PubMed数据库-研究生2020-公开课ppt课件

,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,#,PubMed,数据库,PubMed数据库-研究生2020-公开课ppt课件,1,一、,PubMed,数据库,简介,二、,PubMed,数据来源,三、,PubMed,记录字段,四、,PubMed,检索功能,五、检索结果的处理,六、免费注册，个性化功能,2,一、,PubMed,简介,PubMed,系统是由美国国立医学图书馆附属美国国立生物技术信息中心,National Center for Biotechnology Information,(NCBI)1997,年,开发的全球,免费,的基于网络的生物医学文献数据库。,有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体,系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获,得全文,内容涉及：临床、基础医学、药学、牙医学、护理学、公共卫生、营养、兽医学等专业,一、PubMed 简介PubMed系统是由美国国立医学图书馆,3,二、数据来源,1、MEDLINE,：主体,收录,70,余个国家,5,600,多种,生物医学期刊的题录、文摘和部分全文，是世界上最权威的医学数据库,每一篇文献标引了医学主题词（,MeSH,）,文献时间：,1946,年,-,2、In process,citation,，临时性医学文献数据库，由正在加工处理之中的文献记录组成。其数据经过标引后向,MEDLINE,移加。,3、,Publisher supplied citation，,出版商提供的电子版文献，未被,MEDLINE,收录的期刊,二、数据来源1、MEDLINE：主体,4,三、记录的字段,供检索和显示字段,60,多个,三、记录的字段供检索和显示字段60多个,5,四、,PubMed,检索功能,基本检索,高级检索,主题词检索,其他检索途径,期刊数据库检索、特定文献检索、临床查询,四、PubMed 检索功能基本检索,6,基本检索,基本检索,7,AIDS,AND,therapy,AIDS,OR,Acquired Immunodeficiency,Syndrome,Hepatitis,NOT,Animal,输入几个词，默认为,AND,组配关系,从左到右顺序检索,，括号优先,1、,逻辑运算符,(,and or not,),复合检索,AIDS AND therapy1、逻辑运算符(and,8,2、,自动词语匹配,PubMed,对输入检索框中的检索词进行自动转换匹配，将其逐步地与其数据库中 的各类词表核对、转换、匹配,系统自动将,关键词和主题词,组合检索,MeSH Translation Table,主题词注释表,Journals Translation Table,期刊注释表,Author Index,作者索引表,No Mapping,检索词拆分,AND,2、自动词语匹配MeSH Translation Table,9,PubMed数据库-研究生2020-公开课ppt课件,10,自动转换匹配,主题词,11,默认,AND,连接,自动转换匹配主题词11默认AND连接,针对特定的短语和词组的检索，需要在短语或者词组上,用,双引号,引起来。如,“,single cell,”,，,“,oxygen free radicals,”,，作为一个不可分割词组在全部字段中检索，系统不进行自动转换匹配,避免自动匹配时将短语拆分造成误检，提高查准率,3、,精确检索,针对特定的短语和词组的检索，需要在短语或者词组上用双引号引起,12,加双引号,短语检索,13,oxygen free radicalsAll Fields,加双引号 短语检索13oxygen free radica,14,14,4、,字段检索,限定字段检索更专指,Pubmed,的记录字段有,60,多个,格式：检索词,字段标识符,例：,hepatitisti,不再扩展主题词,Smith cau,Aidsso,Reviewpt,2002dp,4、字段检索 限定字段检索更专指Pubmed的记录字段有60,15,5、,截词检索,在词干的末尾加“,*,”号，,PubMed,就会检索出以该词为词根的所有的词。截词检索将关闭自动词语匹配功能。,输入,bacter*,，可检出,bacteria,、,bacterium,、,bacterial,等词的文献,截词功能只限于单词，对词组无效。,5、截词检索 在词干的末尾加“*”号，PubMed就会检索,6、,作者姓名检索,格式：姓全称,+,名缩写,smith Jau,2002,年以后文献可用姓名全称检索,西方人姓名书写格式：,First name,、,Last name,6、作者姓名检索格式：姓全称+名缩写西方人姓名书写格式：F,17,PubMed数据库-研究生2020-公开课ppt课件,18,7、,期刊名称检索,刊名全称,(e.g.,molecular biology of the cell),刊名缩写,(e.g.,mol biol cell),ISSN,号,(e.g.,1059-1524),19,7、期刊名称检索刊名全称(e.g.,molecular,如果期刊名称正好是一个,MeSH,中的词，,(e.g,Gene Therapy,Science,or,Cell,),，建议期刊检索使用期刊字段标识,ta(,刊名字段,),。否则系统会将其作,MeSH,词进行检索或在所有字段中进行检索。,PubMed数据库-研究生2020-公开课ppt课件,20,molecular biology of the cell,molecular biology of the cell,21,高级检索,支持,基本检索,的规则和技术,查看检索历史,构建检索式,选择检索字段,22,高级检索22,选择字段,检索史,构建检索式,选择检索字段,选择字段检索史构建检索式,选择检索字段,23,主题词检索（,MeSH Database）,PubMed数据库-研究生2020-公开课ppt课件,24,自然语言检索的缺点：,人为的缩小：相同概念的多种说法,人为地扩大：输入的关键字可能命中文章某处，但并非文章重点,自然语言检索的缺点：,25,医学主题词表,（,Medical Subject Heading,，简称,MeSH,）,由于自然语言存在大量的,一词多义、一义多词、单复数变化,等现象，这就给读者查找文献带来了很大困难。,主题词,将自然语言转换成,规范化的人工语言,，,一个语词只表达一个概念，一个概念只用一个词语来表达。,保证,一词输入，多词命中,，提高文献查全率。,MeSH,的主要就是起到规范化作用，保证文献的作者、标引者和检索者在用词上的一致。,目前,28000,多个主题词,部分文献记录不支持,主题词检索,26,医学主题词表（Medical Subject Headi,MeSH,表的树状结构,树状结构表：根据每个主题词的词义范畴和学科属性，将全部主题词分门别类地归入,16,大类，又依次细分多个级别的类目，最多到,11,级）,A Anatomy,解剖学,B Organisms,生物体,C Diseases,疾病,D Chemicals&Drugs,化学物质与药物,E Analytical,诊断治疗技术与设备,F Psychiatry,精神病与心理学,MeSH表的树状结构,27,MeSH,表的树状结构,上、下位主题词,MeSH表的树状结构上、下位主题词,28,SubHeadings,副主题词,对一个主题词的某个方面进行修饰限定的词，又称限定词。提高查准率。,本身无独立检索意义,例如，,hepatitis b,这个主题词涉及到的,病因、病理、诊断、治疗、微生物学,等多个方面。,副主题词与主题词的组配不是随机的，而是有一定规则的。如“诊断”、”治疗“不可与药物、生物等主题词组配，只能组配疾病类主题词。,SubHeadings 副主题词对一个主题词的某个方面进行修,29,使用,MeSH,查询文献的步骤：,1,、将查询需求化为具体的陈述句。,2,、从这个陈述句中，抓出主要概念，作为查询关键字。,3,、将这些关键字分别放到,MeSH Database,中，比对出,最接近、适当,的,MeSH Terms，,选择适合的,副主题词,。,4,、将所找到的,MeSH Terms,，依陈述句中的逻辑，以,AND,OR,NOT,组合成检索策略。,5,、当检索策略完成，点选,Search PubMed,送入,PubMed,查询。,30,使用MeSH查询文献的步骤：30,点击,Mesh Database,按扭，进入主题词检索界面。,输入检索词,点击Mesh Database按扭，进入主题词检索界面。输入,31,主题词检索界面的输入框内输入,liver cancer，,点击,GO,按扭，系统提示,liver cancer,不是,Mesh,词，规范主题词应该是,liver neoplasms。,主题词,主题词检索界面的输入框内输入liver cancer，点击G,32,点击,liver neoplasms，,显示副主题词，可供选择。,可勾选副主题词,点击liver neoplasms，显示副主题词，可供选择。,33,页面下部,主要主题词限定；限制下位词扩检,不进行下位词扩检,限定作为主要主题词匹配,主题词树状结构表,查看上、下位主题词,页面下部主要主题词限定；限制下位词扩检,不进行下位词扩检限,34,用,liver neoplasms,选择副主题词,surgery，,点击,add to search builder,按扭，出现检索策略,点,search PudMed,完成检索。,主题词检索策略,勾选副主题词,用liver neoplasms选择副主题词surgery，,35,检索结束,检索结束,36,期刊检索,输入刊名全称、缩写或国际标准期刊号（,ISSN),检索特定期刊的编目信息；,期刊检索输入刊名全称、缩写或国际标准期刊号（ISSN)检索特,37,PubMed数据库-研究生2020-公开课ppt课件,38,PubMed数据库-研究生2020-公开课ppt课件,39,单篇引文匹配,Single Citation Matcher,单篇引文匹配,40,临床查询,Clinical Queries,临床查询Clinical Queries,41,五、检索结果处理,结果筛选,检索结果的显示与标记,检索结果的保存及发送,PubMed数据库-研究生2020-公开课ppt课件,42,结果显示界面：筛选过滤,时间、可获得性、,类型、年龄、语种,结果显示界面：筛选过滤时间、可获得性、,43,排序方式、显示,格式,每页显示记录数,输出,勾选,结果显示界面,排序方式、显示格式输出勾选结果显示界面,44,Full Text,(,全文的获取,),45,Full Text(全文的获取)45,六、注册，个性化功能：免费,46,加重显示，更方便,六、注册，个性化功能：免费46加重显示，更方便,收藏文献夹,检索历史,自定义结果过滤,47,收藏文献夹47,The end,48,