资源描述
,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,分子生物学考点集锦,各式各样的“组及组学”,各式各样的“体”,各式各样的“子”,以假乱真的把戏,各式各样的“病毒”,一般规则后的例外,形形色色的表观遗传,无处,不在的碱基互补,配对,DNA,复制、转录和翻译之比较,瞄准,“中心法则”的抑制剂,DNA,损伤及其修复,一个基因编码多种蛋白质的秘密,细菌、古菌和真核生物大比较,百花齐放的信号肽,分子生物学考点集锦各式各样的“组及组学”,1,各式各样的“组”与“组学”,名称,定义,研究方法,相关学科,基因组,(genome),一种生物所有的,DNA,,包括基因和非基因序列,大规模,DNA,序列测定和分析,基因组学,外显子组,(exome),一种生物基因组内所有编码蛋白质基因的外显子序列,新一代的,DNA,序列测定和分析,外显子组学,转录组,(transcriptome),一个特定的对象(细胞、组织、器官等)所有转录出来的,mRNA,DNA,芯片或,DNA,微阵列技术,转录组学,蛋白质组,(proteome),一个特定的对象(细胞、组织、器官等)所有翻译出来的蛋白质,二维电泳、质谱、酵母双杂交等,蛋白质组学,代谢组,(metabolome),一个特定的对象(细胞、组织、器官等)所有的代谢小分子,分离:气相层析、,CE,、,HPLC,;检测:质谱、,NMR,代谢组学,互作组,(interactome),一个细胞内蛋白质之间以及蛋白质与其他分子之间相互作用而形成的网络,酵母双杂交、串联亲和层析;,ChIP,互作组学,各式各样的“组”与“组学”名称定义研究方法相关学科基因组(g,2,各式各样的,“,体,”,类型,主要组成,功能,存在,剪接体,5,种,snRNP,,,mRNA,前体,催化真核生物细胞核,mRNA,前体的剪接,真核细胞的细胞核,核糖体,几种,rRNA,,多种核糖体蛋白,翻译的产所,细胞质、叶绿体和线粒体,增强体,组装在增强子上的蛋白质复合物,增强基因的表达效率,一般是真核生物的细胞核,蛋白酶体,由多种蛋白质组装成的桶装复合物,水解发生多聚泛酰化的蛋白质,真核生物和古菌,编辑体,mRNA,,识别编辑、催化编辑的蛋白质,催化,mRNA,的编辑,某些真核生物的细胞核或线粒体,各式各样的“体”类型主要组成功能存在剪接体5种snRNP,m,3,各式各样的“子”,单顺反子(一般是真核生物)和多顺反子(一般是原核生物),内含子(主要是真核生物)与外显子,启动子与终止子(所有生物),操纵子与操作子(原核生物,少数真核生物,如线虫),弱化子或衰减子(原核生物),增强子与沉默子(真核生物),绝缘子(真核生物),各式各样的“子”单顺反子(一般是真核生物)和多顺反子(一般是,4,以假乱真的,把戏,假尿苷(,tRNA,和,rRNA),假基因:两种形式;有的可以真表达,并行使功能,假酶:调节功能,假底物:临时与酶活性中心结合,抑制酶活性,假,节结构,(RNA,的一种三级结构模体),以假乱真的把戏假尿苷(tRNA和rRNA),5,各式各样的,“病毒”,RNA,病毒(,HIV,、,HAV,、,HCV,、,埃博拉,病毒、塞卡病毒及流感病毒),DNA,病毒(,HPV,、,HBV,和,SV40,),朊,病毒(疯牛病、羊搔痒病、克雅氏病、库鲁病):错误折叠,的,具有感染性的蛋白质,类病毒:为共价闭环的单链,RNA,分子,具有酶活性,只感染植物细胞,拟病毒(卫星病毒或类类病毒):单独不能感染宿主细胞;一般是为共价闭环的单链,RNA,分子,少数是,DNA,;一般感染植物细胞,少数感染动物细胞(如,HDV,),巨型病毒:基因组的大小和基因的数目远远超过的一般病毒,如拟菌病毒和潘多拉病毒等,各式各样的“病毒”RNA病毒(HIV、HAV、HCV、埃博拉,6,一般规则后的例外,细菌一般有细胞壁,但支原体没有,细菌细胞膜一般没有胆固醇,但支原体有,原核细胞基因组,DNA,一般只有一个,但霍乱弧菌和耐辐射菌却不止一个;原核基因组,DNA,一般是环状,但有些放线菌却含有线状基因组,DNA,酶通常是蛋白质,但有核酶,DNA,一般没有,U,只有,T,,但枯草杆菌的一种噬菌体只有,U,,没有,T,操纵子一般存在于原核生物,但线虫也有操纵子,遗传密码是通用的,但线粒体内有例外,质粒一般是,DNA,,但有,RNA,质粒,质粒,DNA,一般是环状,但有线状质粒,质粒一般存在于原核生物,但有些真核生物甚至线粒体内也有,线粒体,DNA,一般是环状,但某些生物线粒体,DNA,却是线状,动物细胞一般有中心体,但一些低等动物没有;植物细胞一般没有中心体,但一些低等植物有中心体,一般规则后的例外细菌一般有细胞壁,但支原体没有,7,形形色色的表观遗传,组蛋白化学修饰(,乙酰化,、单,、双或,三甲,基化、泛酰化、小泛素相关修饰物,修饰、,磷酸化、,瓜氨酸化,、,生物,素化和,ADP-,核糖基化,),产生的组蛋白密码对基因表达的影响,在,DNA,分子,CpG,岛上的,C,进行的甲基化修饰产生的第五个碱基对基因表达的影响;,A,的甲基化(第六个碱基)对基因表达对影响,干扰,RNA,介导的基因沉默,雌性哺乳动物体内由,Xist RNA,介导的一条,X,染色体的转录失活,形形色色的表观遗传组蛋白化学修饰(乙酰化、单、双或三甲基化、,8,组蛋白的不同,化学,修饰,除了瓜氨酸化以外,其他共价修饰都是可逆的。一个组蛋白密码从写入、到阅读、再到擦除,共涉及到三类不同的蛋白质:第一类是将乙酰基、甲基或其他化学标识写入组蛋白分子上的“写入器”(,writer,),即修饰酶;第二类是识别并结合一种组蛋白分子上被写入的化学标识的“阅读器”(,reader,);第三类是去除组蛋白上被写入的各种化学标识的“擦除器”(,eraser,),即去修饰酶。构成核小体组蛋白八聚体核心的每一个组蛋白分子都有一个柔性的,N-,端尾巴,此尾巴从核小体的表面伸出,成为各种写入器写入的主要位点。此外,组蛋白位于核小体内部的结构域也可能发生某种化学修饰。,组蛋白的不同化学修饰除了瓜氨酸化以外,其他共价修饰都是可逆的,9,miRNA,和,siRNA,的产生和作用机制,miRNA和siRNA的产生和作用机制,10,无处不在的碱基互补配对,RNA,和,DNA,分子之中各种形式的双螺旋,DNA,复制、,DNA,转录、,RNA,复制、逆转录,真核细胞内依赖于,snRNA,的,mRNA,剪接,真核细胞内依赖于,snoRNA,的,rRNA,的转录后修饰,锥体,虫线粒体内依赖于,gRNA,的,mRNA,编辑,细菌细胞内翻译起始阶段依赖于,SD,序列的起始密码子的识别,翻译过程中密码子和反密码子的相互作用,真核细胞内由,RNAi(microRNA,和,siRNA),介,导的基因沉默,Southern,印迹、,Northern,印迹、,DNA,芯片、荧光,原位杂交(,fluorescent in situ hybridization,,,FISH,)、,R,环技术,和,Cas9,基因组编辑,等,无处不在的碱基互补配对RNA和DNA分子之中各种形式的双螺旋,11,DNA,复制、转录和翻译之比较,DNA复制、转录和翻译之比较,12,瞄准“中心法则”的抑制剂,瞄准“中心法则”的抑制剂,13,DNA,损伤的因素和损伤的主要类型,损伤类型,实例,/,原因,碱基丢失,自发脱碱基(热、酸),脱嘌呤,脱嘧啶,,10,4,嘌呤脱落,/,天,/,细胞(恒温动物),碱基修饰,形成碱基加合物,例如,,8-,羟基脱氧鸟嘌呤(离子辐射或活性氧),,6-,烷基鸟嘌呤(烷基化试剂),碱基交联,嘧啶二聚体和,6-4,光产物(,UV,),碱基转换,CU,,,AI,(自发脱氨基),,100,碱基脱氨基,/,天,/,细胞,碱基错配,GT,(,4,种,dNTP,浓度不平衡、碱基的互变异构或碱基之间的差别不足),DNA,链断裂,因磷酸二酯键被破坏引起单链断裂或双链断裂(离子辐射或特殊的化学试剂),因脱氧核糖环,3,号位发生断裂引起的,DNA,链断裂(博来霉素),DNA,链间交联,互补双链之间产生交联(双功能试剂的作用),DNA,与蛋白,质的交联,UV,;甲醛,DNA损伤的因素和损伤的主要类型损伤类型实例/原因碱基丢失自,14,DNA,损伤修复的几种机制比较,修复机制,直接修复,切除修复,错配修复,损伤跨越,修复的损伤,嘧啶二聚体、烷基化碱基、裂口为,3-OH,和,5-,磷酸等,DNA,链断裂,BER,针对损伤等碱基;,NER,真对导致双螺旋变形或扭曲的损伤,DNA,复制过程中形成的错配碱基对和小的,Indel,影响到正常复制到损伤,涉及到的酶,光复活酶(胎盘类哺乳动物缺乏);甲基转移酶(自杀性催化);,DNA,连接酶,DNA,糖苷酶、,AP,内切酶、外切酶、,DNA,聚合酶和连接酶;,DNA,内切酶和解链酶、,DNA,聚合酶和连接酶,特殊的核苷酸切除修复;需要识别新链和老链,大肠杆菌根据甲基化进行识别,一般由低进行性、无校对活性和任性的,DNA,聚合酶对损伤的区域进行易错合成;也有高保真低进行性的,DNA,聚合酶进行无错复制,存在,光复活酶除了胎盘类哺乳动物缺乏;所有生物,所有生物,所有生物,所有生物,DNA损伤修复的几种机制比较修复机制直接修复切除修复错配修复,15,大肠杆菌的,SOS,反应,大肠杆菌的SOS反应,16,一个基因编码多种,蛋白质或多肽的秘密,DNA,重排(如抗体和,T,细胞受体多样性的产生),启动子的选择性使用,选择性剪接,选择性加尾,编辑,翻译过程中起始密码子的选择性使用,翻译水平的移框、通读和跳跃翻译,不同多肽或蛋白质从同一个蛋白质前体中的剪切释放,一个基因编码多种蛋白质或多肽的秘密DNA重排(如抗体和T细胞,17,细菌、古菌和真核生物大比较,细菌、古菌和真核生物大比较,18,“百花齐放”的信号肽,“百花齐放”的信号肽,19,1.,一,个冈崎片段具有的结构是:,短,的,DNA,链,B.5-,端为,DNA,,,3-,端为,RNA,C,.5-,端为,RNA,,,3-,端为,DNA,D,.,短的,RNA,链,E.,以上都,不是,2.,大肠杆菌,DNA,复制需要:,DNA,聚合酶,I,和,III,B.RNA,聚合酶,C.DNA,解链酶,D.,依赖,于,ATP,的,DNA,连接酶,E.,端聚,酶,3.,大肠杆菌的,DNA,聚合酶,I,若,遇到,以下一段含有缺口的,DNA,,将催化的反应是,:,A.,先合成一个与,C4,相连的,G,,然后再依次合成与,1310,互补的碱基,最终导致缺口被填补,B.,先合成一个与,C10,相连的,G,,然后再依次合成与,1114,互补的碱基,最终导致缺口被填补,C.,先合成一个与,C4,相连的,G,,然后再依次合成与,1310,互补的碱基,但在新合成链与,C3,之间留下一个缺口,D.,先合成一个与,C10,相连的,G,,然后再依次合成与,1114,互补的碱基,但在新合成链与,C4,之间留下一个缺口,E.,先切除,C3,和,C2,,再依次合成与,814,互补的碱基,但最后在新合成链与,C4,之间留下一个缺口,1.一个冈崎片段具有的结构是:,20,4.DNA,聚合酶,III,比,I,更适合复制大肠杆菌染色体,DNA,的原因是:,A.DNA,聚合酶,III,是一种寡聚酶,B.,细胞内的,DNA,聚合酶,III,分子数目多,C.DNA,聚合酶,III,具有校对的功能,D.DNA,聚合酶,III,的进行性高,E.DNA,聚合酶,III,不需要,引物,5.,具有,端聚酶活性的细胞是:,A.,大肠杆菌,B.,红细胞,C.,神经细胞,D.,草履虫,E,.,枯草杆菌,6.,不能,作为四膜虫,rRNA,前体自我剪接的辅助因子是:,A.GMP B.GTP C.GDP D.3,5-cGMP E
展开阅读全文