光合细菌分类、鉴定及保存.ppt

光合细菌分类 鉴定及保存 张德民宁波大学生命科学与生物工程学院 光合细菌应用中存在的问题光合细菌分类学进展宁波大学在光合细菌方面的研究第二届分子微生物生态研讨班 光合细菌应用中存在的问题菌种不纯菌种鉴定不准实验环境因子复杂 实验数据缺乏统计学分析应用效果评价困难光合细菌分类学进展宁波大学在光合细菌方面的研究中国生态学会微生物生态专业委员会宁波大学培训基地 光合细菌分类鉴定研究进展 伯杰细菌鉴定手册 Bergey sManualofDeterminativeBacteriology 1923年第1版1974年第8版1994年第9版都停留在对光合细菌的形态生理描述上 所有的光合细菌都被单独放到红螺菌目1个目中 红螺菌目红螺菌科外硫红螺菌科绿硫菌科绿色丝状细菌 伯杰氏系统细菌学手册 近年的分子系统学研究表明 紫色非硫细菌的系统发育是多起源的 分散在变形菌门 和 两个纲的多个科中 与非光合细菌的系统发育混杂在一起 现在认为 光合器官的性质对种的鉴定还是重要的 但对较高分类阶元 如科 目等则没有太大意义 伯杰氏系统细菌学手册 Bergey sManualofSystematicBacteriology 1989年 第1版2001年 第1版以后的国际分类学权威书籍中 光合细菌的分类采用了完全不同的分类系统 产氧光合细菌蓝细菌门 产氧光养细菌 光合细菌 所有的紫色非硫细菌分属于变形菌门的 两个纲的5个目8个科中 共21个属 红假单胞菌属 Rhodopseudomonas 沼泽红假单胞菌 Rps palustris 荚膜红假单胞菌 Rps capsulata 球形红假单胞菌 Rps sphaeroides 胶质红假单胞菌 Rps geletinosa 绿色红假单胞菌 Rps viridis 嗜酸红假单胞菌 Rps acidophila 粪红假单胞菌 Rps faecalis Rps Rhenobacensis 红长命菌属 Rubrivivax 红细菌属 Rhodobacter 红芽生菌属 Rhodoblastus 芽生绿菌属 Blastochloris 红螺菌属 Rhodospirillum 深红红螺菌 Rsp rubrum 度光红螺菌 Rsp photometricum 黄褐红螺菌 Rsp fulvum 莫氏红螺菌 Rsp molischianum 中盐红螺菌 Rsp mediosalina Phaeospirillum 褐螺菌属 Roseospira 玫瑰螺菌属 1999 3 中国科学院微生物研究所博士论文 紫色非硫细菌资源分类学研究 2001 第一章 光合细菌 东秀珠 蔡妙英主编 常见细菌鉴定手册 2004 第一章 光合细菌的培养 成永旭主编 饵料培养学 2009 杨素萍 微生物学报 宁波大学在光合细菌方面的研究 中国科学院微生物菌种保藏中心的绝大多数光合细菌菌种发表2个新种 有4个可能新种待发表应用DGGE跟踪确定单菌落的纯培养应用分子指纹技术标记重要光合细菌菌种应用分子指纹技术检测养殖水体种光合细菌群落演替光合细菌菌种质量及应用效果评价体系环境细菌菌种资源库养殖废水和河道废水处理菌剂开发 第二届分子微生物生态研讨班 中国生态学会微生物生态专业委员会宁波大学培训基地第二届分子微生物生态研讨班主要培训研讨内容 原位杂交 FISH 环境样品DNA提取及其杂质去除定量PCR技术及其应用 变形菌纲红螺菌目 Rhodospirillales 该目有2科7属 红螺菌科 Rhodospirillaceae 6个属醋酸杆菌科 Acetobacteraceae 1个属红细菌目 Rhodobacterales 有1科4属红细菌科 Rhodobacteraceae 根瘤菌目 Rhizobiales 有3科7属慢生根瘤菌科 Bradyrhizobiaceae 2个属生丝微菌科 Hyphomicrobiaceae 3个属红游动菌科 Rhodobiaceae 2个属 变形菌纲 Betaproteobacteria 伯克霍尔德氏菌目 Burkholderiales 1科丛毛单胞菌科Comamonadaceae2个属红环菌目 Rhodocyclales 1科红环菌科Rhodocyclaceae 变形菌纲3个目6个科 1 红螺菌目 Rhodospirillales 该目有2科7属 红螺菌科 Rhodospirillaceae 红螺菌属 Rhodospirillum 褐螺菌属 Phaeospirillum 红螺细菌属 Rhodospira 红弧菌属 Rhodovibrio 玫瑰螺菌属 Roseospira 红篓菌属 Rhodocista 醋酸杆菌科 Acetobacteraceae 只有红球形菌属 Rhodopila 1个属 2 红细菌目 Rhodobacterales 有1科 红细菌科 Rhodobacteraceae 4属 红细菌属 Rhodobacter 红海菌属 Rhodothalassium 小红卵菌属 Rhodovulum 和最近才发现的Rhodobaca 3 根瘤菌目 Rhizobiales 有3科7属 慢生根瘤菌科 Bradyrhizobiaceae 有红假单胞菌属 Rhodopseudomonas 红芽生菌属 Rhodoblastus 2个属 生丝微菌科 Hyphomicrobiaceae 有芽生绿菌属 Blastochloris 红微菌属 Rhodomicrobium 红菌属 Rhodobium 3个属 红游动菌科 Rhodobiaceae 有红游动菌属 Rhodoplanes 和Roseospirillum2个属 2 变形菌纲 Betaproteobacteria 1 伯克霍尔德氏菌目 Burkholderiales 1科 丛毛单胞菌科Comamonadaceae 2个属 红长命菌属 Rubrivivax 红育菌属 Rhodoferax 2 红环菌目 Rhodocyclales 1科 红环菌科Rhodocyclaceae 红环菌属 Rhodocyclus