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,单击此处编辑母版标题样式,*,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,第三章 微生物的分类,第一节,微生物在生物中的分类地位,第二节,细菌的分类,第三节,病毒的分类,第一节 微生物在生物中的分类地位,六界,四界,（一）无细胞结构,病毒界,病毒界,（二）有细胞结构,1,、无核膜,原核生物界,原核原生物,2,、有核膜,原生物界,细胞无分化,真核原生生物界,真核原生物,细胞有分化,真菌界,植物界,植物界,动物界,动物界,全生命系统树,(P318,图,12,3),地球上最先出现的生命是现有生命的共同祖先，进化向两个方向发展,第二节 细菌的分类,一、分类单元及其等级,二、微生物的命名,三、细菌分类和伯杰氏手册,四、细菌分类鉴定的特征和技术,一、分类单元及其等级,界,Kingdom,门,Phylum,亚门,纲,Class,亚纲,目,Order,亚目,科,Family,亚科,属,Genus,种,Species,常用的细菌分类术语,培养物（,culture),是指一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。,菌株（,strain),，,从自然界分离得到的任何一种微生物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株；用实验方法（如通过诱变）所获得的某一菌株的变异型，也可以称为一个新的菌株，以便与原来的菌株相区别。,型（,form,或,type),常指亚种以下的细分，当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为心的亚种时，可以细分为不同的型。,种（,species),是生物分类中基本的分类单元和分类等级。,二,.,微生物的命名,1.,分类单元的命名,属名,属名用一个单数主格名词或当作名词用的形容词来表示，可以是阳性、阴性或中性，首字母要大写。,种名,和其他生物一样，细菌的种名也用双名法（,binomial nomenclature,）命名，即种的学名由属名和种名加词两部分组合而成。,亚种名,亚种名为三元式组合，即由属名、种名加词和亚种名加词构成。,2.,命名模式及其指定,如前所述，由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准，为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱，细菌系统分类也像其他生物分类一样采用,“模式概念”,。即根据命名法规要求，正式命名的分类单元应指定一个命名模式（简称模式）作为该分类单元命名的依据,。,3.,新名称的发表,根据细菌命名法规的规定，有效发表新的细菌名称应在公开发行的刊物上进行。,若新名称是在,国际系统细菌学杂志,（,IJSB,）以外的其他杂志上发表的，还必须经过新名称的合格化发表，被认为合格后，在该杂志上定期公布，命名日期即从公布之日算起，否则不算合格发表，也不能取得国际上的承认。,发表新名称时，应在新名称之后加上所属新分类等级的缩写词，,如新目“,ord.nov.”,、新属“,gen.nov.”,、新种“,sp.nov.”,等。,20,世纪,60,年代以,前,前，国,际,际上不,少,少细菌,分,分类学,家,家都曾,对,对细菌,进,进行过,全,全面的,分,分类，,提,提出过,一,一些在,当,当代有,影,影响的,细,细菌分,类,类系统,。,。但,70,年代以,后,后，对,细,细菌进,行,行全面,分,分类的,、,、影响,最,最大的,是,是,伯杰氏,手,手册,。所以,该,该书目,前,前已成,为,为对细,菌,菌进行,分,分类鉴,定,定的主,要,要参考,书,书。,三,、,、,细,细,菌,菌,分,分,类,类,和,和,伯,伯,杰,杰,氏,氏,手,手,册,册,四,、,、,细,细,菌,菌,分,分,类,类,鉴,鉴,定,定,的,的,特,特,征,征,和,和,技,技,术,术,（,一,一,）,）,形,形,态,态,学,学,和,和,生,生,理,理,生,生,化,化,特,特,征,征,（,二,二,）,）,血,血,清,清,学,学,试,试,验,验,与,与,噬,噬,菌,菌,体,体,分,分,型,型,（,三,三,）,）,氨,氨,基,基,酸,酸,的,的,顺,顺,序,序,和,和,蛋,蛋,白,白,质,质,的,的,分,分,析,析,（,四,四,）,）,核,核,酸,酸,的,的,碱,碱,基,基,组,组,成,成,和,和,分,分,子,子,杂,杂,交,交,（,一,一,）,）,形,形,态,态,学,学,和,和,生,生,理,理,生,生,化,化,特,特,征,征,1,形,形,态,态,学,学,特,特,征,征,（,1,）,细,细,菌,菌,形,形,态,态,：,：,形,形,状,状,、,、,大,大,小,小,、,、,排,排,列,列,（,2,）,培,培,养,养,特,特,征,征,：,：,菌,菌,落,落,特,特,征,征,（,3,）,特,特,殊,殊,结,结,构,构,：,：,鞭,鞭,毛,毛,、,、,芽,芽,孢,孢,、,、,荚,荚,膜,膜,、,、,孢,孢,子,子,（,4,）,染,染,色,色,反,反,应,应,：,：,革,革,兰,兰,、,、,抗,抗,酸,酸,（,5,）,内,内,含,含,物,物,：,：,异,异,染,染,颗,颗,粒,粒,、,、,伴,伴,孢,孢,晶,晶,体,体,（,6,）,运,运,动,动,性,性,：,：,2,生,生,理,理,生,生,化,化,特,特,征,征,（,1,）,生,生,理,理,：,需,氧,氧,性,性,、,、,温,温,敏,敏,性,性,、,、,噬,噬,盐,盐,性,性,、,、,与,与,宿,宿,主,主,的,的,关,关,系,系,、,、,生,生,活,活,史,史,（,（,有,有,性,性,生,生,殖,殖,情,情,况,况,）,）,等,等,（,2,）,生,生,化,化,：,营,养,养,类,类,型,型,（,（,自,自,养,养,/,异,养,养,）,）,、,、,对,对,碳,碳,源,源,的,的,利,利,用,用,能,能,力,力,、,、,对,对,氮,氮,源,肠杆菌科细菌的分类主要靠生理生化,（,二,二,）,）,血,血,清,清,学,学,试,试,验,验,与,与,噬,噬,菌,菌,体,体,分,分,型,型,1,血,血,清,清,学,学,试,试,验,验,细,菌,菌,细,细,胞,胞,与,与,病,病,毒,毒,等,等,都,都,含,含,有,有,蛋,蛋,白,白,质,质,、,、,脂,脂,白,白,蛋,蛋,、,、,脂,脂,多,多,糖,糖,等,等,有,有,抗,抗,原,原,性,性,的,的,物,物,质,质,，,，,由,由,于,于,不,不,同,同,微,微,生,生,物,物,抗,抗,原,原,物,物,质,质,结,结,构,构,不,不,同,同,，,，,赋,赋,予,予,它,它,们,们,不,不,同,同,的,的抗,原,原,特,特,征,征,。,。,一,种,种,细,细,菌,菌,的,的,抗,抗,原,原,除,除,了,了,可,可,与,与,它,它,自,自,身,身,的,的,抗,抗,体,体,起,起,特,特,异,异,性,性,免,免,疫,疫,反,反,应,应,外,外,，,，,若,若,它,它,与,与,其,其,它,它,种,种,类,类,的,的,细,细,菌,菌,有,有,共,共,同,同,的,的,抗,抗,原,原,组,组,分,分,，,，,它,它,们,们,的,的,抗,抗,原,原,抗,抗,体,体,之,之,间,间,就,就,会,会,发,发,生,生,交,交,叉,叉,反,反,应,应,。,。,2.,噬,菌,菌,体,体,分,分,型,型,在,原,原,核,核,生,生,物,物,中,中,已,已,普,普,遍,遍,发,发,现,现,有,有,相,相,应,应,种,种,类,类,的,的,噬,噬,菌,菌,体,体,.,噬,菌,菌,体,体,对,对,宿,宿,主,主,的,的,感,感,染,染,和,和,列,列,解,解,作,作,用,用,具,具,有,有,高,高,度,度,的,的,特,特,异,异,性,性,即,一,一,种,种,噬,噬,菌,菌,体,体,往,往,往,往,只,只,能,能,感,感,染,染,或,或,裂,裂,解,解,某,某,种,种,细,细,菌,菌,甚,至,至,只,只,裂,裂,解,解,种,种,内,内,的,的,某,某,些,些,菌,菌,株,株,.,所,以,以,根,据,据,噬,噬,菌,菌,体,体,的,的,宿,宿,主,主,范,范,围,围,可,可,将,将,细,细,菌,菌,分,分,为,为,不,不,同,同,的,的,噬,噬,菌,菌,型,型,和,和,利,利,用,用,噬,噬,菌,菌,体,体,裂,裂,解,解,这,这,样,样,的,的,特,特,异,异,性,性,进,进,行,行,细,细,菌,菌,鉴,鉴,定,定,.,这对于追,溯,溯传染病,来,来源、流,行,行病调查,以,以及病原,菌,菌的检测,鉴,鉴定有重,要,要意义,.,（三）氨,基,基酸的顺,序,序和蛋白,质,质的分析,蛋白质是,基,基因的产,因此,可以通过对某些同源蛋白质氨基酸顺序的比较来分析不同生物系统发育关系,序列相似性越高,其亲缘关系愈近,.,因此可以根据蛋白质的氨基酸序列资料构建系统发育树和进行分类,.,（四）核,酸,酸的碱基,组,组成和分,子,子杂交,比较,DNA,和碱基组,成,成和进行,核,核酸分子,杂,杂交,是目前通,过,过直接比,较,较基因组,进,进行生物,分,分类最常,用,用的两种,方,方法,.,1.DNA,的碱基组,成,成,(G+C)%,2,核酸的,分,分子杂交,DNADNA,杂交、,DNArDNA,杂交、核,酸,酸探针,第三节,病,病毒,的,的分类,一、病毒分类,机,机构,二、,病毒分类,原,原理及其,依,依据,三、病毒的分,类,类系统,四、病毒分类,现,现状,五、病毒的,命,命名,一、病,毒,毒分类,机,机构,1966,年莫斯,科,科 国,际,际病毒,命,命名委,员,员会,1973,年国际病,毒,毒分类,委,委员会,（,（,ICTV,）,InternationalCommitteeonTaxonomyofVirus,是病毒,分,分类与,命,命名的,国,国际权,威,威机构,二、病,毒,毒分类,原,原理及,其,其依据,原理：强调,其,其分类,和,和命名,的,的稳定性,、,、实用,性,性、认,可,可性和,灵,灵活性,。,。稳定性是指病,毒,毒名称,及,及其隶,属,属关系,一,一旦确,定,定下来,，,，就应,该,该尽可,能,能的保,留,留。实用性是指病,毒,毒分类,体,体制应,该,该对病,毒,毒学研,究,究领域,是,是有用,的,的。,认,认可性,是,是指病,毒,毒分类,阶,阶元和,名,名称应,该,该为病,毒,毒学研,究,究者乐,意,意接受,和,和使用,，,，所以,，,，认可,性,性也是,实,实用性,的,的必然,结,结果。灵活性是指病,毒,毒分类,阶,阶元可,以,以依据,某,某些新,发,发现而,进,进行重,新,新修订,和,和再确,定,定,二、病,毒,毒分类,原,原理及,其,其依据,依据,病毒粒,子,子特性,抗原性,质,质,病毒生,物,物学特,性,性,病毒粒,子,子特性,病毒形,态,态：如大,小,小、形,状,状、包,膜,膜和包,膜,膜突起,的,的有无,，,，衣壳,结,结构及,其,其对称,性,性；,病毒生,理,理生化,和,和物理,性,性质：如分,子,子量，,沉,沉降系,数,数，浮,力,力密度,，,，病毒,粒,粒子在,不,不同,pH,、温度,、,、,Mg2+,、,Mn2+,、变性,剂,剂、辐,射,射中的,稳,稳定性,；,；,病毒基,因,因组，如基,因,因组大,小,小、核,酸,酸类型,、,、单双,链,链、线,状,状或环,状,状，正,负,负链，,G+C,所占的,比,比例、,核,核苷酸,序,序列等,；,；,病毒蛋,白,白，如结,构,构蛋白,和,和非结,构,构蛋白,的,的数量,，,，大小,以,以及功,能,能和活,性,性，氨,基,基酸序,列,列等；,病毒脂,类,类含量和,特,特性；,碳水化,合,合物含量和,特,特性,。,病毒抗,原,原性质,和,和生物,学,学特性,病毒抗,原,原性质,：,包括病,毒,毒血清,学,学性质,与,与其抗,原,原的关,系,系。,病毒生,物,物学特,性,性：,包括病,毒,毒天然,的,的宿主范,围,围；,病毒在,自,自然状,态,态下的传播与,媒,媒介体的关,系,系；,病毒的地理分,布,布，致,病,病机理,，,，组织,嗜
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