七、蛋白质的α-螺旋与DNA双螺旋

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单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,*,*,蛋白质的,-,螺旋与DNA双螺旋,-,螺旋:,是蛋白质中最常见的一种构象,是由,Pauling,等根据,角蛋白的,X,射线衍射图谱提出的。,特征如下:,1.,多肽链,碳原子为转折点,以肽链平面为单位,通过两侧结合键的旋转,形成稳定的右手螺旋。,2.,每圈螺旋有,3.6,个氨基酸残基,螺距约为,0.54nm,,每个氨基酸残基围绕螺旋中心轴转,100,,上升,0.15nm(3.6,0.15nm,0.54nm),。,3.,相邻两螺旋之间形成链内氢键,其方向与螺旋轴大致平行。氢键是由每个肽基的,C=O,与其前面第,3,个肽基的,N-H,之间形成的,由氢键封闭的环是,13,元环。在肽段中近,N,端的前三个亚胺基上的氢和其,C,端的最后三个羰基上的氧原子都不参与氢键的形成,因此,一些蛋白质肽链的,N,端和,C,端不易形成,螺旋。,4.,肽段中近,N,端的前三个亚胺基上的氢和其,C,端的最后三个羰基上的氧原子都不参与氢键的形成。两端不易形成,-,螺旋。,5.,各氨基酸残基侧链,R,基团均伸向螺旋外侧。基团的大小、荷电状态及形状均对,-,螺旋的形成及稳定有影响。,6.-,螺旋有左手和右手螺旋两种,天然蛋白质的绝大多数都是右手螺旋,但是主链可以存在局部的左手,-,螺旋,并使主链的方向发生改变,从而形成复杂的构象。由于,Gly,没有对称的,-,碳原子,这种左手,-,螺旋多数由,Gly,参与形成。,DNA,二级结构,双螺旋,双螺旋结构模型要点,1.,主链,DNA,分子由两条反向平行的脱氧多核苷酸链组成。一条链方向为,3 5,,另一条链为,5 3,。双链围绕分子中的长轴(螺旋轴)以右手方向盘绕成右手双螺旋。磷酸,-,脱氧核糖借磷酸二酯键相连,位于螺旋的外侧,构成螺旋的主链或骨架。糖环平面与纵轴平行,嘌呤和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,。,2.,碱基对,两条脱氧多核苷酸链的碱基,通过氢链联系,在同一平面上形成碱基对,(base pairs ,bp),。,3.,螺距,双螺旋中任何一条链绕轴一周,(360),所升降的距离叫做螺距。该模型螺距为,3.4nm,,其中包含,10,个碱基对,每两个相邻碱基平面的垂直距离为,0.34nm,,直径为,2.0nm,,每条链中相邻碱基对之间的旋转角为,36,。,4.,大沟和小沟,沿螺旋轴间观察,两条主链和碱基并不充满双螺旋的空间,双螺旋表面形成一大、一小两个凹下去的槽,前者称为大沟(,Major groove,),后者称为小沟,(Minor groove),。,
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