肿瘤基因检测与个体化用药课件

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,2020/1/14,#,肿瘤基因检测与个体化用药,精,准医学研究,所,洛阳中科,信息产业研究院,肿瘤基因检测与个体化用药,肿瘤防治,形势,-,严峻,2,2012,中国肿瘤登记年报,我国每年新发,肿瘤,病例约为：,肿瘤防治形势-严峻22012中国肿瘤登记年报我国每年,肿瘤三大治疗手段,3,约,90%,肿瘤患者在治疗过程中会用到抗肿瘤药物,肿瘤三大治疗手段 3约90%肿瘤患者在治疗过程中会用到抗肿瘤,抗肿瘤药物使用原则,有效,（,*肿瘤治疗,指南,，推荐治疗方案,）,低,毒,（病人身体情况）,经济,卫计委,抗肿瘤药物临床应用指导原则,抗肿瘤药物使用原则有效（*肿瘤治疗指南，推荐治疗方案）低毒,不同肿瘤药物疗效比较,5,肿瘤类型,反应率,反应持续时间（月）,生存期（月）,乳腺癌,25-55%,6-12,24-36,结肠癌,25-35%,6-8,12-18,食管癌,30-50%,4-6,6-9,非小细胞肺癌,20-30%,4-6,6-9,胃癌,20-50%,4-6,6-12,黑色素瘤,15-25%,4-6,6-9,胰腺癌,10-25%,3-5,6-9,肝细胞癌,5-15%,2-4,6-9,胆管癌,15-25%,2-4,6-9,Medical College of Wisconsin #099 Chemotherapy: Response and Survival Data,Author(s): David E,Weissman, Charles,F von,Gunten,April 2009.,不同肿瘤药物疗效比较5肿瘤类型反应率反应持续时间（月）生存,药物不良反应,严重,占据全球主要死亡原因第,4-6,位,我国因药物不良反应住院人数,250,万,/,年,因药物不良反应死亡人数约,20,万,/,年,6,药物不良反应严重占据全球主要死亡原因第4-6位6,循,证医学模式下的抗肿瘤用药,以,群体医疗数据,为,依据，其实存在,个体差异,；,治疗方案的选择依据的是,肿瘤的解剖学部位，,应,着重,考虑同一肿瘤的,基因差异；,7,循证医学模式下的抗肿瘤用药以群体医疗数据为依据，其实存在个体,临床中使用的个体差异检测手段,8,检测技术,药物,检测基因,/,蛋白,荧光原位杂交,伊马替尼,BCR-ABL,基因融合,第一代测序,西妥昔单抗，帕尼单抗,KRAS,基因突变,IHC3+,或,IHC2+/FISH+,曲妥珠单抗,HER2,过表达,第一代测序,吉非替尼，厄洛替尼,，,埃,克替尼,EGFR,基因敏感突变,临床中使用的个体差异检测手段8检测技术药物检测基因/蛋白荧光,传统,基因检测方法的临床局限性,第一代,测序检测不到低频突变，假阴性率高,一次只能测一个,基因,所需样本量大，穿刺,样本耗尽，患者失去其它基因检测和个体化治疗的机会,9,检测手段,点突变,片段变异,灵敏度,优缺点,原位荧光杂交,不可以,1,kb,高,只能检测已知的融合基因,第一代测序,可以,可以,15-20%,灵敏度低，一次检测一个基因,传统基因检测方法的临床局限性第一代测序检测不到低频突变，假阴,第二代,测序,10,灵敏度低，,15-20%,一,次测序检测,一个,基因,第一代测序,第二代,测序,灵敏度高，,0.5%,一次测序检测,多个,基因，,第二代测序10灵敏度低，15-20%第一代测序第二代测序灵敏,美国第二代测序临床应用,-,举例,11,临床病历资料,女性，,58,岁，病理诊断为转移性胸腺癌；,胸腔和肝内病灶增大迅速,基因检测结果,KIT,基因突变（在此种肿瘤非常罕见）,临床治疗,KIT,蛋白激酶抑制剂,伊,马替,尼,，一天一次，连续,1,月,RECIST,标准疗效评价，,SD,（疾病稳定）,伊马替尼治疗前,伊马替尼治疗,1,个月,美国第二代测序临床应用-举例11临床病历资料基因检测结果临,12,12,产品简介,13,通过第二代测序检测患者肿瘤组织和正常组织的,88,个,基因，找出体细胞突变和,某些多态性位点，结合患者的其他临床信息，借助晶云的,药物基因组知识库,和,大数据,算法,，为医生提供最优的用药方案参考。,基因突变,及多态性,个性化用药分析报告,药物基因组知识库,产品简介13通过第二代测序检测患者肿瘤组织和正常组织的88个,为什么是,88,个基因,药物基因组数据库、文献挖掘,国内外靶向药,伴随诊断,的基因,化疗药,代谢,有关基因,化疗,药有效性的,标记基因,国内,药物临床试验,入选标准中提到的基因,文献中报道的可能,耐药基因,14,为什么是88个基因药物基因组数据库、文献挖掘14,自主研发的药物,基因组,知识库,基于,PharmGKB,、,SNPedia,数据库，加上文献挖掘，收录对药物在人体内吸收、代谢、疗效及不良反应产生影响的基因变异,国内外药物临床试验数据库,15,自主研发的药物基因组知识库基于PharmGKB、SNPedi,个性化用药分析报告,16,个性化用药分析报告16,临床分析报告中的三大内容,推荐合适的靶,向,药、化疗药,提醒靶向药原发性耐药,推荐患者参加国内外药物临床试验,17,临床分析报告中的三大内容推荐合适的靶向药、化疗药17,推荐合适的靶向药,18,靶标,靶向药,EGFR,吉非替尼，厄洛替尼，埃克替尼,KRAS, BRAF ,PIK3CA,西妥昔单抗，帕尼单抗，尼妥珠单抗,KIT, PDGFRA,伊马替尼，舒尼替尼,BRAF,维罗菲尼，达拉菲尼,ALK, ROS1, MET,克唑替尼，色瑞替尼,推荐合适的靶向药18靶标靶向药EGFR吉非替尼，厄洛替尼，埃,EGFR-TKI,药物与,EGFR,基因敏感性突变,埃克替尼的适应症,本,品单药适用于治疗表皮生长因子受体（,EGFR,）,基因敏感,突变的局部晚期或转移性非小细胞肺癌（,NSCLC,）患者的一线,治疗,不推荐本品用于,EGFR,野生型非小细胞肺癌,患者,埃克替尼的用药问题,1,0% EGFR,基因敏感突变的患者原发性耐药,19,EGFR-TKI药物与EGFR基因敏感性突变埃克替尼的适应症,靶向,药原发性耐药提醒,EGFR-TKI,药物原发性耐药的机制,EGFR T790M,ALK,基因重排,RAS,基因突变,BRAF,基因突变,PTEN,基因突变,20,靶向药原发性耐药提醒EGFR-TKI药物原发性耐药的机制20,推荐合适的化疗药,21,检测靶标,药物,ERCC1,BRCA1,XRCC1,ERCC2,GSTP1,顺铂，卡铂，奥沙利铂,TYMS,DPYD,MTHFR,氟尿嘧啶，卡培他滨,RRM1,CDA,吉西他滨,MTHFR,DHFR,甲氨蝶呤,TYMS,培美曲塞,UGT1A1,伊立替康，托泊替康,TOP2A,CYP3A4,依托泊苷，替尼泊苷,CYP2C9,CYP2C19,环磷酰胺，异环磷酰胺,NQO1,丝裂霉素,TOP2A,GSTP1,多柔比星，表柔比星,推荐合适的化疗药21检测靶标药物ERCC1,BRCA1,XR,ERCC1, CDA,多态性与铂类药物使用,22,肺癌患者,ERCC1,基因,CDA,基因,CDA,基因,ERCC1, CDA多态性与铂类药物使用22肺癌患者CDAC,推荐,患者参加国内外药物临床试验,23,推荐患者参加国内外药物临床试验23,服务流程,24,肿瘤,组织样本,第二代,测序法,服务流程24肿瘤组织样本第二代测序法,25,感谢,25感谢,26,26,27,27,肿瘤组织样本要求,28,一、石蜡组织,标本,手术样本（大样本）：切片,25,张以上（防脱玻片），厚度,5,m,，肿瘤细胞占比,50%,，坏死组织区域,10%,；,穿刺样本（小样本）：切片,35,张以上（防脱玻片），厚度,5,m,，肿瘤细胞占比,50%,，坏死组织区域,10%,。,切片时注意对切片机及台面进行消毒处理，不同样本更换新刀片，防止交叉污染。,切片时摊片即可，无需烤片处理，切片编号规范清晰。,为保证石蜡标本,DNA,提取的成功率，请尽可能送检,1,年以内的蜡块或,6,个周以内的石蜡切片。,标本存放于塑料玻片盒中，,4-8,保存、运输。,肿瘤组织样本要求28一、石蜡组织标本,肿瘤组织样本要求,29,二,、新鲜组织,标本,手术样本（大样本）：肿瘤组织,50mg,，肿瘤细胞占比,50%,，坏死组织区域,10%,；,穿刺样本（小样本）：,穿刺,1,针以上，肿瘤细胞占比,50%,，坏死组织区域,10%,。,收到组织后立即用至少,5,倍体积的,10%,中性福尔马林固定液固定，置于贴好标签的标本瓶中，于,4-8,条件下,72h,内送达实验室（穿刺样本尽量,48h,内送达）。,肿瘤组织样本要求29二、新鲜组织标本,肿瘤组织样本要求,30,三、胸,水,胸水细胞沉渣：胸水沉渣,3000rpm,离心,5min,，将沉渣所得细胞转入,1.5mlEP,管中，封口膜封管口，管盖和管壁标记姓名编号，,4-8,条件下保存、运输。,胸水细胞沉渣石蜡切片：将胸水细胞沉渣制作成石蜡包埋蜡块，,4-8,条件下送检蜡块或按照石蜡组织样本要求切片后送检。,肿瘤组织样本要求30三、胸水,产品升级,临床应用,推荐,合适的靶向药、化疗药,靶向药抗药性预测,推荐患者可参与的药物,临床试验,依据,本产品使用者的反馈，推荐标准治疗方案,科学研究,发现驱动基因,发现预后基因,31,产品升级临床应用31,32,精准医学的核心内涵是三个集成,：,1,.,基因蛋白与代谢组学的集成,；,2,.,临床和影象信息的集成,；,3.,大数据信息的集成与分析,。于金明,32精准医学的核心内涵是三个集成：,检测基因列表（部分）,33,检测基因列表（部分）33,循证医学的进步,-,靶向治疗,个体差异检测,FISH,基因芯片,第一代测序, ,34,靶向治疗,2001,年月，分子靶向药,伊马替尼,在,美国上市,循证医学的进步-靶向治疗个体差异检测34靶向治疗,