微生物生态学-2.1自然界中微生物和它们的1

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microorganism,),:,指在一个给定的生境中那些能生存、生长和进行活跃代谢的微生物,并且这些微生物能与来自其他群落的微生物进行有效的竞争。,外来微生物(,Allochthonous,microorganism,),:,指来自于其他生态系统的微生物,所以这些微生物不能在这一生境中长期生活下去。,群落(,Community,),:,指一定区域里,各种群体,(Population),相互松散结合的一种结构单位。,土壤是固体无机物,(,岩石和矿物质,),、有机物、水、空气和生物组成的复合物,是微生物的合适生境。,土壤是微生物的大本营!,第一节,土壤,微生物生活的良好环境,营养,水分,pH,氧化还原电位(,Eh,),土壤中含有有机物和矿质元素,有机物:提供微生物生长所需的,N,、,C,源,矿质元素:,P,、,S,、,Ca,、,K,、,Mg,、,Fe,等,土壤的,pH,值范围一般在,3.5,10.5,水是土壤的组成部分,土壤可保证植物及微生物生长发育所需的水分。,渗透压,土壤中的空气,土壤温度,一般土壤溶液浓度在,0.1,1,,渗透压,0.5,5,个,atm,,,浓度越高,渗透压越高。,土壤温度决定于地区、季节因素,一般在,0,30,,其中大部分时间为,10,25,。,一般土壤中,CO,2,多、,O,2,少,靠近植物根系,CO,2,多,,土层浅,O,2,多,土层深,CO,2,少。,土壤微生物种类多、数量多、代谢潜力巨大,是主要的微生物源,是微生物的大本营。,石英,第二节 土壤微生物,P9,一、土壤微生物的数量和生物量,微生物,数目,/,每克土干重,生物量(,g/m,3,),细菌,10,8,160,真菌,10,5,200,放线菌,10,5,10,6,160,藻类,10,4,10,5,32,原生动物,10,4,38,农田上表层(,15cm,),处微生物数目和生物量,各类微生物都可在土壤中生存发展,但随着,土壤类型、肥力水平、环境条件和季节变化,等因素的不同,土壤微生物的数量和分布存在很大差异。,1,、数量,不同类型土壤中微生物的总数和各类微生物的比列关系,地带,土壤,微生物总数(,10,8,/g,),细菌(),细菌中的孢子(),放线菌(),真菌(),冻土原始森林,冰沼潜育土,2140,95.6,0.7,1.4,2.0,森林草地,灰壤,1080,89.3,12.0,8.1,2.6,草地草原,黑钙土,3630,63.8,21.4,35.4,0.8,干旱草原,栗钙土,3480,64.8,19.3,34.7,0.5,沙漠草原,褐色土,4490,63.4,17.7,36.1,0.5,生物量:生物细胞的重量(以单个细胞为标准),2,、生物量,生物量的计算:,(,1,)一个细菌细胞的湿重,1.510,12,g,1g,土壤含细菌,10,9,个,一亩田表土约,30,万斤(耕作土重),(,310,5,500,),g,(,10,9,个,/g,),(,1.510,12,),g,=22.5X10,4,g,=225kg,生物量可作为土壤肥力的指标,细菌、放线菌:,160 g/m,3,真菌:,200,g/m,3,(,一个真菌菌丝湿重,9.410,-5,g,),影响土壤中微生物生物量的因素:,土壤肥力状况:肥力越好,生物量越多,耕作管理:耕作越频繁,生物量越少,二、土壤微生物的分布,土壤微生物的垂直分布,A,B,C,一般以表土层,A,微生物最多,因为,O,2,、,水分、有机物含量高;,随着层次加深,微生物数量减少。,二、土壤微生物的分布,土壤微生物分布的不均匀性,无论是大面积的土壤或小的土团,微生物都不可能均匀分布。,一般微生物都分布在土粒表面,如芽孢杆菌、细菌、真菌;,土粒内部有球菌、无芽孢杆菌,采样:五点样品混合后再分离,,振荡的目的是将土粒内部的微生物释放出来。,三、土壤微生物的生理群和优势种,1,、生理群:指按生理特性将微生物划分为不同的类群。,同一生理群的微生物,其生理特性相同,但形态特征可以不同。,划分生理群微生物的原则:主要以营养类型来划分。,生理特性,所,需要的特定生长条件,在物质转化中具有特定功能,氨化微生物生理群:细菌、放线菌、真菌,反硝化细菌生理群:芽孢杆菌、假单胞菌,光能自养,光能异养,化能自养,化能异养,能源 氢的供体 基本碳源 微生物举例,光 无机物 二氧化碳 蓝细菌,光 有机物 二氧化碳 紫色非硫细菌,及简单有机物 无机物 无机物 二氧化碳 硝化细菌,有机物 有机物 有机物 大多数已知细菌,和全部真核微生物,2,、优势种,在,一定条件下或在一个生理群中常只有少数种类占优势,即在最高稀释度平皿中出现较多菌落数的菌种,该菌种称优势种。,通过优势种的多少,可以反映土壤中某一物质转化的强弱。,四、土壤细菌,P10,1,、土壤细菌的数量,一般土壤细菌的数量占土壤微生物总量的,7090%,;,1g,肥沃土壤中约有土壤细菌几十万,几十亿;,土壤细菌是土壤中重要的物质转化的生物因子。,2,、土壤细菌的特点,个体形状和大小往往与人工培养条件下不同;,土壤细菌数量多、代谢强、繁殖快、代时短,对其延续带来很大好处;,土壤细菌按其来源可分为土著性和外来性,一般土著是优势种。,增强菌体本身的竞争能力(以多取胜),细菌个体有很强的应变能力(顺应反应,,genotypic flexibility,),四、土壤细菌,3,、优势种属,节杆菌(,Arthrobacter,),,球状与杆状相互转化(不同营养条件);,产芽胞杆菌,目前有,16,个属,,Bacillus,常见;,假单胞菌(,Pseudomonas,),,农药降解、重金属抗性的重要菌属,大多含有质粒;,土壤杆菌(,Agrobacterium,),产碱杆菌(,Alcaligenes,),,生物塑料,PHA(,聚羟基脂肪酸,),、,PHB(,聚羟基丁酸酯,),,细菌多糖;,黄杆菌(,Flavobacterium,),,耐饥饿,有毒物质的降解,环保型微生物;,微球菌(,Micrococcus,);,黄单胞菌(,Xanthomonas,),等;,4,、粘细菌,(,1,)在土壤中的数量不是很多,但亦常见,在施用有肥料的土壤中更为普遍。,能降解多种大分子化合物,如纤维素、半纤维素等。,分布非常广泛,自热带到两极都有,以热带和温带较多,淡水、海水和土壤是它们生活的主要场所。在潮湿的土壤上常常大量繁殖。,有些种类能耐高温、干旱等极端环境条件。,多数种类能固氮,(,异形胞,),,是土壤一个重要的生物,N,的来源。,念珠藻在某些土壤生境中既能固定氮气,又能通过光合作用合成有机物。,蓝细菌能在没有植物生长的土壤表面形成表面壳,对土壤具有稳定作用。,5,、蓝细菌(,光合自养细菌群体,),五、,土壤放线菌,1,、数量和分布,多数好气、腐生,以孢子或菌丝片段存在于土壤,细胞数,10,4,10,6,个,/g,土,土壤肥沃时可达,10,8,个,/g,土。,主要分布于土表,是土壤重要的土著性微生物,也是土壤微生物的第二大类群,占,530%,。,对干燥条件抗性比较大,(,在沙漠土壤中生存,),;,比较适合在碱性或中性条件下生长,并对酸性条件敏感(高氏,1,号培养基)。,主要参与复杂有机物的分解,如木质素、几丁质、烃类。,2,、优势菌属,链霉菌属和诺卡氏菌属在土壤放线菌中所占的比例最大。,链霉菌属(,Streptomyces,):,1000,多种,,96%,的抗菌素主要来源于该属;有基质、气生菌丝,后者上有孢子。,链霉菌,诺卡氏菌属(,Nocardia,):,无气生菌丝,以基质菌丝的断裂繁殖;,有很多种产生抗生素,如利福霉素;,参与复杂的难分解的有机物的降解。,小单胞菌属(,Micromonospora,):,气生菌丝很短,顶端只生一个孢子;,耐高温(,5565,),是堆肥高温阶段的重要分解菌,,重要的抗生素产生菌,如庆大霉素。,六、土壤真菌,P10-11,1,、数量和分布,真菌是常见的土壤微生物之一,,10,4,10,5,个,/g,,,是土壤微生物的第三大类群;,数量虽小,但生物量很大(第一),,200g/m,3,;,六、土壤真菌,在土壤中常见的真菌主要是子囊菌亚门、接合菌亚门、半知菌亚门:,根霉属、毛霉属、小克银汉霉属,赤霉属,曲霉属(,Aspergillus,)、,青霉属(,Penicillum,)、,木霉属(,Trichoderma,),2,、优势属种,土壤中的土著酵母菌主要是半知菌:,假丝酵母(,Candida,)、,红酵母(,Rhodotorula,)、,汉孙氏酵母(,Hansenula,),七、土壤藻类,P11,土壤藻类是单细胞或多细胞的真核原生生物;,优势属种:硅藻、绿藻、黄藻,藻类生长状况可以作为土壤肥力的指标。,肥沃的中性土壤,藻类一般生长旺盛,土壤表面常出现黄褐色或黄绿色的薄藻层;,藻类缺乏,土壤贫瘠缺肥;,硅藻多,土壤营养丰富;,八、土壤原生动物,P11,原生动物是单细胞动物;,往往只存在于土壤的表层,15cm,处,因为它们需要相对高浓度的氧气,,10,5,10,6,个,/g,肥土,几十几万个,/g,贫瘠土;,原生动物主要靠摄取可溶性有机物和细菌而生长,是土壤细菌和藻类的捕食者。,常见的优势种属:鞭毛虫、变形虫、纤毛虫等。,细菌病毒在土壤中分布广泛,但数量少,根瘤菌与其噬菌体的关系(有抗性的却不固氮),植物致病病毒在土壤中转播,(,芸苔油壶菌,可以感染植物根并引起病变,且可以携带烟草坏死病毒和莴苣巨脉病毒进行传播),九、土壤病毒,P11,十、影响土壤中微生物分布的因素,P12,土壤颗粒性质 腐殖质,砂土,土壤水分 游动微生物,氧气 上层好氧微生物多(穴居动物活动可以给微生物好氧生长提供条件),pH,pH,对营养物质的利用,微生物吸附,胞外酶的产生和分泌产生影响,温度 蓝细菌能抗变化范围很大的温度;耐寒的藻类(雪藻),营养状况 有机物对自养细菌有抑制作用(刍溪藻喜欢在营养丰富的鸟粪中)(土壤颗粒中细菌的不均匀分布),人类生产活动,(一)微生物数量的测定,十一、测定土壤微生物数量和生物量的方法,1,、总数的测定,细菌的显微镜直接计数法,荧光显微镜法,电子显微镜法,2,、活菌数的测定,稀释平板培养法,液体稀释培养法(,MPN,法,-,最大可能数法,),大肠菌群检数表接种水样总量,111.1mL,(,100mL,、,10mL,、,1mL,、,0.1mL,各,1,份),接 种 水 样 量,/,mL,100,10,1,0.1,每升水样中大肠菌群数,2380,“”大肠菌群发酵阳性;“”大肠菌群发酵阴性。,(二)微生物生物量的测定,1,、熏蒸法,目前使用最广的一种测定土壤微生物生物量的方法。,用氯仿将土壤中的微生物杀死,然后加入少量未灭菌的土壤(即重新接入活的微生物),新接入的微生物可以分解利用死细胞,产生,CO,2,。,根据,CO,2,的产生量和微生物体矿化率常数,K,计算出该土壤中微生物的生物量。,试验需要,20,天,,10,天预处理,,10,天测定,CO,2,总产量。,生物量,一种生物或一组生物单位体积的重量,多以,g,为单位,如湿重、干重。,2,、,ATP,含量换算法,ATP,与生物量保持一定的比例关系。,用
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