生命中的化学4酶与辅酶

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单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,生命中的化学物质酶与辅酶,所有的生命现象都是各种复杂化学变化的结果。生物体内化学变化几乎都是在,酶(Enzyme),的催化下进行的。, 17世纪晚期开始发现和描述酶的作用;, 1897年Eduard Buchner证明细胞的提取液有催化活性无细胞发酵, 1926年James Sumner分离并结晶得到urease;确定了酶的化学成分蛋白质。,内容提纲,一:酶是生物催化剂,二:辅酶,三:酶的结构和酶的催化作用机制,酶是生物催化剂,酶是活细胞产生的一类具有催化功能的生物分子,所以又称为生物催化剂。,绝大多数酶都是蛋白质,少数是RNA。,酶催化的生物化学反应,称为,酶促反应,。,在酶的催化下发生化学变化的物质,称为,底物(substrate),。,酶能够改变化学反应的速度,但是不能改变化学反应平衡。稳定底物形成的过渡态,降低反应活化能,从而加速反应的进行。,一、酶的概念,二、酶催化作用特性,1、,高效性,自然界催化活性最高的一类催化剂,可使反应速度提高10,7,10,16,倍,比普通的催化剂效率高几倍。,酶是生物催化剂,2、,选择性,(1),反应专一性,选择性催化一种或一类相同类型的化学反应,几乎不产生副反应。,(2),底物专一性,只作用于某一种或某一类结构类似的物质:,绝对专一性,:对底物要求非常严格,只作用于一个特定的底物;如:脲酶只催化尿素的水解;,相对专一性,:一类化合物或化学键;又分为:,a. 族(group) 专一性;,b. 键(bond)专一性;,c. 位置选择性(或区域选择性);,酶是生物催化剂,酶是生物催化剂,(3),立体化学专一性,对分子构型有选择性,手性专一性,:专一性地与手性底物结合,催化其反应;如:胰蛋白酶只能水解由L-氨基酸形成的肽键,对D-氨基酸形成的肽键不起作用;淀粉酶只能选择性地水解D-葡萄糖形成的1,4-糖苷键,而不能影响L-葡萄糖形成的糖苷键;,几何专一性,:选择性催化某种几何异构体底物的反应,而对另一种构型则无催化作用;,苹果酸,延胡索酸,酶是生物催化剂,3、,反应条件温和,:pH58的水溶液;反应温度范围是2040;副反应少。,4、,酶活力可调节控制,:如抑制剂、共价修饰、反馈、酶原激活及激素控制等。,三、酶的命名及分类,1、酶的命名:,习惯命名,方便常用,如:淀粉酶、蛋白酶等;,系统命名,底物名称+ 构型+ 反应性质+ 酶;,酶是生物催化剂,2、酶的分类根据酶所催化的反应类型;分为7大类;,(1),氧化还原酶(oxidoreductases),催化氢原子以及电子转移反应;主要包括:脱氢酶和氧化酶;氧化酶一般都有氧分子直接参与反应;脱氢酶最多,反应通式:,(2),转移酶(transferases),催化基团转移反应,从一个底物到另一个底物;根据被转移的基团又可以分为氨基、磷酸基、甲基、糖基转移酶等;,(3),水解酶(hydrolases),催化底物加水分解,主要包括:淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶;,酶是生物催化剂,酶是生物催化剂,(4),裂合酶(lyases),催化从底物分子中移去一个基团或原子形成双键的反应及其逆反应。主要包括:醛缩酶、水化酶、脱氨酶等。,(5),异构酶(isomerases),催化同分异构体的相互转化,即底物分子内基团或原子重排。,酶是生物催化剂,(6),合成酶(ligases),又称连接酶,能够催化C-C、C-O、C-N、C-S键的形成反应,热力学上不能自发进行,必须与ATP分解反应偶联;,(7),核酶,唯一的非蛋白酶,一类特殊的RNA,能够催化RNA分子的磷酸酯键的水解及其逆反应。,辅酶,根据酶的组成,可以将酶分成两大类:,(1),单纯蛋白酶,组成为单一蛋白质,本身的氨基酸残基可以形成催化活性中心,并能有效实施催化功能。例如蛋白水解酶。,(2),结合蛋白酶,分子中除了蛋白质外,还含有非蛋白质组分。蛋白质部分叫酶蛋白(又叫,apoprotein,脱辅基蛋白,),非蛋白质部分包括,辅酶,(,coenzyme,)及金属离子(又叫cofactors)。,辅酶,辅酶,一、辅酶的结构特点与功能,某些小分子有机化合物与酶蛋白结合在一起、协同实施催化作用,被称为,辅酶(或辅基)Coenzyme。,辅酶多数,具有氧化还原性质,或者具有转移基团的能力,,因此多数参与氧化还原或基团转移的酶促反应。,前体大多为,维生素,,主要是,水溶性B族,的维生素。许多维生素的生理功能与辅酶的作用密切相关:,辅酶,1、,NAD+,(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸,辅酶)和,NADP+,(烟酰胺腺嘌呤磷酸二核苷酸,辅酶),维生素烟酰胺的衍生物,多种重要脱氢酶的辅酶。,烟酰胺环的,4位碳具有碳正离子的性质,容易从底物分子中夺取电子和质子,,,得到还原型的辅酶,在340 nm有特征吸收峰。逆反应也容易发生。起着,电,子和质子传递,体的作用。其参与的氧化还原反应具有严格的手性选择性。,辅酶,2、,FAD,(黄素腺嘌呤二核苷酸),和,FMN,(黄素单核苷酸),核黄素(V,B2,),的衍生物,多种脱氢酶的辅酶,功能分子为,异吡络嗪环,。,辅酶,2、,FAD,(黄素腺嘌呤二核苷酸),和,FMN,(黄素单核苷酸),电子和质子传递体。与酶分子通常以共价键相连,有时称为辅基。,辅酶,3、,CoA,(辅酶A),生物体内代谢中乙酰化酶的辅酶,前体是,维生素泛酸(V,B3,),。传递酰基,形成代谢中间产物。例如:乙酸与辅酶A的巯基结合形成乙酰辅酶A,是糖代谢的重要中间产物。,辅酶,4、,FH4或THFA,(四氢叶酸),前体是叶酸,作为,一碳基团(如-CH3,-CH2-,-CHO等)的载体,,这些一碳基团主要连接在四氢叶酸的N,5,和N,10,位,参与多种生物合成。,辅酶,5、,TPP,(焦磷酸硫胺素),脱羧酶的辅酶,前体是硫胺素。催化酮酸的脱羧反应。,辅酶,6、,磷酸吡哆素,转氨酶通过磷酸吡哆醛和胺间的相互转换,起转移氨基的作用。,辅酶,7、,生物素,羧化酶的辅酶,本身就是B族维生素,功能是在生物合成中作为CO2 的传递体。,辅酶,8、,维生素B12,又叫钴胺素。变位酶的辅酶,催化底物分子内基团(主要为甲基)的变位反应。,辅酶,9、,硫辛酸,非维生素辅酶,6,8-二硫辛酸,有硫辛酸(氧化型)和二氢硫辛酸(还原型)两种形式。在酶分子中,通过酰胺键与赖氨酸残基相连。,高效抗氧化剂,再生谷胱甘肽的功能。,辅酶,10、,辅酶Q,又称为,泛醌,,广泛存在于动物和细菌的线粒体中,最常见的形式侧链含有10个异戊二烯结构单元(n=10)。,良好的电子传递体,,,氧化型(醌)和还原型(氢醌),两种形式。主要作为,线粒体呼吸链氧化-还原酶的辅酶,,在酶与底物分子间传递电子。,辅酶,二、辅酶在酶促反应中的作用特点,1、辅酶在催化反应过程中,,直接,参与了反应。,2、每一种辅酶都具有特殊的功能,可以,特定,地催化某一类型的反应。,3、全酶中的辅酶,决定,了酶所催化的,反应类型,(反应专一性),而酶蛋白则决定了所催化的底物类型(底物专一性)。,酶的结构和酶的催化作用机制,酶的催化作用主要取决于酶分子的特殊结构。,一、酶分子的结构,酶基本上都是复杂的蛋白质分子。决定酶活性的特殊空间结构叫,酶的活性部位,。,按照酶活性部位的功能,可以分为如下几部分:,1、,结合部位,结构上有利于与底物,形成复合物,,,使参加反应的基团,相互接近并定向,,从而使反应具有分子内反应的特点。,酶的结构和酶的催化作用机制,2、,催化部位,一般与结合部位重叠,或者非常靠近。,含有多种具有活性侧链的氨基酸残基,,如:Ser、His、Asp、Cys等,有的还含有辅酶或者金属离子。其作用是:使底物的价键发生形变或极化,起到激活底物和降低过渡态活化能的作用。,通常将,结合部位,和,催化部位,总称为酶的,活性部位或活性中心,。,酶的结构和酶的催化作用机制,3、,调控部位,不是酶的活性中心,可以与底物以外的其他分子发生某种程度结合,从而引起酶分子空间构象的变化,对酶起激活或抑制作用。可以调节酶促反应的速度或方向。,(细胞的信号转导),4、,酶活性中心的必需基团,(1)亲核性基团丝氨酸的,羟基、半胱氨酸的巯基和组氨酸的咪唑基,;,(2)酸碱性基团天冬氨酸和谷氨酸的羧基,赖氨酸的氨基,酪氨酸的酚羟基,组氨酸的咪唑基和半胱氨酸的巯基等。,5、,酶活性中心的测定方法,(1)切除法用专一性蛋白水解酶将酶分子的肽链切除一部分,然后测定剩余部分的活性,反复进行,直到找到活性中心。,(2)化学修饰法选择性运用一些试剂,对酶活性中心的氨基酸残基进行选择性修饰,而后测定活性,进而推断活性中心的组成。,(3)X-射线晶体衍射法测定酶分子的三维结构。,(4),基因定点突变技术site-directed mutagenesis,;,酶的结构和酶的催化作用机制,二、酶催化作用举例,1、酶催化作用位点的活性官能团,Nucleophiles亲核基团,Electrophiles亲电基团,酶的结构和酶的催化作用机制,二、酶催化作用举例,糜蛋白酶 (胰凝乳蛋白酶)为胰腺分泌的一种蛋白水解酶,能迅速分解、变性蛋白质,用于创伤或手术后伤口愈合、抗炎及防止局部水肿、积血、扭伤血肿、术后浮肿、中耳炎及鼻炎等。可用于白内障摘除。,酶的结构和酶的催化作用机制,二、酶催化作用举例,酶的结构和酶的催化作用机制,二、酶催化作用举例,酶的结构和酶的催化作用机制,二、酶催化作用举例,酶的结构和酶的催化作用机制,二、酶催化作用举例,酶的结构和酶的催化作用机制,二、酶催化作用举例,酶的结构和酶的催化作用机制,二、酶催化作用举例,酶的结构和酶的催化作用机制,二、酶催化作用举例,酶的结构和酶的催化作用机制,三、酶催化作用的机制,酶的催化可以使反应速度提高10,7,10,16,倍;为什么高催化效率?酶催化的高效性、专一性的原因是什么?,1、酶显著降低反应的活化能大幅提高反应速度,反应方向(化学平衡方向)主要取决于,反应自由能变化,G,0,,而反应速度快慢主要取决于反应的,活化能,Ea,。酶作为催化剂可以降低反应活化能。,酶与底物分子通过,短程非共价力(氢键、离子键、疏水键等),形成E-S反应中间物,,结果使底物的,价键状态发生形变或极化,,起到,激活底物分子和降低过渡态活化能的作用。,酶的结构和酶的催化作用机制,G,0,Ea,G,0,Ea,酶的结构和酶的催化作用机制,(1)底物与酶结合形成高度有序、低熵的复合物,酶的结构和酶的催化作用机制,(2)底物与酶结合使得底物分子脱溶剂化,增加了ES复合物的能量,使其更加活泼而容易反应;,酶的结构和酶的催化作用机制,(3)底物分子的带电荷基团与酶活性中心的电荷相互作用,导致,静电去稳定化作用,底物分子发生扭曲、形变,从而引起反应加速进行。,
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