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PubMed检索与利用 医药文献检索 药物化学教研室张玲2010 3 25 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 总结 检索结果的处理 一 简介 由美国国立医学图书馆 NLM 所属国家生物技术信息中心 NCBI 建立 http www ncbi nlm nih gov pubmed 收录范围 MEDLINE记录标注 PubMed indexedforMEDLINE PreMedline是临时性医学文献数据库 每天接收新数据 经MeSH词表标引后 每周向medline移加一次 记录标注 PubMed inprocess Publishersuppliedcitations出版商直接向PubMed递送的电子记录中不被Medline收录的部分 记录标注 PubMed assuppliedbypublisher MEDLINE数据库由美国国家医学图书馆 NationalLibraryofMedicine 简称NLM 编制 是印刷刊 IndexMedicus 医学索引 IndextoDentalLiterature 牙科文献索引 和 InternationgalNursingIndex 国际护理索引 的光盘版 数据摘自3700种期刊 是生物医学的主要数据库 时间跨度1966年至今 简介 PubMed的特点 二 PubMed的特点 免费提供题录和文摘可与提供原文的网址链接 部分免费获取 提供检索词自动转换匹配操作简便 快捷 自动转换匹配 PubMed对输入检索框中的检索词进行智能化地校对 将其逐步地与其数据库中的各类术语匹配的原则 MeSHTranslationTable主题词注释表 JournalsTranslationTable期刊注释表 CommonPhraseList常用词组表 AuthorIndex作者索引表 NoMapping 检索词拆分AND 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 基本检索输入框 特征栏提供辅助检索功能 侧栏提供其他检索如期刊数据库检索 主题词数据库检索 特定文献检索 执行检索按钮 JournalsDatabaseMeSHDatabaseSingleCitationMatcherBatchCitationMatcherClinicalQueriesSpecialQueriesLinkOutMyNCBI 三 PubMed检索界面 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 PubMed基本检索功能 一 单词 短语 词组检索 二 作者姓名检索 三 期刊名称检索 四 截词检索 五 带逻辑运算符的复合检索 在PubMed基本检索里面的前面四项其实也就是告诉我们在基本检索输入框中 可以输入任何具有实质性意义的词语 比如说 自由词 主题词 人名或者刊名 系统都会智能化地同系统中词表的进行匹配后完成检索 在基本检索里面 PubMed能够完成 1 单词 短语 词组检索 2 作者检索 3 期刊名称检索 4 截词检索 5 带逻辑运算符的复合检索式 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 PubMed基本检索功能 一 单词 短语 词组检索 主题词 以规范化的词汇来表达文献内容的主题 这种词汇叫主题词 叙词 医学主题词表美国国立医学图书馆邀请专家 学者汇集约16 000多个医学主题词并加以整理 使之规范化 编制成的一个表 即 医学主题词表 MedicalSubjectHeadings 简称Mesh MeSH附有各种参照和注释 它是对生物医学文献进行标引和检索的依据 医学主题词表的作用 在标引人员将情报输入检索系统以及检索者 用户 利用系统内情报这两个过程中 以主题词作为标准用语 使标引和检索之间用语一致 达到最佳检索效果 在手工和联机检索前 查阅医学主题词表是制定检索策略的重要依据 cancer carcinoma tumor neoplasms 医学主题词表主要包括下面三部分 主题词变更表 年新增主题词 年删去主题词 年累积新增主题词 字顺表 AlphabeticList 字顺表将主题词 次要主题词 非主题词 款目词 非主题词 按字顺统一排列 范畴表 CategoriesandSubcategories 选择规范化主题词要注意的几个问题 1 对于自然医学语汇中同义词 近义词 学名与俗名的处理例 Cancer Neoplasms 近义词 GermanMeales Rubella 同义词 VitamanC AscorbicAcid 学 俗名 Apoplexy CerbrovascularDisorders 同义词 DeoxyribonucleicAcid DNA 繁 简称 有 者为IM规范化主题词 2 倒置主题词倒置主题词就是把复合主题词中被修饰的名词作为标目 放前面 定语放在名词之后 并用逗号分开 这样 可使医学概念相近的族性词汇集中在同一主题下 便于检索 例 SHOCK CARDIOGENIC 心源性休克 SHOCK HEMORRHAGIC 出血性休克 SHOCK SEPTIC 败血性休克 SHOCK SORGICAL 外科性休克 SHOCK TRAUMATIC 创伤性休克 例中的复合主题词经倒置后 各种有关休克的文献都集中在SHOCK这个主题词下 3 主题词与副主题词的组配使用 为了使主题词的专指性更强 主题词要与副主题词组配使用 副主题词又称限定词 Qualifiers 用它将某一主题词的概念进行复分 使主题词具有更高的专指性 在一个主题词下面往往收录了许多篇文献 为了让读者不必花太多时间从关到尾一题不漏地看所有题录 就在每一个主题词下面又用若干副主题词 以便把内容相近的文献集中到相应的副主题词下面 让读者有目的地选择查阅 1989 1990年IM使用的副主题词是77个 1991 1994年是80个 范畴表 CategoriesandSubcategories 范畴表又称树形结构 TreeStructure 此表是将字顺表中的主题词 主要叙词 次要叙词按其学科性质 词义范围的上下类属及派生关系 分别划为15大类 依次用A N Z代表 在15个类目中 有9类又分若干子类目 加用数字代表 子类目共有101个 子类目下面又分若干更小的类目 这就是通常供检索使用的主题词 共一万六千多个 都按其医学概念的性质分别列入各自所属的类目之下 GASTROINTESTINALNEOPLASMS胃肠肿瘤INTESTINALNEOPLASMS肠肿瘤CECALNEOPLASMS盲肠肿瘤APPENDICEALNEOPLASMS阑尾肿瘤COLONICNEOPLASMS结肠肿瘤COLONICPOLYPS结肠息肉 DUODENALNEOPLASMS十二指肠肿瘤ILEALNEOPLASMS回肠肿瘤 字顺表与树形结构 范畴表 在功能上的关系及如何利用 查全率与查准率是文献检索的两大要素 这两者关系到词表的科学设计 医学主题词表通过 字顺表 反映主题词之间的横向关系 通过 树状结构 揭示词与词之间的纵向隶属关系 两个表相互配合 形成一个功能完善的检索体系 以满足检索者对文献查准与查全要求 检索出文章总篇数 综述类文献总篇数 单词检索 系统自动进行转换匹配后生成的检索式 Livercancer 固定搭配词组检索 可以保证查全率 自动转换匹配后 进行逻辑或的运算 短语检索 自动转换匹配后的结果 强制短语 词组检索 针对特定的短语和词组的检索 需要在短语或者词组上加上双引号 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 PubMed基本检索功能 一 单词 短语 词组检索 二 作者姓名检索 作者姓名检索 格式 姓 名缩写 不用标点 如要查找王智彪教授发表的文章 输入格式为 wangzb 系统会自动在作者字段内进行检索 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 PubMed基本检索功能 一 单词 短语 词组检索 二 作者姓名检索 三 期刊名称检索 建议期刊检索使用期刊名称检索字段标识 ta 或者是 so 这是因为 如果期刊名称正好是一个MeSH中的词 系统会将其作MeSH词进行检索 如果期刊名称是一个单词 系统会在所有字段中进行检索 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 PubMed基本检索功能 一 单词 短语 词组检索 二 作者姓名检索 三 期刊名称检索 四 截词检索 在词的末尾加 号 PubMed就会检索出以该词为词根的所有的词 截词检索将关闭自动词语匹配功能 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 PubMed基本检索功能 一 单词 短语 词组检索 二 作者姓名检索 三 期刊名称检索 四 截词检索 五 带逻辑运算符的复合检索 如我们要检索肿瘤的诊断和治疗方面的文献 我们可以在基本检索输入框中输入 cancerAND diagnosisORtherapy 点击 Go 进行检索 复合检索式检索 布尔逻辑运算符有 AND OR或NOT 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 限制字段和条件检索 检索史管理 预检索及浏览索引检索 详细匹配过程 剪贴板 界面介绍 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 限制字段和条件检索 Limits 输入检索词 系统默认空格为AND关系 子文档 检索词字段 出版类型选择限制 文献发表日期 只要有文摘的文献 语种 研究对象年龄 限制字段和条件检索 Limits 性别 数据输入时间 研究对象 将检索词限制在一个特定范围 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 限制字段和条件检索 Limits 预检索 浏览索引检索 Preview Index 检索式 预检索 索引加词检索 预检索按钮 索引检索按钮 预检索 浏览索引检索界面 Preview Index 检索结果数量 therapy 预览检索结果 修改和增删检索词 步骤2输入待选词 步骤1点击预览 索引按钮 hepatitisb 步骤3点击index按钮 步骤5确定与检索栏中检索提问的逻辑关系 步骤4索引选词 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 限制字段和条件检索 Limits 预检索 浏览检索 Preview Index 检索史管理 History 检索历史回顾 检索式 检索时间 检出篇数 点击预检索按钮 1andtherapy 用于查看检索记录和检索结果的数量 并进行各种逻辑运算 检索史管理界面 History 检索号 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 限制字段和条件检索 Limits 预检索 浏览检索 Preview Index 检索史管理 History 剪贴板管理 Clipboard 剪贴板管理界面 Clipboard 暂存需下载或者是打印的记录 多项检索后集中存盘或者打印 最多允许存储1000条 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 限制字段和条件检索 Limits 预检索 浏览检索 Preview Index 检索史管理 History 剪贴板管理 Clipboard 详细匹配过程 Details 详细匹配过程界面 Details 点击后 系统可以把我们真正执行了自动匹配转换功能的检索式显示出来 可以看见系统详细的转换过程 数据库匹配过程 规范词转换 你输入的检索式 检索明细 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 期刊浏览检索 主题词浏览检索 单个引文匹配器 临床查询 期刊浏览检索 主题词浏览检索 单个引文匹配器 批引文匹配器 临床查询 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 期刊浏览检索 一 期刊浏览检索 Journaldatabase cancer 点击 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 期刊浏览检索 主题词浏览检索 二 主题浏览检索 MeshDatabase 功能 确定规范检索词查看词义注释 树状结构表副主题词 扩展 主要主题词 主题词数据库检索 1 输入检索词 3 点按此处可获详细注解 2 执行浏览 主题词注释 可选副主题词 限定作为主要主题词检索 不进行下位词扩检 该主题词所替代的非规范词形式 主题词树形结构表 发送至检索框 通过MeSHDatabase检索的结果 其中32篇综述文献 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 期刊浏览检索 主题词浏览检索 单个引文匹配器 三 单个引文匹配检索 MeshDatabase 输入题录信息 查找特定文献 刊名要准确 缩写要标准著者姓名大小写不敏感如查找 王智彪教授1997年发表在UltrasonSonochem期刊上的一篇文章的其他作者的名字 单个引文匹配检索 UltrasonSonochem 1997 Wangzb 得出其他著者 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 期刊浏览检索 主题词浏览检索 单个引文匹配器 临床查询 四 临床查询 ClinicalQueries 检索临床研究方法学 循证医学 文献 主要涉及治疗 诊断 病因 和预后四个分类 并提供强调选择 即敏感度 强调查全 或专指度 强调查准 有三个方面的内容 研究类别查询 治疗 诊断 病因学及预后系统评价查询医学遗传学查询 诊断 临床描述 管理 基因 分子遗传学 基因测试等内容 研究类别查询 系统评价查询 医学遗传学查询 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 检索结果的处理 显示检索结果 Display 输出检索结果 sendto 输出到文本 sendtoText 输出到文件 sendtoFile 输出到E mail sendtoE mail 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 检索结果的处理 显示检索结果 Display 显示检索结果 Display 检索格式选择 显示记录数 排序方式 有摘要 有free全文 无摘要 全文链接图标 点击下载PDF格式的全文 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 检索结果的处理 显示检索结果 Display 输出检索结果 sendto 检索结果输出 sendto Text 当前网页所显示记录的文本格式 用浏览器文件菜单中的保存文件的功能保存文件 File 所有记录纯文本文件格式 用对话框保存 Clipboad 剪贴板 暂存需下载记录 多项检索后一起保存 Email 通过邮件发送文献 最多500篇文献 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 检索结果的处理 显示检索结果 Display 输出检索结果 sendto 输出到文本 sendtoText 检索结果输出 sendtoText 当前网页所显示记录的文本格式 用浏览器文件保存 保存该文本文件 打印该文本文件 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 检索结果的处理 显示检索结果 Display 输出检索结果 sendto 输出到文本 sendtoText 输出到文件 sendtoFile 检索结果输出 sendtoFile 以纯文本文件保存 注意的是 在display中的显示格式就是存盘的格式 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 检索结果的处理 显示检索结果 Display 输出检索结果 sendto 输出到文本 sendtoText 输出到文件 sendtoFile 输出到E mail sendtoE mail 检索结果输出 sendtoE mail 通过邮件发送检索结果 abc 简介 PubMed的特点 PubMed检索界面 特征栏辅助检索 PubMed基本检索功能 其他辅助检索 总结 检索结果的处理 八 总结 Preview Index 建议多使用 便于节省检索时间 修正检索策略 得出最佳检索策略 History 进行多项组合检索检索词 不区分检索词的大小写 双引号作用 在对一些特定内容 如作者名 期刊名 进行检索时进行特定短语搜索时 强制短语检索检索标签 应用方括号括起来 不区分字母大小写 不区分检索标签与检索词之间是否有空格利用通配符 进行检索 可以查全因为词性变化的文献 TheEnd