总RNA提取的原理、步骤(共2页)

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总RNA提取的原理、步骤1.原理及方法(异硫氰酸胍-酚-氯仿 一步法) TRIZOL试剂中的主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,其中异硫氰酸胍可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离开。水相层(无色)主要为RNA,有机层(黄色)主要为DNA和蛋白质。2.简易步骤细胞或组织,加入0.4ml TRIZOL试剂后匀浆室温静置5分钟加入1/5 TRIZOL试剂体积量的氯仿,剧烈震荡混匀室温静置5分钟,12000g 4离心l5分钟将上清液转移至新的离心管中,加入与上清液等体积的异丙醇,颠倒混匀室温静置10分钟,12000g 4离心l0分钟,弃上清向沉淀中加入1ml的75%乙醇清洗沉淀,12000g 4离心5分钟弃上清保留沉淀,干燥沉淀物溶解于11l的DEPC处理水中注意:以上操作应在生物安全柜内完成,以防止污染。注意事项 全程配戴一次性手套。皮肤经常带有细菌和霉菌,可能污染RNA的抽提并成为RNA酶的来源。培养良好的微生物实验操作习惯预防微生物污染。使用灭菌的,一次性的塑料器皿和自动吸管抽提RNA,避免使用公共仪器所导致的RNA酶交叉污染。在TRIZOL中,RNA是隔离在RNA酶污染之外的。而对样品的后续操作会要求用无RNA酶的非一次性的玻璃器皿或塑料器皿。玻璃器皿可以在150C的烘箱中烘烤4小时。塑料器皿可以在0.5MNaOH中浸泡10分钟,用水彻底漂洗干净后高压灭菌备用。用TRIZOL抽提RNA时要戴手套和护眼罩。避免接触皮肤和衣服。在化学通风橱完成操作。避免呼吸道吸入。如无例外,所有的操作应该在15-30C的条件下完成,试剂亦在15-30C的条件下。75%乙醇(用DEPC处理过的水配制:将水加入无RNA酶的玻璃瓶中,加入DEPC至0.01%(v/v)。放置过夜并高压灭菌。)每50100mg组织加1ml的TRIZOL。匀浆化时组织样品容积不能超过TRIZOL容积的10%。单层生长的细胞直接往直径3.5cm的培养板中加入1ml的TRIZOL溶解细胞,通过移液管分次移出细胞裂解物。依据培养板的面积而不是依据细胞的数量来决定所需的TRIZOL量(每10cm2加1ml)。当TRIZOL量不足时可导致抽提的RNA中污染有DNA。在匀化后和加入氯仿之前,样品可以在6070C保存至少一个月。RNA沉淀(RNA洗脱)溶于75%的乙醇在28C至少可以保存一周,在520C下至少可保存一年。逆转录cDNA及注意事项如果cDNA当天不使用,则要保存在-20或-70。RNA逆转录成cDNA操作流程简图如下:(在冰盒上操作)1.将提取的RNA溶解于11 l DEPC-t净化水中, 加入1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP轻微震荡后离心3-5秒。2.在PCR扩增仪上70 5分钟。3.冰上冷却1分钟,并短暂离心,向反应体系中加入5reaction buffer 4l,RibolockTM Ribonuclease inhibitor (20 u/l) 1l,10 mM dNTP mix 2l。4.轻微震荡后离心3-5秒,在PCR扩增仪上37 5分钟。5.向反应体系中加入RevertAidTM M-MuLV Reverse Transcriptase (200u/ul) 1l,在PCR扩增仪上42 60分钟进行逆转录,70 10分钟灭活逆转录酶。6.收集反应产物,冰上冷却
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