转座子类型

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,6/8/2013,#,转座子,1,、,转座子的基本概念,2,、,转座子的转座特征,3,、,转座子的类型,4,、,转座子的转座机制,5,、,转座引起的遗传效应,1,、转座子,的基本概念,转座子,（,transposon,简称,Tn,）,又称易位子，是指存在于染色体,DNA,上可以自主复制和位移的一段,DNA,序列,。,BACK,2,、转座子的转座特征,（,1,）,基因组内移动,；,（,2,）,不依赖于供体与受体间的序列关系,；,（,3,）,一般仅移动转座子序列本身。,BACK,3,、转座子,的类型,3.1,简单,转座子（插入序列,）,Simple,transposon,（,insertion sequence,）,结构特征,和,转座特点,3.2,复合转座子,(,Composite transposon,),结构,特征,和,转座,特点,3.3,类插入序列,（,IS-like elements,）,3.4,TnA,家族,BACK,插入序列的结构特征,（,1,）含短的末端,反向重复序列,，,且每条链上的反向重复序列可以相互配对形成茎环结构,;,（,2,）含编码转座酶的,基因（其突变将导致不能转座）,;,（,3,）在转座子两外侧的靶,DNA,中存在,5-9 bp,的短正向重复序列,。,正向重复序列的形成,过程,转座酶,DNA,聚合酶和连接酶,插入序列的转座特点,作为一个整体进行转座。,复合转座子,由,两个重复序列夹着一个或多个结构基因如某些抗药性基因和其它基因组,成,，其,两端的组件由,IS,和类,IS,组成,。,转座因子,长度,(bp),遗传标记,末端组件,方向,二组件的关系,组件的功能,Tn903,3100,Kan,R,IS903,反向,相同,二者皆有功能,Tn9,2500,Cam,R,IS 1,正向,推测相同,预计有功能,Tn10,9300,Tet,R,IS 10R,有功能,IS 10L,反向,有,2.5%,的差异,无功能,Tn5,5700,Kan,R,IS 50R,有功能,IS 50L,反向,1 bp,的改变,无功能,复合转座子的结构特征,(1),中间区域含编码转座酶以外的,标记基因,；,(2),两端具有插入序列；,(3),两末端是反向重复序列；,(4),靶位点存在短正向重复序列。,复合,转座子的转座特点,可以作为一个整体进行转座；,含有的一个或两个,IS,元件也可进行单独转座。,类插入序列,指,IS10R,，,IR50R,和,IS903,，它们的结构和,IS,相似，但不独立存在。而是作为复合转座子,（,compositetransposons,）,两臂的组件。,TnA,家族,长,约,5kb,左右，两端具有,IR,，而不是,IS,，中部的编码区不仅编码抗性标记，还编码转座酶和,解离酶的,DNA,序列。,4,、转座子的转座机制,所有转座子的共同机制：,在,靶,DNA,上造成交错切口，转座子与,突出的末端,相连，填补缺口。,据转座子的移动机制，可分为,：,复制型转座,（,replicative transposition,）,非复制型转座,（,nonreplicative transposition,）,保守型转座,（,conservative transposition,）,BACK,转座子,靶质粒,第一步,切口,DNA,第二步,连接自由末端,第三步,转座子复制,第四步,完成,复制,=,第五步,Res,位点两侧重组,第六步,Tn3,的复制式转座,Nonreplicative transposition,Conservative transposition,供体保持裂缺。不形成共合体。,5,、转座引起的,遗传效应,（,1,）引起插入突变,（,2,）产生新的基因,（,3,）引起生物进化,（,4,）引起,染色体畸变,注：,转座引起,DNA,重排（,Rearrangement,),转座子多个拷贝之间的同源重组引起宿主,DNA,的重排；,转座子重复序列间的同源重组导致精确或不精确切除。,真核生物的,转座子,物种,II,类转座因子家族,ITR,TSD,果蝇,P,Hobo,Mariner,FB,31,12,28,大,8,8,2,9,线虫,Tc1,54,2,玉米,Ac/Ds,Spm/dsom,Mu/mn,10/11,13,200,8,3,9,金鱼草,Tam1,Tam3,13/14,12,3,8/5,一些真核生物,TU/puppy,大,8,反转录病毒的反转录转座子,含有,LTR,的反转录转座子,非,LTR,的反转录转座子,Thank you!,