医学信息检索与利用概论ppt课件

医学信息检索与利用 概论 1 Whereisthewisdomwehavelostinknowledge Whereistheknowledgewehavelostininformation T S Eliot 1888 1965 我们在信息里面失去的知识 到哪里去了 我们在知识里面失去的智慧 到哪里去了 艾略特 1888 1965 2 第一节基本概念1 信息 Information 英国科学家K Popper认为信息可分为 有关客观物质世界的信息有关人类主观精神世界的信息有关概念世界的信息 3 基本概念2 知识 knowledge 人类在认识世界 改造世界的过程中 不断接受客观事物发出的信息 经过思维加工 获得对事物本质及其运动规律的认识 由此信息转化为知识 国际经济合作与发展组织提出知识的4W概念 know what know why know how know who 4 基本概念3 情报 Information 当人们为了解决某一特定问题去搜寻所需要的知识 那一部分知识就是情报 是被传递的知识或事实 情报的三个基本属性 知识性 传递性 效用性 5 基本概念4 文献 document literature 文献是记录有知识的一切载体 6 4个概念之间的关系 7 网络环境下的信息资源1 电子信息资源文本型 text 多媒体型 multimedia 超文本型 hypertext 8 网络环境下的信息资源2 传统文献印刷型缩微型声像型 9 按文献发布的类型分类 图书期刊特种文献 10 按揭示文献内容程度分类 一次文献二次文献三次文献 11 第二节计算机检索与数据库 计算机检索 利用计算机从文献数据库或因特网上查寻所需文献信息的过程 包括 联机检索 光盘检索 网络检索 12 计算机检索发展简史 脱机检索 off lineretrieval 联机检索 on lineretrieval 光盘检索 opticaldiscretrieval 网络检索 13 数据库的类型与结构 数据库是指有计算机进行处理的一定数量同类信息的有序集合 是用来存储和查找文献的电子化检索工具 14 数据库的类型 书目型数据库 bibliographicdatabase 事实型数据库 factdatabase 数值型数据库 numericdatabase 全文数据库 fulltextdatabase 图像型数据库 imagedatabase atlasonline 15 书目数据库 BibliographicDatabase 存储的是二次文献 包括文献的外部特征 题录 文摘和主题词等 检索结果是所需文献的线索而非原文 许多书目数据库是印刷型文献检索工具的机度版 如MEDLINE CBMDISC等 16 数值数据库 NumericDatabase 主要包含的是数字数据 如各种统计数据 科学实验数据 科学测量数据等 例如医学上使用的化学制剂 药物的各种理化参数 人体生理上的各种数值 人口统计数据都可收入数值数据库 美国国立医学图书馆编制的化学物质毒性数据库RTECS 包含10万多种化学物质的急 慢性毒理实验数据 17 事实数据库 FactDatabase 存储的是用来描述人物 机构 事物等信息的情况 过程 现象的事实数据 如名人录 机构指南 大事记等 均可归入事实数据库 美国MEDLARS系统的医生咨询数据库 PDQ 能提供有关癌症治疗和临床实验的相关病因 诊断标准 治疗方案以及最新研究进展等信息 18 全文数据库 FullTextDatabase 存储的是原始文献的全文 如杂志论文 报纸新闻 法院案例等 全文检索可直接获取原始资料 而不是书目检索时的线索 提高了用户的检索效率 在DIALOG中有48种医药期刊全文数据库 我国有 中国学术期刊 数据库 万方数据库 维普数据库等全文数据库 19 图像数据库 ImageDatabase 以图像为信息主体 配有文字解释 如 解剖图谱 中药图谱 诊断图谱 手术图谱等 如 NLM的ThevisibleHumanProject 哈佛大学医学院的TheWholeBrainAtlas等 20 数据库的结构 文档 file 记录 record 字段 field 21 数据库的结构 文档 file 数据是能满足某种特定目的或某一特定数据处理系统需要的一种数据集合 由一个或多个文档构成现期文档 回溯文档 如MEDLINE 顺排文档 倒排文档 22 记录 record 数据库中基本文献单元一个记录在数据库中通常记录着一篇文献的相关信息 23 字段 field 组成记录的基本信息单元 每一个字段都描述文献的某一方面特征 包括外表特征和内容特征 每个字段有自己的名称和缩写 如 题名 ti 著者 au 文摘 ab 出版年 py 等 24 25 26 计算机检索的途径 检索途径是指用记录的某一特征为检索切入点进行检索 27 自由词检索 自由词又称文本词 textword 是作者写文章时所使用的自然词语 包括 标题词 titleword 关键词 keyword 文摘词 abstractword 全文词 fulltextword 28 主题词检索 主题词 subject subjectheadings 又称叙词 是一种规范化的检索语言 主题词的规范作用在于 对同义词 近义词 异形词 全称与缩写进行归并 以保证一词输入 多词命中 规范的依据 医学主题词表 MESH 例 renalfailureseekidneyfailure 29 分类检索 分类法 Classification 利用学科 专业 概念之间的逻辑关系建立起来的一种等级体系 分类号 由数字或数字加字母构成 代表一个个概念 概念间有上下隶属关系 也有同位间的并列关系 国内常用的分类法是 中国图书资料分类法 30 著者检索 著者 author 检索是用文献上署名的作者或编者的姓名作为检索入口词 检索时注意著者姓名的处理 姓前 名后 姓用全称 名用首字母 如 CharlesGreenberg处理为 Greenbergc闻玉梅处理为 wenym 31 引文检索 参考文献 在学术论文 综述 专著文献后面 列有的著者撰文借鉴利用过的书目清单 引用文献 列有参考文献的文献 参考文献又称为被引用文献 引文检索 以被引用文献为检索起点来查找引用文献的过程 32 机构检索 以机构名称为检索词 来查找该机构学者发表的文献 33 刊名检索 检索指定刊物上发表的文章 有的数据库提供刊名浏览 只需点击刊名链接即可有的数据库则需输入刊名 刊名全称或刊名缩写刊名缩写全称转换可查Pubmed的JournalDatabase http www ncbi nlm nih gov 34 默认检索 默认检索又称缺省检索 隐含检索 是指在检索系统预先设定的多个字段中进行检索 如 在WinSPIRS系统的MEDLINE数据库中 Search状态为默认检索所有非限制字段 包括 ti ab MH等字段 CBMdisc中的 缺省 检索是在中文标题 文摘 主题词 关键词 特征词 刊名等6个字段中搜词检索 35 限定检索 不少数据库提供limit检索功能 用来对检出结果进行数量限制 常用的限定检索有 语种 language 文献类型 publicationtype 出版日期 publicationdate 只要含有全文的记录 fulltextonly 限于临床医学期刊 clinicaljournals 等 36 其他检索途径 专利号 国际连续出版物编号 化学物质登记号检索 分子式检索 特征词检索 记录顺序号检索等 37 计算机检索途径的另一划分法 简单检索复合检索高级检索目录检索导航检索专家检索 38 简单检索 SimpleSearch 也称初级检索 自由词检索 基本检索 指在数据库首页的检索词输入框 查询提问框 内输入一个单词或词组 提交检索工具查询的一种检索方式 39 基本检索说明 基本检索说明 检索字段 基本检索 40 复合检索 CombineSearch 也称布尔逻辑组配检索 BooleanSearch 或简称组配检索 复合检索指在任意字段情况下在检索词输入框中输入复合逻辑检索式提交检索工具查询的一种检索方式 41 高级检索 AdvancedSearch 高级检索指在已设定的高级检索窗口中输入多个检索词 运用逻辑组配关系 查找同时满足多个检索条件的数据 在高级检索界面上一次性实现本应多次检索的结果的一种检索方式 42 高级检索 多栏复合检索 词表查询 多栏逻辑组配 43 目录检索 CategorySearch 或称分类检索 有些检索工具如雅虎 万方 提供分类目录检索 目录检索指按类名分类 每类又分为若干子类目 层层逐级展开 最后点击末级类名 显示网页名链接和简短内容提要 点击链接 显示相关网页内容 如雅虎 或显示该类的文献记录 如万方 维普 44 45 导航检索 NavigationSearch 或称浏览检索 BrowseSearch 与目录检索类似 指在系统设置的导航区内按检索树格式逐级展开和进行浏览选择的检索方式 导航检索有学科分类导航和刊名导航检索 46 NGC的导航检索 导航检索 47 专家检索 ExpertSearch 指系统在检索界面设置的一个较大的提问框供用户输入检索策略 用户可根据检索课题的需要 调用相应的检索技术编制比较细致复杂的检索提问式 以一次达到比较满意的检索结果 这种方式适用于有丰富检索经验的用户 48 专家检索 49 计算机检索的步骤 分析检索课题 明确检索要求选择数据库和检索途径确定检索标识 构筑检索提问式上机检索操作整理检索结果 获取原始文献 50 计算机信息检索技术 布尔逻辑检索位置检索截词检索指定字段检索 51 布尔逻辑检索 检索系统中应用最为广泛的检索技术理论基础是集合论与布尔逻辑采用布尔逻辑表达式来表达用户的检索要求通过布尔逻辑运算符来连接检索词 以及表示运算优先级的括号组成的一种表达检索要求的算式 52 逻辑或 OR AORB 记录中出现检索词A或检索词B或两词同时出现在一条记录中 其作用是扩大检索范围 提高查全率 AORB 如查有关维生素C方面的文献 检索式可写成 VitaminCorAscorbicacid 53 逻辑与 AND AANDB 检索词A和检索词B同时出现在一条记录中 其作用是缩小检索范围 提高查准率 AandB 例如查有关 妇女吸烟 的文献 检索式可写成 Womenandsmoking 54 逻辑非 NOT ANOTB 记录必须包含检索词A但不能包含检索词B 即在含有A检索词的文献中去除含有B检索词的文献 其作用是缩小检索范围 提高查准率 ANOTB 例如查找有关 非儿童白血病 的文献 检索式可写成 Leukemianotchild 55 布尔逻辑算符的运算次序 NOT AND OR 号里的部分运算优先 56 位置检索 With同字段检索AwithBAB同时出现在一个字段中Near相邻检索Anear4BAB出现在一个句中相隔n 1个单词 57 截词检索 截词 Truncation 检索者将检索词在他认为合适的地方截断 截词检索 检索时针对检索词附加一个截断符号 指明该检索词在与数据库中的词比较时 采取完整匹配还是部分匹配 58 无限截断 检索词串与被检索词实现部分一致的匹配 被截断的部分没有限定有多少个字符 左截断 leukemia preleukemia leukemia右截断 leukocyt leukocyteleukocyticleukocythemia中间截断 leuk ic leukemicleukaemicleukemogenicleukocytoctastic左右截断 leukemia leukemiapreleukemialeukemias 59 有限截断 检索词串与被检索词只在指定的位置可以不一致 每个被屏蔽的字符通常都有 来替代 如 leukemi leukemialeukemidleukemic 60 指定字段检索 同样的词出现在记录的不同位置对表达文献的主要内容所起的作用不同 题名 文摘 全文有些词在记录的不同位置出现表示的意义不同 人名在著者字段中出现 表明其为著者之一人名在摘要或全文中出现 可能为文献评论的对象 61 TITitle题名AIDSINTIAUAuthor著者HeMINAUSOSource文献出处circulationinsoPYPublicationYearPY 1998LALanguageChineseinlaABAbstracthypertensioninabMeshMedicalSubjecthepatitisinmeshHeadings 62 检索结果的反馈调整 扩大检索范围的措施降低检索词的专指度 可从词表或检出文献中选择泛指词 调节检索式的网罗度 如删除某个不重要的检索词 进行族性检索 可用分类号或用OR连接一组同义词和近义词 取消某些限制过严的限制符 63 缩小检索范围的措施提高检索词的专指度 增加AND连接 进一步限定主题词 把检索词限定在主要字段 如标题字段 主题词字段等 缩短检索年限 或限定某些刊物 64 65