单细胞凝胶电泳--课件

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单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,ppt课件,*,实验十七 单细胞凝胶电泳技术,丁书茂,单细胞凝胶电泳技术,丁书茂,1,ppt课件,单细胞凝胶电泳技术,(single cell gel electrophoresis,SCGE),,也称彗星试验,(,comet assay),,是,Ostling O,和,Johanson,KJ,首次提出,后经,Singh,等进一步完善的一种在单个细胞水平上检测,DNA,损伤、交联和修复的方法。因其简单、灵敏、低耗、快速等优点而广泛应用于生物检测、遗传毒理、流行病学调查等诸多方面。,2,ppt课件,一、实验原理,DNA,链多为磷酸复合物,在生理条件下,DNA,的多聚核酸链多呈阴离子状态,,,当外源性因素(如紫外照射)造成,DNA,链断裂时,负超螺旋结构变得松散,那么在电场作用下,DNA,就会以一定速率向正极移动。,在细胞裂解液作用下,细胞膜、核膜等结构受到破坏,胞内蛋白质、,RNA,及其它成分均扩散到溶液中,而核,DNA,由于分子量大而只能留在原位。,3,ppt课件,经碱处理和在碱性电解质的作用后,,DNA,解旋,损伤的,DNA,断链及其片段会被释放出来,而在电泳条件下,,DNA,片段可进入凝胶孔隙发生迁移。由于这些,DNA,分子量很小,所以在电泳过程中会离开核,DNA,向正极移动,形成彗星状的图像。,在一定条件下,,DNA,迁移距离和,DNA,含量分布与,DNA,损伤程度呈线性相关。随着,DNA,损伤程度加剧,断片数目增加,表现为尾部,DNA,含量增加,彗尾延长,荧光强度加强。,4,ppt课件,二、实验流程,采用碱性,SCGE,,其基本操作过程包括:,5,ppt课件,1.,细胞制,取,取处于对数生长期的,Hela,细胞,吹打为单细胞悬液,用,PBS,调节细胞密度为,10,5,-10,6,个,/,ml,。,6,ppt课件,2.,细胞染毒,染毒组:取,1ml,细胞悬液加入,10,-3,M H,2,O,2,溶液,50l,,混匀,,37,水浴,30,min,;,阴性对照组:取,1ml,细胞悬液加入,50l PBS,缓冲液,同等条件下水浴,30,min,。,7,ppt课件,3.,制,片,第一层胶:在完全磨毛的载玻片上铺,180L,质量分数为,1%,的正常熔点琼脂糖,(,NMA,),,室温固化,10,min,;,可将玻片用吹风机稍微加热,以延缓琼脂糖凝固。,8,ppt课件,第二层胶:取,50L,质量分数为,0.8%,的低熔点琼脂糖(,LMA,)和,30L,的细胞悬液,混匀后滴加于第一层胶上,加该盖片使其均匀铺开,,4,凝固,10min,;,9,ppt课件,第三层胶:移开盖片,滴加,100,L,质量分数为,0.5%,的,LMA,于第二层胶上,加盖片,,4,凝固,10,min,。,10,ppt课件,4.,裂解,将制好的凝胶放入,冷的,裂解液中,,4,下裂解,2,小时;,裂解液使用时新配,(,铺完第二层胶后即可配制,),90,ml lysis,solution,10ml DMSO,1ml Triton-X100,11,ppt课件,5.,解旋,从裂解液中将载玻片取出,在蒸馏水中洗去过多盐,晾干。,将新配制的电泳缓冲液倒入电泳槽中,约覆过载玻片,0.25cm,,盖上盖子,在高,pH,电泳缓冲液中放置,20 min,以便,DNA,解螺旋。,12,ppt课件,6.,电泳,室温下调节缓冲液液面高低,于,20V,,,200mA,下电泳,20,min,。,13,ppt课件,7.,中和,将凝胶浸入,0.4,M Tris,缓冲液(,pH7.5,)中,浸洗,30,min,。,14,ppt课件,8.,染色观察,用,20g/L,的吖啶橙染色,3,5min,,用双蒸水洗掉表面的染料,,24,小时内在荧光显微镜下观察。,15,ppt课件,三 结果观察,16,ppt课件,17,ppt课件,18,ppt课件,四 注意事项,实验操作均在红光或暗处条件下进行,以避免造成,DNA,的额外损伤。,关键步骤是铺胶,尤其是第一层胶,一定要平整,均匀。若有气泡,用下一层胶填平。,配制裂解液时,,DMSO,为致癌剂,注意安全。用去尖的枪头取,Triton-X100,19,ppt课件,五 思考题,试分析三层胶浓度不同的原因。,试分析影响单细胞凝胶电泳实验结果的因素。,20,ppt课件,
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