细菌的分类及命名课件

,*,单击此处编辑母版标题样式,精选ppt课件,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,二级,三级,四级,五级,精选ppt课件,*,细菌的分类及命名,一、细菌的分类地位,二、细菌的命名,三、细菌分类鉴定的标准,四、细菌的分类体系,五、细菌的鉴定,1,精选ppt课件,细菌的分类及命名一、细菌的分类地位1精选ppt课件,一、细菌分类学,对细菌进行,分类，命名与鉴定,的 一门学科。,任务：,在全面了解,细菌生物学特征,的基础上，研究它们的,种类,，探索其,起源,，,演化,以及与,其他类群之间的亲缘关系,，进而提出能反映,自然发展的分类系,统，并将细菌加,以分门别类,。,2,精选ppt课件,一、细菌分类学对细菌进行分类，命名与鉴定的 一门学科。任,细菌分类学,包括分类，命名和鉴定,1,、细菌分类：,根据细菌各自的特征，并按照,亲缘关系,分类，以不同等级,编排系统,。分类有两种：,细菌的生理生化分类法,，包括有传统分类法和数值分类法。,细菌核酸、蛋白质结构的同源程度进行分类法,，称种系分类或自然分类。,3,精选ppt课件,细菌分类学包括分类，命名和鉴定1、细菌分类：根据细菌各自的特,2,、细菌命名,：在分类基础上，给每种细菌一个,科学名称,，便于交流并保证所有的科研工作者给予同样名称。,3,、细菌鉴定：,将未知细菌按分类原则，,确定细菌的分类地位,。,4,精选ppt课件,2、细菌命名：在分类基础上，给每种细菌一个科学名称，便于交流,二、细菌的分类地位,1,、过去属于植物界，,现在划为：,原核生物,在兽医微生物中，古细菌不占重要地位,古菌,细菌,5,精选ppt课件,二、细菌的分类地位1、过去属于植物界，古菌细菌5精选ppt课,2,、细菌还包括,衣原体、立克次氏体、霉形体、螺旋体、放线菌等,对动物和人具有致病作用,蓝细菌、紫色光合细菌等,6,精选ppt课件,2、细菌还包括6精选ppt课件,7,精选ppt课件,7精选ppt课件,界,Kingdom(,拉：,Regnum),门,Phylum(,拉：,Phylum),纲,Class (,拉：,Classis),目,Order(,拉：,Ordo),科,Family(,拉：,Familia),属,Genus,（拉：,Genus,）,种,Species,（拉：,Species,）,3,、细菌的分类单元,细菌的分类单元与动植物一样，依次为,科及科以上的划分在细菌不太完善，且随着研究的深入科属的划分会发生变动,8,精选ppt课件,界 Kingdom(拉：Regnum)3、细菌的分类单元,1,、属,（,genus,）,性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属，与其他属有明显差异。,2,、种,（,species,）,是细菌学分类的最基本单元，生物学性状基本相同的细菌群体归成一个菌种,。,3,、菌株,（,strain,）,是不同来源的,某一种,细菌的纯培养物。,9,精选ppt课件,1、属（genus）性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属,三、细菌的命名,1,、,细菌的命名依据“,国际细菌命名法规”,(The International Code of Nomenclature of Bacteria),学名用拉丁文，遵循“,双名法,”。,每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分组成,如：,产气荚膜梭菌,（,Clostridium perfringens,）,属名在前，字首,字母要大写,，,其余小写,整个属名及种名在出版物中应,排成斜体,中文译名，种名在前，属名在后,10,精选ppt课件,三、细菌的命名1、细菌的命名依据“国际细菌命名法规”(The,2,、,分类学文献中的细菌拉丁文学名，属名和种名之后，往往还要加上首次定名人（加括号）、,现名定名人和现名定名年份,，这些均用,正体排字。,一般兽医学及医学微生物学文献中，,属名和种名之后的部分均予省略,。,如：,Escherichia coli,11,精选ppt课件,2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属名和种名之后，往往还要加,例如,大肠埃希菌的学名全名是,：,Escherichia coli,(Migula)Castellani et Chalmers l919,指的是,Migula,于,1895,年命名此菌为,Bacillu coli,，,Castellani,及,Chalmers,于,1919,年改为现名。,12,精选ppt课件,例如12精选ppt课件,金黄色葡萄球菌的学名为,：,Staphylococcus aureus,Rosenbach 1884,属名葡萄球菌,种名金黄色,命名人的姓,命名年份,金黄色葡萄球菌的学名为,13,精选ppt课件,金黄色葡萄球菌的学名为：Staphylococcus au,Peptostreptococcus foetidus,（,Veillon,）,Smith,属名消化链球菌,种名恶臭,原命名者,改名者,恶臭消化链球菌的学名,恶臭消化链球菌是由,Veillon,首先发现和定名的，后,Smith,重新定为现名。,14,精选ppt课件,Peptostreptococcus foetidus（,3,、,拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规则读念,4,、,属名重复出现时，拉丁文可缩写，用第一个字母，为避免混肴，也可用,2,个字母。大肠杆菌,(,E.coli,),15,精选ppt课件,3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规则读念 15精选ppt课,5,、,只确定属名、未确定种名的某一株细菌，其拉丁文学名可在,属名之后加,sp,(,正体字,),；如果,同属未定种名的若干菌株,，则用,spp,(species,的缩写，,sp.,表示单数，,spp.,表示复数,),，,如,Micrococcus,sp.,表示微球菌属的一个种，,Micrococcus,spp.,表示微球菌属的一些种。,16,精选ppt课件,5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌，其拉丁文学名可在属名,6,、如果是新种,，在新种的拉丁文学名之后还要加上“,sp.nov,。”，,nov,是,novel,的缩写。,例如,Lawsonia intracellularis,gen,Nov.sp.Nov.,，译为：胞内劳森菌，新属新种。,17,精选ppt课件,6、如果是新种，在新种的拉丁文学名之后还要加上“sp.nov,7,、,亚种用,subsp.(,正体字,),表示，这是,subspecies,的缩写，,例如,Pasteurella multocida,subsp,septica,，中译名为多杀性巴氏杆菌败血亚种。,18,精选ppt课件,7、亚种用subsp.(正体字)表示，这是subspecie,四、细菌分类鉴定的标准,1,、,长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是其表型,(phenotype),特征,这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有应用价值。,形态,染色,培养,细胞壁结构,生理生化,抗原特性,19,精选ppt课件,四、细菌分类鉴定的标准1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是,2,、,目前微生物学界普遍考虑的分类依据是,细菌的种系发生关系,(phylogenetic relationship),，即分析其基因特征从而确定分类地位。,研究细菌的种系发生关系主要,采用三种方法：,1,）,测定,DNA,碱基,(G+C)mol,2,）,核酸分子杂交,3,）,16SrRNA,寡核苷酸编目,20,精选ppt课件,2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据是细菌的种系发生关系(p,1,）,DNA,碱基,G+C%,比例的测定,亲缘关系相近的种比也相近，比差别大亲缘关系必然远,（,G+C,）,%=100%,A+T+G+C,G+C,简称,GC,比,种内差距,2.54.0,种间,5%,属间差距,10%,21,精选ppt课件,1）DNA碱基G+C%比例的测定亲缘关系相近的种比也相近,2,）核酸分子杂交法,DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA,方法,:,待测菌株,dsDNA-ssDNA,参照菌株，同位素标记的,ssDNA,检测杂合,DNA,的放射性强度,，参照菌株自身为,DNA,复性的放射性强度,100%,DNA-DNA,杂交同源性性,60%,为同种,70%,同一亚种,2060%,为同一属,22,精选ppt课件,2）核酸分子杂交法DNA-DNA DNA-rRNA,23,精选ppt课件,23精选ppt课件,3,）,rRNA,寡核苷酸编目分析,rRNA,是细胞中的“活化石”,原核生物：,23s,、,16s,、,5s,真核生物：,28s,、,18s,、,5.8s,16s,或,18s,用作系统分类,：（提出三域学说）,生理功能重要又恒定、含量高易提取、核苷酸序列保守、分子质量适中、信息量大易于分析,24,精选ppt课件,3）rRNA寡核苷酸编目分析rRNA是细胞中的“活化石”24,五、细菌的分类体系,细菌分类体系主要是“,伯吉氏系统细菌学手册,”，,Holt,（美国）编共,4,卷。及“,伯吉氏细菌鉴定手,册”,国际系统与进化微生物学杂志,是细菌分类命名世界公认权威为期刊。,国际公认的菌种保藏权威机构是“,美国典型培养物保藏中心,(ATCC),”,以及“,德国微生物及细胞保藏中心,(DSM),”,等。我国兽医微生物菌（毒）种由,中国兽药检察所鉴定保存,。,25,精选ppt课件,五、细菌的分类体系25精选ppt课件,五、细菌的鉴定,纯培养细菌,才能进行鉴定。,DNA,分子水平的鉴定主要限于专业实验室；,常规细菌鉴定沿用表型特征检测方法；,有成套检测指标的快速诊断试剂盒,商品化的细菌鉴定试剂盒有,Enteotube,系统、,API,系统、,Vitek,系统等。,有条件的单位可用,PCR,技术检测鉴定,26,精选ppt课件,五、细菌的鉴定 26精选ppt课件,1,、分类方法,数值分类法,：,根据细菌的各种性状的数值分析，借助计算机，将拟分类的细菌按其性状的相似程度归类定位。,27,精选ppt课件,1、分类方法27精选ppt课件,在进行数值分类时,需要选择,分类单位,（菌株、种或属）,将性状编码,按公式计算出相似度（,S,矩阵）,进行系统聚类,画出相似矩阵图,最后转绘树状普（,dendrogam,）,计算相似度的公式为：,S%=NS/,（,NS+ND,）其中,S,为相似度，,NS,为相似性状，,ND,为相异性状。,此法应用时所选性状必须要多，越多准确性越高，至少高达,100,个，否则易误判。,28,精选ppt课件,在进行数值分类时28精选ppt课件,2,、常见动物致病菌的鉴定已形成固定的程序。,革兰氏阳性细菌,革兰氏阴性细菌,29,精选ppt课件,2、常见动物致病菌的鉴定已形成固定的程序。革兰氏阳性细菌革兰,革兰氏阳性细菌,球菌,杆菌,丝状或树枝状,葡萄球菌,链球菌,粪肠球菌,微球菌,MZN,染色阴性,MZN,染色阳性,牛放线菌,粘性放线菌,星形奴卡菌,刚果嗜皮菌,产芽胞,无芽胞,抗酸染色阳性,抗酸染色阴性,梭菌,芽胞杆菌,炭疽杆菌,分支杆菌,牛分支杆菌和禽分支杆菌,鼠麻风杆菌,副结核分支菌,棒状杆菌,化脓放线菌,马红球菌,产单核李氏杆菌,猪丹毒杆菌,30,精选ppt课件,革兰氏阳性细菌球菌杆菌丝状或树枝状葡萄球菌MZN染色阴性MZ,革兰氏阴性细菌,球菌,/,球杆菌,杆菌,MZN,染色阴性,MZN,染色阴性,弧状杆菌,中等大小杆菌,螺旋状菌,丝状菌,弯曲菌,弧菌,耐瑟菌,生摩拉菌,不动杆菌,肠杆菌科,假单胞菌,波氏杆菌,放线杆菌,嗜血杆菌,巴氏杆菌,拟杆菌,钩端螺旋体,蛇形螺旋体,密螺旋体,疏螺旋体,坏死杆菌,布氏杆菌属,鹦鹉热衣原体,31,精选ppt课件,革兰氏阴性细菌球菌/球杆菌杆菌MZN染色阴性MZN染色阴性弧,感谢亲观看此幻灯片，此课件部分内容来源于网络，,如有侵权请及时联系我们删除，谢谢配合！,感谢亲观看此幻灯片，此课件部分内容来源于网络，,