结核分枝杆菌的核酸检测--课件

,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,PPT课件,*,结核分枝杆菌核酸及,血清学检测,检验科,1,PPT课件,结核分枝杆菌核酸检测是检测结核分枝杆菌特异的核酸序列；,阳性结果提示该检测结核分枝杆菌核酸的存在，在排除核酸污染的情况下，可确定该检测标本中存在结核分枝杆菌。,结核分枝杆菌核酸检测较常采用的目的片段有,16SrRNA,、,IS6110,、,MBP64,、,rpoB,、,hsp65,等,2,PPT课件,结核分枝杆菌核酸检测,增加分子生物学阳性可以作为确诊标准，及强调病原学检查的重要性。,3.4.2,分子生物学检查,结核分枝杆菌核酸检测阳性。,4,诊断原则,肺结核的诊断是以病原学（包括细菌学、分子生物学）检查为主，结合流行病史、临床表现、胸部影像、相关的辅助检查及鉴别诊断等，进行综合分析做出诊断。以病原学、病理学结果作为确诊依据。,5.3,确诊病例,结核分枝杆菌核酸检测阳性，及胸部影像学检查支持即可确诊。,3,PPT课件,常用技术,传统实时荧光定量,PCR,检测,半巢式全自动实时荧光定量,PCR,检测,环介导等温扩增检测,实时荧光核酸恒温扩增检测,交叉引物恒温扩增检测,基因探针检测,4,PPT课件,抗酸染色,每张检查,3-5min,或更长时间,阳性率低,因素之一,荧光染色,1.,阳性率,30%,2.,无法区分,TB,or NTB,1.,假阳性率高,2.,结合抗酸染色,5,PPT课件,结核菌需要先培养出来（,2-6,周,）,再加入不同浓度抗菌药物的培养基中继续培养,4-8,周,报告药敏结果,6,PPT课件,2014,年,WHO,关于结核诊断的标准,肺结核,所有患者，包括儿童，当疑似肺结核并可咳痰时，应送,2,份痰做涂片镜检 或,1,份痰做,Xpert MTB/RIF,检测,对于涂阴疑似肺结核患者，应当使用,Xpert MTB/RIF,或培养 进行诊断,耐药结核,当患者具有耐药结核的风险，或者合并,HIV,感染，或者病情严重时，应使用,Xpert MTB/RIF,做初始诊断；,肺外结核,所有患者，包括儿童，怀疑有肺外结核时，应当采集相应的样本进行微生物学和组织学检查；优先推荐使用,Xpert MTB/RIF,做初始诊断,7,PPT课件,GeneXpert,Xpert,MTB/RIF,一种半巢式实时荧光,PCR,体外诊断技术，可以检测结核分枝杆菌以及利福平耐药性；,针对,rpoB,基因,81bp,利福平耐药核心区间（,RRDR,）设计引物、探针。,5,个探针结合到野生型，而不是突变体目标。每个探针用不同的荧光染料标记，允许同时检测。,8,PPT课件,痰标本与处理液,1,：,2,混合,吸取,2ml,处理样品,到反应盒,将反应盒放入检测模块（手工操作完成）,标本自动,清洗过滤,超声裂解,DNA,提纯,DNA,和,PCR,反应试剂混合,半巢式实时荧光定量核酸扩增检测,打印检测报告,获得检测结果时间：,1,小时,50,分钟,系统内自动完成,9,PPT课件,INH,单耐药的患者通常不会考虑立即改变治疗方案，与此相反，对,RIF,单耐药的患者，无论,INH,是否耐药，都会采取与耐多药患者相同的治疗方,案,1,。,约,90%,利福平耐药的结核患者同时异烟肼耐药，也就是耐多药结核患,者,2,。,Sven,O.Friedrich et al,.Suitability of,Xpert,MTB/RIF and Genotype,MTBDRplus,for Patient Selection for a Tuberculosis Clinical Trial.Journal of Clinical Microbiology.2011(49):2827-2831,.,Xichao,Ou,et al.A feasibility study of,Xpert,MTB/RIF test at the peripheral level laboratory in China.International Journal of Infectious Diseases.2015(31):41-46,.,MTB/,RIF,检测对,MDR-TB,的防控,“,结核,+,利福平耐药,”,对多耐结核控制产生的效果最为显著。即便补充异烟肼耐药，能提升的效果有,限,。,10,PPT课件,环介导等温扩增仪（,TB-LAMP,）,体外定性检测结核分枝杆菌复合群；,在恒温条件下进行基因扩增反应；,4,种引物识别,6,个区域，特异性高；,扩增反应效率高，,67,，,40min,。,主要优点在于对实验室仪器的依赖程度较小，而且试剂成本较低,。,11,PPT课件,传统实时荧光定量,PCR,检测,目的：,定量,检测人标本中的结核分枝杆菌核酸,原理：,PCR,反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号累计实时监测整个,PCR,进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的办法。,12,PPT课件,Xpert,MTB/RIF,TB-LAMP,结核杆菌,DNA,目的基因片段,rpoB,gryB,及,IS6110,IS6110,方法,半巢式实时荧光,PCR,环介导恒温扩增,实时荧光定量,PCR,时间,2,小时,1,小时,2.5,小时,检测敏感度,131,菌条,/ml,100,菌条,/ml,1000,10000,菌,条,/ml,优点,全自动、同时检测利福平耐药基因、特异性高，生物安全性高,67,恒温扩增，扩增时间短，特异性高，生物安全性高,适合大批量筛查，低费用,缺点,最多一次同时检测八个样本,标本用量较少，除痰标本以外的标本需进一步认证,假阳性，易污染，需专业人员操作,13,PPT课件,样本类型（一）,抗酸杆菌涂片镜检：,痰液、支气管灌洗液、支气管抽吸物、肺穿刺物、肺活检标本、胃灌洗液、体液、组织、脓肿物、吸出的脓液、创伤标本、大便标本,分枝杆菌分离培养：,痰液、支气管灌洗液、支气管抽吸物、肺穿刺物、肺活检标本、胃灌洗液、体液、组织、脓肿物、吸出的脓液、创伤标本、大便标本、,血液,结核分枝杆菌的核酸检测：,痰液、支气管灌洗液、支气管抽吸物、肺穿刺物、肺活检标本、胃灌洗液、体液、组织、脓肿物、吸出的脓液、创伤标本、大便标本、,血液（,GeneXpert,除外）、病理切片,14,PPT课件,样本类型（二）,分枝杆菌菌种鉴定,临床分枝杆菌分离培养物,结核分枝杆菌药物敏感性试验,：,临床分离结核杆菌纯培养物,结核抗体的检测：,血清,IFN-,释放试验（,T-SPOT.TB,）,：,肝素锂或肝素钠抗凝血,15,PPT课件,标本留取标准,1.,痰标本：,（,1,）可疑肺结核患者：初诊病人应收集,3,份标本（当日即时、夜间和次日晨痰），治疗中或随访病人应按期留取,2,份痰标本（晨痰、夜间痰），体积,3,5ml,，盛于广口和具有螺旋盖子的痰瓶中。,（,2,）即时痰采集后立即送检，夜间痰和晨痰采集后常温保存不应超过,12,小时，对当日不能进行涂片检查的标本，须置于,4,冰箱保存，注意防止痰液干涸或污染。,（,3,）对无法咳痰的患者：可使用高渗盐水（,3%NaCl,）诱导痰或收集清晨胃液标本，或使用支气管镜采集支气管灌洗液标本。,16,PPT课件,2,支气管抽吸物、支气管肺泡灌洗标本、肺穿刺物、肺活检标本,（,1,）对于不能留取痰标本的患者：推荐使用侵入性采集技术获取标本，比如纤维支气管镜检查、细针肺穿刺、肺活组织检查。,（,2,）严格器械清洁和消毒，避免引起交叉污染和感染。,（,3,）支气管镜不能接触自来水，通免污染环境分枝杆菌。,（,4,）对难以诊断的病例推荐使用其他侵入性技术采集标本，比如细针穿刺、开放肺活组织检查，无菌条件下采集的经支气管活检和其他活检标本，运输过程中，应加入,0.5,1ml,无菌的生理盐水。,（,5,）支气管分泌物至少,2,5ml,；支气管肺泡灌洗液至少,20-50ml,。,17,PPT课件,3.,胃灌洗液,（,1,）婴幼儿、儿童和迟钝者诊断肺结核时，鉴于无法采集标本或支气管灌洗液，推荐采集胃液标本，通过胃灌洗咽下去的痰液。,（,2,）标本应在采集,4,小时内送到实验室，否则应置于一次性内含,100ml,碳酸钠酸他的无菌容器中。,（,3),胃灌洗液需连续采集,3,天，体积,5,10ml,，调节,pH,至中性。,4.,尿液,（,1,）采集标本前，应清洗外生殖器，推荐连续采集,3,天清晨中段尿于无菌容器中，用于培养的尿液标本至少需要,40ml,（,2,）只有在不能获得中段尿时，可以使用导尿术采集标本。,（,3,）标本运送不及时，应冷藏保存。,18,PPT课件,5.,无菌采集的体液（脑脊液、胸水、腹水、心包积液、关节液、骨髓）,（,1,）临床医生采用抽吸技术或外科操作无菌收集体液标本于无菌容器。,结核杆菌,DNA,及,Xpert,标本：为防止标本凝固，需加入,EDTA,抗凝处理（可注入于长紫管中颠倒混匀抗凝处理）。,IFN-,释放试验（,T-SPOT.TB,）标本：分离淋巴细胞需加入肝素抗凝，抗凝比例为,100ml,胸腹水加入,0.8ml,肝素，颠倒混匀。,（,2,）标本尽可能快的运送到实验室,（,3,）应提交足够量的样本，脑脊液,5ml,，胸水和腹水,5,10ml,。,19,PPT课件,6,无菌采集的组织（淋巴结、皮肤和其他活检标本）,（,1,）采集标本尽可能无菌操作，放置到无固定剂或防腐剂的无菌容器中，不能浸泡在盐水或其他液体或用纱布包裹，重量不少于,1g,。应迅速运送到实验室，对于长时间的运输，为防止脱水可加入无菌盐水，保持温度在,4,15,（,2,）针对皮肤溃疡，宜从病变组织周边采集活检标本。,（,3,）,福尔马林溶液浸泡过的标本不能用于培养检查。,（,4,）极少量的活检标本可以浸泡在少量无菌盐溶液中。,20,PPT课件,7.,血液,（,1,）如果血液标本接种培养基之前需要运输，肝素成柠檬酸盐可以用于抗凝。,EDTA,抗凝和凝固的血不能做培养。,（,2,）血液和脑脊液标本培养推使且,MYCO,FLYTIC,瓶（,BD,）血培养瓶。（暂时不做）,8.,大便标本,大便标本涂片的敏感性只有,32,34,，不能根据涂片的结果决定是否进行培养。,21,PPT课件,9,、病理组织切片（核酸检测）,在一只干净的离心管中加入,6-12,片,5-10m,厚的,FFPE,，,勿切白片。,病理组织切片已固定，结核分枝杆菌已无活性，无法做培养。,22,PPT课件,DNA,扩增技术检测有哪些不足,相比,DNA,检测技术，,RNA,检测更适合判断病原体转录活性，,DNA,检测技术不能判断病原体转录活性，不能区分潜伏感染和活动性感染（活动性感染：指示,RNA,转录活跃，潜伏感染：指示,RNA,不转录）,交叉污染问题,变温检测，对仪器要求高,抑制反应（,Taq,酶）,23,PPT课件,免疫斑点干扰素释放试验,结核菌感染的免疫应答反应主要是细胞介导免疫反应；,T-SPOT.TB,定量检测人外周抗凝全血中受结核杆菌特异混合多肽抗原（,ESAT-6,和,CFP-10,）刺激分泌细胞因子干扰素的效应,T,淋巴细胞数量。,结核特异性抗原,ESAT-6,和,CFP-10,由结核杆菌基因组,RD1,区相同的操纵子编码的蛋白；,所以的卡介苗菌株均丢失该基因序列,绝大多数环境分枝杆菌也不存在,RD1,区,24,PPT课件,标本采集：肝素或柠檬酸钠抗凝的外周静脉血,分离单个核细胞，每个检测孔含有,25,万,个细胞。每个检测标本分,4,个孔：空白对照，阳性对照，两个样本孔,37,孵育,16-20,个小时,洗涤,-,抗体孵育,1h-,洗涤,-,显色,-,计数蓝色斑点,阴性结果：患者体内不存在结核杆菌特异的效应,T,细胞；排除结核感染（包括排除肺外结核感染）,阳性结果：患者存在结核感染，但是不能区别是否为活动性结核病。,25,PPT课件,