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Click to edit Master title style,Click to edit Master text styles,Second level,Third level,Fourth level,Fifth level,*,*,按一下以編輯母片標題樣式,按一下以編輯母片,第二層,第三層,第四層,第五層,*,*,*,中華大學生物資訊學程規劃及學研合作經驗,鄭藏勝,中華大學工學院,大學校院工程及技術學院校院長會議,1,生物資訊,(,Bio-informatics),已是二十一世紀全世界科技研究最重要的課題之一,配合中華大學現有教學及育成資源,，,積極投入生物資訊人才培育,結合生物科技產業發展形成產學共生效應,配合竹科生技環境創造學校特色形成聚落群益,規劃緣由,2,以資訊工程為主體並結合生物科技之訓練,，,規劃生物資訊學程,，,讓國內廣大之工程人才經由學程之訓練即可成為生物科技產業之專門人才,成為國家未來發展生物科技中最有特色之重點學校之一,規劃目標,3,人才培育,大學部,：,生物資訊學程,研究所,：,生物資訊組,學研合作,於民國90年與台灣動物科技研究所簽訂人員交流及研究計畫合作同意書,執行方法,4,中華大學,生物資訊,育成中心,(新竹市),台灣動物科技,研究所,(竹南),園區四期,生技產業區,(竹南),國家衛生,研究院,(竹南),工研院,生醫中心,(新竹市),台大醫學院,(竹北),清大、交大,元培,(新竹市),5,資工系專任師資(25+,2,),姓名,職稱,學歷,專長,鄭芳炫,教授兼系主任,國立清華大學電機工程博士,彩色影像處理、圖形識別、視訊處理,游坤明,副教授,美國,UT Dallas,電腦科學博士,作業系統、排程理論、分散式系統,梁秋國,副教授,國立清華大學資訊科學博士,演算法、平行處理,陳永源,副教授,美國,SUNY Buffalo,電機與計算機工程博士,超大型積體電路設計與測試,曾秋蓉,副教授,國立交通大學資訊工程博士,多媒體系統、資料庫系統,周智勳,副教授,大同大學電機工程博士,模糊類神經系統、專家、人機系統,林道通,副教授,美國,U.of Maryland,電機工程博士,類神經網路、虛擬實境、電腦視覺,6,資工系專任師資(續),姓名,職稱,學歷,專長,劉懷仁,副教授,國立清華大學資訊科學博士,非同步傳輸模式、交換系統,俞征武,副教授,國立台灣大學資訊工程博士,圖學演算法、平行計算、行動計算,顏金泰,副教授,國立交通大學資訊工程博士,超大型積體電路電腦輔助設計,韓欽銓,副教授,國立中央大學資工所博士,影像處理、圖形識別、電腦視覺,石昭玲,副教授,國立交通大學資訊科學所博士,影像處理、圖形識別,嚴力行,副教授,國立交通大學資訊工程博士,行動計算、無線通信、分散式計算,劉志俊,助理教授,國立清華大學資訊科學博士,資料庫管理系統、多媒體系統,7,資工系專任師資(續),姓名,職稱,學歷,專長,李建興,助理教授,國立交通大學資訊工程博士,影像處理、多媒體資料壓縮,連振昌,助理教授,國立清華大學電機工程博士,影像處理、電腦視覺,許慶賢,助理教授,逢甲大學資工所博士,平行處理、高性能計算,王俊鑫,助理教授,國立清華大學資工博士,高速電腦網路,8,資工系專任師資-,生物資訊,(續),姓名,職稱,學歷,專長,許文龍,副教授,美國,Wayne state,大學電腦工程博士,資料庫系統、資料庫電腦結構,吳哲賢,副教授,國立交通大學電機工程博士,網路及系統可靠度分析、計算理論,曾文慶,副教授,美國,Cornell,大學食品科學博士,蛋白質結構預測、生物統計,侯玉松,助理教授,國立交通大學資訊工程博士,平行處理、資訊安全,謝瑞建,助理教授,美國,Rutgers,大學醫學工程博士,生物計算,心臟電生理,張慧玫,助理教授,美國,UT Austin,生物系分子生物遺傳學博士,分子生物遺傳學、生命科學,劉世華,助理教授,美國,Texas A&M,大學動物科學博士,生殖生理、細胞生理研究,9,生物資訊學程動科所兼任師資,姓名,職稱,學歷,專長,楊天樹,副教授,澳洲,University of Adelaide,博士,動物生理學,金悅祖,助理教授,美國,Mississippi State Univ.,博士,生物化學,葉光勝,助理教授,美國,University Iowa,博士,細菌學,遺傳學,劉世華,助理教授,美國,Texas A&M,大學動物科學博士,生殖生理、細胞生理研究,註,:,其中劉世華於,91,學年度借調為中華專任師資為期三年,10,生物資訊學程規劃,(大學部:24學分),編號,課程名稱,學分數,修習系所,備註,1,生物資訊導論,3,資訊工程學系,(,上學期,),必修,(8,學分,),2,生物資訊實務,3,資訊工程學系,(,下學期,),3,分子細胞生物學,2,資訊工程學系,(,上學期,),4,基礎生物學,2,資訊工程學系,(,上學期,),選修,3,選,2,(4,學分,),5,生物化學,2,資訊工程學系,(,下學期,),6,分子遺傳學,2,資訊工程學系,(,下學期,),7,演算法,3,全校各系,選修,7,選,4,(12,學分,),8,資料庫系統,3,全校各系,9,統計學,3,全校各系,10,作業研究,3,全校各系,11,影像處理,3,全校各系,12,平行處理,3,全校各系,13,人工智慧,3,全校各系,11,(研究所:24學分),生物資訊組規劃,12,(九十學年度修課人數),生物資訊學程成果,課程名稱,修課人數,備註,基礎生物學,151,學程必修,分子細胞生物學,32,學程選修,分子遺傳學,91,學程選修,生物化學,64,學程選修,生物資訊導論,142,學程必修,生物資訊實務,187,學程必修,13,(九十一學年度上學期修課人數),生物資訊學程成果,課程名稱,修課人數,備註,基礎生物學,162,學程必修,分子細胞生物學,45,學程選修,生物資訊導論,194,學程必修,14,九十一學年度開始招收10名碩士班研究生,其中7名為資工系畢業,，,3名各為陽明醫學系,、,中興動物系,、,東海畜牧系畢業,研究所生物資訊組成果,15,生物資訊研究方向,研究方向分四大主軸,生物資訊計算法研究,生物資訊知識庫研究,3,D,視覺化計算及醫學影像處理研究,生物晶片設計,16,生物資訊計算演算法,DNA,序列分析,基因認定,演化樹建構,蛋白質三維結構推測,生物資訊計算法研究,17,硬體環境的架構,PC,叢集：利用16台單,AMD 1.6G CPU,，組合成具有平行計算能力的多處理器系統。,叢集伺服器：利用1台雙,AMD 1.2G CPU,，管理,PC,叢集平行系統。,高速網路：,PC,叢集配置,10/100M,網路卡，利用24 端,10/100M,交換式，連接伺服器。伺服器配置,10/100/1000M,網路卡，利用12 端高速,10/100/1000M,交換式，連接資料庫及網際網路。,生物資訊計算法研究,18,軟體環境的架構,作業系統平台：,Linux RedHat 7.1,程式編譯器：,GNU C/C+/Fortran,叢集管理系統：,XPBS,平行計算軟體：,MPI,及,XPVM,生物資訊計算法研究,19,發展大儲存系統-,Storage Acessed Network (SAN),用,PC,叢集，發展平行資料庫電腦系統,用公開程式碼，發展軟體工具,建構大型,Web/FTP,伺服器，用,Linux Virtual Server（LVS),生物資訊知識庫研究,20,收集現有,DB,現況,名稱,種類,大小,Genbank,Gene,12,GB,EMBL,Gene,16,GB,PIR,Protein,4,GB,Swiss-Port,Protein,2,GB,PDB,Protein,15,GB,生物資訊知識庫研究,21,UNI-BIO DB,現況,種類,數量,DNA,SEQUENCE,約25萬筆,PROTEIN,SEQUENCE,約4萬筆,生物資訊知識庫研究,22,研究方向,應用3,D,視覺化計算方法進行蛋白質比對及製藥分析,CT,及,MRI,醫學影像立體重建與病變特徵辨識及量化(,indexing),3,D,視覺化計算與醫學影像處理,23,生物晶片,基因晶片(,GeneChip,DNAChip,Microarray),蛋白質晶片(,Protein Chip),微流體晶片(,Microfluidics),實驗室晶片(,Lab-on-a-chip),生物晶片設計,24,完成大學部生物資訊學程之規劃,，,並於九十學年度起開始開課,完成研究所生物資訊組之規劃,，,並於九十一學年度開始招收生物及資訊專長之學生(第一次招生有醫學系之學生報考),完成大學部生物資訊學系之課程規劃,，,並將於九十二學年度起開始招生,初步成果,25,完成三十二個點之,PC,叢,集系統之建置,完成部份基因及蛋白質資料庫系統之建置,獲得國科會,生物與資訊工程教育整合計畫,補助,，,共申請到三年經費伍佰柒拾萬元整,，,計畫已從九十年十月開始執行,。(,開始撰寫國內第一本生物資訊課程教科書),獲得國科會,提昇私校研發能量計畫-高效能生物資訊系統之建構,補助,，,第一年申請經費共肆佰參拾餘萬元,，,已於九十一年八月開始執行,。,初步成果,26,初步成果,與台灣動物科技研究所共同向農委會申請豬繁殖力功能性基因組解析及生物晶片之研發與應用:熱帶豬學生物資訊中心之建置計畫己獲通過,，,共申請到第一年經費壹仟陸佰餘萬元整,，,計畫已從九十一年一月開始執行。,加入台灣大學向教育部申請生物資訊跨校研究中心計畫,，,成立生物資訊協同實驗室。,27,未來目標與展望,二年內建置完成六十四個點之,PC,叢集系統及軟體程式工具,，,並提供國內外其他研究機構高速生物計算及工具程式需求之服務。,二年內建置完成基因及蛋白質知識庫及資訊探勘技術,，,並透過網際網路提供國內外生物科技研究者資訊服務。,28,未來目標與展望,成立生物資訊研究中心,，,以做為學校中長程發展之特色,二年後申請大型之生物科技產學合作案,29,30,31,谢谢观看,/,欢迎下载,BY FAITH I MEAN A VISION OF GOOD ONE CHERISHES AND THE ENTHUSIASM THAT PUSHES ONE TO SEEK ITS FULFILLMENT REGARDLESS OF OBSTACLES.BY FAITH I BY FAITH,内容总结,中華大學生物資訊學程規劃及學研合作經驗。彩色影像處理、圖形識別、視訊處理。美國UT Dallas 電腦科學博士。模糊類神經系統、專家、人機系統。美國U.of Maryland電機工程博士。類神經網路、虛擬實境、電腦視覺。圖學演算法、平行計算、行動計算。影像處理、圖形識別、電腦視覺。行動計算、無線通信、分散式計算。資料庫系統、資料庫電腦結構。生殖生理、細胞生理研究。澳洲University of Adelaide博士。(研究所:24學分)。其中7名為資工系畢業，3名各為陽明醫學系、中興動物系、東海畜牧系畢業。PC叢集：利用16台單AMD 1.6G CPU，組合成具有平行計算能力的多處理器系統。叢集伺服器：利用1台雙AMD 1.2G CPU，管理PC叢集平行系統。高速網路：PC叢集配置10/100M網路卡，利用24 端10/100M交換式，連接伺服器。作業系統平台：Linux RedHat 7.1。谢谢观看/欢迎下载,
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