贵州大学分子生物学复习题.docx

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1.1、生物大分子种类:蛋白质、糖类、脂类、核酸1.2、生物大分子的相互作用力:(主要是非共价作用力,即次级键,包括氢键、范德华引力、疏水作用力、盐键等)2.1 、miRNA:又称微小RNA,是指植物和动物细胞中自然产生的一类长度为1825bp的小分子RNA。3.1、顺反子(遗传学上的最小单位)是一段核苷酸序列,能编码一条完整的多肽链,这种多肽链既可以是一种生物活性的蛋白质,也可与其他多肽聚合而形成复杂的蛋白质。顺反子中最小交换单位(交换子)和最小突变单位(突变子)都是DNA分子中的一个核苷酸对。3.2、在不连续基因中有编码功能的区段称为外显子(exon),无编码功能的区段称为内含子(intron)。3.3 、ORF:可读框,是指从起始密码子起到终止密码子为止的一段连续的密码子区域,或在DNA序列测定中由计算机系统辨别认出的可能的编码区域 4.1、8.参与DNA复制有关的酶和蛋白质?(1)、DnaA识别起始序列,在起始特异性位置解开双链、 (2)、DnaB 解开DNA双链、 (3)、DnaC帮助DnaB结合于起点、 (4)、HU类组蛋白,DNA结合蛋白,促进起始(5)、DnaG(引物合成酶)合成RNA引物(6)、SSB(单链DNA结合蛋白)结合单链DNA、 (7)、RNA聚合酶促进DnaA活性、 (8)、DNA解旋酶(拓扑异构酶II)释放DNA解链过程中产生的扭曲张力、 (9)、Dam甲基化酶使起点GATC序列的腺嘌呤甲基化。4.2、前导链(leading strand):与复制叉移动的方向一致,通过连续的5-3聚合合成的新的DNA链。后随链或滞后链(lagging strand):与复制叉移动的方向相反,通过不连续的5-3聚合合成的新的DNA链。又称滞后链5.1、点突变(碱基对置换):DNA错配碱基在复制后被固定下来。由原来的一个碱基对被另一个碱基对取代。碱基对置换有两种类型:转换(transition),指两种嘧啶或两种嘌呤之间互换;颠换(transversion),发生在嘧啶和嘌呤之间的互换。6.1、DNA重组类型:同源重组、位点特异性重组、转座重组和异常重组。6.2、同源重组(homologous recombination)是指一般性重组,由两条通远去的DNA分子,通过配对、链断裂和再连接而产生的片段之间的交换过程。6.3、Holliday模型:它是通过要发生重组的2个DNA分子的2条单链在同一部位断裂,断裂的游离末端彼此交换形成异源双链,然后2条杂合单链彼此连接形成Holliday连接体。是用来解释同源重组现象。6.4、转座子(transposon):是在基因组中可以移动的一段DNA序列。类型:插入序列(insertion sequence,IS,简称IS因子),最简单的转座子;复合转座子,这类转座子中除了有转座酶基因外,还带有药物抗性基因(或其相关基因),因结构较大而复杂。6.5、复合型转座子与IS元件异同复合型转座子特点:(1)末端有反向重复序列,为转座酶所必须(2)中间有ORF作为标记基因(3)转座后,把位点大都成为正向重复序列。异同点:IS元件较小,含一个转座酶基因,编码与转座有关的蛋白质;两侧为短的末端反向重复序列。复合型转座子:较大而复杂;含一个转座酶基因,基因末端为反向重复序列;中间含有标记基因、转为后,靶位点成正向重复序列。7.1、原核RNA转录的一般过程。7.2、简述真核与原核生物基因转录的差异(1)原核只有一种RNA聚合酶,真核有三种(2)启动子结构不同,真核有三种不同的启动子和相关元件(3)真核RNApol高度分工,核内三种RNA聚合酶分别转录不同类型的核基因(4)真核RNApol借助各种转录因子选择结合启动子,转录过程有很多蛋白因子参与(5)转录产物差别很大,原核的初始转录产物大多数都是编码序列,与蛋白质氨基酸序列成线性关系;真核,初始产物很长,有内含子,成熟的mRNA只占初始转录产物的一小部分。(6)真核转录产物经历剪接,修饰的转录后加工成熟过程,原核初始转录产物基本无成熟过程,直接作为成熟mRNA行使翻译模板工功能;原核生物的其他各类RNA仍以前体方式合成,然后加工为成熟的rRNA,tRNA等(7)原核:转录产物mRNA为多顺反子;大多数真核,mRNA是单顺反子结构。(8)原核:转录产物直接作为翻译模板,转录合成mRNA的同时,蛋白质翻译也在进行。即原核转录mRNA与蛋白翻译进行偶联。(9)真核转录以正调控为主,原核调控正、负都有。(10)真核DNA的顺式元件比原核复杂得。7.3、转录的不对称性是指在RNA的合成中,DNA的二条链中仅有一条链可作为转录的模板,称为转录的不对称性。与mRNA序列相同的那条DNA链称为编码连(encoding strand)/(非模板链(non- template strand)/:非模链板与合成的RNA产物链从一个方向阅读时序列完全相同。/有义链(sense strand)/正链(Positive-strand);将另一条根据碱基互补原则指导mRNA合成的DNA链称为模板链(template strand):用于转录的链。/反义链(anti-sense strand):复制出的互补链。/负链(Negative strand)。7.4、TF(transcription factor,转录因子):真核生物RNA聚合酶在转录过程中所需要的各种蛋白质因子。分为两类:通用转录因子(general transcription ,GTF)和基因特性转录因子(gene specific transcription factor,)7.5、TBP(TATA结合蛋白)作用,TBP是PIC的一部分,并在组建复合物过程中发挥组织作用;TBP的特异性由与其相伴的TAF决定;TBP是一种普通的对所有启动子都起作用的转录因子,而不要求启动子是否都具有TATA框。7.6、真核三种RNA聚合酶分别转录什么RNA:RNA聚合酶I转录产物为rRNA,RNA聚合酶II的产物负责hmRNA或mRNA前体转录,RNA聚合酶III负责tRNA。8.1、核mRNA前体内含子的剪接有哪几种:(1)自我剪接内含子(2)蛋白质参与剪接的内含子(3)依赖snRNP剪接的内含子。9.1、遗传密码的简并性:同一种氨基酸具有两个或更多个密码子的现象,主要变现在mRNA密码子的第三位碱基上。简并性的出现是由于tRNA反密码子的第一位碱基可以和mRNA构成摆动碱基对。极性通常是由密码子的第二位碱基决定。9.2、反密码子:是位于tRNA反密码环中部、可与mRNA中的三联体密码子形成碱基配对的三个相邻碱基。SD序列:细菌的mRNA通常含有一段位于起始AUG序列上游10nt左右富有嘌呤碱基的区域。9.3、何谓信号肽?有哪些功能特点?信号肽(signal peptide):是进入ER受体蛋白N端的一段疏水性肽段,其基因的5端有一段1632个氨基酸肽段。功能特点:(1)几乎所有的信号肽都是疏水的(2)信号肽一般位于蛋白质的N端,进入膜后被信号肽酶水解(3)信号肽中部由10-15个残基构成疏水性核,这种核容易形成 螺旋,进而被折叠,这些机构对信号肽功能很重要。 (4)信号肽C端有一个能被信号肽酶识别的位点(5)将信号肽认为只是位于N端的一段疏水短肽是片面的(6)信号肽没有严格的专一性(7)信号肽还是一种环状结构。(起功能是在信号识别蛋白(SRP)和SRP受体等因子的协助下引导多肽链穿过ER膜进入腔内)。10.11、乳糖操纵子调控模型主要内容: Z、Y、A基因的产物由同一条多顺反子的mRNA分子所编码这个mRNA分子的启动子紧接着操纵区(O区),而位于阻遏基因I与操纵基因O之间的启动子区(P),不能单独起动合成-半乳糖苷酶和透过酶的生理过程。操纵基因是DNA上的一小段序列(仅为26bp),是阻遏物的结合位点。当阻遏物与操纵基因结合时,lacmRNA的转录起始受到抑制。诱导物通过与阻遏物结合,改变它的三维构象,使之不能与操纵基因结合,从而激发lacmRNA的合成。当有诱导物存在时,操纵基因区没有被阻遏物占据,所以启动子能够顺利起始mRNA的合成。10.12、色氨酸操纵子机制(1)阻遏蛋白的负调控:受其上游调控蛋白R基因的调控。R并没有与O结合的活性,只有当环境能提供足够浓度的色氨酸时,R与色氨酸结合后而活化,能够与O结合,阻遏结构基因的转录。 (2)弱化子及其作用:当色氨酸达到一定浓度,但还没有高到能够活化R使其起阻遏作用的程度时,产生色氨酸合成酶类的量已经明显降低,而且产生的酶量与色氨酸浓度呈负相关。这种调控现象与色氨酸操纵子特殊的结构有关。 10.2、CAP(环腺苷酸受体蛋白) 是大肠杆菌分解代谢物基因活化蛋白,这种蛋白可将葡萄糖饥饿信号传递个许多操纵子,使细菌在缺乏葡萄糖时可以利用其他碳源,属于正调控。10.3、操纵子一般包括调节基因、启动子、操纵基因核仁结构基因等功能序列组成。10.4、 反式作用因子10.5、模体(motif)和结构域(domain)区别10.6、反式作用因子和DNA怎么结合的结构域:螺旋-转角-螺旋(HTH)、螺旋-环-螺旋(HLH) 、锌指(zinc finger)、亮氨酸拉链(ZIP)10.7、增强子(enhancer):是指能使与它连锁的基因(位于同一条DNA链上,但可远程作用)转录效率明显增加的DNA序列。衰减子(attenuator):因为转录终止发生在这一区域,并且这种终止能被调节,因此这个区域被称为衰减子。
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