋转柄，对话框中输入180,单击旋转,127,六、Newman结构,从Object菜单选择BringtoFront命令,128,六、Newman结构,后面结构移至前面,按Esc键,添加阴影框,129,七、立体化学,130,七、立体化学,131,七、立体化学,132,七、立体化学,133,七、立体化学,134,反应装置,示例11：实验装置,135,示例12：薄层色谱图,薄层色谱图,136,1.下载Chemoffice。2.安装Chemoffice软件3.用chemoffice软件制作5个有机结构式，一个有机反应机理方程式。,上机作业,4.画出1个实验蒸馏装置5.制作苯环分子的立体结构图,