荧光探针的选择标准

荧光探针的选择标准 (zz)荧光团探针的选择依赖于下面的重要标准：A. 仪器。比如，光源，滤片，检测系统。B. 多标记中对探针色彩区分程度的要求。例如，若丹明红-X (RRX)和德克萨斯红(TR)荧光素的区别就比四甲基若丹明（TRITC）或者Cy3的区别明显。C. 要求的灵敏度。比如，Cy3和Cy5就比其他的荧光团探针要亮。Aminomethylcoumarin Acetate (AMCA) 耦联的AMCA吸收光波长最大为350nm，发荧光则为450nm。对于荧光显微镜来说，AMCA可以用汞灯来激发，用紫外滤板来观察。由于AMCA的信号相对较弱，单标实验中不推荐使用AMCA。AMCA和荧光素的荧光波长只有很小的重叠范围，而和发出长波长荧光的荧光基团没有或者只有极少的重叠，因此它最常用于多标记实验中，比如免疫荧光显微镜和流式细胞仪。由于人眼不能很好的检测蓝色荧光，在多标记的实验中，AMCA耦联的二抗应当被用于检测大量的抗原。AMCA和荧光素一样很快淬灭，使用抗淬灭剂可以减轻。如果使用在流式细胞仪中，AMCA可以用汞灯或者水冷却的氩光灯激发，因为它们发出的光线是在光谱的紫外区。Fluorescein Isothiocyanate (FITC) 异硫氰酸荧光素耦联的荧光素基团吸收的最大波长为492nm，发射的最大波长为520nm。由于FITC被使用了很长时间而且产量很大，FITC被广泛应用。荧光素的最大缺点是淬灭快，因此要和抗淬灭剂一起使用。DTAF是荧光素的一个衍生物，激发和发射波长均和FITC相同。当和链霉亲合素耦联时，因为荧光强度上有明显的区别，最好不使用FITC，而使用DTAF。Cyanine dyes （Cy2, Cy3, Cy5）花青染料Cy2耦联基团激发波长为492nm，发光为波长510nm的绿色可见光。Cy2和FITC使用相同的滤波片。由于Cy2比FITC在光下更稳定。要避免使用含有磷酸化的苯二胺的封片剂，因为这种抗淬灭剂和Cy2反应，在染色片储存后会导致荧光微弱和扩散。Cy3和Cy5比其他的荧光团探针要更亮，更稳定，背景更弱。Cy3耦联基团激发光的最大波长为550nm，最强发射光为570nm。因为激发光和发射光波长很接近TRITC, 在荧光显微镜中，可使用和TRITC一样的滤波片。Cy3在氩光灯（514nm或528nm）下可以被激发出50的光强，在氦氖灯（543nm）或者汞灯（546nm）下则约75。Cy3可以和荧光素一起作双标。Cy3还可以和Cy5一起在共聚焦显微镜实验中作多标记。Cy5耦联基团的激发波长最大650nm，发光波长最大670nm。在氪氩灯（647nm）下它们可被激发出98的荧光，在氦氖灯下（633nm）为63。Cy5可以和很多其他的荧光基团一起用在多标记的实验中。由于它的最大发射波长在670nm，Cy5很难用裸眼观察，而且不能用汞灯作理想的激发。通常观察Cy5时采用具有合适激发光和远红外检测器的共聚焦显微镜。在水相封片剂中应当加入抗淬灭剂。使用传统的表面荧光显微镜时，不推荐使用Cy5。Tetramethyl Rhodamin Isothiocyanate（TRITC）四甲基异硫氰酸罗丹明Rhodamine Red-X (RRX) 若丹明红X, Texas Red (TR) 得克萨斯红这些若丹明的衍生物耦联基团具有不同的吸收波长 (550, 570, 596nm)和最大发射波长（570, 590, 620nm）。尽管TRITC经常和FITC一起在双标记实验中使用，使用RRX和TR可以得到更好的颜色区分。在使用装有氪氩灯的激光共聚焦扫描显微镜作三标记的实验时，RRX尤其有用，可以和Cy2(或者FITC)和Cy5一起使用，因为RRX的发射波长在Cy2和Cy5中间，而且和这两者覆盖都很少。氪氩灯激发光为488nm，598nm和647nm，分别是Cy2(FITC), RRX和Cy5的理想激发波长。因为FITC和PE可以被氩灯的488nm波长激发, 在流式细胞仪中用FITC作双标，另一种用藻红蛋白（PE）耦联基团要比若丹明好，。亲和层析纯化的抗HRP及其耦联物的抗体可以用来检测HRP，或者放大含有HRP试剂的效果。哺乳动物细胞的免疫染色中，由于抗HRP的抗体不识别内源性的过氧化物酶的类似酶，因此这个抗体的优势就是可以降低背景。