翻译和翻译后水平的调节.ppt

第四节 翻译和翻译后水平的调控,mRNA的寿命与蛋白质的合成,mRNA的寿命决定其指导翻译蛋白质的时间，半衰期的长短主要决定于其选择性降解的速度，不同mRNA的结构，特别是3端非翻译区的序列决定其寿命。不同基因的mRNA寿命差别很大，珠蛋白mRNA的半衰期约为17h，而有些生长因子不超过30 min。,很多蛋白质的合成与激素的作用有关。在某些情况下，激素并不能增加mRNA的转录，而在翻译水平上起调节作用。如：催乳素可延长酪蛋白mRNA的寿命达25倍，其他激素也能相应提高某些特定mRNA的稳定性。,激素对RNA稳定的影响,转铁蛋白( transferrin ) mRNA的3端和转铁蛋白受体（transferrin receptor, TFR）mRNA的5端有非常相似的铁反应元件（iron response element, IRE )，该区域可形成多个复杂的茎环结构，其中部分茎环与铁反应有关。细胞中这两种蛋白质的浓度受到铁离子浓度的调节，可能主要与其基因转录后的翻译调节有关，因为通过抑菌素抑制转录过程并不能阻断其对铁的反应。蛋白质的最终浓度可能与细胞中该编码蛋白质mRNA的半衰期有关，其半衰期的长度则是受铁浓度的调控的.(见下图),转铁蛋白及转铁蛋白受体mRNA稳定性的铁依赖性调节（自Lodish , 2000）,Poly(A)对翻译的调控： 在小鼠的未成熟卵母细胞质中可以翻译的mRNA具有较长的poly(A), 减数成熟分裂后poly(A)降解，翻译终止。 在减数成熟分裂前不表达的mRNA的poly(A)较短(15-90A), 但其3UTR具有胞质多聚腺苷酸化信号序列(CPEs)(UUUUAU in mice and frogs)。减数成熟分裂后这些 mRNA迅速加上一个长的polyA,开始翻译。,mRNA的结构和翻译效率,所有真核生物mRNA 5端都有帽子结构，早在1976年Shtkin就根据体外翻译实验结果指出，5端帽子有增强翻译效率的作用。此后众多研究证实，大多数mRNA的翻译依赖于帽子结构。 除了帽子外，真核生物mRNA的3端大都有polyA尾巴，在许多体内实验和高活性的体外翻译体系中都观察到，mRNA polyA结构与翻译效率有直接的关系，带polyA的mRNA比无polyA尾巴的相应mRNA的翻译效率高得多。5端帽子和3端polyA能够协同地调节mRNA的翻译效率。,翻译后水平的调控,许多蛋白质的合成完成后就具有生物功能，但更多的蛋白质则必须经过适当的加工修饰才有活性，有些蛋白质的活性在与其他蛋白质的作用后往往发生明显的变化。,翻译后水平的调控,一条长链被剪切并除去部分而激活, 胰岛素; 除去某些保护/抑制性片段而激活，Dorsal; 特定的亚细胞定位，膜蛋白、核蛋白等; 与其它蛋白质一起装配成为功能单位，血红蛋白； 与某些离子结合而激活，钙调蛋白; 通过蛋白质修饰（磷酸化、乙酰化）而激活，鱼精蛋白、晶体蛋白。,第五节 表观遗传修饰与细胞分化,表观遗传修饰,定义：由于DNA的甲基化、组蛋白N端的修饰、变异体及微小RNA(miRNA)的作用等引起染色体的状态和构型发生，进而引起基因表达发生相应的改变。 特点：这种变化并不包括DNA序列及信息的任何改变，是经典遗传学之上或之外的改变。,一、DNA的甲基化,DNA甲基化的发生 小干扰RNA（siRNA）和长非编码RNA（lineRNA）可通过与基因的启动子序列结合，指导其发生特异性的甲基化，组合组蛋白的修饰而使染色质发生重塑而抑制其表达，但也有少数例证表明有些 lincRNA（l例如HOTTIP)可能通过与其配体蛋白质结合定位在其靶基因区，导致组蛋白H3K4的三甲基化而激活该基因。 DNA的甲基化多发生在胞嗜陡的第5位碱基，在真核生物中十分普遍，也被认为是DNA的“第5种碱基” 。 DNA的甲基化经常出现在3类DNA序列（ CpG,CHG,CHHo ）中。前2种序列为对称甲基化位点,CHH是非对称甲基化位点,CpG经常位于基因启动子附近或者GC岛中 。,哺乳动物中的三种甲基化酶,在哺乳动物中DNA的甲基化是由3种甲酶催化的（Dnmtl，Dnmt3 a和Dnmt3 b）。 Dnmtl对DNA复制后甲基化模式的维持有重要作用，它可对半甲基化的新合成DNA链进行甲基化。Dnmt3 a和Dnmt3 b是与从头甲基化过程有关（de novo methylation )，在这个过程中需要建立新的甲基化模式。Dnmtl和Dnmt3 a均可与组蛋白脱乙酞酶（HDACs）互作，从而抑制基因的表达。,基因表达的激活和抑制,激活：胶质纤维酸性蛋白（GFAP)基因启动子的START3结合位点CpG的脱甲基化可以激活该基因的表达。 抑制：(1)DNA的甲基化也可以通过几种甲基CpG结合蛋白 （MECPs)识别DNA甲基化模式而抑制基因的表达 (2)另一种甲基CpG结合蛋白MBD2与多亚基的NuRD（它们含有依赖ATP的染色体重塑因子Mi-2和HDACs)形成复合物，抑制甲基化的启动子，使染色体发生高效的重塑。,从头甲基化过程,在动物受精后，不论是来源于父系基因组还是母系基因组均发生大规模的脱甲基化（印迹基因除外），然后再重建新的甲基化模式。 有一个模型可能揭示其机制：基因转录起始点结合RNA聚合酶B，募集SET蛋白使覆盖这个区域的核小体组蛋白H3 K4发生甲基化，H3 K4甲基可抑制Dnmt3 L的结合，使从头甲基化酶不能作用这个区域，因而整个基因组中除了结合有RNA聚合酶11的CpG岛外，均可发生从头甲基化过程。,二、组蛋白的修饰与细胞分化,组蛋白八聚体中的4种蛋白N端尾巴有许多氨基酸可被不同的酶所修饰，例如，甲基化（Me）、乙酞化（Ac）和脱乙酞化、磷酸化（P）、泛素化、ADP一核糖基化等，其中发生在精氨酸和赖氨酸的甲基化修饰比较复杂，有单甲基化、双甲基化（对称和不对称）及三甲基化。 组蛋白密码：这些修饰的种类、位置和组合共同决定着核小体的状态，进一步控制基因的转录或者抑制，被称做组蛋白密码（histone code）。,组蛋白修饰的作用,（1） 组蛋白的修饰可以通过改变不同组蛋白之间及组蛋白与DNA之间的接触影响染色质的高级结构，组蛋白密码决定着染色质的环境，从而进一步调节核DNA的复制、转录、DNA修复及染色体凝聚。 （2）组蛋白H3K4,H3K36,H3K79的三甲基化可以导致染色体的开放构型产生常染色质，同时由组蛋白乙酞转移酶(HATs）催化的组蛋白高水平乙酞化也是保证常染色质的一个特征。,不管是干细胞还是组织特异性细胞，特定的miRNA均可参与重要转录因子、细胞周期蛋白、染色质修饰酶及其他调节蛋白的表达调控。 在干细胞分化为组织特异性细胞的过程中及分化细胞诱导成多能干细胞的过程中，这些miRNA在调控许多重要基因的表达的网络中无疑起着十分重要的作用。,三、miRNA与细胞分化,