第四章：病毒的命名和分类

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,第四章 病毒的分类与命名,一、病毒的分类,（一）病毒分类的发展历程,1937年：,Levadifi,&,Leptin,根据病毒对组织的亲和性进行分类；,1948年：,Holmes,提出根据病毒感染引起的症状来分类；,1950年：国际微生物学会提出分类的八项原则；,1953年：,Andremes,提出按病毒的理化特性来分；,1963年：国际微生物命名委员会病毒学分会提出新的八项分类原则；,1966年成立国际病毒命名委员会（,international committee on nomenclature of virus, ICNV,）；1971年发表第一份报告：500多种病毒分成43个病毒属（组）；,1973年更名为国际病毒分类委员会（,international committee on taxonomy of virus, ICTV,）；,最新的病毒分类报告：第六次报告（ 1995年）,现在已知的病毒有,3600,多种，它们分别属于,71,个病毒科;,其中动物病毒（包括脊椎动物病毒和无椎脊动物病毒）有,2000,余种，分属,27,个病毒科;,（二）分类依据,1病毒的形态学特征,病毒粒子的大小和形状；,有无表面纤突和纤突的特征；,有无囊膜；,衣壳对称型和结构；,2理化学特性,病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系数；,对酸碱的稳定性；,对热的稳定性；,对两价阳离子的稳定性；,对去污剂的稳定性；,对脂溶剂的稳定性；对辐射的稳定性。,3基因组,核酸类型：,DNA,或,RNA,基因组大小；线状还是环状；,单股还是双股,是整个的还是分节段的，节段的大小和数目,4.基因组的复制策略、开放阅读框架的数目和位置、转录特征、翻译特征、翻译后加工特征。,5蛋白质,结构蛋白的数目、大小和功能活性，非结构蛋白的数目、大小和功能活性，蛋白质的特殊功能活性（转录酶、反转录酶、血凝素、神经氨酸酶）,6脂质、糖类含量和特性,7在细胞培养中的生长特性,对细胞种类的特异性；,病毒蛋白的聚集场所；,病毒粒子的装配场所；,病毒粒子成熟和释放的部位和性质。,8抗原性,与其他相关病毒的血清学关系,9生物学特性,自然宿主范围、传播方式、传播介体，地理分布、致病性及与疾病的关系；,组织嗜性和组织病理学。,二病毒的命名规则,（一）一般规则：,1,病毒的分类和命名应是国际性的，应普遍适用于所有病毒;,2,. 通用的病毒分类系统采用,目、科、亚科、属和种的等级制度,，在种的命名尚不完善的情况下，许多病毒可用国际通用的俗名。,3,ICTV,不统一规定病毒种以下的分类和命名。关于血清型、基因型、病毒株、变异株等的命名由公认的国际专家组决定。,4对人工产生的病毒和实验室杂交株不予分类考虑，这些病毒的命名也同样由公认的国际专家组决定。,5当代表成员病毒经过充分鉴定并在发表的文献上描述后，才能建立一个类，以便与相似的类区别。同样，命名一个病毒时，该病毒必须经过充分鉴定并在文献上发表以明确区别于相似的病毒,（二）关于类和病毒的命名原则,6,现有的类和病毒的名称无论是否适用均应予保留。,7在类和病毒的命名中不遵守优先率。,8不使用人名。,9类和病毒的名称应便于使用，容易记忆，最好使用听起来悦耳的名称。,10不使用上标、下标、连字符、斜杠和希腊字母。,11新名称不应与已通过的名称有重复，应选用与正在使用的或过去使用的名称不相近的名称。,12如果缩拼词对病毒学家有意义，且得到公认的国际专家组的推荐，可以接受作为类的名称。,关于类和病毒的命名原则,13由一个类或病毒的名称所,隐含的任何意义,都会因在名称中涉及不是所有成员或潜在成员所具有的特征，以及不是均等地适用于不同类的特征而排斥该类中的合适成员病毒，,这种情况应当避免。,14新名的选用应考虑国家或民族敏感性问题。应采用那些被病毒学家在科学杂志上发表的工作中常用的名称及衍生名称作为命名的基础，此时可不必考虑国家来源；在有一个以上的候选名称时，相应的研究组或分委员会向,ICTV,执行委员会提出建议，由执行委员会决定取哪一个名称。,15新的名称和名称的变更应以分类建议格式提交,ICTV,。,16病毒种是组成一个复制系并占有一个特定生态环境的一类多原则病毒。,17种名应由少而实用的字组成,18种名，通常与株名一起，必须表示明确的特征，不涉及属名或科名。,19已经广泛应用的数字、字母及其组合可用作种名性质形容词。但新提出的连续数字、字母或其组合不单独接受作为种名性质形容词。,20,ICTV,通过新提议的种、种名和型名的程序分两步：首先，给予暂时性通过，这样的建议将发表在,ICTV,报告中；然后，经过三年的等候期，如果不撤销或修正，该建议将得到最后通过。,（三）关于属的规则,21属是一组具有某些共同特性的种。,22属名应是一个以“,Virus”,结尾的单词。,23通过一个属名的同时需通过一个代表种。,瘟病毒属：,Pestivirus,冠状病毒属：,Coronavirus,（四）关于亚科的规则,24亚科是一组具有某些共同特性的属。只有当需要处理复杂等级结构问题时才使用亚科。,25亚科名应是一个以“,Virinae,”,结尾的单词。,E.g.,Retrovirinae,：,反转录病毒亚科,Spumavirinae,：,泡沫病毒亚科,（五）关于科的规则,26科是一组具有某些共同特性的属（不管这些属是否组成了亚科）。,27科名应是一个以“,Viridae,”,结尾的单词。,28通过一个科名的同时需通过一个属名。,疱疹病毒科：,Herpesviridae,腺病毒科：,Adenoviridae,（六）关于目的规则,29,目是一组具有某些共同特性的科。,30,目名应是一个以“,Virales,”,结尾的单词。,动物病毒的命名现状：,1、种的命名,1）大多用其所引起疾病的名称，后加“病毒”两字,脊髓灰质炎病毒、猪瘟病毒、流感病毒,2）在病名前加上最初发现该病毒的地名,日本乙型脑炎病毒、东方型马脑炎病毒,3）直接用地名称呼病毒,新城疫病毒,（Newcastle disease virus),4）用人名称呼,马立克氏病病毒(,Marek,s disease virus),2、,科、属的命名,1）依据病毒粒子的形态和理化学特性,小,RNA,病毒科、反转录病毒科、轮状病毒属,2）依据病毒所引起的病变的性质,疱疹病毒科、痘病毒科,3）以病毒酶作用的基质,正粘病毒科、副粘病毒科,4）以病毒的最初分离部位,腺病毒科,5）感染宿主的部位,鼻病毒属、肠道病毒属,6）以几个属的缩拼词作为科名,乳多空病毒科,流感病毒的命名方法,1.国际上通用的流感病毒命名方法,型别/分离地点/分离序号/分离时间（年代）（血凝素和神经氨酸酶序号）,e.g A/,Hongkong,/1/68（H3N2）,A/,京科/1/56（,H1N1）,H：,hemagglutinin,血凝素,N：,neuraminidase,神经氨酸酶,流感病毒的命名方法,2. 动物流感病毒的命名则在型别与分离地点之间加上动物宿主名称,e.g,甲/马/布拉格/1/56（,H1N1）,三、,Baltimore,的分类系统,以,mRNA,为核心：根据病毒的,DNA,或,RNA,是与,mRNA,互补(-）和不互补,（+),而将病毒分为6类。,II,类（+,DNA）,I,类（,DNA）,mRNA,III,类（,RNA）,V,类（-,RNA）,VI,类,IV,类,+,RNA,一,DNA,病毒,（一）单链,DNA,病毒,细小病毒科（,Parvoviridae,)：,猪细小病毒（,PPV）,圆环病毒科（,Circoviridae,),：,猪圆环病毒（,PCV）,四、动物病毒的分类现状,（,二） 双链,DNA,病毒,痘病毒科（,Poxviridae,)：,痘苗病毒、天花病毒,疱疹病毒科（,Herpesviridae,)：,伪狂犬病病毒（,PRV）、,马立克氏病病毒（,MDV）、,鸡传染性喉气管炎病毒（,ILTV）、,鸭瘟病毒（,DPV）、,牛传染性鼻气管炎病毒（,IBRV）,腺病毒科（,Adenoviridae,)：,减蛋综合症病毒（,EDS76）,乳多空病毒科（,Papovaviridae,)：,猴空泡病毒40(,SV40),非洲猪瘟病毒科（,Asfarviridae,)：,非洲猪瘟病毒,嗜肝,DNA,病毒科（,Hepadnaviridae,)：,人乙型肝炎病毒（,HBV）,虹彩病毒科（,Iridoviridae,)：,杆状病毒科（,Baculoviridae,)：,二,RNA,反转录病毒,反转录病毒科（,Retroviridae,)：,马传染性贫血病毒（,EIAV）、,人免疫缺陷病病毒（,HIV）,三,RNA,病毒,（一）双股,RNA,病毒,呼肠孤病毒科（,Reoviridae,)：,蓝舌病病毒（,BTV）、,轮状病毒,双,RNA,病毒科（,Birnaviridae,)：,鸡传染性法氏囊病病毒（,IBDV）,（二）单股负链,RNA,病毒（不分节段）,副粘病毒科（,Paramyxoviridae,)：,新城疫病毒（,NDV）,弹状病毒科（,Rhabdoviridae,)：,狂犬病病毒（,RV）、,水疱性口炎病毒（,VSV）,丝状病毒科（,Filoviridae,)：,埃博拉病毒（,EBV）,(三）单股负链,RNA,病毒（分节段）,正粘病毒科（,Orthomyxviridae,)：,流感病毒（,IFV）,布尼病毒科（,Bunyaviridae,)：,嵌砂病毒科（,Arenaviridae,)：,（四）单股正链,RNA,病毒,微,RNA,病毒科（,Picornaviridae,)：,口蹄疫病毒（,FMDV）、,猪水疱病病毒（,SVDV）、,鸭肝炎病毒（,DHV）、,甲肝病毒（,HAV）,披膜病毒科（,Togaviridae,)：,黄病毒科（,Flaviviridae,)：,流行性乙型脑炎病毒（,JEV）、,猪瘟病毒（,HCV）、,丙型肝炎病毒（,HCV）,动脉炎病毒科（,Arteriviridae,)：,猪繁殖与呼吸综合征病毒（,PRRSV）,冠状病毒科（,Coronaviridae,)：,传染性支气管炎病毒（,IBV）、,猪流行性胃肠炎病毒（,TGEV）、,猪流行性腹泻病毒（,PEDV）,杯状病毒科（,Caliciviridae,)：,猪水疱疹病毒（,SVEV）,思考题,动物病毒的分类原则是什么？,目、科、亚科、属的词尾分别是什么？,请举例说明国际流感病毒的命名方法？,一些主要的病毒分属于哪个科？,