2.第二章 菌物的分类

一、菌物在自然界的地位一、菌物在自然界的地位 林奈林奈(Linnaeus)(Linnaeus),1753-201753-20世纪世纪5050年代，年代，两界系统两界系统：植物界植物界(真菌、黏菌及细菌真菌、黏菌及细菌)和和动物界动物界。Hogg Hogg 和和HaeckelHaeckel,1861-1866,1861-1866年，年，三界系统三界系统：植物界、植物界、动物界和动物界和原生生物界原生生物界（所有单细胞生物、藻类、原生动（所有单细胞生物、藻类、原生动物和真菌，细菌和蓝藻另立为物和真菌，细菌和蓝藻另立为“无核类无核类”）。）。CopelandCopeland,1938-1956,1938-1956年，年，四界系统四界系统：植物界、动物植物界、动物界、原生生物界界、原生生物界和和菌界菌界。“无核类无核类”被单独为菌界被单独为菌界。WhittakerWhittaker,1969,1969年，年，五界系统五界系统：正式把真菌（菌物）：正式把真菌（菌物）独立成界，形成了一个较完整的纵横统一的系统。独立成界，形成了一个较完整的纵横统一的系统。第二节第二节 菌物的分类菌物的分类五界系统五界系统植物界植物界动物界动物界原生生物界原生生物界真菌界真菌界原核生物界原核生物界真核生物真核生物原核单细胞生物原核单细胞生物无细胞生物无细胞生物 卡瓦尼史密斯卡瓦尼史密斯Cavaliver-SmithCavaliver-Smith，1988-1989年，年，八八界系统界系统（今年来由于（今年来由于分子生物学技术的发展，分类学家们将分子生物学技术的发展，分类学家们将rRNA的碱的碱基序列用于系统发育的分析中）基序列用于系统发育的分析中）细菌总界细菌总界（Empire BacteriaEmpire Bacteria）（1 1）真细菌界真细菌界（EubacteriaEubacteria）（2 2）古细菌界古细菌界（ArchaebacteriaArchaebacteria）真核总界真核总界（Empire EukaryotaEmpire Eukaryota）（3 3）原始动物界原始动物界（ArchezoaArchezoa）（4 4）原生动物界原生动物界（ProtozoaProtozoa）黏菌、根肿菌）黏菌、根肿菌（5 5）植物界植物界（PlantaePlantae）（6 6）动物界动物界（AnimaliaAnimalia）（7 7）真菌界真菌界（FungiFungi）狭义真菌）狭义真菌（8 8）假菌界假菌界（ChromistaChromista）卵菌卵菌菌物菌物（藻物界）（藻物界）独立成界独立成界原生生物界原生生物界 从八界分类系统可见从八界分类系统可见：所谓真菌实际上是一个所谓真菌实际上是一个由不同祖先的后裔组成的若由不同祖先的后裔组成的若干生物界的混合体，亦即多干生物界的混合体，亦即多元的元的复系类群复系类群(Polyphyletic g r o u p),并并 非 单 系 群非 单 系 群(Monophyletic group)。这。这个混杂的生物类群，过去叫个混杂的生物类群，过去叫真菌界。为了将这个旧真菌真菌界。为了将这个旧真菌界与现在的新真菌界（也叫界与现在的新真菌界（也叫真真菌）区分开，现在将过真真菌）区分开，现在将过去这个混杂的生物类群（旧去这个混杂的生物类群（旧真菌界）称为菌物。因此菌真菌界）称为菌物。因此菌物包括粘菌、卵菌和真菌，物包括粘菌、卵菌和真菌，分别被列入原生动物界、假分别被列入原生动物界、假菌界和真菌界。菌界和真菌界。原生动物界（黏菌）假菌界（卵菌）真菌界（真菌）细胞壁细胞壁营养阶段无细胞壁 纤维素 几丁质及-葡聚糖线粒体的线粒体的嵴嵴管状管状平坦赖氨酸合赖氨酸合成途径成途径二氨基庚二酸(DAP)二氨基庚二酸(DAP)-氨基已二酸(AAA)原生动物界、假菌界和真菌界的异同原生动物界、假菌界和真菌界的异同二、菌物的分类系统二、菌物的分类系统 菌物分类的目的菌物分类的目的：根据国际上已经承认的一些分类系统，给根据国际上已经承认的一些分类系统，给每一种菌物命名，以便相互交流有关菌物每一种菌物命名，以便相互交流有关菌物方面的资料；方面的资料；尽可能地指出已知菌种之间的亲缘关系。尽可能地指出已知菌种之间的亲缘关系。因为亲缘关系相近的种，其生物学特性是因为亲缘关系相近的种，其生物学特性是相似的。相似的。菌物分类系统菌物分类系统 由菌物学家根据相关类群菌物的形态、生理、由菌物学家根据相关类群菌物的形态、生理、生化、遗传、生态、超微结构及分子生物学等方面生化、遗传、生态、超微结构及分子生物学等方面的特征进行归类建立起来的。的特征进行归类建立起来的。目前应用最广的个系统：目前应用最广的个系统：以英国出版的以英国出版的菌物词典菌物词典为代表的为代表的Ainsworth 系系统统以 美 国 出 版 的以 美 国 出 版 的 菌 物 学 概 论菌 物 学 概 论 为 代 表 的为 代 表 的Alexopoulos系统系统 我国目前使用最广的是我国目前使用最广的是Ainsworth在在菌物词典菌物词典第版（第版（1971）和）和真菌进展论文集真菌进展论文集（1973）中）中阐述的分类系统。即采用阐述的分类系统。即采用Whitaker(1969)的生物五界的生物五界系统：系统：真菌（菌物）界包括粘菌门和真菌门，而真真菌（菌物）界包括粘菌门和真菌门，而真菌门包括菌门包括5个亚门：个亚门：鞭毛菌亚门鞭毛菌亚门（Mastigomycotina）接合菌亚门接合菌亚门（Zygomycotina）子囊菌亚门子囊菌亚门（Ascomycotina）担子菌亚门担子菌亚门（Basidiomycotina）半知菌亚门半知菌亚门（Deuteromycotina）真菌真菌5 5个亚门的主要特征个亚门的主要特征亚 门营 养 体无性繁殖有性生殖鞭毛菌原质团或没有隔膜的菌丝体 游动孢子休眠孢子囊或卵孢子接合菌菌丝体，典型的没有隔膜 孢囊孢子接合孢子子囊菌有隔膜的菌丝体，少数是单细胞分生孢子等子囊孢子担子菌有隔膜的菌丝体不发达担孢子半知菌有隔膜的菌丝体或单细胞 分生孢子等没有有性生殖，但可能进行准性生殖三、菌物的分类方法三、菌物的分类方法1.分类单元分类单元此外还有：变种、专化型、生理小种、生物型此外还有：变种、专化型、生理小种、生物型等等1 1）种种（Species）：）：是菌物分类的基本单元，是菌物分类的基本单元，多采用生物学种的概念多采用生物学种的概念，即以形态特征为基础，种即以形态特征为基础，种与种之间在主要形态上应该具有显著而稳定的差异。与种之间在主要形态上应该具有显著而稳定的差异。但有些菌物种的建立，有时还应辅助以生态、生理、但有些菌物种的建立，有时还应辅助以生态、生理、生化及遗传等方面的差异。对于某些寄生性菌物，有生化及遗传等方面的差异。对于某些寄生性菌物，有时也根据寄主范围的不同而分为不同的种。时也根据寄主范围的不同而分为不同的种。近年，分近年，分子生物学技术应用于菌物学分类，出现了根据子生物学技术应用于菌物学分类，出现了根据DNADNA序列序列同源性来划分的系统发育种的概念（同源性来划分的系统发育种的概念（Phylogenetic Phylogenetic speciesspecies）。）。2）变种变种(Variety，Var.)、亚种亚种(Subspecies，subsp.)：种下：种下具有一定的形态差异。具有一定的形态差异。3）专化型专化型(Forma specialis，f.sp.)：根据植物病原菌物种对：根据植物病原菌物种对不同科、属的寄主植物的寄生专化性，在种的下面划分为不同科、属的寄主植物的寄生专化性，在种的下面划分为专化型。专化型。（如禾柄锈菌可根据寄生麦类情况划分为（如禾柄锈菌可根据寄生麦类情况划分为6个专化型。危害个专化型。危害小麦的是其中一个专化型：小麦的是其中一个专化型：Puccinia graminis f.sp.tritici）。）。4）小种小种(Race)、生理小种生理小种(Physiological race)：根据对不：根据对不同种或品种（一般是一套鉴别寄主品种）的致病能力差异同种或品种（一般是一套鉴别寄主品种）的致病能力差异而划分的生物类群。而划分的生物类群。5）生物型生物型(Biotype)：在遗传上完全一致的个体叫生物型。：在遗传上完全一致的个体叫生物型。6）营养体亲和群营养体亲和群(Vegetative compatibility group,VCG)、菌丝融合群菌丝融合群（Anastomosis group,AG）:根据营养体亲和根据营养体亲和性在种下或专化型下面划分的类群，这些真菌通常不产生性在种下或专化型下面划分的类群，这些真菌通常不产生孢子。孢子。根据根据国际植物命名法规国际植物命名法规；命名起点命名起点：国际植物命名法规国际植物命名法规（1981）真菌和）真菌和植物的命名起点都是植物的命名起点都是 1753年年5月月1日。日。合格发表合格发表：有拉丁文描述；清晰的照片或绘图；发：有拉丁文描述；清晰的照片或绘图；发表在正式的刊物上；必需保存模式标本（表在正式的刊物上；必需保存模式标本（Type）。）。优先权优先权：第一个发表的具有优先权，其它以后发表：第一个发表的具有优先权，其它以后发表的名称都是该名称的异名（的名称都是该名称的异名（Synonym）。）。学名需改动，建立新组合时，将原定名人用括号括学名需改动，建立新组合时，将原定名人用括号括起来。起来。2.2.分类单元分类单元 属名属名+种名（种名（+命名人）命名人）：一种真菌只能有一个学名（有性），对于半知菌的允许一种真菌只能有一个学名（有性），对于半知菌的允许 性阶段和无性阶段采用不同的学名；性阶段和无性阶段采用不同的学名；小麦赤霉病菌：小麦赤霉病菌：Gibberella zeae（有性）（有性）Fusarium graminearum（无性）（无性）Puccinia graminis Pers.Gaeumannomyces graminis(Sacc.)Arx et/&Oliver Phytophthora parasitica Dastur var.nicotianae(Brade de Haan)Tucker（学名更改人）（学名更改人）Colletotrichum gleosporioides(Penz.)Sacc.f.sp.cuscutae 属名的首字要大写，种名则一律小写，并用斜体（印刷属名的首字要大写，种名则一律小写，并用斜体（印刷体）体）或下划线（手写）。或下划线（手写）。林奈林奈1753年创立了年创立了“双名制命名法双名制命名法”，现已广泛应用，现已广泛应用于动物、植物、菌物和细菌等各类生物。双名制的名称即于动物、植物、菌物和细菌等各类生物。双名制的名称即生物的学名（生物的学名（Scientific name）,用拉丁名书写。用拉丁名书写。界（界（Kingdon）真菌界（真菌界（Fungi）门（门（Phylum）担子菌门（担子菌门（Basidiomycota）纲（纲（Class）冬孢菌纲（冬孢菌纲（Teliomycetes）目（目（Order）锈菌目（锈菌目（Uredinales）科（科（Family）柄锈菌科（柄锈菌科（Pucciniaceae）属（属（Genus）柄锈菌属（柄锈菌属（Puccinia）种（种（Species）禾谷种（禾谷种（Graminis）变种（变种（Variety）小麦变种（）小麦变种（Tritici）以禾柄锈菌小麦变种为例说明其分类地位：以禾柄锈菌小麦变种为例说明其分类地位：Puccinia graminis Pers.var.tritici Erikss.et.Henn.3.3.授课采用的分类系统授课采用的分类系统 基本按照基本按照菌物词典菌物词典第版第版(1995)(1995)和和第版第版(2001)(2001)的方法，将菌物划分到原生动物的方法，将菌物划分到原生动物界、假菌界和真菌界。并根据我国的情况单独界、假菌界和真菌界。并根据我国的情况单独成立半知菌类，仍按其中的三个纲（芽孢纲、成立半知菌类，仍按其中的三个纲（芽孢纲、丝孢纲和腔孢纲）讲解。丝孢纲和腔孢纲）讲解。菌物词典菌物词典第版中子囊菌不分纲直接第版中子囊菌不分纲直接分分4646目，但第版中却分了目，但第版中却分了8 8纲纲5656目目.为便于学为便于学习，本书仍按习，本书仍按Ainsworth(1973)Ainsworth(1973)系统，将子囊系统，将子囊菌分纲。菌分纲。原生动物界原生动物界 集孢黏菌门 网柱黏菌门 黏菌门 根肿菌门根肿菌门 根肿菌纲根肿菌纲 假菌界假菌界 丝壶菌门 网黏菌门 卵菌门卵菌门 卵菌纲卵菌纲 真菌界真菌界 壶菌门壶菌门 壶菌纲壶菌纲 接合菌门接合菌门 接合菌纲接合菌纲 毛菌纲子囊菌门子囊菌门半子囊菌纲半子囊菌纲不整囊菌纲核菌纲核菌纲腔菌纲腔菌纲盘菌纲盘菌纲虫囊菌纲担子菌门担子菌门担子菌纲冬孢菌纲冬孢菌纲黑粉菌纲黑粉菌纲半知菌类半知菌类芽孢纲芽孢纲丝孢纲丝孢纲腔孢纲腔孢纲第一、二节重点第一、二节重点 1.1.菌物的基本特征；菌物的基本特征；2.2.菌物营养体的变态和菌组织类型及其功能；菌物营养体的变态和菌组织类型及其功能；3.3.菌物无性繁殖和有性繁殖的方式和孢子类型；菌物无性繁殖和有性繁殖的方式和孢子类型；它们在病害发生发展过程中的作用如何？它们在病害发生发展过程中的作用如何？4.4.病原物生活史及类型；相关名词术语的含义。病原物生活史及类型；相关名词术语的含义。5.5.了解现有分类系统及其分类主要依据知道了解现有分类系统及其分类主要依据知道生物分八界系统中与菌物有关内容分别被归在生物分八界系统中与菌物有关内容分别被归在哪一界当中。哪一界当中。