药物设计与成药性医药卫生专业资料课件

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性,活性强度,选择性,成功药物的两个必需条件,内在活性是核心,成药性是载体,两者互为依存,和谐共处于分子结构之中。,药效,药代,物化性质,安全性,生化性质,新药创制的木桶效应,忌讳和杜绝短板,先导化合物发现类药性,候选药物的选择成药性,优化,类药性和成药性,类药5原则:化合物的类药性,类药性(lead-like)是Lipinski从众多口服吸收药物结构中归纳出的经验性规律,当,分子量 500,Clog P 5,氢键给体 5,氢键接受体 10,难以成口服药物。,Lipinski CA et al.Adv Drug Deliv Rev,1997,23:3-25,类药5原则的扩展:,极性表面积1402,或氢键给体与接受体总数12,可旋转性键30 mg/min/kg(大鼠),Log D7.43,0,与CYP450结合:低,血浆蛋白结合99%,在有效难度或治疗剂量下,无或低毒性,5-10倍的治疗剂量下,无三致作用,Hann MM and Opera TI.Pursuing the leadlikeness concept in pharmaceutical research.Curr Opinion in Chem Biol.2004,8:255,毒副作用是药物对非靶标的作用表现,作用于非靶标(off-target):不良反应。,作用于遗传基因:致癌、致畸、致突变。,作用于CYP450:底物、抑制剂、诱导剂,毒性,药物-药物相互作用。,代谢产物引起的毒性。,作用于hERG:心脏毒性。,结构基础:,整体分子结构:分子的杂泛性(promiscuity),局部分子结构:亲电基团,自由基等,以实例说明成药性的优化,增加溶解性,提高PK-PD效应,肾上腺能受体拮抗剂哌唑嗪(prazosin)与1974年上市,治疗高血压和前列腺肥大。,11年后上市的特拉唑嗪(terazosin),只将呋喃环换成四氢呋喃环,提高水溶解度,改善了药代,药效优于哌唑嗪(Dr.Martin Winn)。,溶解度 1.1 mg/mL 28.1 mg/mL,口服利用度(F)57%90%,半衰期 3 h 12 h,用药 3次/日 1次/日,Kuncl JJ.Pharmacology of terazosin.Am J Med,1986,80:12-19,L-685434 IC50=0.3 nM 细胞IC50=400 nM 水不溶解 无口服生物利用度,Indinavir IC50=0.41 nM 细胞IC50=100 nM 可离解性基团,增溶 人口服生物利用度F=60%,HIV蛋白酶抑制剂:离解性基团-水溶性-口服吸收-有效性,IC50=0.004 nM 低溶解性,体内活性很弱,IC50=0.021 nM 水溶解性,体内活性很强,微管蛋白聚合抑制剂:Cryptophycin 52 类似物增加助溶基团,左:虽体外活性很高,因溶解性低,体内无活性。,右:加入增溶基团,活性虽略低,但体内活性增大。,Al-awar RS et al.J Med Chem,2003,46:2985,SB 209670 恩拉生坦(Enrasentan),ETA,Ki(nM)0.43 1.1,Caco2(cm/h)0.0075 0.2045,F(%,大鼠)4 66,内皮素受体A拮抗剂:降低离解性优化过膜性和生物利用度,Ellens H et al.Adv Drug Deliv Rev,1997,23:99,Factor Xa Ki 0.12 nM 0.19 nM,t1/2(h)3.7 3.4,Vd ss(L/Kg)4.6 5.3,Cl(L/h/Kg)1.1 1.1,Caco-2(x10-6 cm/s)0.2 5.6,F(%)24 84,Factor Xa抑制剂:增加亲脂性利于过膜和吸收,Quan ML et al J Med Chem,2005,48:1729),平面性强的分子,熔点和晶格能高,水溶性低。引入基团打破平面性,可增加溶解性。,分子的平面性与溶解性:NMDA(甘氨酸位点)受体拮抗剂,IC5025 nM 溶解度10g/mL,IC504 nM 溶解度=1mg/mL,打破平面性,溶解度=8.6g/mL,溶解度=150g/mL,PNQX,打破平面性,PNQX体内外活性很强,但溶解性差,在肾脏结晶。去平面性,降低不良反应。,Fray MJ et al.JMC,2001,44:1951,Nikam SS et al.JMC,1999,42:2266,提高化学稳定性,DPPIV抑制剂 酰胺键稳定化,维达利汀(vildagliptin),萨沙利汀(saxagliptin),J Med Chem 2005,48:5025,Combretostatin A4 稳定顺式构型,.J.Med.Chem.,2002,45:16971711,提高血浆中稳定性,Epothilone B 内酯变成内酰胺,半衰期延长,Ixabepilone,Epothilone B,真菌代谢产物Balanol,易在血浆中水解,IC50=5 nM IC50=4 nM t1/2=1 min t1/2=69 h,提高血浆中稳定性,CDK2激酶抑制剂:乙酯基用5-乙基噁唑置换。,IC50=20 nM,Kim DJ et al.J Med Chem,2002,45:3905-3927,Cathepsin K抑制剂:治疗骨质疏松,酰胺键的氧用CF3置换。Odanacatib于III期临床,默克。,IC50=5 pM!,N无碱性,形成H键,不形成H键,Gauthier JY et al.Bioorg Med Chem Lett,2008,18:923=928,Diflomotecan phase II,罗氏,Elomotecan phase II,罗氏,喜树碱:E环开环失效;人血浆37C t1/2=5 min,扩环喜树碱:降低了羟基的拉电子效应,人血浆37C t1/2=3 h,提高喜树碱的血浆稳定性,Lesueur-Ginot L et al.ring nmodified camptothecin with enhanced lactone stability,ratains topoisomerase I-targeted activity and antitulor properties.Cancer Res,1999,59:2939-2943,降低脂溶性:改善药代,普萘洛尔(propranolol)的萘环用噻二唑环作等排置换得到噻吗洛尔(timolol),降低了脂溶性。,提高了口服生物利用度,降低了清除率。,减少了过BBB、降低中枢的副作用。,改善了抗心律过速的效应。,Propranolol timolol,Wilson TW et al.Propranolol and timolol:bioavailability,plasma concentrations,and beta blokade.Clin Pharmacol Ther,1982,32:676-685,-受体阻滞剂普拉洛尔(practolol),O-去烷基化,氧化生成亚胺-醌,该代谢活化产物可与正常生理蛋白发生不可逆结合,导致特质性硬化性腹膜炎,因毒性而撤出市场。,为了去除这种毒性作用,将胺基变为电子等排体亚甲基,难以产生次甲基-醌,因而比索洛尔(bisprolol)、美托洛尔(metoprolol)和阿替洛尔(atenolol)等-阻滞剂就没有毒性作用。,-受体阻滞剂的代谢性质的优化,IC50=2M MW=369 log P=5.7 HBD=0 HBA=3,IC50=1 nM MW=591 log P=7.3 HBD=1 HBA=6 口服吸收很差,神经肽YY1受体拮抗剂:高活性不能补偿药代的损失,I相代谢稳定性:延长丁螺环酮的半衰期,丁螺环酮(busprone)为5-HT1A受体激动剂,抗焦虑药。因被CYP3A4羟化,半衰期短。,引入F原子,半衰期延长。,被羟化,EC500.025M t1/2=4.6 min,EC500.063M t1/2=52.3 min,Tandon M et al.BMCL,2004,14:1709;Science,2007,317:1881-1886,提高I相代谢稳定性:增加代谢位点的位阻,受体阻滞剂美托洛尔的甲氧基已被CYP2D6去甲基(首过效应),环丙甲基取代为倍他洛尔,延长了半衰期,提高了生物利用度。,Metoprolol 体内首过效应消除率 50%人体半衰期t1/2=3.5-6 h,Betaxolol 体内首过效应消除率 15%人体半衰期t1/2=16-22 h,Manoury PM et al.JMC,1987,30:1003,II相代谢稳定性:阻止酚性羟基的葡醛酸化,酚羟基易发生II相代谢的葡醛酸化,生物利用度低,可在邻位引入拉电子基团如氰基,降低电性,增加位阻,减少II相代谢。,酚基可用环脲或环硫脲等排替换,提高生物利用度和稳定性。,Ki(D1)=1.2 nM Ki(D5)-2.0 nM%F=0.6%AUC0-6h=0.16h g/mL,Ki(D1)=7.0 nM Ki(D5)=4.2 nM%F=87%AUC0-6h=5.9h g/mL,Wu WL et al.JMC,2005,48:680,易葡醛酸化,酚羟基用环脲替换的另一个实例,Mewshaw RE et al.Bioorg Med Chem Lett,2002,12:271-274,多巴胺D2受体部分激动剂,羟基用环脲代替,羰基拉电子效应提高了N-H的离解性,模拟酚羟基,降低了II相代谢。,苯酚和儿茶酚的电子等排体,FTase IC50 1.9 nM 3.5 nM 54 nM,hERG IP 440 nM 4700 nM 11000 nM,克服法呢基转移酶抑制剂的hERG作用,环合限制了构象,降低了与hERG的结合力。,Bell IM et al.3-Aminopyrrolidinone farnesyltransferase inhibitors:design of macrocyclic compounds with improved pharmacokinetics and excellent cell potency.J Med Chem,2002,45:2388-2409,克服抗HIV的CCR5抑制剂与hERG结合作用,Log D 未测 1.6 1.8 2.1,HIV IC50 2 M 8 M 14 M 2 M,hERG 80%30%14%0,(于300 nM的抑制率%),Price DA et al.Overcoming hERG affinity in the discovery of the CCR5 antagonist maraviroc.Bioorg Med Chem Lett,2006,16:4633-4637,增加整体分子的log P有时并不提高与hERG的结合。例如为消除CCR5抑制剂的hERG活性,将苯并咪唑换成三氮唑,降低了-堆积作用环丁基用二氟环己基替换,增加了局部的极性,消除了与hERG结合力。,特非那定的甲基变成羧基(非索那定)消除hERG抑制。,hERG IC50 56 nM 23 M,这也是CYP代谢活化而生成的实例。特非那定于1998年停止使用。,神经肽Y5受体拮抗剂引入磺酰胺基消除hERG抑制,Blum CA et al.Design,synthesis and biological evaluation of substituted 2-cyclohexyl-4-phenyl-1H-imidazole:potent and selective neuropeptide Y Y5-receptor atagonists.2004,47:2318-2325,消除对hERG的抑制作用,新颖性:苯并噁唑烷酮代替苯酚环,促代谢型谷氨酸受体5亚型(mGluR5)的选择性负性变构调节剂用于治疗焦虑症。,水杨酰胺变换成苯并噁唑,维持分子内氢键。结构新颖性。,Fenobam(老化合物),IC50=68 nM,RO0156(HTS),IC50=70 nM,IC50=65 nM,10 mg/kg,po,Ceccarelli SM,Jaeschke G,Buettelmann B et al.Rational design,synthesis,and structure-activity relationship of benzoxazolones:new potent mglu5 receptor antagonists based on the fenobam structure.Bioorg Med Chem Lett.2007,17:1302-1306,新颖性:药物模拟创新的前提,应用电子等排、优势结构或骨架迁越原理获得新化学实体。,抗炎药美洛昔康的芳环等排体泰诺昔康。,PDE5抑制剂由西地那非创制瓦德那非。,辉瑞1998 拜耳2003,辉瑞1979 罗氏1987,结构新颖性:获得知识产权,塞来昔布 罗非昔布 依他昔布 艾瑞昔布,COX-1为构成性酶,在大多数组织中稳定表达。,COX-2是构成性酶,也是诱导性酶。,在血管内皮细胞等组织中正常表达,而且当受到多种刺激后可在局部组织中诱导表达。,过分和长时间抑制COX-2,使前列环素殆尽,血栓烷A2“猖獗”,引起心血管事件。,血栓烷A2(TxA2),前列环素(PGI2),收缩血管 促进血小板聚集,舒张血管 抑制血小板聚集,花生四烯酸(AA),适度抑制的理念指导选择候选药物,选择性程度,心血管风险,胃肠道风险,出血,溃疡,血栓,心肌梗塞,艾瑞昔布,NSAID和昔布类药物选择性抑制 与不良反应的关系,艾瑞昔布的十四年(1997-2011),关键决策:适度抑制指导选择候选药物。,产研结合,探索了适合于我国的新药创制的路径。,体验了顺利与挫折,新药创制的风险。,2011年获得SFDA批准。,积累了经验教训,仍有诸多不尽人意之为。,药物的化学结构承载了药理活性和成药性,先导物的优化是多目标或成多维度的优化。,活性、物化、生化、药代和安全性和谐共存于结构中,交错制约,往往需要综合总体效果。,药物化学和分子设计中,难度和技巧在于成药性的优化。在这个意义上,是药物化学的灵魂。,小结:多目标优化,Thank You,世界触手可及,携手共进,齐创精品工程,
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