pubmed文献检索

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单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,PubMed,-,网上,MEDLINE,检索,基本情况,检索,方法,结果处理,基本情况,PubMed,简介,PubMed,系统是由美国国立生物技术信息中心(,NCBI,)开发的用于检索,MEDLINE,数据库的网上检索系统。,进入,PubMed,的方法,Http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed,数据来源,MEDLINE,In Process Citations,Publisher-Supplied Citations,Medline,收录文献起止时,间,1948,年,以来,医学、护理、牙科、兽医、卫生保健、基础医学,70,多个国家和地区的,5000,多种生物期刊,在线图书,书目文摘条,目,2000,万条,In Process,1998,年开始建立,是一个临时性医学文献数据库,收录由出版商提供的尚未经过规范化处理的新数据,提供简单的书目信息和文摘,数据每周转入,MEDLINE,一次,有,in process,的标记,Publisher-Supplied Citations,由出版商提供的电子文献记录,不属于,MEDLINE,收录范围的,标记为,:PubMed,或,PubMed as supplied by publisher,出版商提供的先于印刷版文献出现的网络版题录,Epub ahead of print,检索方法,基本检索功能,Limits,检索功能,高级检索功能,主题词数据库检索功能,其他检索功能,基本检索功能,自动词语匹配功能,强制检索功能,截词检索,布尔检索,字段检索,自动词语匹配功能,自动词语匹配是,PubMed,最具特色的检索功能之一,,PubMed,会自动对输入的检索词进行分析、匹配、转换并检索,是一种智能化的检索过程。,自动词语匹配基本原理,对输入的检索词,系统首先在多个索引词表,MeSH,转换表,刊名转换表,著者索引及转换表,进行搜索、比对,并自动转换为相应的,MeSH,主题词、著者或刊名,自动词语匹配基本原理,再将检索词在,all fields,(所有字段)中检索,并执行“,OR”,布尔逻辑运算。,如果输入多个检索词或短语词组,系统会继续将其拆分为单词后分别在,all fields,(所有字段)中检索,单词之间的布尔逻辑关系为“,AND”,。,如果在,3,个转换表中都没有,把词组分开重复进行自动匹配直到找到匹配词为止。,如果还没有找到匹配词系统将把单个词用逻辑”与”组配并到所有字段中检索。,single cell,(single personMeSH Terms OR (singleAll Fields AND personAll Fields) OR single personAll Fields OR singleAll Fields) AND (cellAll Fields OR cellsMeSH Terms OR cellsAll Fields),强制检索功能,如果将短语作为一个词组进行检索,可用“”将其引起来。系统不进行自动词语匹配的转换,系统不能进行扩展检索,“,single cell” single-cell single cellti,截词检索,截词符“*”可代表多个,字符,PubMed,一次最多可以检索出,600,个词形变异词。,截词功能只限于单词,对词组无效,布尔检索,布尔运算符,AND,,,OR,,,NOT,必须大写,从左至右进行布尔运算,以通过加圆括符改变运算顺序,检索词后附加字段标识,字段标识要用方括号括起来,位于检索词之后,例如,dna mh AND crick au AND 1993 dp ,字段限,定检索,字段标识,字段名称,简要说明,AD,Affiliation,第一责任者的工作单位、地址,合同号,ALL,All Fields,全字段,AU,Author Name,著者姓名,IP,Issue,期刊的期号,TA,Journal Title,期刊名称或,ISSN,号,LA,Language,语言文种,MAJR,MeSH Major Topic,主要,MeSH,主题词,MH,MeSH Terms,全部,MeSH,主题词,PG,Page Number,期刊页码,DP,Publication Date,文献出版日期,PT,Publication Type,文献类型包括综述、临床试验、通信等,TW,Text Words,题名词和文摘词,TI,Title words,题名词,VI,Volume,期刊卷号,Limits,限定,检,索功能,出版日期,出版类型,语种,研究对象,限制检索子集,年龄,性别,可以对全文、文摘限制检索,可以限制检索字段,练习,查找,1997-2000,高血压(,hypertension,)与鼻出血(,nosebleed,)的有关文献,高级检索,(advanced search),检索栏 search box,检索编辑器 search builder,检索史 history,更多资源,more resources,检索细节 details,检索编辑器,search builder,查找微量元素铜、铁、锌与白血病的文献,Copper,Iron,Zinc,leukemia,Mesh,Database,检索,浏览,Mesh,词表,选择规范化主题词,选择副主题词,查看主题词注释,浏览树状结构表,建立检索式,利用,MeSH,主题词检索有关艾滋,病的,文献,MeSH,主题词检索是,PubMed,最具特色的检索功,能之一,能保证较好的查全率和查准率。这是因为:,(,1,)主题词对同一概念的不同表达方式进行了规范。,(,2,)主题词可以组配相应的副主题词,使检索结果更加专指。,(,3,)用主题词的树状结构表,可以很方便进行主题词的扩展检索(,Explode,)。默认状态下,系统自动对含有下位概念的主题词进行扩展检索,点选,Do Not Explode this term,则不进行主题词扩检。,4,)应用,MeSH,主题词的,Major Topic,(主要主题词)检索:,可以使检索结果更加准确。,点选,Restrictions Search to Major Topic headings only,,,限定检索结果为主要主题词。,建立检索式,如果有多个主题词,,可以先分别对每个主题词进行检索,,再在高级检索的,Search History,中用检索序号进行布尔逻辑运算;,也可以通过主题词检索页面,的,PubMed search,直,接建立检索式,膝关节滑囊炎的,诊断,要求膝关节为主要主题词,其他检索功能,特定文献检索,点击,single citation matcher,或,batch citation matcher,按界面提示输入所知信息,点击,search,Clinical Queries,临床咨询,研究范畴,:,一般疾病的,病因学、预后、诊断、预防以及,治疗,Finding Systematic Reviews,:提供系统评价、,meta,分析、临床试验综述临床指南等循证医学文献信息的查找,Medical Genetics Searches,检索结果的处理,显示,保存与输出,显示,默认格式,显示设置,保存与输出,其他工具,MY NCBI,SAVE HISTORY,小结,1,、,PubMed,基本检索提供的自动词语匹配功能一般适合检索经验有限的初级用户,也适合对课题做初步检索,大致了解检索结果的分布情况。因为自动词语匹配检索有较好的查全率,但因为自动进行词语拆分,查准率有时不能令人满意。,2. PubMed,的主题词检索是其最具特色的功能之一,能保证较好的查准率及查准率。主题词组配副主题词使检索结果更为专指,限定在主要主题词检索能使结果更准确。,3.,但是主题词检索也有一些固有的缺陷,比如很多专指的概念没有相应的主题词,一些新出现的概念要几年后才收录为主题词这种情况下,不宜采用主题词检索,采用字段限定检索等方法也能得到较好的查准率。此外,主题词检索还可能会漏掉一些最新的文献(,in process citations,),这也是需要注意的。,4.,熟练运用,PubMed,限定功能,和临床查询、引文匹配等工具能大大提高检索效率。,作业,1,查找有关活体供(,Living donor,)肝移植(,liver transplantation,)的有关信息,要求查找,2005,年以来的临床试验,并且用英文发表的文献,2.,用,Mesh database,检索主要内容为前列腺癌,(prostate cancer),的文献。将检索的结果的题录和文摘存储到本地硬盘中。,3,查找涉及儿童骨肉瘤,(,osteosarcoma,)手术后使用顺铂,(,cisplatin,),进行化疗的文献,要求骨肉瘤作为主要研究内容。选择部分文献通过,e-mail,发送到个人信箱中。,4,检索有关更昔洛韦(,Ganciclovir,)用于预防与治疗器官移植(,Organ Transplantation,)后巨细胞病毒感染(,Cytomegalovirus Infection,)的文献。使用基本检索、,Mesh,主题词检索和字段限制检索(将检索词限制到标题字段),比较三种检索的结果。评价这三种检索的检索效率。,
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